MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopseudomonas palustris CGA009 chromosome

Total Repeats: 125534

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_005296	CGC	2	6	193584	193589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
4502	NC_005296	CGA	2	6	193649	193654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933251
4503	NC_005296	ATC	2	6	193665	193670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933251
4504	NC_005296	GGC	2	6	193701	193706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933251
4505	NC_005296	CGA	2	6	193709	193714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933251
4506	NC_005296	CCGT	2	8	193924	193931	0 %	25 %	25 %	50 %	39933251
4507	NC_005296	GCC	2	6	193940	193945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
4508	NC_005296	TCG	2	6	193993	193998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933251
4509	NC_005296	CCG	2	6	194006	194011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933251
4510	NC_005296	GCT	2	6	194055	194060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933251
4511	NC_005296	GGT	2	6	194265	194270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933252
4512	NC_005296	CG	3	6	194316	194321	0 %	0 %	50 %	50 %	39933252
4513	NC_005296	TCG	2	6	194329	194334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933252
4514	NC_005296	CTG	2	6	194352	194357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933252
4515	NC_005296	TGG	2	6	194372	194377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933252
4516	NC_005296	GCC	2	6	194463	194468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933252
4517	NC_005296	ACG	2	6	194473	194478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933252
4518	NC_005296	TCT	2	6	194480	194485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933252
4519	NC_005296	TTG	2	6	194488	194493	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933252
4520	NC_005296	CCG	2	6	194498	194503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933252
4521	NC_005296	CCA	2	6	194534	194539	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	39933252
4522	NC_005296	GCC	2	6	194778	194783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
4523	NC_005296	CGG	2	6	194785	194790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933253
4524	NC_005296	CTT	2	6	194795	194800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933253
4525	NC_005296	CGC	2	6	194843	194848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
4526	NC_005296	CG	3	6	194882	194887	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
4527	NC_005296	CGA	2	6	194914	194919	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4528	NC_005296	CGA	2	6	194950	194955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4529	NC_005296	GAT	2	6	195047	195052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933253
4530	NC_005296	CTG	2	6	195083	195088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4531	NC_005296	CG	3	6	195096	195101	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
4532	NC_005296	CGA	2	6	195121	195126	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4533	NC_005296	GTCGA	2	10	195150	195159	20 %	20 %	40 %	20 %	39933253
4534	NC_005296	CCG	2	6	195169	195174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
4535	NC_005296	GGT	2	6	195212	195217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
4536	NC_005296	GTC	2	6	195263	195268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4537	NC_005296	TGG	4	12	195310	195321	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
4538	NC_005296	GC	3	6	195337	195342	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
4539	NC_005296	GTCG	2	8	195347	195354	0 %	25 %	50 %	25 %	39933253
4540	NC_005296	CCG	2	6	195376	195381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
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4543	NC_005296	CGA	2	6	195445	195450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4544	NC_005296	CGG	2	6	195530	195535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933253
4545	NC_005296	GC	3	6	195559	195564	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
4546	NC_005296	CGC	3	9	195577	195585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
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4550	NC_005296	GCC	2	6	195740	195745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933253
4551	NC_005296	CAG	2	6	195782	195787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4552	NC_005296	CGA	2	6	195790	195795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4553	NC_005296	TGG	2	6	195858	195863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
4554	NC_005296	ATG	2	6	195927	195932	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933253
4555	NC_005296	GC	3	6	195970	195975	0 %	0 %	50 %	50 %	39933253
4556	NC_005296	GGT	2	6	196013	196018	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	39933253
4557	NC_005296	TGC	2	6	196056	196061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4558	NC_005296	CGA	2	6	196147	196152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933253
4559	NC_005296	CGT	2	6	196271	196276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
4560	NC_005296	GAT	2	6	196297	196302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933254
4561	NC_005296	ATC	2	6	196322	196327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933254
4562	NC_005296	ATC	2	6	196367	196372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	39933254
4563	NC_005296	GC	3	6	196413	196418	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
4564	NC_005296	GTT	2	6	196432	196437	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933254
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4566	NC_005296	GC	3	6	196446	196451	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
4567	NC_005296	AGG	2	6	196524	196529	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	39933254
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4569	NC_005296	GCT	2	6	196575	196580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
4570	NC_005296	CTT	2	6	196672	196677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	39933254
4571	NC_005296	GAT	2	6	196738	196743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933254
4572	NC_005296	GCG	2	6	196759	196764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933254
4573	NC_005296	GCT	2	6	196767	196772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
4574	NC_005296	AGA	2	6	196794	196799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933254
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4578	NC_005296	CAG	3	9	196906	196914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933254
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4580	NC_005296	CAG	2	6	196942	196947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933254
4581	NC_005296	GC	3	6	196953	196958	0 %	0 %	50 %	50 %	39933254
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4586	NC_005296	GCG	2	6	197050	197055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933254
4587	NC_005296	GGC	2	6	197065	197070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933254
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4589	NC_005296	TCG	2	6	197109	197114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933254
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4592	NC_005296	GCA	2	6	197408	197413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
4593	NC_005296	CAG	2	6	197418	197423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
4594	NC_005296	CG	3	6	197436	197441	0 %	0 %	50 %	50 %	39933255
4595	NC_005296	TTG	2	6	197446	197451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	39933255
4596	NC_005296	GCG	2	6	197519	197524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933255
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4598	NC_005296	CAG	2	6	197571	197576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
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4601	NC_005296	CGA	2	6	197694	197699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
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4603	NC_005296	GAA	2	6	197751	197756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	39933255
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4606	NC_005296	GC	3	6	197899	197904	0 %	0 %	50 %	50 %	39933255
4607	NC_005296	CGG	2	6	197958	197963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933255
4608	NC_005296	GCG	2	6	197964	197969	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	39933255
4609	NC_005296	CAG	3	9	197970	197978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
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4611	NC_005296	GAT	2	6	198024	198029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	39933255
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4613	NC_005296	ACG	2	6	198130	198135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933255
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4622	NC_005296	ACA	2	6	198731	198736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	39933255
4623	NC_005296	CGCGG	2	10	198810	198819	0 %	0 %	60 %	40 %	39933255
4624	NC_005296	GCCT	2	8	198830	198837	0 %	25 %	25 %	50 %	39933256
4625	NC_005296	GAC	2	6	198908	198913	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933256
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4647	NC_005296	CGT	3	9	200432	200440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933257
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4732	NC_005296	GCC	2	6	203811	203816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	39933259
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4738	NC_005296	CA	3	6	204024	204029	50 %	0 %	0 %	50 %	39933259
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4742	NC_005296	GCT	2	6	204308	204313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	39933260
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4744	NC_005296	CG	3	6	204470	204475	0 %	0 %	50 %	50 %	39933260
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4993	NC_005296	GCA	2	6	213574	213579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	39933268
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