MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_005027	GAT	2	6	214282	214287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470897
4002	NC_005027	GATC	2	8	214327	214334	25 %	25 %	25 %	25 %	32470897
4003	NC_005027	TGC	2	6	214399	214404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4004	NC_005027	CGG	2	6	214405	214410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470897
4005	NC_005027	TCC	3	9	214526	214534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470897
4006	NC_005027	GCC	2	6	214538	214543	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470897
4007	NC_005027	CCCATG	2	12	214560	214571	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32470897
4008	NC_005027	CCAT	2	8	214614	214621	25 %	25 %	0 %	50 %	32470897
4009	NC_005027	GTC	2	6	214664	214669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4010	NC_005027	GCCC	2	8	214674	214681	0 %	0 %	25 %	75 %	32470897
4011	NC_005027	GAACA	2	10	214778	214787	60 %	0 %	20 %	20 %	32470897
4012	NC_005027	CGA	2	6	214846	214851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4013	NC_005027	TGC	2	6	214852	214857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4014	NC_005027	CTCG	2	8	214936	214943	0 %	25 %	25 %	50 %	32470897
4015	NC_005027	CTT	2	6	214999	215004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470897
4016	NC_005027	CTC	2	6	215036	215041	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470897
4017	NC_005027	CCAC	2	8	215071	215078	25 %	0 %	0 %	75 %	32470897
4018	NC_005027	GTT	2	6	215131	215136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470897
4019	NC_005027	CGA	2	6	215140	215145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4020	NC_005027	CTT	2	6	215186	215191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470897
4021	NC_005027	CAA	2	6	215237	215242	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470897
4022	NC_005027	GT	3	6	215257	215262	0 %	50 %	50 %	0 %	32470897
4023	NC_005027	GTC	2	6	215271	215276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4024	NC_005027	TGGA	2	8	215279	215286	25 %	25 %	50 %	0 %	32470897
4025	NC_005027	AC	3	6	215347	215352	50 %	0 %	0 %	50 %	32470897
4026	NC_005027	CGG	2	6	215443	215448	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470897
4027	NC_005027	AGC	2	6	215489	215494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470897
4028	NC_005027	ACA	2	6	215620	215625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470897
4029	NC_005027	CATCAG	2	12	215815	215826	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	32470898
4030	NC_005027	CGC	2	6	215841	215846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470898
4031	NC_005027	TTGCT	2	10	215889	215898	0 %	60 %	20 %	20 %	32470898
4032	NC_005027	TTC	2	6	215925	215930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470898
4033	NC_005027	AAC	2	6	215953	215958	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470898
4034	NC_005027	AGA	2	6	216062	216067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470898
4035	NC_005027	CTC	2	6	216069	216074	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470898
4036	NC_005027	CGT	2	6	216095	216100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470898
4037	NC_005027	TGG	2	6	216280	216285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470898
4038	NC_005027	GTA	2	6	216321	216326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
4039	NC_005027	GTCG	2	8	216333	216340	0 %	25 %	50 %	25 %	32470898
4040	NC_005027	GTA	2	6	216432	216437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
4041	NC_005027	TTC	2	6	216439	216444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470898
4042	NC_005027	CGT	2	6	216509	216514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470898
4043	NC_005027	CGTC	2	8	216548	216555	0 %	25 %	25 %	50 %	32470898
4044	NC_005027	ATGC	2	8	216594	216601	25 %	25 %	25 %	25 %	32470898
4045	NC_005027	CTG	2	6	216621	216626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470898
4046	NC_005027	A	6	6	216655	216660	100 %	0 %	0 %	0 %	32470898
4047	NC_005027	TCGTTT	2	12	216718	216729	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	32470898
4048	NC_005027	TGCC	2	8	216775	216782	0 %	25 %	25 %	50 %	32470898
4049	NC_005027	GTA	2	6	216783	216788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
4050	NC_005027	GTA	2	6	216855	216860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
4051	NC_005027	TTG	2	6	216891	216896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470898
