MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005296	CGC	2	6	41872	41877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1002	NC_005296	CGA	2	6	41911	41916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1003	NC_005296	CGA	2	6	41932	41937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1004	NC_005296	ACG	2	6	41968	41973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1005	NC_005296	CAC	2	6	41987	41992	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
1006	NC_005296	CGA	2	6	42004	42009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1007	NC_005296	CGG	2	6	42036	42041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1008	NC_005296	GAT	2	6	42101	42106	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933115
1009	NC_005296	GTC	2	6	42110	42115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1010	NC_005296	ACC	3	9	42132	42140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
1011	NC_005296	GCC	2	6	42155	42160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1012	NC_005296	TGG	2	6	42181	42186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933115
1013	NC_005296	GCA	2	6	42202	42207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1014	NC_005296	CGC	2	6	42223	42228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1015	NC_005296	GC	3	6	42242	42247	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1016	NC_005296	GGT	2	6	42326	42331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933115
1017	NC_005296	AGC	2	6	42340	42345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1018	NC_005296	CAC	2	6	42355	42360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
1019	NC_005296	ATG	2	6	42363	42368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933115
1020	NC_005296	GCGA	2	8	42372	42379	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
1021	NC_005296	TCG	2	6	42393	42398	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1022	NC_005296	AGC	2	6	42450	42455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1023	NC_005296	GGCGC	2	10	42470	42479	0 %	0 %	60 %	40 %	39933115
1024	NC_005296	ACC	2	6	42480	42485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
1025	NC_005296	GGC	2	6	42503	42508	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1026	NC_005296	GCGA	2	8	42529	42536	25 %	0 %	50 %	25 %	39933115
1027	NC_005296	CGG	3	9	42763	42771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1028	NC_005296	CG	4	8	42778	42785	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1029	NC_005296	GGC	2	6	42872	42877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1030	NC_005296	ACCG	2	8	42878	42885	25 %	0 %	25 %	50 %	39933115
1031	NC_005296	CGGC	2	8	42892	42899	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1032	NC_005296	GAT	2	6	42905	42910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933115
1033	NC_005296	CGT	2	6	42913	42918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1034	NC_005296	CGG	2	6	42940	42945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1035	NC_005296	CGC	2	6	42973	42978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933115
1036	NC_005296	TGCCGA	2	12	42985	42996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1037	NC_005296	AT	3	6	43017	43022	50 %	50 %	0 %	0 %	39933115
1038	NC_005296	GCG	2	6	43030	43035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1039	NC_005296	GC	4	8	43056	43063	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1040	NC_005296	GC	3	6	43069	43074	0 %	0 %	50 %	50 %	39933115
1041	NC_005296	CAC	2	6	43079	43084	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933115
1042	NC_005296	GGC	2	6	43154	43159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933115
1043	NC_005296	TCG	2	6	43269	43274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933115
1044	NC_005296	GAT	2	6	43282	43287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933115
1045	NC_005296	AG	3	6	43298	43303	50 %	0 %	50 %	0 %	39933115
1046	NC_005296	CGC	2	6	43508	43513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933116
1047	NC_005296	GC	3	6	43512	43517	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
1048	NC_005296	GC	3	6	43521	43526	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
1049	NC_005296	GC	3	6	43676	43681	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
1050	NC_005296	ACC	2	6	43734	43739	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933116
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1052	NC_005296	CG	3	6	43879	43884	0 %	0 %	50 %	50 %	39933116
1053	NC_005296	CCGC	2	8	44213	44220	0 %	0 %	25 %	75 %	39933117
1054	NC_005296	AAC	2	6	44282	44287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933117
1055	NC_005296	CGAT	2	8	44327	44334	25 %	25 %	25 %	25 %	39933117
1056	NC_005296	CCAG	2	8	44427	44434	25 %	0 %	25 %	50 %	39933117
1057	NC_005296	CGG	2	6	44471	44476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933117
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1059	NC_005296	GAA	2	6	44557	44562	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933117
1060	NC_005296	CGG	2	6	44710	44715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933117
1061	NC_005296	CTTC	2	8	44784	44791	0 %	50 %	0 %	50 %	39933117
1062	NC_005296	CCGGG	2	10	44821	44830	0 %	0 %	60 %	40 %	39933117
1063	NC_005296	GTC	2	6	44866	44871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933117
