MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_005027	GGGCCG	2	12	188596	188607	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470877
3502	NC_005027	AG	3	6	188708	188713	50 %	0 %	50 %	0 %	32470877
3503	NC_005027	CGC	2	6	188716	188721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470877
3504	NC_005027	CTA	2	6	188733	188738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470877
3505	NC_005027	GCA	2	6	188759	188764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470877
3506	NC_005027	GCA	2	6	188802	188807	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470877
3507	NC_005027	TGC	3	9	188849	188857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470877
3508	NC_005027	TTC	2	6	188912	188917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470877
3509	NC_005027	CAC	2	6	188943	188948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470877
3510	NC_005027	CACG	2	8	188958	188965	25 %	0 %	25 %	50 %	32470877
3511	NC_005027	TGA	3	9	189002	189010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470877
3512	NC_005027	CCTTC	2	10	189048	189057	0 %	40 %	0 %	60 %	32470877
3513	NC_005027	TAC	2	6	189100	189105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470877
3514	NC_005027	A	6	6	189151	189156	100 %	0 %	0 %	0 %	32470877
3515	NC_005027	AAG	2	6	189191	189196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470877
3516	NC_005027	CCG	2	6	189206	189211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470877
3517	NC_005027	TCAC	2	8	189285	189292	25 %	25 %	0 %	50 %	32470878
3518	NC_005027	CAA	2	6	189406	189411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470878
3519	NC_005027	GGT	2	6	189432	189437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470878
3520	NC_005027	TGC	2	6	189455	189460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470878
3521	NC_005027	TCT	2	6	189527	189532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470878
3522	NC_005027	AGCGA	2	10	189547	189556	40 %	0 %	40 %	20 %	32470878
3523	NC_005027	ACG	2	6	189605	189610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470878
3524	NC_005027	CTA	2	6	189630	189635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470878
3525	NC_005027	TCGT	3	12	189667	189678	0 %	50 %	25 %	25 %	32470878
3526	NC_005027	GGTT	2	8	189807	189814	0 %	50 %	50 %	0 %	32470878
3527	NC_005027	GTT	2	6	190033	190038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470878
3528	NC_005027	TGC	2	6	190061	190066	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470878
3529	NC_005027	CCG	2	6	190103	190108	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470878
3530	NC_005027	CTT	2	6	190185	190190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470879
3531	NC_005027	AACCG	2	10	190193	190202	40 %	0 %	20 %	40 %	32470879
3532	NC_005027	TGC	2	6	190223	190228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3533	NC_005027	CGT	2	6	190235	190240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3534	NC_005027	TTG	2	6	190299	190304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470879
3535	NC_005027	AGC	2	6	190309	190314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3536	NC_005027	GCC	2	6	190341	190346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3537	NC_005027	AGA	2	6	190367	190372	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470879
3538	NC_005027	CAGC	2	8	190386	190393	25 %	0 %	25 %	50 %	32470879
3539	NC_005027	TAC	2	6	190404	190409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470879
3540	NC_005027	GCCGGG	2	12	190433	190444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470879
3541	NC_005027	ACA	2	6	190445	190450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470879
3542	NC_005027	GTG	2	6	190500	190505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470879
3543	NC_005027	CGT	2	6	190548	190553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3544	NC_005027	CGC	2	6	190598	190603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3545	NC_005027	CCA	2	6	190634	190639	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470879
3546	NC_005027	CGA	2	6	190721	190726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3547	NC_005027	GAT	2	6	190754	190759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470879
3548	NC_005027	CAA	2	6	190905	190910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470879
3549	NC_005027	AAG	2	6	190915	190920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470879
3550	NC_005027	TGA	2	6	190925	190930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470879
3551	NC_005027	CATC	2	8	190960	190967	25 %	25 %	0 %	50 %	32470879
3552	NC_005027	GCA	2	6	190990	190995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3553	NC_005027	CCAA	2	8	191001	191008	50 %	0 %	0 %	50 %	32470879
3554	NC_005027	CCG	2	6	191050	191055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3555	NC_005027	GAC	2	6	191174	191179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3556	NC_005027	GAT	2	6	191213	191218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470879
3557	NC_005027	GGT	2	6	191351	191356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470879
3558	NC_005027	CCG	2	6	191371	191376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3559	NC_005027	CAG	2	6	191471	191476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470879
3560	NC_005027	GAT	2	6	191480	191485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470879
3561	NC_005027	CCA	2	6	191494	191499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470879
3562	NC_005027	CGG	2	6	191558	191563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470879
3563	NC_005027	GCC	2	6	191577	191582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3564	NC_005027	CGC	2	6	191588	191593	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3565	NC_005027	TCA	2	6	191747	191752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470879