4052	NC_005027	GTC	2	6	216991	216996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470898
4053	NC_005027	TCGC	2	8	217024	217031	0 %	25 %	25 %	50 %	32470898
4054	NC_005027	ATC	2	6	217098	217103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470898
4055	NC_005027	ACC	2	6	217114	217119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470898
4056	NC_005027	CGC	2	6	217200	217205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470898
4057	NC_005027	ATG	2	6	217273	217278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470898
4058	NC_005027	AGG	2	6	217286	217291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470898
4059	NC_005027	GCG	2	6	217372	217377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470898
4060	NC_005027	TCA	2	6	217430	217435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470898
4061	NC_005027	CCG	2	6	217448	217453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470898
4062	NC_005027	CGG	2	6	217472	217477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470898
4063	NC_005027	CGA	2	6	217515	217520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4064	NC_005027	CTCG	2	8	217588	217595	0 %	25 %	25 %	50 %	32470899
4065	NC_005027	TCA	3	9	217624	217632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470899
4066	NC_005027	AAC	2	6	217736	217741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470899
4067	NC_005027	CAA	2	6	217762	217767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470899
4068	NC_005027	CCG	2	6	217781	217786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470899
4069	NC_005027	A	7	7	217863	217869	100 %	0 %	0 %	0 %	32470899
4070	NC_005027	CGGA	2	8	217910	217917	25 %	0 %	50 %	25 %	32470899
4071	NC_005027	CCT	2	6	217969	217974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470899
4072	NC_005027	GAC	2	6	217990	217995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4073	NC_005027	CAC	2	6	218118	218123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470899
4074	NC_005027	AAAG	2	8	218158	218165	75 %	0 %	25 %	0 %	32470899
4075	NC_005027	TTCT	2	8	218176	218183	0 %	75 %	0 %	25 %	32470899
4076	NC_005027	GAT	2	6	218284	218289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470899
4077	NC_005027	CTG	2	6	218302	218307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4078	NC_005027	TCT	2	6	218351	218356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470899
4079	NC_005027	CGA	2	6	218394	218399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4080	NC_005027	GTC	2	6	218415	218420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4081	NC_005027	TCAT	2	8	218480	218487	25 %	50 %	0 %	25 %	32470899
4082	NC_005027	GCT	2	6	218622	218627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4083	NC_005027	CAA	2	6	218641	218646	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470899
4084	NC_005027	GTT	2	6	218709	218714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470899
4085	NC_005027	CAA	2	6	218748	218753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470899
4086	NC_005027	CTG	2	6	218780	218785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4087	NC_005027	TCG	2	6	218867	218872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4088	NC_005027	TGC	2	6	218888	218893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470899
4089	NC_005027	ACT	2	6	218957	218962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470900
4090	NC_005027	CGG	2	6	219011	219016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470900
4091	NC_005027	CTAC	2	8	219049	219056	25 %	25 %	0 %	50 %	32470900
4092	NC_005027	CGGC	2	8	219203	219210	0 %	0 %	50 %	50 %	32470900
4093	NC_005027	TGC	2	6	219355	219360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470900
4094	NC_005027	GT	3	6	219390	219395	0 %	50 %	50 %	0 %	32470900
4095	NC_005027	CCGG	2	8	219400	219407	0 %	0 %	50 %	50 %	32470900
4096	NC_005027	CAAG	2	8	219422	219429	50 %	0 %	25 %	25 %	32470900
4097	NC_005027	AAC	2	6	219433	219438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470900
4098	NC_005027	CGA	2	6	219457	219462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470900
4099	NC_005027	ACA	2	6	219469	219474	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470900
4100	NC_005027	AAGCAA	2	12	219505	219516	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	32470900
4101	NC_005027	GTC	2	6	219533	219538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470900
4102	NC_005027	CAG	2	6	219729	219734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470900
