MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_005027	AATC	2	8	162999	163006	50 %	25 %	0 %	25 %	32470849
3002	NC_005027	CGC	2	6	163068	163073	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470849
3003	NC_005027	TTCG	2	8	163092	163099	0 %	50 %	25 %	25 %	32470849
3004	NC_005027	CCG	2	6	163100	163105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470849
3005	NC_005027	ATC	2	6	163117	163122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470849
3006	NC_005027	GTC	2	6	163184	163189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470850
3007	NC_005027	GAT	2	6	163249	163254	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470850
3008	NC_005027	GCC	2	6	163318	163323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470850
3009	NC_005027	CTG	2	6	163384	163389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470850
3010	NC_005027	CGAT	2	8	163467	163474	25 %	25 %	25 %	25 %	32470850
3011	NC_005027	CCG	2	6	163505	163510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470850
3012	NC_005027	TCGC	2	8	163566	163573	0 %	25 %	25 %	50 %	32470850
3013	NC_005027	CAAG	2	8	163579	163586	50 %	0 %	25 %	25 %	32470850
3014	NC_005027	T	6	6	163636	163641	0 %	100 %	0 %	0 %	32470850
3015	NC_005027	CAC	2	6	163662	163667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470850
3016	NC_005027	GAC	2	6	163730	163735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470850
3017	NC_005027	CACTC	2	10	163903	163912	20 %	20 %	0 %	60 %	32470851
3018	NC_005027	TTCGT	2	10	163971	163980	0 %	60 %	20 %	20 %	32470851
3019	NC_005027	CGAAGT	2	12	164122	164133	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32470851
3020	NC_005027	GCG	2	6	164138	164143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470851
3021	NC_005027	GCA	2	6	164150	164155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3022	NC_005027	T	6	6	164162	164167	0 %	100 %	0 %	0 %	32470851
3023	NC_005027	ATCC	2	8	164181	164188	25 %	25 %	0 %	50 %	32470851
3024	NC_005027	ACG	2	6	164193	164198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3025	NC_005027	CGC	2	6	164275	164280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470851
3026	NC_005027	GAA	2	6	164312	164317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470851
3027	NC_005027	GAA	2	6	164456	164461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470851
3028	NC_005027	TCG	2	6	164499	164504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3029	NC_005027	GAA	2	6	164516	164521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470851
3030	NC_005027	ATCGA	2	10	164531	164540	40 %	20 %	20 %	20 %	32470851
3031	NC_005027	TCG	2	6	164541	164546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3032	NC_005027	CCAA	2	8	164562	164569	50 %	0 %	0 %	50 %	32470851
3033	NC_005027	TGCG	2	8	164619	164626	0 %	25 %	50 %	25 %	32470851
3034	NC_005027	TTGC	2	8	164695	164702	0 %	50 %	25 %	25 %	32470851
3035	NC_005027	TTG	2	6	164783	164788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470851
3036	NC_005027	CGGTC	2	10	164833	164842	0 %	20 %	40 %	40 %	32470851
3037	NC_005027	TCA	2	6	164892	164897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470851
3038	NC_005027	CAGC	2	8	164934	164941	25 %	0 %	25 %	50 %	32470851
3039	NC_005027	ATCA	2	8	164954	164961	50 %	25 %	0 %	25 %	32470851
3040	NC_005027	AATC	2	8	164962	164969	50 %	25 %	0 %	25 %	32470851
3041	NC_005027	TC	3	6	165039	165044	0 %	50 %	0 %	50 %	32470851
3042	NC_005027	CAA	2	6	165083	165088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470851
3043	NC_005027	CGA	2	6	165091	165096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3044	NC_005027	CGT	2	6	165149	165154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3045	NC_005027	GCG	2	6	165223	165228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470851
3046	NC_005027	GCG	2	6	165320	165325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470851
3047	NC_005027	CAA	2	6	165349	165354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470851
3048	NC_005027	TGA	2	6	165360	165365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470851
3049	NC_005027	GAC	2	6	165443	165448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3050	NC_005027	CCGTC	2	10	165517	165526	0 %	20 %	20 %	60 %	32470851
3051	NC_005027	CGAT	2	8	165571	165578	25 %	25 %	25 %	25 %	32470851
3052	NC_005027	TCG	2	6	165604	165609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3053	NC_005027	GGC	2	6	165701	165706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470851
3054	NC_005027	CTT	2	6	165782	165787	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470851
3055	NC_005027	GGCT	2	8	165875	165882	0 %	25 %	50 %	25 %	32470851
3056	NC_005027	TCG	2	6	165888	165893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470851
3057	NC_005027	CCT	2	6	166021	166026	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470852
3058	NC_005027	AAG	2	6	166162	166167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470852
3059	NC_005027	GAAA	2	8	166202	166209	75 %	0 %	25 %	0 %	32470852
3060	NC_005027	GAATCG	2	12	166219	166230	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	32470852
3061	NC_005027	CTG	2	6	166236	166241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3062	NC_005027	TGC	2	6	166258	166263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3063	NC_005027	CCAG	2	8	166292	166299	25 %	0 %	25 %	50 %	32470852
3064	NC_005027	CGA	2	6	166305	166310	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3065	NC_005027	CTT	2	6	166418	166423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470852
3066	NC_005027	GGTC	2	8	166518	166525	0 %	25 %	50 %	25 %	32470852
3067	NC_005027	CAAT	2	8	166529	166536	50 %	25 %	0 %	25 %	32470852
3068	NC_005027	ATGG	2	8	166555	166562	25 %	25 %	50 %	0 %	32470852
3069	NC_005027	CGT	2	6	166590	166595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3070	NC_005027	GTG	2	6	166625	166630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470852