3566	NC_005027	TCA	2	6	191841	191846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470879
3567	NC_005027	CGC	2	6	191864	191869	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470879
3568	NC_005027	TGG	2	6	191887	191892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470879
3569	NC_005027	GTT	2	6	191931	191936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470879
3570	NC_005027	TCAA	2	8	191972	191979	50 %	25 %	0 %	25 %	32470880
3571	NC_005027	ACG	2	6	191991	191996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3572	NC_005027	TTG	2	6	192023	192028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470880
3573	NC_005027	ACG	2	6	192031	192036	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3574	NC_005027	ACC	2	6	192122	192127	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470880
3575	NC_005027	GATTGC	2	12	192162	192173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	32470880
3576	NC_005027	CGCTGC	2	12	192294	192305	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	32470880
3577	NC_005027	GAT	2	6	192344	192349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470880
3578	NC_005027	CG	3	6	192469	192474	0 %	0 %	50 %	50 %	32470880
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3580	NC_005027	ACG	2	6	192582	192587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3581	NC_005027	ATC	2	6	192689	192694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470880
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3583	NC_005027	CAACA	2	10	192732	192741	60 %	0 %	0 %	40 %	32470880
3584	NC_005027	TTG	2	6	192773	192778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470880
3585	NC_005027	GAA	2	6	192902	192907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470880
3586	NC_005027	CAG	2	6	192933	192938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3587	NC_005027	GCCGT	2	10	192960	192969	0 %	20 %	40 %	40 %	32470880
3588	NC_005027	TGG	2	6	192977	192982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470880
3589	NC_005027	ATC	2	6	193031	193036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470880
3590	NC_005027	CAATG	2	10	193100	193109	40 %	20 %	20 %	20 %	32470880
3591	NC_005027	ACC	2	6	193136	193141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470880
3592	NC_005027	CAT	2	6	193154	193159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470880
3593	NC_005027	GAA	2	6	193169	193174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470880
3594	NC_005027	CCA	3	9	193230	193238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470880
3595	NC_005027	GTC	2	6	193298	193303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3596	NC_005027	CA	3	6	193317	193322	50 %	0 %	0 %	50 %	32470880
3597	NC_005027	GTC	2	6	193376	193381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3598	NC_005027	ACC	2	6	193397	193402	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470880
3599	NC_005027	CGG	2	6	193437	193442	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470880
3600	NC_005027	AAG	2	6	193455	193460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470880
3601	NC_005027	TCA	2	6	193467	193472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470880
3602	NC_005027	CGC	2	6	193481	193486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470880
3603	NC_005027	GAA	2	6	193498	193503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470880
3604	NC_005027	GA	3	6	193578	193583	50 %	0 %	50 %	0 %	32470880
3605	NC_005027	GATC	2	8	193684	193691	25 %	25 %	25 %	25 %	32470880
3606	NC_005027	GCG	2	6	193695	193700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470880
3607	NC_005027	GGT	2	6	193736	193741	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470880
3608	NC_005027	AAC	3	9	193752	193760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470880
3609	NC_005027	GAC	2	6	193761	193766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3610	NC_005027	CCG	2	6	193798	193803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470880
3611	NC_005027	GATT	2	8	193809	193816	25 %	50 %	25 %	0 %	32470880
3612	NC_005027	GAT	2	6	193820	193825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470880
3613	NC_005027	CCGG	2	8	193844	193851	0 %	0 %	50 %	50 %	32470880
3614	NC_005027	GCT	2	6	193933	193938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3615	NC_005027	CAAC	2	8	193954	193961	50 %	0 %	0 %	50 %	32470880
3616	NC_005027	GCG	2	6	193988	193993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470880
3617	NC_005027	CGTTCG	2	12	194020	194031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470880
3618	NC_005027	CGACG	2	10	194050	194059	20 %	0 %	40 %	40 %	32470880
3619	NC_005027	ACCA	2	8	194120	194127	50 %	0 %	0 %	50 %	32470880
3620	NC_005027	CA	3	6	194151	194156	50 %	0 %	0 %	50 %	32470880
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3991	NC_005027	GTG	2	6	213934	213939	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470897
3992	NC_005027	TCA	2	6	213969	213974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470897
3993	NC_005027	CGT	2	6	213991	213996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
3994	NC_005027	TGC	2	6	214014	214019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
3995	NC_005027	TGC	2	6	214065	214070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470897
3996	NC_005027	TCCA	2	8	214112	214119	25 %	25 %	0 %	50 %	32470897
3997	NC_005027	ATCG	2	8	214182	214189	25 %	25 %	25 %	25 %	32470897
3998	NC_005027	CAA	2	6	214229	214234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470897
3999	NC_005027	GTT	2	6	214244	214249	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470897
4000	NC_005027	CAA	2	6	214265	214270	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470897

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