MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 4192

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005296	ACCAC	2	10	1991	2000	40 %	0 %	0 %	60 %	39933081
2	NC_005296	AGGCG	2	10	3449	3458	20 %	0 %	60 %	20 %	39933082
3	NC_005296	GCAGC	2	10	4291	4300	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
4	NC_005296	GACGC	2	10	4469	4478	20 %	0 %	40 %	40 %	39933083
5	NC_005296	GTGCT	2	10	5896	5905	0 %	40 %	40 %	20 %	39933084
6	NC_005296	CCGCG	2	10	5955	5964	0 %	0 %	40 %	60 %	39933084
7	NC_005296	CCCGA	2	10	6076	6085	20 %	0 %	20 %	60 %	39933084
8	NC_005296	GCTCG	2	10	7122	7131	0 %	20 %	40 %	40 %	39933084
9	NC_005296	CCTCG	2	10	8053	8062	0 %	20 %	20 %	60 %	39933085
10	NC_005296	GATCG	2	10	11160	11169	20 %	20 %	40 %	20 %	39933088
11	NC_005296	GCCGA	2	10	11200	11209	20 %	0 %	40 %	40 %	39933089
12	NC_005296	CGGCG	2	10	11411	11420	0 %	0 %	60 %	40 %	39933089
13	NC_005296	GACGT	2	10	13336	13345	20 %	20 %	40 %	20 %	39933090
14	NC_005296	CCCGA	2	10	13653	13662	20 %	0 %	20 %	60 %	39933090
15	NC_005296	GCGCA	2	10	14305	14314	20 %	0 %	40 %	40 %	39933091
16	NC_005296	GCGCG	2	10	15444	15453	0 %	0 %	60 %	40 %	39933093
17	NC_005296	ATCGC	2	10	15617	15626	20 %	20 %	20 %	40 %	39933093
18	NC_005296	GGCGA	2	10	16654	16663	20 %	0 %	60 %	20 %	39933093
19	NC_005296	TCCAC	2	10	16701	16710	20 %	20 %	0 %	60 %	39933093
20	NC_005296	GGCCG	2	10	17605	17614	0 %	0 %	60 %	40 %	39933095
21	NC_005296	GGTCG	2	10	19281	19290	0 %	20 %	60 %	20 %	39933096
22	NC_005296	GGCCG	2	10	23607	23616	0 %	0 %	60 %	40 %	39933100
23	NC_005296	TGCCC	2	10	24117	24126	0 %	20 %	20 %	60 %	39933101
24	NC_005296	GTTGC	2	10	24497	24506	0 %	40 %	40 %	20 %	39933101
25	NC_005296	CGCGC	2	10	24721	24730	0 %	0 %	40 %	60 %	39933102
26	NC_005296	TGCGG	2	10	25220	25229	0 %	20 %	60 %	20 %	39933102
27	NC_005296	CTTGC	2	10	27090	27099	0 %	40 %	20 %	40 %	39933104
28	NC_005296	TGCCC	2	10	28161	28170	0 %	20 %	20 %	60 %	39933105
29	NC_005296	CGGGT	2	10	28717	28726	0 %	20 %	60 %	20 %	39933105
30	NC_005296	CGGCG	2	10	29038	29047	0 %	0 %	60 %	40 %	39933105
31	NC_005296	GATCG	2	10	29538	29547	20 %	20 %	40 %	20 %	39933106
32	NC_005296	CGCGC	2	10	29937	29946	0 %	0 %	40 %	60 %	39933106
33	NC_005296	CGGCG	2	10	32181	32190	0 %	0 %	60 %	40 %	39933108
34	NC_005296	GGCGT	2	10	32881	32890	0 %	20 %	60 %	20 %	39933108
35	NC_005296	GCGCG	2	10	34081	34090	0 %	0 %	60 %	40 %	39933109
36	NC_005296	AGCGC	2	10	34990	34999	20 %	0 %	40 %	40 %	39933109
37	NC_005296	GCCGC	2	10	36563	36572	0 %	0 %	40 %	60 %	39933110
38	NC_005296	CGCGC	2	10	38480	38489	0 %	0 %	40 %	60 %	39933113
39	NC_005296	CCATG	2	10	39433	39442	20 %	20 %	20 %	40 %	39933114
40	NC_005296	ACCGC	2	10	40038	40047	20 %	0 %	20 %	60 %	39933114
41	NC_005296	GCGCG	2	10	41110	41119	0 %	0 %	60 %	40 %	39933115
42	NC_005296	GGCGC	2	10	42470	42479	0 %	0 %	60 %	40 %	39933115
43	NC_005296	CCGGG	2	10	44821	44830	0 %	0 %	60 %	40 %	39933117
44	NC_005296	GTCCG	2	10	47867	47876	0 %	20 %	40 %	40 %	39933121
45	NC_005296	AGCCA	2	10	49184	49193	40 %	0 %	20 %	40 %	39933122
46	NC_005296	CGGCG	2	10	50550	50559	0 %	0 %	60 %	40 %	39933124