3071	NC_005027	TC	3	6	166664	166669	0 %	50 %	0 %	50 %	32470852
3072	NC_005027	ACC	2	6	166764	166769	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470852
3073	NC_005027	ATC	2	6	166795	166800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470852
3074	NC_005027	CAG	2	6	166843	166848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3075	NC_005027	CGG	2	6	166851	166856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470852
3076	NC_005027	CGA	2	6	166935	166940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3077	NC_005027	TCG	2	6	167014	167019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3078	NC_005027	CA	3	6	167130	167135	50 %	0 %	0 %	50 %	32470852
3079	NC_005027	GGC	2	6	167140	167145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470852
3080	NC_005027	GCGCA	2	10	167185	167194	20 %	0 %	40 %	40 %	32470852
3081	NC_005027	TCG	2	6	167216	167221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3082	NC_005027	ATC	2	6	167347	167352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470852
3083	NC_005027	TGG	2	6	167396	167401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470852
3084	NC_005027	GTG	2	6	167411	167416	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470852
3085	NC_005027	AAG	2	6	167420	167425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470852
3086	NC_005027	CGC	3	9	167577	167585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470852
3087	NC_005027	TCG	2	6	167624	167629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3088	NC_005027	TTGG	2	8	167745	167752	0 %	50 %	50 %	0 %	32470852
3089	NC_005027	AAC	2	6	167798	167803	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470852
3090	NC_005027	CGC	2	6	167814	167819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470852
3091	NC_005027	GGT	2	6	167823	167828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470852
3092	NC_005027	TCGA	2	8	167840	167847	25 %	25 %	25 %	25 %	32470852
3093	NC_005027	CGC	2	6	167853	167858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470852
3094	NC_005027	ATC	2	6	167860	167865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470852
3095	NC_005027	AAC	2	6	167984	167989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470852
3096	NC_005027	GAC	2	6	167998	168003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3097	NC_005027	CAA	2	6	168046	168051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470852
3098	NC_005027	AGG	2	6	168059	168064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470852
3099	NC_005027	TG	3	6	168080	168085	0 %	50 %	50 %	0 %	32470852
3100	NC_005027	ACG	2	6	168098	168103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3101	NC_005027	CGC	2	6	168213	168218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470852
3102	NC_005027	AAC	2	6	168221	168226	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470852
3103	NC_005027	A	6	6	168233	168238	100 %	0 %	0 %	0 %	32470852
3104	NC_005027	TGT	2	6	168314	168319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470852
3105	NC_005027	CTT	2	6	168324	168329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470852
3106	NC_005027	CGC	4	12	168354	168365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470852
3107	NC_005027	CAG	2	6	168375	168380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470852
3108	NC_005027	TGA	3	9	168444	168452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470853
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3110	NC_005027	CAC	2	6	168501	168506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470853
3111	NC_005027	CGC	3	9	168518	168526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470853
3112	NC_005027	CGCA	2	8	168634	168641	25 %	0 %	25 %	50 %	32470853
3113	NC_005027	CTTCC	2	10	168773	168782	0 %	40 %	0 %	60 %	32470854
3114	NC_005027	CCA	2	6	168787	168792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470854
3115	NC_005027	CACG	2	8	168798	168805	25 %	0 %	25 %	50 %	32470854
3116	NC_005027	TTC	2	6	168808	168813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470854
3117	NC_005027	ACGCTC	2	12	168829	168840	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	32470854
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3119	NC_005027	CGT	2	6	168891	168896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470854
3120	NC_005027	CAA	2	6	168912	168917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470854
3121	NC_005027	TGGT	2	8	168926	168933	0 %	50 %	50 %	0 %	32470854
3122	NC_005027	AACACC	2	12	168954	168965	50 %	0 %	0 %	50 %	32470854
3123	NC_005027	ACG	2	6	168986	168991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470854
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3354	NC_005027	A	7	7	182050	182056	100 %	0 %	0 %	0 %	32470869
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3372	NC_005027	GTA	2	6	182768	182773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470870
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3491	NC_005027	ATCG	2	8	188071	188078	25 %	25 %	25 %	25 %	32470876
3492	NC_005027	CAA	2	6	188085	188090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470876
3493	NC_005027	ACT	2	6	188144	188149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470876
3494	NC_005027	TCG	2	6	188172	188177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470876
3495	NC_005027	CGA	2	6	188178	188183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470876
3496	NC_005027	GGC	2	6	188187	188192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470876
3497	NC_005027	CGT	2	6	188436	188441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470877
3498	NC_005027	GCT	2	6	188490	188495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470877
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3500	NC_005027	CGG	2	6	188562	188567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470877

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