MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_005027	CGTTG	2	10	28392	28401	0 %	40 %	40 %	20 %	32470706
502	NC_005027	GAT	2	6	28425	28430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470706
503	NC_005027	TTC	2	6	28444	28449	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470706
504	NC_005027	GTG	2	6	28480	28485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470706
505	NC_005027	GAA	2	6	28558	28563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470706
506	NC_005027	CGCT	2	8	28582	28589	0 %	25 %	25 %	50 %	32470706
507	NC_005027	GCG	2	6	28628	28633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470706
508	NC_005027	CCA	2	6	28743	28748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470707
509	NC_005027	CTG	2	6	28769	28774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470707
510	NC_005027	CGG	2	6	28785	28790	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470707
511	NC_005027	TCA	2	6	28800	28805	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470707
512	NC_005027	ATG	2	6	28892	28897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470707
513	NC_005027	GTC	2	6	28994	28999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470707
514	NC_005027	TTTG	2	8	29163	29170	0 %	75 %	25 %	0 %	32470708
515	NC_005027	CGT	2	6	29224	29229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470708
516	NC_005027	CGG	2	6	29283	29288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
517	NC_005027	TTGCCT	2	12	29292	29303	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	32470708
518	NC_005027	GCG	2	6	29310	29315	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
519	NC_005027	GTT	2	6	29495	29500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470708
520	NC_005027	GCC	2	6	29545	29550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470708
521	NC_005027	TCA	2	6	29566	29571	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470708
522	NC_005027	GGC	2	6	29587	29592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470708
523	NC_005027	CAG	2	6	29625	29630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470708
524	NC_005027	GA	4	8	29695	29702	50 %	0 %	50 %	0 %	32470708
525	NC_005027	ACC	2	6	29794	29799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470710
526	NC_005027	GTT	2	6	29806	29811	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470710
527	NC_005027	TCG	2	6	29828	29833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
528	NC_005027	TGC	2	6	29862	29867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
529	NC_005027	CT	3	6	29879	29884	0 %	50 %	0 %	50 %	32470710
530	NC_005027	GCT	2	6	29937	29942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470710
531	NC_005027	GAT	2	6	30169	30174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470710
532	NC_005027	CCA	2	6	30202	30207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470710
533	NC_005027	GCGG	2	8	30237	30244	0 %	0 %	75 %	25 %	32470710
534	NC_005027	TGAA	2	8	30254	30261	50 %	25 %	25 %	0 %	32470710
535	NC_005027	TGG	2	6	30315	30320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470711
536	NC_005027	TTG	2	6	30373	30378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470711
537	NC_005027	GAC	2	6	30575	30580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
538	NC_005027	ATCA	2	8	30655	30662	50 %	25 %	0 %	25 %	32470712
539	NC_005027	TGC	2	6	30759	30764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470712
540	NC_005027	GTT	2	6	30811	30816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470712
541	NC_005027	CCAA	2	8	30822	30829	50 %	0 %	0 %	50 %	32470712
542	NC_005027	TCGA	2	8	30860	30867	25 %	25 %	25 %	25 %	32470712
543	NC_005027	TTGC	2	8	30886	30893	0 %	50 %	25 %	25 %	32470712
544	NC_005027	ACG	2	6	31089	31094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470712
545	NC_005027	CGA	2	6	31299	31304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470713
546	NC_005027	GATT	2	8	31359	31366	25 %	50 %	25 %	0 %	32470713
547	NC_005027	CGC	2	6	31398	31403	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470713
548	NC_005027	CGG	2	6	31409	31414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470713
549	NC_005027	GAC	2	6	31447	31452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470713
550	NC_005027	CAT	2	6	31503	31508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470714
551	NC_005027	TTG	2	6	31516	31521	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470714
552	NC_005027	GCG	2	6	31546	31551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470714
553	NC_005027	TG	4	8	31555	31562	0 %	50 %	50 %	0 %	32470714
554	NC_005027	GAC	2	6	31591	31596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470714
555	NC_005027	GCT	2	6	31624	31629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470714
556	NC_005027	AAG	2	6	31748	31753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470714
557	NC_005027	A	6	6	31792	31797	100 %	0 %	0 %	0 %	32470714
558	NC_005027	TGA	2	6	31845	31850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470714
559	NC_005027	GATCGG	2	12	31957	31968	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	32470714
560	NC_005027	CGC	2	6	32022	32027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470714
561	NC_005027	GGA	2	6	32028	32033	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470714
562	NC_005027	CAA	2	6	32047	32052	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470714
563	NC_005027	ACG	2	6	32057	32062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470714
564	NC_005027	TGA	2	6	32064	32069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470714
