MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 megaplasmid pHG1

Total Repeats: 5589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005241	CGA	2	6	160	165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637669
2	NC_005241	CGT	2	6	345	350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637669
3	NC_005241	GAT	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637669
4	NC_005241	GAC	2	6	376	381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637669
5	NC_005241	GGC	2	6	390	395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637669
6	NC_005241	CCA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637669
7	NC_005241	GAG	2	6	424	429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38637669
8	NC_005241	CAT	2	6	507	512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637669
9	NC_005241	AGC	2	6	533	538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637669
10	NC_005241	TGA	2	6	707	712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637669
11	NC_005241	TCG	2	6	845	850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637669
12	NC_005241	GAC	2	6	859	864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637669
13	NC_005241	CCA	2	6	935	940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637669
14	NC_005241	CGT	2	6	1104	1109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637669
15	NC_005241	GGC	2	6	1116	1121	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637669
16	NC_005241	GAA	3	9	1164	1172	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637669
17	NC_005241	AAT	2	6	1232	1237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	38637670
18	NC_005241	GAC	2	6	1269	1274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
19	NC_005241	GTC	2	6	1290	1295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637670
20	NC_005241	CAA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637670
21	NC_005241	GCA	2	6	1676	1681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
22	NC_005241	TGC	2	6	1813	1818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637670
23	NC_005241	ATT	2	6	1849	1854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38637670
24	NC_005241	CGG	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637670
25	NC_005241	ACT	2	6	1927	1932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637670
26	NC_005241	CGA	2	6	2030	2035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
27	NC_005241	ATC	2	6	2037	2042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637670
28	NC_005241	CGG	3	9	2117	2125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637670
29	NC_005241	CCA	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637670
30	NC_005241	ACA	2	6	2176	2181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637670
31	NC_005241	CGG	2	6	2201	2206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637670
32	NC_005241	CGA	2	6	2306	2311	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
33	NC_005241	CGA	2	6	2405	2410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
34	NC_005241	CGC	2	6	2437	2442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637670
35	NC_005241	CAA	2	6	2516	2521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637670
36	NC_005241	AGC	2	6	2542	2547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
37	NC_005241	GAT	2	6	2564	2569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637670
38	NC_005241	GTT	2	6	2627	2632	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38637670
39	NC_005241	ATG	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637670
40	NC_005241	TGA	2	6	2953	2958	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637670
41	NC_005241	AGC	2	6	2980	2985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637670
42	NC_005241	CGA	2	6	3205	3210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637671
43	NC_005241	CGC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637671
44	NC_005241	ATC	2	6	3468	3473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637671
45	NC_005241	AGG	2	6	3522	3527	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38637671
46	NC_005241	TGC	2	6	3537	3542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637671
47	NC_005241	TTC	2	6	3614	3619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637671
48	NC_005241	TCT	2	6	3621	3626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637671
49	NC_005241	CAT	2	6	3761	3766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637671
50	NC_005241	CAT	2	6	3829	3834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637671
51	NC_005241	GCC	2	6	3837	3842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637671
52	NC_005241	TCG	2	6	3924	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637672
53	NC_005241	TGG	2	6	3968	3973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637672
54	NC_005241	AGT	2	6	4022	4027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637672
55	NC_005241	ATC	2	6	4106	4111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	38637672
56	NC_005241	TCC	2	6	4148	4153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	38637672
57	NC_005241	ACC	2	6	4204	4209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637672
58	NC_005241	GGT	2	6	4281	4286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637673
59	NC_005241	CAG	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637673
60	NC_005241	CCA	2	6	4425	4430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637673
61	NC_005241	CTG	2	6	4450	4455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637673
62	NC_005241	AAG	2	6	4540	4545	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637673
63	NC_005241	GCA	2	6	4611	4616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637673
64	NC_005241	GGT	2	6	4617	4622	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637673
65	NC_005241	GGA	2	6	4641	4646	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38637673
66	NC_005241	GGA	2	6	4650	4655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38637673
67	NC_005241	GGC	2	6	4660	4665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637673
68	NC_005241	TGA	2	6	4679	4684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38637673
69	NC_005241	GGA	2	6	4695	4700	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38637673
70	NC_005241	TGC	2	6	4724	4729	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637673