47	NC_005296	CGCGC	2	10	51994	52003	0 %	0 %	40 %	60 %	39933125
48	NC_005296	CGATT	2	10	52732	52741	20 %	40 %	20 %	20 %	39933126
49	NC_005296	GCGCC	2	10	55064	55073	0 %	0 %	40 %	60 %	39933129
50	NC_005296	CGCGC	2	10	56459	56468	0 %	0 %	40 %	60 %	39933130
51	NC_005296	CGGAA	2	10	62198	62207	40 %	0 %	40 %	20 %	39933136
52	NC_005296	GTAGC	2	10	64338	64347	20 %	20 %	40 %	20 %	39933138
53	NC_005296	GCCTC	2	10	68429	68438	0 %	20 %	20 %	60 %	39933141
54	NC_005296	CGCGC	2	10	69647	69656	0 %	0 %	40 %	60 %	39933143
55	NC_005296	TCGCC	2	10	69765	69774	0 %	20 %	20 %	60 %	39933143
56	NC_005296	ACCCG	2	10	70338	70347	20 %	0 %	20 %	60 %	39933144
57	NC_005296	GATCG	2	10	70559	70568	20 %	20 %	40 %	20 %	39933144
58	NC_005296	CAGCG	2	10	71810	71819	20 %	0 %	40 %	40 %	39933144
59	NC_005296	GAAGT	2	10	72746	72755	40 %	20 %	40 %	0 %	39933145
60	NC_005296	GCCGC	2	10	74342	74351	0 %	0 %	40 %	60 %	39933148
61	NC_005296	GAGCC	2	10	75917	75926	20 %	0 %	40 %	40 %	39933149
62	NC_005296	AGCCG	2	10	77896	77905	20 %	0 %	40 %	40 %	39933151
63	NC_005296	CGCTG	2	10	79490	79499	0 %	20 %	40 %	40 %	39933153
64	NC_005296	CGGCG	2	10	79523	79532	0 %	0 %	60 %	40 %	39933153
65	NC_005296	GCCAG	2	10	81370	81379	20 %	0 %	40 %	40 %	39933154
66	NC_005296	CCGGA	2	10	81924	81933	20 %	0 %	40 %	40 %	39933154
67	NC_005296	GCCGC	2	10	82230	82239	0 %	0 %	40 %	60 %	39933154
68	NC_005296	GCGCG	2	10	82552	82561	0 %	0 %	60 %	40 %	39933154
69	NC_005296	CCTGC	2	10	82568	82577	0 %	20 %	20 %	60 %	39933154
70	NC_005296	CGCGC	2	10	85153	85162	0 %	0 %	40 %	60 %	39933155
71	NC_005296	CGCTG	2	10	85869	85878	0 %	20 %	40 %	40 %	39933155
72	NC_005296	CGCGC	2	10	85917	85926	0 %	0 %	40 %	60 %	39933155
73	NC_005296	GCCGC	2	10	86172	86181	0 %	0 %	40 %	60 %	39933155
74	NC_005296	CGGCG	2	10	86428	86437	0 %	0 %	60 %	40 %	39933155
75	NC_005296	CAGCT	2	10	87570	87579	20 %	20 %	20 %	40 %	39933157
76	NC_005296	CGCGG	2	10	88342	88351	0 %	0 %	60 %	40 %	39933158
77	NC_005296	GCTCG	2	10	90730	90739	0 %	20 %	40 %	40 %	39933159
78	NC_005296	GACCG	2	10	93112	93121	20 %	0 %	40 %	40 %	229220836
79	NC_005296	AGCCG	2	10	93915	93924	20 %	0 %	40 %	40 %	229220836
80	NC_005296	GGCGA	2	10	94569	94578	20 %	0 %	60 %	20 %	39933162
81	NC_005296	GGCCG	2	10	95481	95490	0 %	0 %	60 %	40 %	39933162
82	NC_005296	AACCC	2	10	99653	99662	40 %	0 %	0 %	60 %	39933166
83	NC_005296	GCTCG	2	10	99753	99762	0 %	20 %	40 %	40 %	39933166
84	NC_005296	GATCC	2	10	101624	101633	20 %	20 %	20 %	40 %	39933167
85	NC_005296	CGCGC	2	10	102495	102504	0 %	0 %	40 %	60 %	39933169
86	NC_005296	GCCCC	2	10	104577	104586	0 %	0 %	20 %	80 %	39933173
87	NC_005296	GCCGC	2	10	104982	104991	0 %	0 %	40 %	60 %	39933173
88	NC_005296	CCGGT	2	10	106105	106114	0 %	20 %	40 %	40 %	39933174
89	NC_005296	GCGCA	2	10	106689	106698	20 %	0 %	40 %	40 %	39933175
90	NC_005296	CCGGC	2	10	109834	109843	0 %	0 %	40 %	60 %	39933176
91	NC_005296	GGCTG	2	10	110267	110276	0 %	20 %	60 %	20 %	39933176
92	NC_005296	CGGCG	2	10	110381	110390	0 %	0 %	60 %	40 %	39933176
93	NC_005296	GGCGC	2	10	110396	110405	0 %	0 %	60 %	40 %	39933176