1064	NC_005296	CGG	3	9	44973	44981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933117
1065	NC_005296	CGG	2	6	45015	45020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933117
1066	NC_005296	CGG	2	6	45059	45064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933117
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1069	NC_005296	GCT	2	6	45126	45131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933117
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1072	NC_005296	CGC	2	6	45471	45476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933118
1073	NC_005296	CGA	3	9	45515	45523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933118
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1075	NC_005296	GC	3	6	45608	45613	0 %	0 %	50 %	50 %	39933118
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1083	NC_005296	CTT	2	6	45953	45958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933119
1084	NC_005296	GCG	2	6	46408	46413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933120
1085	NC_005296	CGT	2	6	46480	46485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933120
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1088	NC_005296	ATC	2	6	46629	46634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933120
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1090	NC_005296	TCT	2	6	46666	46671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933120
1091	NC_005296	GC	3	6	46679	46684	0 %	0 %	50 %	50 %	39933120
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1093	NC_005296	CTT	2	6	46694	46699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933120
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1096	NC_005296	CGA	2	6	46751	46756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933120
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1098	NC_005296	G	6	6	46913	46918	0 %	0 %	100 %	0 %	39933120
1099	NC_005296	CGG	2	6	47323	47328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933121
1100	NC_005296	CGG	2	6	47376	47381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933121
1101	NC_005296	GC	3	6	47437	47442	0 %	0 %	50 %	50 %	39933121
1102	NC_005296	TCC	2	6	47485	47490	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	39933121
1103	NC_005296	GCTG	2	8	47519	47526	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
1104	NC_005296	AG	3	6	47529	47534	50 %	0 %	50 %	0 %	39933121
1105	NC_005296	TCG	2	6	47584	47589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933121
1106	NC_005296	GGC	2	6	47593	47598	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933121
1107	NC_005296	CTG	3	9	47608	47616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933121
1108	NC_005296	GCC	2	6	47630	47635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933121
1109	NC_005296	GCG	3	9	47636	47644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933121
1110	NC_005296	GCC	2	6	47650	47655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933121
1111	NC_005296	CGCCGG	2	12	47681	47692	0 %	0 %	50 %	50 %	39933121
1112	NC_005296	GTCCG	2	10	47867	47876	0 %	20 %	40 %	40 %	39933121
1113	NC_005296	GCTG	2	8	47928	47935	0 %	25 %	50 %	25 %	39933121
1114	NC_005296	CCGA	2	8	47944	47951	25 %	0 %	25 %	50 %	39933121
1115	NC_005296	GAT	2	6	47967	47972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933121
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1117	NC_005296	GAG	2	6	48034	48039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933121
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1119	NC_005296	CCGC	2	8	48237	48244	0 %	0 %	25 %	75 %	39933122
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1126	NC_005296	CG	4	8	48543	48550	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
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1128	NC_005296	GC	4	8	48640	48647	0 %	0 %	50 %	50 %	39933122
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1247	NC_005296	CGC	2	6	53998	54003	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933127
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1252	NC_005296	ACC	2	6	54340	54345	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933128
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1255	NC_005296	CGG	2	6	54422	54427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933128
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1362	NC_005296	GC	3	6	59022	59027	0 %	0 %	50 %	50 %	39933132
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1366	NC_005296	ATT	2	6	60007	60012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	39933134
1367	NC_005296	TCCGGC	2	12	60048	60059	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	39933134
1368	NC_005296	TCGA	2	8	60069	60076	25 %	25 %	25 %	25 %	39933134
1369	NC_005296	CAA	2	6	60077	60082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933134
1370	NC_005296	TTC	2	6	60087	60092	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933134
1371	NC_005296	CTG	2	6	60194	60199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933134
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1374	NC_005296	G	6	6	60333	60338	0 %	0 %	100 %	0 %	39933134
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1377	NC_005296	CAG	2	6	60395	60400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933134
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