71	NC_005241	GCC	2	6	4843	4848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637673
72	NC_005241	ACG	2	6	4971	4976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637674
73	NC_005241	CAG	2	6	5008	5013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637674
74	NC_005241	GCT	2	6	5022	5027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637674
75	NC_005241	TGC	2	6	5099	5104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637674
76	NC_005241	CTG	2	6	5113	5118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637674
77	NC_005241	TTC	2	6	5208	5213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637674
78	NC_005241	CGA	2	6	5271	5276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637675
79	NC_005241	CCG	2	6	5288	5293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637675
80	NC_005241	GAC	2	6	5351	5356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637675
81	NC_005241	GGC	3	9	5366	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637675
82	NC_005241	TTC	2	6	5462	5467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38637675
83	NC_005241	CGG	2	6	5633	5638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637675
84	NC_005241	GCC	2	6	5662	5667	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637675
85	NC_005241	CGG	2	6	5691	5696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637675
86	NC_005241	CGG	2	6	5701	5706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637675
87	NC_005241	TGC	2	6	5776	5781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
88	NC_005241	TGC	2	6	5863	5868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
89	NC_005241	TGC	2	6	5911	5916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
90	NC_005241	GAA	2	6	5991	5996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38637676
91	NC_005241	GTG	2	6	6105	6110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637676
92	NC_005241	CGA	2	6	6127	6132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637676
93	NC_005241	GCA	2	6	6153	6158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637676
94	NC_005241	TGC	2	6	6166	6171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
95	NC_005241	GCG	2	6	6172	6177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637676
96	NC_005241	GTC	2	6	6309	6314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
97	NC_005241	CGC	2	6	6337	6342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637676
98	NC_005241	CGA	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637676
99	NC_005241	TGC	2	6	6374	6379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637676
100	NC_005241	AGC	2	6	6423	6428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637676
101	NC_005241	GTG	2	6	6453	6458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637676
102	NC_005241	ACC	2	6	6477	6482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38637676
103	NC_005241	ACG	2	6	6600	6605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637677
104	NC_005241	GGC	2	6	6655	6660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637677
105	NC_005241	CTG	2	6	6685	6690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637677
106	NC_005241	CTG	2	6	6907	6912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637678
107	NC_005241	GTG	2	6	6944	6949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637678
108	NC_005241	CGA	2	6	7133	7138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637678
109	NC_005241	ATT	2	6	7207	7212	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	38637678
110	NC_005241	TGC	2	6	7475	7480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637679
111	NC_005241	GCG	2	6	7535	7540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637679
112	NC_005241	CGC	2	6	7593	7598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
113	NC_005241	CCG	2	6	7653	7658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
114	NC_005241	GCC	2	6	7780	7785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
115	NC_005241	CGC	2	6	7828	7833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
116	NC_005241	TGC	2	6	7967	7972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637679
117	NC_005241	GCC	2	6	8039	8044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
118	NC_005241	TGG	2	6	8306	8311	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637679
119	NC_005241	CGC	2	6	8315	8320	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637679
120	NC_005241	CGG	2	6	8334	8339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637679
121	NC_005241	GCG	2	6	8436	8441	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637679
122	NC_005241	GCG	2	6	8799	8804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637680
123	NC_005241	TCG	2	6	9032	9037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637681
124	NC_005241	GCC	2	6	9051	9056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38637681
125	NC_005241	GCG	2	6	9061	9066	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637681
126	NC_005241	CAA	2	6	9186	9191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	38637681
127	NC_005241	TGC	2	6	9198	9203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637681
128	NC_005241	TCG	2	6	9221	9226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637681
129	NC_005241	GAC	2	6	9276	9281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637681
130	NC_005241	GCG	2	6	9309	9314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637681
131	NC_005241	CAG	2	6	9355	9360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38637681
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258	NC_005241	GCG	2	6	18693	18698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637689
259	NC_005241	GGC	2	6	18805	18810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637689
260	NC_005241	GCG	2	6	19042	19047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637689
261	NC_005241	GTG	2	6	19095	19100	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	38637689
262	NC_005241	GGC	2	6	19199	19204	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38637689
263	NC_005241	TCG	2	6	19264	19269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637689
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265	NC_005241	TGC	2	6	19351	19356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38637689
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