MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_005027	GATT	2	8	55161	55168	25 %	50 %	25 %	0 %	32470735
1002	NC_005027	CAGC	2	8	55170	55177	25 %	0 %	25 %	50 %	32470735
1003	NC_005027	GTC	2	6	55185	55190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470735
1004	NC_005027	GCC	2	6	55235	55240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470735
1005	NC_005027	GCG	2	6	55364	55369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470735
1006	NC_005027	CCT	2	6	55452	55457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470735
1007	NC_005027	TCG	2	6	55478	55483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470735
1008	NC_005027	CTT	2	6	55565	55570	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470736
1009	NC_005027	TTC	2	6	55587	55592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470736
1010	NC_005027	AATC	2	8	55593	55600	50 %	25 %	0 %	25 %	32470736
1011	NC_005027	CGATT	2	10	55620	55629	20 %	40 %	20 %	20 %	32470736
1012	NC_005027	CCGTG	2	10	55760	55769	0 %	20 %	40 %	40 %	32470736
1013	NC_005027	GCATC	2	10	55813	55822	20 %	20 %	20 %	40 %	32470736
1014	NC_005027	GCA	2	6	55829	55834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470736
1015	NC_005027	CACGC	2	10	55848	55857	20 %	0 %	20 %	60 %	32470736
1016	NC_005027	CGA	2	6	55938	55943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470736
1017	NC_005027	CGG	2	6	55985	55990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470736
1018	NC_005027	CAA	2	6	56016	56021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470736
1019	NC_005027	CGG	2	6	56042	56047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470736
1020	NC_005027	TCGA	2	8	56134	56141	25 %	25 %	25 %	25 %	32470736
1021	NC_005027	CCG	2	6	56164	56169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470736
1022	NC_005027	CAGG	2	8	56181	56188	25 %	0 %	50 %	25 %	32470736
1023	NC_005027	CGT	3	9	56196	56204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470736
1024	NC_005027	CAA	2	6	56232	56237	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470736
1025	NC_005027	TTC	2	6	56328	56333	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470736
1026	NC_005027	GGC	2	6	56346	56351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470736
1027	NC_005027	TCCT	2	8	56448	56455	0 %	50 %	0 %	50 %	32470736
1028	NC_005027	ACG	2	6	56474	56479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470736
1029	NC_005027	TCG	2	6	56521	56526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470736
1030	NC_005027	CAAG	2	8	56643	56650	50 %	0 %	25 %	25 %	32470736
1031	NC_005027	AGACG	2	10	56692	56701	40 %	0 %	40 %	20 %	32470736
1032	NC_005027	ACA	2	6	56831	56836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470737
1033	NC_005027	GTT	3	9	56958	56966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470738
1034	NC_005027	GGC	2	6	56979	56984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470738
1035	NC_005027	GGC	2	6	56991	56996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470738
1036	NC_005027	GCA	2	6	57011	57016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1037	NC_005027	ACG	2	6	57056	57061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1038	NC_005027	CAA	2	6	57099	57104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470738
1039	NC_005027	ACC	2	6	57121	57126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470738
1040	NC_005027	CGTT	2	8	57164	57171	0 %	50 %	25 %	25 %	32470738
1041	NC_005027	GCC	2	6	57219	57224	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470738
1042	NC_005027	CTT	2	6	57255	57260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470738
1043	NC_005027	ACG	2	6	57266	57271	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1044	NC_005027	CTCG	2	8	57417	57424	0 %	25 %	25 %	50 %	32470738
1045	NC_005027	CGAA	2	8	57427	57434	50 %	0 %	25 %	25 %	32470738
1046	NC_005027	CGC	2	6	57438	57443	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470738
1047	NC_005027	ACG	2	6	57491	57496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1048	NC_005027	CGA	2	6	57605	57610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1049	NC_005027	AAC	2	6	57673	57678	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470738
1050	NC_005027	GCG	3	9	57686	57694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470738
1051	NC_005027	GAT	2	6	57700	57705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470738
1052	NC_005027	CCAA	2	8	57775	57782	50 %	0 %	0 %	50 %	32470738
1053	NC_005027	CGT	2	6	57818	57823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1054	NC_005027	TGA	2	6	57827	57832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470738
1055	NC_005027	AGC	2	6	57913	57918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470738
1056	NC_005027	TCA	2	6	57921	57926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470738
1057	NC_005027	GCG	2	6	57929	57934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470738
1058	NC_005027	CGGA	2	8	57950	57957	25 %	0 %	50 %	25 %	32470738
1059	NC_005027	TCA	2	6	57968	57973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470738
1060	NC_005027	CGATT	2	10	57975	57984	20 %	40 %	20 %	20 %	32470738
1061	NC_005027	GGGTG	2	10	57991	58000	0 %	20 %	80 %	0 %	32470738
1062	NC_005027	GC	3	6	58032	58037	0 %	0 %	50 %	50 %	32470738
1063	NC_005027	CT	3	6	58442	58447	0 %	50 %	0 %	50 %	32470739
1064	NC_005027	AAC	2	6	58463	58468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470739
