MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_005296	CCGG	2	8	499148	499155	0 %	0 %	50 %	50 %	39933530
11502	NC_005296	TCGGT	2	10	499186	499195	0 %	40 %	40 %	20 %	39933530
11503	NC_005296	TGAA	2	8	499197	499204	50 %	25 %	25 %	0 %	39933530
11504	NC_005296	GTC	3	9	499371	499379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933531
11505	NC_005296	CAT	2	6	499398	499403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933531
11506	NC_005296	CACCGG	2	12	499404	499415	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933531
11507	NC_005296	CAT	2	6	499472	499477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933531
11508	NC_005296	GCC	2	6	499480	499485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933531
11509	NC_005296	CGG	2	6	499625	499630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933531
11510	NC_005296	GCA	2	6	499706	499711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933531
11511	NC_005296	CAC	2	6	499713	499718	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933531
11512	NC_005296	GCC	3	9	499719	499727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933531
11513	NC_005296	CG	3	6	499761	499766	0 %	0 %	50 %	50 %	39933531
11514	NC_005296	CGG	2	6	499775	499780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933531
11515	NC_005296	GTC	2	6	499782	499787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933531
11516	NC_005296	GCTG	2	8	499835	499842	0 %	25 %	50 %	25 %	39933531
11517	NC_005296	GC	4	8	499869	499876	0 %	0 %	50 %	50 %	39933531
11518	NC_005296	CGATG	2	10	499885	499894	20 %	20 %	40 %	20 %	39933531
11519	NC_005296	ATG	2	6	500118	500123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933532
11520	NC_005296	TCG	2	6	500229	500234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933532
11521	NC_005296	GCC	2	6	500300	500305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933532
11522	NC_005296	TTC	2	6	500399	500404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933532
11523	NC_005296	CTT	2	6	500435	500440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933532
11524	NC_005296	TCT	2	6	500443	500448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933532
11525	NC_005296	GTCA	2	8	500468	500475	25 %	25 %	25 %	25 %	39933532
11526	NC_005296	TCT	2	6	500515	500520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933532
11527	NC_005296	TCA	2	6	500539	500544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933532
11528	NC_005296	GCCGG	2	10	500553	500562	0 %	0 %	60 %	40 %	39933532
11529	NC_005296	TTG	2	6	500634	500639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933532
11530	NC_005296	CG	3	6	500656	500661	0 %	0 %	50 %	50 %	39933532
11531	NC_005296	TGC	2	6	500673	500678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933532
11532	NC_005296	GCC	2	6	500730	500735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933532
11533	NC_005296	CCGA	2	8	500760	500767	25 %	0 %	25 %	50 %	39933532
11534	NC_005296	CAGC	2	8	500819	500826	25 %	0 %	25 %	50 %	39933532
11535	NC_005296	CG	3	6	500832	500837	0 %	0 %	50 %	50 %	39933532
11536	NC_005296	GAT	2	6	500894	500899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933532
11537	NC_005296	CTT	2	6	500903	500908	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933532
11538	NC_005296	CGC	2	6	500933	500938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933532
11539	NC_005296	GTCCG	2	10	500969	500978	0 %	20 %	40 %	40 %	39933532
11540	NC_005296	CGA	2	6	501016	501021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933532
11541	NC_005296	GCC	2	6	501221	501226	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11542	NC_005296	GCC	2	6	501238	501243	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11543	NC_005296	GCC	3	9	501297	501305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11544	NC_005296	CGC	3	9	501348	501356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11545	NC_005296	GCA	2	6	501362	501367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11546	NC_005296	CAG	2	6	501387	501392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11547	NC_005296	ATCG	2	8	501450	501457	25 %	25 %	25 %	25 %	39933533
11548	NC_005296	CGC	2	6	501476	501481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11549	NC_005296	CAG	3	9	501486	501494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11550	NC_005296	GCC	2	6	501529	501534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11551	NC_005296	CGG	2	6	501539	501544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11552	NC_005296	GCC	2	6	501554	501559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11553	NC_005296	AGC	2	6	501562	501567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11554	NC_005296	CGG	2	6	501569	501574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11555	NC_005296	GCGACC	2	12	501583	501594	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	39933533
11556	NC_005296	GAA	2	6	501639	501644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933533
11557	NC_005296	GCC	2	6	501688	501693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11558	NC_005296	CAGC	2	8	501698	501705	25 %	0 %	25 %	50 %	39933533
11559	NC_005296	GGC	3	9	501717	501725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11560	NC_005296	AAC	2	6	501754	501759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933533
11561	NC_005296	GCAG	2	8	501802	501809	25 %	0 %	50 %	25 %	39933533
11562	NC_005296	CG	3	6	501836	501841	0 %	0 %	50 %	50 %	39933533
11563	NC_005296	CGC	3	9	501869	501877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11564	NC_005296	CGA	2	6	501926	501931	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11565	NC_005296	GCC	2	6	501982	501987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11566	NC_005296	GAT	2	6	502002	502007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933533
11567	NC_005296	CGA	2	6	502016	502021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11568	NC_005296	ATC	2	6	502048	502053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933533