4103	NC_005027	GATC	2	8	219749	219756	25 %	25 %	25 %	25 %	32470900
4104	NC_005027	CGC	2	6	219783	219788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470900
4105	NC_005027	CGCCT	2	10	219807	219816	0 %	20 %	20 %	60 %	32470900
4106	NC_005027	CAA	2	6	219834	219839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470900
4107	NC_005027	CTT	3	9	219848	219856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470900
4108	NC_005027	GCA	2	6	219862	219867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470900
4109	NC_005027	CCG	2	6	219905	219910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470900
4110	NC_005027	AG	3	6	219954	219959	50 %	0 %	50 %	0 %	32470900
4111	NC_005027	GAA	2	6	219973	219978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470900
4112	NC_005027	TCA	2	6	219983	219988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470900
4113	NC_005027	GCC	2	6	220061	220066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470901
4114	NC_005027	TTCA	2	8	220106	220113	25 %	50 %	0 %	25 %	32470901
4115	NC_005027	GA	3	6	220116	220121	50 %	0 %	50 %	0 %	32470902
4116	NC_005027	GCT	2	6	220130	220135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470902
4117	NC_005027	TCT	2	6	220141	220146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470902
4118	NC_005027	GCTC	2	8	220213	220220	0 %	25 %	25 %	50 %	32470902
4119	NC_005027	CTG	2	6	220238	220243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470902
4120	NC_005027	CCA	2	6	220262	220267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470902
4121	NC_005027	ACAA	2	8	220351	220358	75 %	0 %	0 %	25 %	32470902
4122	NC_005027	GCCA	2	8	220381	220388	25 %	0 %	25 %	50 %	32470902
4123	NC_005027	AAC	2	6	220440	220445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470902
4124	NC_005027	TCGG	2	8	220474	220481	0 %	25 %	50 %	25 %	32470902
4125	NC_005027	AATC	2	8	220491	220498	50 %	25 %	0 %	25 %	32470902
4126	NC_005027	TCC	2	6	220563	220568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470902
4127	NC_005027	ACCG	2	8	220569	220576	25 %	0 %	25 %	50 %	32470902
4128	NC_005027	ACCG	2	8	220760	220767	25 %	0 %	25 %	50 %	32470902
4129	NC_005027	AAC	2	6	220791	220796	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470902
4130	NC_005027	TTG	2	6	220866	220871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470902
4131	NC_005027	CGT	2	6	220886	220891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470902
4132	NC_005027	CGG	2	6	220952	220957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470902
4133	NC_005027	CAC	2	6	220968	220973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470902
4134	NC_005027	ACGAC	2	10	221018	221027	40 %	0 %	20 %	40 %	32470902
4135	NC_005027	CCG	2	6	221039	221044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470902
4136	NC_005027	CGG	2	6	221054	221059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470902
4137	NC_005027	GAT	2	6	221134	221139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470902
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4141	NC_005027	CCG	2	6	221430	221435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470903
4142	NC_005027	TCG	2	6	221478	221483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470903
4143	NC_005027	GAC	2	6	221552	221557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470903
4144	NC_005027	GGAT	2	8	221575	221582	25 %	25 %	50 %	0 %	32470903
4145	NC_005027	TTGA	2	8	221747	221754	25 %	50 %	25 %	0 %	32470903
4146	NC_005027	TCA	2	6	221763	221768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470903
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4148	NC_005027	CATCG	2	10	221854	221863	20 %	20 %	20 %	40 %	32470903
4149	NC_005027	ACG	2	6	221867	221872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470903
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4152	NC_005027	CTG	2	6	221966	221971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470903
4153	NC_005027	TCG	2	6	222193	222198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470903
4154	NC_005027	CAA	2	6	222254	222259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470903
4155	NC_005027	AATGG	2	10	222281	222290	40 %	20 %	40 %	0 %	32470904
4156	NC_005027	CCG	2	6	222310	222315	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470904
4157	NC_005027	A	6	6	222342	222347	100 %	0 %	0 %	0 %	32470904
4158	NC_005027	CAA	2	6	222435	222440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470904
