MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_005296	GCG	2	6	65466	65471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933139
1502	NC_005296	TTG	2	6	65490	65495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933139
1503	NC_005296	CG	3	6	65496	65501	0 %	0 %	50 %	50 %	39933139
1504	NC_005296	CGG	2	6	65654	65659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933139
1505	NC_005296	GGT	2	6	65804	65809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933139
1506	NC_005296	GAT	2	6	65891	65896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933139
1507	NC_005296	GCC	2	6	65915	65920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933139
1508	NC_005296	CGCC	2	8	66081	66088	0 %	0 %	25 %	75 %	39933139
1509	NC_005296	TTG	2	6	66120	66125	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933139
1510	NC_005296	CGC	2	6	66146	66151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933139
1511	NC_005296	AGGG	2	8	66166	66173	25 %	0 %	75 %	0 %	39933139
1512	NC_005296	TCG	2	6	66189	66194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933139
1513	NC_005296	CCGG	2	8	66195	66202	0 %	0 %	50 %	50 %	39933139
1514	NC_005296	TGA	2	6	66214	66219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933139
1515	NC_005296	GCC	2	6	66260	66265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933139
1516	NC_005296	GATC	2	8	66280	66287	25 %	25 %	25 %	25 %	39933139
1517	NC_005296	ATG	2	6	66687	66692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933140
1518	NC_005296	CTT	3	9	66712	66720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933140
1519	NC_005296	TCG	2	6	66741	66746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933140
1520	NC_005296	TCG	3	9	66750	66758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933140
1521	NC_005296	TCG	2	6	66765	66770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933140
1522	NC_005296	GTC	2	6	66779	66784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933140
1523	NC_005296	CAC	2	6	66797	66802	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933140
1524	NC_005296	GCG	2	6	66925	66930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933140
1525	NC_005296	CAC	2	6	66950	66955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933140
1526	NC_005296	CGT	2	6	67013	67018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933140
1527	NC_005296	GC	3	6	67231	67236	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1528	NC_005296	GCG	2	6	67241	67246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1529	NC_005296	CG	4	8	67260	67267	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1530	NC_005296	GC	3	6	67310	67315	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1531	NC_005296	TCA	2	6	67364	67369	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933141
1532	NC_005296	GC	4	8	67386	67393	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1533	NC_005296	GCCG	2	8	67580	67587	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1534	NC_005296	GCG	2	6	67590	67595	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1535	NC_005296	TCG	2	6	67598	67603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1536	NC_005296	GGT	2	6	67629	67634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933141
1537	NC_005296	AGC	2	6	67639	67644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1538	NC_005296	GGC	2	6	67648	67653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1539	NC_005296	CCG	2	6	67736	67741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933141
1540	NC_005296	TGC	2	6	67742	67747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1541	NC_005296	CGAGGC	2	12	67785	67796	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	39933141
1542	NC_005296	TGC	2	6	67820	67825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1543	NC_005296	CCGAAG	2	12	67850	67861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1544	NC_005296	GCG	2	6	67907	67912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1545	NC_005296	GGT	3	9	67917	67925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933141
1546	NC_005296	GCCG	2	8	67926	67933	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1547	NC_005296	CGG	2	6	67943	67948	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1548	NC_005296	TGG	2	6	67970	67975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933141
1549	NC_005296	TGA	2	6	68006	68011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933141
1550	NC_005296	ACG	2	6	68038	68043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1551	NC_005296	TCGA	2	8	68062	68069	25 %	25 %	25 %	25 %	39933141
1552	NC_005296	GCC	2	6	68151	68156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933141
1553	NC_005296	CG	3	6	68161	68166	0 %	0 %	50 %	50 %	39933141
1554	NC_005296	GAT	2	6	68172	68177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933141
1555	NC_005296	CGA	2	6	68178	68183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1556	NC_005296	CGC	2	6	68202	68207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933141
1557	NC_005296	CAC	2	6	68223	68228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933141
1558	NC_005296	CGG	2	6	68285	68290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1559	NC_005296	TGC	2	6	68294	68299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1560	NC_005296	CGA	2	6	68331	68336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1561	NC_005296	TCG	2	6	68342	68347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1562	NC_005296	GCG	2	6	68369	68374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933141