1065	NC_005027	GGT	2	6	58500	58505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470739
1066	NC_005027	GGA	2	6	58535	58540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470739
1067	NC_005027	GTC	2	6	58761	58766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1068	NC_005027	CG	3	6	58777	58782	0 %	0 %	50 %	50 %	32470740
1069	NC_005027	CTT	2	6	58793	58798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470740
1070	NC_005027	ATG	2	6	58816	58821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470740
1071	NC_005027	ATG	2	6	58839	58844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470740
1072	NC_005027	GAA	2	6	58860	58865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470740
1073	NC_005027	TTG	2	6	58897	58902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470740
1074	NC_005027	CAG	2	6	58956	58961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1075	NC_005027	GCGA	2	8	59034	59041	25 %	0 %	50 %	25 %	32470740
1076	NC_005027	GCT	2	6	59109	59114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1077	NC_005027	T	6	6	59166	59171	0 %	100 %	0 %	0 %	32470740
1078	NC_005027	CGC	2	6	59282	59287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470740
1079	NC_005027	CAC	2	6	59291	59296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470740
1080	NC_005027	GTT	2	6	59306	59311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470740
1081	NC_005027	TTG	2	6	59319	59324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470740
1082	NC_005027	CTG	2	6	59331	59336	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1083	NC_005027	GCC	2	6	59343	59348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470740
1084	NC_005027	GAT	3	9	59358	59366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470740
1085	NC_005027	ACC	2	6	59398	59403	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470740
1086	NC_005027	CCG	2	6	59410	59415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470740
1087	NC_005027	CGA	2	6	59422	59427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1088	NC_005027	GTC	3	9	59447	59455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470740
1089	NC_005027	CTG	2	6	59476	59481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470741
1090	NC_005027	GAAAA	2	10	59496	59505	80 %	0 %	20 %	0 %	32470741
1091	NC_005027	CA	3	6	59541	59546	50 %	0 %	0 %	50 %	32470741
1092	NC_005027	GGGAA	2	10	59570	59579	40 %	0 %	60 %	0 %	32470741
1093	NC_005027	TCT	2	6	59853	59858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470742
1094	NC_005027	TGG	2	6	59899	59904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470742
1095	NC_005027	ACG	2	6	59944	59949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1096	NC_005027	CCG	2	6	59962	59967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470742
1097	NC_005027	GCA	2	6	59975	59980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1098	NC_005027	TCA	2	6	59998	60003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470742
1099	NC_005027	CGT	3	9	60032	60040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1100	NC_005027	TCG	2	6	60085	60090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1101	NC_005027	CCGA	2	8	60145	60152	25 %	0 %	25 %	50 %	32470742
1102	NC_005027	GACGC	2	10	60168	60177	20 %	0 %	40 %	40 %	32470742
1103	NC_005027	GAC	2	6	60242	60247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1104	NC_005027	ACCA	2	8	60264	60271	50 %	0 %	0 %	50 %	32470742
1105	NC_005027	CTG	2	6	60324	60329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1106	NC_005027	CGAT	2	8	60331	60338	25 %	25 %	25 %	25 %	32470742
1107	NC_005027	CCG	2	6	60340	60345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470742
1108	NC_005027	CATC	2	8	60351	60358	25 %	25 %	0 %	50 %	32470742
1109	NC_005027	GATC	2	8	60461	60468	25 %	25 %	25 %	25 %	32470742
1110	NC_005027	AAG	2	6	60490	60495	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470742
1111	NC_005027	GCT	2	6	60532	60537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1112	NC_005027	CGG	3	9	60637	60645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470742
1113	NC_005027	GGA	2	6	60674	60679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470742
1114	NC_005027	CGA	2	6	60719	60724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470742
1115	NC_005027	CCG	2	6	60755	60760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470742
1116	NC_005027	CGG	2	6	60802	60807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470742
1117	NC_005027	CGA	3	9	60928	60936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470743
1118	NC_005027	CGG	2	6	61013	61018	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470743
1119	NC_005027	CGA	2	6	61024	61029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470743
1120	NC_005027	AGA	2	6	61030	61035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470743
1121	NC_005027	CT	3	6	61043	61048	0 %	50 %	0 %	50 %	32470743
1122	NC_005027	CGT	2	6	61166	61171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470743
1123	NC_005027	GGC	2	6	61193	61198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470743
1124	NC_005027	AGTC	2	8	61212	61219	25 %	25 %	25 %	25 %	32470743
1125	NC_005027	CCGG	2	8	61242	61249	0 %	0 %	50 %	50 %	32470743
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1127	NC_005027	GA	3	6	61331	61336	50 %	0 %	50 %	0 %	32470743
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