MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005296	CGA	2	6	149326	149331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3502	NC_005296	CAG	2	6	149348	149353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3503	NC_005296	CCCG	2	8	149395	149402	0 %	0 %	25 %	75 %	39933210
3504	NC_005296	GGC	2	6	149407	149412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210
3505	NC_005296	GGC	2	6	149486	149491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210
3506	NC_005296	GCA	2	6	149500	149505	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3507	NC_005296	CGGC	2	8	149520	149527	0 %	0 %	50 %	50 %	39933210
3508	NC_005296	GCA	2	6	149608	149613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3509	NC_005296	CAG	2	6	149624	149629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3510	NC_005296	CAG	2	6	149654	149659	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3511	NC_005296	TGC	2	6	149662	149667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3512	NC_005296	CGAC	2	8	149683	149690	25 %	0 %	25 %	50 %	39933210
3513	NC_005296	CG	3	6	149704	149709	0 %	0 %	50 %	50 %	39933210
3514	NC_005296	GAC	2	6	149735	149740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3515	NC_005296	GAA	2	6	149771	149776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933210
3516	NC_005296	GGC	2	6	149780	149785	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210
3517	NC_005296	GC	3	6	149835	149840	0 %	0 %	50 %	50 %	39933210
3518	NC_005296	CTG	2	6	149888	149893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933210
3519	NC_005296	CGG	2	6	149968	149973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210
3520	NC_005296	CAC	2	6	150020	150025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933210
3521	NC_005296	GGC	2	6	150054	150059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933210
3522	NC_005296	TGC	2	6	150132	150137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3523	NC_005296	GCA	2	6	150169	150174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3524	NC_005296	GCA	2	6	150205	150210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3525	NC_005296	TTG	2	6	150240	150245	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933211
3526	NC_005296	GGC	2	6	150263	150268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933211
3527	NC_005296	GCG	2	6	150293	150298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933211
3528	NC_005296	CTT	2	6	150323	150328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933211
3529	NC_005296	GCC	2	6	150359	150364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3530	NC_005296	CGC	2	6	150403	150408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3531	NC_005296	CCA	2	6	150421	150426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933211
3532	NC_005296	CCG	2	6	150589	150594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3533	NC_005296	CGC	2	6	150604	150609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3534	NC_005296	GGT	2	6	150611	150616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933211
3535	NC_005296	CGA	2	6	150671	150676	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3536	NC_005296	CGC	2	6	150705	150710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3537	NC_005296	AGC	2	6	150711	150716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3538	NC_005296	CG	3	6	150727	150732	0 %	0 %	50 %	50 %	39933211
3539	NC_005296	CTT	2	6	150797	150802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933211
3540	NC_005296	CCG	2	6	150841	150846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3541	NC_005296	CTG	2	6	150896	150901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3542	NC_005296	ACA	2	6	150919	150924	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933211
3543	NC_005296	GCA	2	6	150928	150933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3544	NC_005296	GCA	2	6	150974	150979	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3545	NC_005296	GCC	2	6	150997	151002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933211
3546	NC_005296	CAG	2	6	151019	151024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3547	NC_005296	CTC	2	6	151034	151039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933211
3548	NC_005296	CAC	2	6	151076	151081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933211
3549	NC_005296	GGC	2	6	151103	151108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933211
3550	NC_005296	GAT	2	6	151109	151114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933211
3551	NC_005296	TGCC	2	8	151132	151139	0 %	25 %	25 %	50 %	39933211
3552	NC_005296	TTC	2	6	151151	151156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933211
3553	NC_005296	CAC	2	6	151190	151195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933211
3554	NC_005296	GAC	2	6	151199	151204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3555	NC_005296	GCAC	2	8	151279	151286	25 %	0 %	25 %	50 %	39933211
3556	NC_005296	CCA	2	6	151339	151344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933211
3557	NC_005296	TCT	2	6	151384	151389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933211
3558	NC_005296	GAA	2	6	151502	151507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933211
3559	NC_005296	CTG	2	6	151514	151519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3560	NC_005296	CGA	2	6	151525	151530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3561	NC_005296	GAT	2	6	151591	151596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933211
3562	NC_005296	CAG	2	6	151604	151609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3563	NC_005296	CTT	2	6	151640	151645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933211
3564	NC_005296	CGT	2	6	151807	151812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933211
3565	NC_005296	CAGGA	2	10	151824	151833	40 %	0 %	40 %	20 %	39933211
3566	NC_005296	CGG	2	6	151894	151899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933211
3567	NC_005296	GGCT	2	8	151915	151922	0 %	25 %	50 %	25 %	39933211
3568	NC_005296	GAC	2	6	151972	151977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3569	NC_005296	GGC	2	6	152023	152028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933212
3570	NC_005296	CGA	2	6	152130	152135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3572	NC_005296	TCG	2	6	152222	152227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3573	NC_005296	GC	3	6	152233	152238	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3574	NC_005296	CGC	2	6	152295	152300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933212
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3578	NC_005296	GCTC	2	8	152499	152506	0 %	25 %	25 %	50 %	39933212
3579	NC_005296	CAC	2	6	152524	152529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933212
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3581	NC_005296	GC	4	8	152600	152607	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3582	NC_005296	CGGC	2	8	152628	152635	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3583	NC_005296	CGA	2	6	152651	152656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3589	NC_005296	GCG	2	6	152831	152836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933212
3590	NC_005296	CTG	2	6	152866	152871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3591	NC_005296	CG	3	6	152893	152898	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3592	NC_005296	CG	3	6	152904	152909	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3593	NC_005296	GTC	2	6	152917	152922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3595	NC_005296	CGA	2	6	152976	152981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3599	NC_005296	CAA	2	6	153097	153102	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933212
3600	NC_005296	GCCG	2	8	153124	153131	0 %	0 %	50 %	50 %	39933212
3601	NC_005296	ACC	2	6	153143	153148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933212
3602	NC_005296	CTG	2	6	153220	153225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3603	NC_005296	TCG	2	6	153266	153271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3605	NC_005296	CGAG	2	8	153360	153367	25 %	0 %	50 %	25 %	39933212
3606	NC_005296	TGC	2	6	153488	153493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3607	NC_005296	GCA	2	6	153528	153533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3608	NC_005296	CAG	2	6	153538	153543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933212
3609	NC_005296	GTC	2	6	153613	153618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3612	NC_005296	GAA	2	6	153781	153786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933212
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3614	NC_005296	TCG	2	6	153833	153838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933212
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3620	NC_005296	GCC	2	6	154137	154142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933213
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3622	NC_005296	TCA	2	6	154360	154365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933213
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3854	NC_005296	GGAA	2	8	163921	163928	50 %	0 %	50 %	0 %	39933221
3855	NC_005296	GTC	2	6	164374	164379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933222
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3859	NC_005296	CGA	2	6	164518	164523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933222
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3862	NC_005296	CCGCG	2	10	164650	164659	0 %	0 %	40 %	60 %	39933222
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3864	NC_005296	GCGA	2	8	164666	164673	25 %	0 %	50 %	25 %	39933222
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3989	NC_005296	GGC	2	6	169414	169419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933228
3990	NC_005296	GCA	2	6	169448	169453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933228
3991	NC_005296	GGC	2	6	169499	169504	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933228
3992	NC_005296	TGA	2	6	169538	169543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933228
3993	NC_005296	CG	3	6	169583	169588	0 %	0 %	50 %	50 %	39933228
3994	NC_005296	CGA	2	6	169616	169621	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933228
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3997	NC_005296	CG	4	8	169697	169704	0 %	0 %	50 %	50 %	39933228
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