94	NC_005296	CCTCG	2	10	111057	111066	0 %	20 %	20 %	60 %	39933177
95	NC_005296	CGCGG	2	10	111543	111552	0 %	0 %	60 %	40 %	39933178
96	NC_005296	CGGCG	2	10	111949	111958	0 %	0 %	60 %	40 %	39933178
97	NC_005296	GCCGC	2	10	112575	112584	0 %	0 %	40 %	60 %	39933179
98	NC_005296	GCGCA	2	10	114126	114135	20 %	0 %	40 %	40 %	39933180
99	NC_005296	CGGTC	2	10	115860	115869	0 %	20 %	40 %	40 %	39933182
100	NC_005296	AAGGC	2	10	115871	115880	40 %	0 %	40 %	20 %	39933182
101	NC_005296	GGCGA	2	10	117104	117113	20 %	0 %	60 %	20 %	39933183
102	NC_005296	GCGTC	2	10	117724	117733	0 %	20 %	40 %	40 %	39933183
103	NC_005296	GCCGC	2	10	118239	118248	0 %	0 %	40 %	60 %	39933184
104	NC_005296	GCCAG	2	10	118573	118582	20 %	0 %	40 %	40 %	39933184
105	NC_005296	GGTCG	2	10	118783	118792	0 %	20 %	60 %	20 %	39933184
106	NC_005296	CCGCA	2	10	119431	119440	20 %	0 %	20 %	60 %	39933184
107	NC_005296	GCAGC	2	10	120040	120049	20 %	0 %	40 %	40 %	39933185
108	NC_005296	CGGCG	2	10	121832	121841	0 %	0 %	60 %	40 %	39933186
109	NC_005296	TCGGA	2	10	121873	121882	20 %	20 %	40 %	20 %	39933186
110	NC_005296	CGGCC	2	10	122807	122816	0 %	0 %	40 %	60 %	39933187
111	NC_005296	GATCG	2	10	122934	122943	20 %	20 %	40 %	20 %	39933187
112	NC_005296	CGGCG	2	10	123519	123528	0 %	0 %	60 %	40 %	39933187
113	NC_005296	GGCCC	2	10	124072	124081	0 %	0 %	40 %	60 %	39933188
114	NC_005296	CCGCG	2	10	124867	124876	0 %	0 %	40 %	60 %	39933188
115	NC_005296	GATGC	2	10	124940	124949	20 %	20 %	40 %	20 %	39933188
116	NC_005296	GCCCG	2	10	125105	125114	0 %	0 %	40 %	60 %	39933188
117	NC_005296	GCGCC	2	10	128275	128284	0 %	0 %	40 %	60 %	39933192
118	NC_005296	CCGCA	2	10	128719	128728	20 %	0 %	20 %	60 %	39933192
119	NC_005296	GCTCG	2	10	136976	136985	0 %	20 %	40 %	40 %	39933199
120	NC_005296	CCGGT	2	10	137467	137476	0 %	20 %	40 %	40 %	39933199
121	NC_005296	GCCGC	2	10	137901	137910	0 %	0 %	40 %	60 %	39933199
122	NC_005296	GGCAC	2	10	138648	138657	20 %	0 %	40 %	40 %	39933199
123	NC_005296	CAACA	2	10	140615	140624	60 %	0 %	0 %	40 %	39933200
124	NC_005296	GCGAC	2	10	146194	146203	20 %	0 %	40 %	40 %	39933206
125	NC_005296	CGCGG	2	10	146798	146807	0 %	0 %	60 %	40 %	39933207
126	NC_005296	CAGGA	2	10	151824	151833	40 %	0 %	40 %	20 %	39933211
127	NC_005296	TGGTC	2	10	154483	154492	0 %	40 %	40 %	20 %	39933213
128	NC_005296	TCGCG	2	10	154714	154723	0 %	20 %	40 %	40 %	39933213
129	NC_005296	CGGCC	2	10	158613	158622	0 %	0 %	40 %	60 %	39933216
130	NC_005296	GCTTT	2	10	160107	160116	0 %	60 %	20 %	20 %	39933216
131	NC_005296	GATCG	2	10	161089	161098	20 %	20 %	40 %	20 %	39933218
132	NC_005296	GAGGC	2	10	162235	162244	20 %	0 %	60 %	20 %	39933219
133	NC_005296	GCGCG	2	10	162403	162412	0 %	0 %	60 %	40 %	39933219
134	NC_005296	CGAAG	2	10	162815	162824	40 %	0 %	40 %	20 %	39933219
135	NC_005296	CGGCT	2	10	164618	164627	0 %	20 %	40 %	40 %	39933222
136	NC_005296	CCGCG	2	10	164650	164659	0 %	0 %	40 %	60 %	39933222
137	NC_005296	AATCG	2	10	167215	167224	40 %	20 %	20 %	20 %	39933225
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