MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia typhi str. Wilmington

Total Repeats: 22278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_006142	TAA	2	6	240018	240023	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473397
5003	NC_006142	T	6	6	240079	240084	0 %	100 %	0 %	0 %	51473397
5004	NC_006142	TTG	2	6	240088	240093	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473397
5005	NC_006142	TAT	2	6	240107	240112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5006	NC_006142	TGT	2	6	240113	240118	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473397
5007	NC_006142	AAT	2	6	240162	240167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473397
5008	NC_006142	T	7	7	240179	240185	0 %	100 %	0 %	0 %	51473397
5009	NC_006142	A	6	6	240188	240193	100 %	0 %	0 %	0 %	51473397
5010	NC_006142	ATT	2	6	240198	240203	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5011	NC_006142	TTA	2	6	240271	240276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5012	NC_006142	AAATAA	2	12	240326	240337	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	51473397
5013	NC_006142	AAG	2	6	240398	240403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51473397
5014	NC_006142	AT	3	6	240479	240484	50 %	50 %	0 %	0 %	51473397
5015	NC_006142	TGA	2	6	240550	240555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473397
5016	NC_006142	TAT	2	6	240578	240583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5017	NC_006142	ATC	2	6	240618	240623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473397
5018	NC_006142	TA	3	6	240635	240640	50 %	50 %	0 %	0 %	51473397
5019	NC_006142	TTA	2	6	240646	240651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5020	NC_006142	ATT	2	6	240675	240680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473397
5021	NC_006142	TAA	2	6	240728	240733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473397
5022	NC_006142	AT	3	6	240773	240778	50 %	50 %	0 %	0 %	51473397
5023	NC_006142	ACTTT	2	10	240830	240839	20 %	60 %	0 %	20 %	51473397
5024	NC_006142	AT	3	6	240900	240905	50 %	50 %	0 %	0 %	51473397
5025	NC_006142	T	6	6	240928	240933	0 %	100 %	0 %	0 %	51473397
5026	NC_006142	T	6	6	240952	240957	0 %	100 %	0 %	0 %	51473397
5027	NC_006142	GAAG	2	8	241065	241072	50 %	0 %	50 %	0 %	51473398
5028	NC_006142	TCCA	2	8	241085	241092	25 %	25 %	0 %	50 %	51473398
5029	NC_006142	TTC	2	6	241094	241099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473398
5030	NC_006142	AAT	2	6	241106	241111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473398
5031	NC_006142	T	7	7	241184	241190	0 %	100 %	0 %	0 %	51473398
5032	NC_006142	TGT	2	6	241195	241200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473398
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5034	NC_006142	CAAG	2	8	241236	241243	50 %	0 %	25 %	25 %	51473398
5035	NC_006142	T	6	6	241327	241332	0 %	100 %	0 %	0 %	51473398
5036	NC_006142	CTT	2	6	241333	241338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473398
5037	NC_006142	CAT	2	6	241339	241344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473398
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5039	NC_006142	ATTAAT	2	12	241458	241469	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5040	NC_006142	AT	3	6	241484	241489	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5041	NC_006142	T	6	6	241489	241494	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
5042	NC_006142	TTAA	2	8	241525	241532	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5043	NC_006142	TAT	2	6	241565	241570	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
5044	NC_006142	ATTA	2	8	241581	241588	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5045	NC_006142	GTT	2	6	241615	241620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473399
5046	NC_006142	TAT	2	6	241626	241631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
5047	NC_006142	ATT	2	6	241669	241674	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
5048	NC_006142	TCT	2	6	241675	241680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473399
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5050	NC_006142	TAG	2	6	241691	241696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473399
5051	NC_006142	AATCTC	2	12	241737	241748	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
5052	NC_006142	AT	3	6	241793	241798	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5053	NC_006142	T	6	6	241805	241810	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
5054	NC_006142	ATA	2	6	241826	241831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473399
5055	NC_006142	GGT	2	6	241888	241893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	51473399
5056	NC_006142	AT	3	6	241958	241963	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5057	NC_006142	TTA	2	6	242009	242014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473399
5058	NC_006142	T	6	6	242048	242053	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
5059	NC_006142	TAC	2	6	242094	242099	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
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5061	NC_006142	ATTT	2	8	242199	242206	25 %	75 %	0 %	0 %	51473399
5062	NC_006142	TA	3	6	242216	242221	50 %	50 %	0 %	0 %	51473399
5063	NC_006142	GTC	2	6	242248	242253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473399
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5071	NC_006142	T	7	7	242427	242433	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