4159	NC_005027	TCG	2	6	222529	222534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470904
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4161	NC_005027	CGC	2	6	222587	222592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470904
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4165	NC_005027	TCG	3	9	222688	222696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470904
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4168	NC_005027	ATGC	2	8	222767	222774	25 %	25 %	25 %	25 %	32470904
4169	NC_005027	CTG	2	6	222786	222791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470904
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4172	NC_005027	TGG	2	6	222912	222917	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470904
4173	NC_005027	CGA	3	9	222924	222932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470904
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4212	NC_005027	GC	3	6	225241	225246	0 %	0 %	50 %	50 %	32470906
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4214	NC_005027	CGC	2	6	225302	225307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470906
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4226	NC_005027	CGT	2	6	225955	225960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470907
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4228	NC_005027	AC	3	6	226026	226031	50 %	0 %	0 %	50 %	32470907
4229	NC_005027	ATCAA	2	10	226150	226159	60 %	20 %	0 %	20 %	32470908
4230	NC_005027	CCCA	2	8	226166	226173	25 %	0 %	0 %	75 %	32470908
4231	NC_005027	TCG	2	6	226193	226198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470908
4232	NC_005027	GAT	2	6	226257	226262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470909
4233	NC_005027	TGC	2	6	226302	226307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4234	NC_005027	TTG	2	6	226309	226314	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470909
4235	NC_005027	GAA	2	6	226351	226356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470909
4236	NC_005027	CGA	2	6	226437	226442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
4237	NC_005027	GCGT	2	8	226460	226467	0 %	25 %	50 %	25 %	32470909
4238	NC_005027	AAG	2	6	226505	226510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470909
4239	NC_005027	GGCA	2	8	226514	226521	25 %	0 %	50 %	25 %	32470909
4240	NC_005027	CGAC	2	8	226544	226551	25 %	0 %	25 %	50 %	32470909
4241	NC_005027	GCC	2	6	226569	226574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4242	NC_005027	CGC	2	6	226678	226683	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470909
4243	NC_005027	CTTC	2	8	226690	226697	0 %	50 %	0 %	50 %	32470909
4244	NC_005027	GGA	2	6	226698	226703	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470909
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4246	NC_005027	CGA	2	6	226795	226800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470909
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4371	NC_005027	CGAA	2	8	233536	233543	50 %	0 %	25 %	25 %	32470914
4372	NC_005027	GGC	2	6	233544	233549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470914
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4404	NC_005027	A	7	7	235277	235283	100 %	0 %	0 %	0 %	32470917
4405	NC_005027	CAAGGC	2	12	235305	235316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470917
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4486	NC_005027	ACAA	2	8	239619	239626	75 %	0 %	0 %	25 %	32470924
4487	NC_005027	TGC	2	6	239694	239699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470924
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4490	NC_005027	CTA	2	6	239863	239868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470924
4491	NC_005027	AAATC	2	10	239929	239938	60 %	20 %	0 %	20 %	32470924
4492	NC_005027	T	6	6	240113	240118	0 %	100 %	0 %	0 %	32470924
4493	NC_005027	GAA	2	6	240133	240138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470924
4494	NC_005027	GCA	2	6	240177	240182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470924
4495	NC_005027	GCC	2	6	240191	240196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470924
4496	NC_005027	AC	3	6	240225	240230	50 %	0 %	0 %	50 %	32470924
4497	NC_005027	ACAA	2	8	240270	240277	75 %	0 %	0 %	25 %	32470924
4498	NC_005027	CAGCG	2	10	240344	240353	20 %	0 %	40 %	40 %	32470924
4499	NC_005027	ACC	2	6	240358	240363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470924
4500	NC_005027	CCAG	2	8	240402	240409	25 %	0 %	25 %	50 %	32470924

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