565	NC_005027	AGCG	2	8	32111	32118	25 %	0 %	50 %	25 %	32470714
566	NC_005027	GATCC	2	10	32154	32163	20 %	20 %	20 %	40 %	32470714
567	NC_005027	GGC	2	6	32301	32306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470714
568	NC_005027	TCA	2	6	32369	32374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470714
569	NC_005027	GTG	2	6	32417	32422	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470714
570	NC_005027	CGT	2	6	32490	32495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470714
571	NC_005027	A	6	6	32502	32507	100 %	0 %	0 %	0 %	32470714
572	NC_005027	GTTT	2	8	32515	32522	0 %	75 %	25 %	0 %	32470714
573	NC_005027	TGGT	2	8	32543	32550	0 %	50 %	50 %	0 %	32470714
574	NC_005027	CCA	2	6	32705	32710	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470714
575	NC_005027	AAGC	2	8	32774	32781	50 %	0 %	25 %	25 %	32470715
576	NC_005027	GAC	2	6	32797	32802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470715
577	NC_005027	TGC	2	6	32837	32842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470715
578	NC_005027	GAT	2	6	32848	32853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470715
579	NC_005027	CGG	2	6	32904	32909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470715
580	NC_005027	CGCGA	2	10	32978	32987	20 %	0 %	40 %	40 %	32470715
581	NC_005027	CGTG	2	8	32989	32996	0 %	25 %	50 %	25 %	32470715
582	NC_005027	GAT	2	6	33014	33019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470715
583	NC_005027	CGC	2	6	33109	33114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470715
584	NC_005027	GATT	2	8	33138	33145	25 %	50 %	25 %	0 %	32470715
585	NC_005027	GTT	2	6	33232	33237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470715
586	NC_005027	GAC	2	6	33344	33349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470715
587	NC_005027	TGC	2	6	33399	33404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470715
588	NC_005027	CTA	2	6	33436	33441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470715
589	NC_005027	CAT	2	6	33471	33476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470715
590	NC_005027	TGG	2	6	33507	33512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470715
591	NC_005027	GAAG	2	8	33517	33524	50 %	0 %	50 %	0 %	32470715
592	NC_005027	ACTC	2	8	33528	33535	25 %	25 %	0 %	50 %	32470715
593	NC_005027	CCA	2	6	33545	33550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470715
594	NC_005027	TGG	2	6	33558	33563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470715
595	NC_005027	ACA	2	6	33589	33594	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470715
596	NC_005027	GAT	2	6	33734	33739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470715
597	NC_005027	GGCT	2	8	33779	33786	0 %	25 %	50 %	25 %	32470715
598	NC_005027	TACTTC	2	12	33842	33853	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	32470715
599	NC_005027	ACT	2	6	33861	33866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470715
600	NC_005027	CGC	2	6	33868	33873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470715
601	NC_005027	TTG	2	6	33887	33892	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470715
602	NC_005027	GAA	3	9	33896	33904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470715
603	NC_005027	TGG	2	6	33968	33973	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470715
604	NC_005027	TGA	2	6	34023	34028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470715
605	NC_005027	CTT	2	6	34290	34295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470716
606	NC_005027	ACC	2	6	34319	34324	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470716
607	NC_005027	CGC	2	6	34333	34338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470716
608	NC_005027	CTT	2	6	34370	34375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470716
609	NC_005027	GTG	2	6	34425	34430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470716
610	NC_005027	GGGC	2	8	34481	34488	0 %	0 %	75 %	25 %	32470716
611	NC_005027	GCC	2	6	34545	34550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470716
612	NC_005027	GTC	2	6	34587	34592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470716
613	NC_005027	ACA	2	6	34593	34598	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470716
614	NC_005027	CGC	2	6	34600	34605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470716
615	NC_005027	TTG	2	6	34623	34628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	32470716
616	NC_005027	ACG	2	6	34666	34671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470716
617	NC_005027	GGT	2	6	34770	34775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470716
618	NC_005027	CCG	2	6	34788	34793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470716
619	NC_005027	ACGA	2	8	34883	34890	50 %	0 %	25 %	25 %	32470716
620	NC_005027	ACT	2	6	34903	34908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470716
621	NC_005027	ACG	2	6	34972	34977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470716
622	NC_005027	GAT	2	6	34995	35000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470716
623	NC_005027	GGT	2	6	35007	35012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470716
624	NC_005027	AAC	2	6	35073	35078	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470716
625	NC_005027	GGC	2	6	35091	35096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470716
626	NC_005027	CTT	2	6	35144	35149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	32470716
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628	NC_005027	GTG	2	6	35315	35320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470716
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