MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia eutropha H16 megaplasmid pHG1

Total Repeats: 8036

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
8001	NC_005241	GTCG	2	8	449099	449106	0 %	25 %	50 %	25 %	38638088
8002	NC_005241	GC	3	6	449168	449173	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8003	NC_005241	GC	3	6	449225	449230	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8004	NC_005241	GCC	3	9	449303	449311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38638088
8005	NC_005241	GCA	2	6	449317	449322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38638088
8006	NC_005241	CGT	2	6	449326	449331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38638088
8007	NC_005241	GCC	2	6	449375	449380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	38638088
8008	NC_005241	GAA	2	6	449426	449431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38638088
8009	NC_005241	CG	3	6	449437	449442	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8010	NC_005241	GTA	2	6	449480	449485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38638088
8011	NC_005241	TTC	2	6	449601	449606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	38638088
8012	NC_005241	CG	3	6	449630	449635	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8013	NC_005241	GTGCAG	2	12	449636	449647	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	38638088
8014	NC_005241	GGC	2	6	449662	449667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38638088
8015	NC_005241	ATG	2	6	449718	449723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38638088
8016	NC_005241	GC	3	6	449754	449759	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8017	NC_005241	CGG	2	6	449782	449787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38638088
8018	NC_005241	GGC	2	6	449822	449827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38638088
8019	NC_005241	TTG	2	6	449835	449840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38638088
8020	NC_005241	TCG	2	6	449904	449909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	38638088
8021	NC_005241	GCCC	2	8	449926	449933	0 %	0 %	25 %	75 %	38638088
8022	NC_005241	GCTTGG	2	12	449983	449994	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	38638088
8023	NC_005241	CAG	2	6	450005	450010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38638088
8024	NC_005241	GGC	2	6	450013	450018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38638088
8025	NC_005241	GCGCTC	2	12	450032	450043	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	38638088
8026	NC_005241	GAT	2	6	450047	450052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38638088
8027	NC_005241	GC	3	6	450113	450118	0 %	0 %	50 %	50 %	38638088
8028	NC_005241	GAT	2	6	450152	450157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	38638088
8029	NC_005241	AGA	2	6	450220	450225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	38638088
8030	NC_005241	GTT	2	6	450236	450241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	38638088
8031	NC_005241	CGGT	2	8	450297	450304	0 %	25 %	50 %	25 %	38638088
8032	NC_005241	CAC	2	6	450308	450313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	38638088
8033	NC_005241	GGA	2	6	450329	450334	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	38638088
8034	NC_005241	GCG	2	6	450382	450387	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	38638088
8035	NC_005241	CAG	2	6	450404	450409	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	38638088
8036	NC_005241	GGCTT	2	10	450492	450501	0 %	40 %	40 %	20 %	38638088

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.