11569	NC_005296	GAA	2	6	502071	502076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933533
11570	NC_005296	GC	3	6	502102	502107	0 %	0 %	50 %	50 %	39933533
11571	NC_005296	AGC	2	6	502228	502233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11572	NC_005296	GCG	2	6	502237	502242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11573	NC_005296	GAT	2	6	502248	502253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933533
11574	NC_005296	GCG	2	6	502274	502279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11575	NC_005296	CAT	2	6	502323	502328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933533
11576	NC_005296	GCA	2	6	502361	502366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11577	NC_005296	CGA	2	6	502409	502414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11578	NC_005296	CAG	2	6	502437	502442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11579	NC_005296	AC	3	6	502451	502456	50 %	0 %	0 %	50 %	39933533
11580	NC_005296	CAG	3	9	502470	502478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11581	NC_005296	GCC	2	6	502522	502527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11582	NC_005296	GCCGT	2	10	502531	502540	0 %	20 %	40 %	40 %	39933533
11583	NC_005296	GCG	2	6	502576	502581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933533
11584	NC_005296	GC	3	6	502586	502591	0 %	0 %	50 %	50 %	39933533
11585	NC_005296	CGC	2	6	502606	502611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11586	NC_005296	CAG	2	6	502635	502640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11587	NC_005296	CCG	2	6	502649	502654	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933533
11588	NC_005296	AGC	2	6	502669	502674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11589	NC_005296	CGAA	2	8	502693	502700	50 %	0 %	25 %	25 %	39933533
11590	NC_005296	CAA	2	6	502704	502709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933533
11591	NC_005296	GAC	2	6	502714	502719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11592	NC_005296	AGC	2	6	502741	502746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933533
11593	NC_005296	ACG	2	6	503114	503119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11594	NC_005296	GGC	2	6	503200	503205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933534
11595	NC_005296	CGA	2	6	503217	503222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11596	NC_005296	CGC	2	6	503229	503234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933534
11597	NC_005296	GGCCA	2	10	503254	503263	20 %	0 %	40 %	40 %	39933534
11598	NC_005296	CGG	2	6	503274	503279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933534
11599	NC_005296	GCCTC	2	10	503303	503312	0 %	20 %	20 %	60 %	39933534
11600	NC_005296	CCGCG	2	10	503385	503394	0 %	0 %	40 %	60 %	39933534
11601	NC_005296	GCT	2	6	503441	503446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11602	NC_005296	GCCG	2	8	503517	503524	0 %	0 %	50 %	50 %	39933534
11603	NC_005296	CGA	2	6	503529	503534	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11604	NC_005296	CGC	2	6	503544	503549	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933534
11605	NC_005296	CCG	2	6	503587	503592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933534
11606	NC_005296	AGG	2	6	503600	503605	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933534
11607	NC_005296	GCG	2	6	503791	503796	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933534
11608	NC_005296	CTG	2	6	503803	503808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11609	NC_005296	CGT	2	6	503829	503834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11610	NC_005296	GGT	2	6	503859	503864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933534
11611	NC_005296	TGCC	2	8	503888	503895	0 %	25 %	25 %	50 %	39933534
11612	NC_005296	TCG	2	6	503912	503917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933534
11613	NC_005296	ACC	2	6	503920	503925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933534
11614	NC_005296	CGGC	2	8	503945	503952	0 %	0 %	50 %	50 %	39933534
11615	NC_005296	GCCG	2	8	503992	503999	0 %	0 %	50 %	50 %	39933534
11616	NC_005296	GC	3	6	504005	504010	0 %	0 %	50 %	50 %	39933534
11617	NC_005296	GGC	3	9	504012	504020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933534
11618	NC_005296	GCCC	2	8	504043	504050	0 %	0 %	25 %	75 %	39933534
11619	NC_005296	GCA	3	9	504075	504083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933534
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11621	NC_005296	ATG	2	6	504374	504379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933535
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11982	NC_005296	GAC	2	6	519490	519495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933548
11983	NC_005296	CGGG	2	8	519625	519632	0 %	0 %	75 %	25 %	39933548
11984	NC_005296	TGGTGA	2	12	519644	519655	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	39933548
11985	NC_005296	GGC	2	6	519664	519669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933548
11986	NC_005296	TGG	2	6	519689	519694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933548
11987	NC_005296	GC	3	6	519705	519710	0 %	0 %	50 %	50 %	39933548
11988	NC_005296	TGG	2	6	519725	519730	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933548
11989	NC_005296	ACC	2	6	519733	519738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933548
11990	NC_005296	CGC	2	6	519774	519779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933548
11991	NC_005296	CGA	2	6	519780	519785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933548
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11995	NC_005296	GGC	2	6	519951	519956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933548
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11998	NC_005296	GCT	2	6	520056	520061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933548
11999	NC_005296	CGCTG	2	10	520086	520095	0 %	20 %	40 %	40 %	39933548
12000	NC_005296	TGA	2	6	520439	520444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933549

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