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5073	NC_006142	TAC	2	6	242496	242501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473399
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5081	NC_006142	T	6	6	242812	242817	0 %	100 %	0 %	0 %	51473399
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5098	NC_006142	AT	3	6	243243	243248	50 %	50 %	0 %	0 %	51473400
5099	NC_006142	TG	3	6	243260	243265	0 %	50 %	50 %	0 %	51473400
5100	NC_006142	TGT	2	6	243324	243329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	51473400
5101	NC_006142	T	6	6	243355	243360	0 %	100 %	0 %	0 %	51473400
5102	NC_006142	TAAA	2	8	243370	243377	75 %	25 %	0 %	0 %	51473400
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5105	NC_006142	AGAGT	2	10	243516	243525	40 %	20 %	40 %	0 %	51473400
5106	NC_006142	TTTA	2	8	243530	243537	25 %	75 %	0 %	0 %	51473400
5107	NC_006142	AAT	2	6	243548	243553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
5108	NC_006142	GAT	2	6	243595	243600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473400
5109	NC_006142	TAA	2	6	243671	243676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
5110	NC_006142	AAT	2	6	243682	243687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473400
5111	NC_006142	AG	3	6	244071	244076	50 %	0 %	50 %	0 %	51473401
5112	NC_006142	TAT	2	6	244123	244128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
5113	NC_006142	TGA	2	6	244144	244149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473401
5114	NC_006142	AT	3	6	244155	244160	50 %	50 %	0 %	0 %	51473401
5115	NC_006142	A	6	6	244172	244177	100 %	0 %	0 %	0 %	51473401
5116	NC_006142	TTA	2	6	244263	244268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
5117	NC_006142	TAAT	2	8	244272	244279	50 %	50 %	0 %	0 %	51473401
5118	NC_006142	TGC	2	6	244303	244308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	51473401
5119	NC_006142	TAT	2	6	244315	244320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473401
5120	NC_006142	ATC	2	6	244444	244449	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473401
5121	NC_006142	T	7	7	244644	244650	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
5122	NC_006142	ATT	2	6	244683	244688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473402
5123	NC_006142	GTTT	2	8	244702	244709	0 %	75 %	25 %	0 %	51473402
5124	NC_006142	T	6	6	244707	244712	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
5125	NC_006142	TAT	2	6	244721	244726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473402
5126	NC_006142	TTC	2	6	244734	244739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
5127	NC_006142	T	6	6	244794	244799	0 %	100 %	0 %	0 %	51473402
5128	NC_006142	TCT	2	6	244821	244826	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	51473402
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5131	NC_006142	CT	3	6	245013	245018	0 %	50 %	0 %	50 %	51473402
5132	NC_006142	CTA	2	6	245033	245038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473402
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5247	NC_006142	AT	3	6	251021	251026	50 %	50 %	0 %	0 %	51473405
5248	NC_006142	AACT	2	8	251044	251051	50 %	25 %	0 %	25 %	51473405
5249	NC_006142	TTA	2	6	251058	251063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473405
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5251	NC_006142	TGA	2	6	251094	251099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473405
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5256	NC_006142	TA	3	6	251244	251249	50 %	50 %	0 %	0 %	51473405
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5359	NC_006142	AATA	2	8	261327	261334	75 %	25 %	0 %	0 %	51473411
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5370	NC_006142	TG	3	6	261818	261823	0 %	50 %	50 %	0 %	51473411
5371	NC_006142	GT	3	6	261842	261847	0 %	50 %	50 %	0 %	51473411
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5376	NC_006142	TCA	2	6	262042	262047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473411
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5480	NC_006142	T	6	6	267074	267079	0 %	100 %	0 %	0 %	51473415
5481	NC_006142	GGC	2	6	267128	267133	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	51473415
5482	NC_006142	AGAAA	2	10	267243	267252	80 %	0 %	20 %	0 %	51473415
5483	NC_006142	ATTTT	2	10	267286	267295	20 %	80 %	0 %	0 %	51473415
5484	NC_006142	AAT	2	6	267343	267348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51473415
5485	NC_006142	ATC	2	6	267356	267361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473415
5486	NC_006142	A	6	6	267454	267459	100 %	0 %	0 %	0 %	51473415
5487	NC_006142	GTTT	2	8	267471	267478	0 %	75 %	25 %	0 %	51473415
5488	NC_006142	TTA	2	6	267487	267492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473415
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5491	NC_006142	GCA	4	12	267568	267579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	51473415
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5493	NC_006142	TA	3	6	267658	267663	50 %	50 %	0 %	0 %	51473415
5494	NC_006142	ATC	2	6	267675	267680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	51473415
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5496	NC_006142	A	7	7	267962	267968	100 %	0 %	0 %	0 %	51473416
5497	NC_006142	TAT	2	6	267979	267984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51473416
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5499	NC_006142	A	6	6	268030	268035	100 %	0 %	0 %	0 %	51473416
5500	NC_006142	TGA	2	6	268042	268047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	51473416

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