1563	NC_005296	CCAC	2	8	68384	68391	25 %	0 %	0 %	75 %	39933141
1564	NC_005296	ATC	2	6	68396	68401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933141
1565	NC_005296	GCCTC	2	10	68429	68438	0 %	20 %	20 %	60 %	39933141
1566	NC_005296	CGA	2	6	68457	68462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933141
1567	NC_005296	CCA	2	6	68477	68482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933141
1568	NC_005296	GAT	2	6	68502	68507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933141
1569	NC_005296	CGA	2	6	68565	68570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933142
1570	NC_005296	CGGT	2	8	68573	68580	0 %	25 %	50 %	25 %	39933142
1571	NC_005296	GCG	2	6	68591	68596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933142
1572	NC_005296	GCC	2	6	68603	68608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933142
1573	NC_005296	AGCC	2	8	68640	68647	25 %	0 %	25 %	50 %	39933142
1574	NC_005296	GCA	2	6	68700	68705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933142
1575	NC_005296	AGC	2	6	68726	68731	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933142
1576	NC_005296	CG	3	6	68829	68834	0 %	0 %	50 %	50 %	39933142
1577	NC_005296	CAT	2	6	68881	68886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933142
1578	NC_005296	CG	3	6	68889	68894	0 %	0 %	50 %	50 %	39933142
1579	NC_005296	CCGC	2	8	68895	68902	0 %	0 %	25 %	75 %	39933142
1580	NC_005296	GCA	2	6	69024	69029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933142
1581	NC_005296	GCC	2	6	69045	69050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933142
1582	NC_005296	ATC	2	6	69380	69385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933143
1583	NC_005296	CG	3	6	69482	69487	0 %	0 %	50 %	50 %	39933143
1584	NC_005296	CGA	2	6	69526	69531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933143
1585	NC_005296	GC	4	8	69533	69540	0 %	0 %	50 %	50 %	39933143
1586	NC_005296	CG	3	6	69550	69555	0 %	0 %	50 %	50 %	39933143
1587	NC_005296	CGA	2	6	69577	69582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933143
1588	NC_005296	GCC	2	6	69614	69619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933143
1589	NC_005296	GGT	2	6	69622	69627	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933143
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1591	NC_005296	AGA	2	6	69669	69674	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933143
1592	NC_005296	CGC	3	9	69679	69687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933143
1593	NC_005296	TCGCC	2	10	69765	69774	0 %	20 %	20 %	60 %	39933143
1594	NC_005296	CCG	2	6	69790	69795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933143
1595	NC_005296	CGA	2	6	69829	69834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933143
1596	NC_005296	CGA	2	6	69865	69870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933143
1597	NC_005296	CGG	2	6	69888	69893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933143
1598	NC_005296	CGC	2	6	69894	69899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933143
1599	NC_005296	CAAG	2	8	69901	69908	50 %	0 %	25 %	25 %	39933143
1600	NC_005296	GGC	2	6	69953	69958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933143
1601	NC_005296	GCC	2	6	69965	69970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933143
1602	NC_005296	ACCCG	2	10	70338	70347	20 %	0 %	20 %	60 %	39933144
1603	NC_005296	CGA	2	6	70348	70353	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1604	NC_005296	CGC	2	6	70357	70362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933144
1605	NC_005296	CGA	2	6	70369	70374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1606	NC_005296	CGG	2	6	70384	70389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933144
1607	NC_005296	GTC	2	6	70424	70429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1608	NC_005296	GATCG	2	10	70559	70568	20 %	20 %	40 %	20 %	39933144
1609	NC_005296	CG	3	6	70596	70601	0 %	0 %	50 %	50 %	39933144
1610	NC_005296	GC	3	6	70607	70612	0 %	0 %	50 %	50 %	39933144
1611	NC_005296	AG	3	6	70618	70623	50 %	0 %	50 %	0 %	39933144
1612	NC_005296	AAC	2	6	70652	70657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933144
1613	NC_005296	GGC	2	6	70694	70699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933144
1614	NC_005296	TGA	2	6	70782	70787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933144
1615	NC_005296	CGC	2	6	70823	70828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933144
1616	NC_005296	TCG	2	6	70839	70844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1617	NC_005296	AGC	2	6	70881	70886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1618	NC_005296	CGT	2	6	70933	70938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1619	NC_005296	TCG	2	6	70965	70970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1620	NC_005296	CGG	2	6	70975	70980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933144
1621	NC_005296	CTG	2	6	70991	70996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933144
1622	NC_005296	CCGA	2	8	71033	71040	25 %	0 %	25 %	50 %	39933144
1623	NC_005296	GTCAAG	2	12	71063	71074	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	39933144
1624	NC_005296	ATC	2	6	71075	71080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933144
1625	NC_005296	AGC	2	6	71121	71126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933144
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