MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhodopirellula baltica SH 1 chromosome

Total Repeats: 135412

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_005027	CGG	2	6	266358	266363	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470948
5002	NC_005027	GGTT	2	8	266377	266384	0 %	50 %	50 %	0 %	32470948
5003	NC_005027	CGT	3	9	266422	266430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470948
5004	NC_005027	GTG	2	6	266453	266458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470948
5005	NC_005027	GCTCG	2	10	266571	266580	0 %	20 %	40 %	40 %	32470948
5006	NC_005027	AAGG	2	8	266620	266627	50 %	0 %	50 %	0 %	32470948
5007	NC_005027	TCAA	2	8	266780	266787	50 %	25 %	0 %	25 %	32470948
5008	NC_005027	TCG	2	6	266834	266839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470948
5009	NC_005027	CGT	2	6	266965	266970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470948
5010	NC_005027	GCG	2	6	267007	267012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470948
5011	NC_005027	TGA	2	6	267050	267055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470948
5012	NC_005027	CAA	2	6	267120	267125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470948
5013	NC_005027	GTCG	2	8	267213	267220	0 %	25 %	50 %	25 %	32470948
5014	NC_005027	CA	3	6	267232	267237	50 %	0 %	0 %	50 %	32470948
5015	NC_005027	AGA	2	6	267309	267314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470948
5016	NC_005027	CGG	3	9	267432	267440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470948
5017	NC_005027	GGC	2	6	267580	267585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470948
5018	NC_005027	CCCCAT	2	12	267588	267599	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	32470948
5019	NC_005027	GTC	2	6	267637	267642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5020	NC_005027	CGTTG	2	10	267656	267665	0 %	40 %	40 %	20 %	32470949
5021	NC_005027	CGTT	2	8	267688	267695	0 %	50 %	25 %	25 %	32470949
5022	NC_005027	TGC	2	6	267699	267704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5023	NC_005027	TGA	2	6	267722	267727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470949
5024	NC_005027	AGC	3	9	267783	267791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5025	NC_005027	CTC	2	6	267838	267843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470949
5026	NC_005027	GCCAC	2	10	267890	267899	20 %	0 %	20 %	60 %	32470949
5027	NC_005027	GTC	2	6	267976	267981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5028	NC_005027	CAAAG	2	10	267992	268001	60 %	0 %	20 %	20 %	32470949
5029	NC_005027	AGC	2	6	268069	268074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5030	NC_005027	GAG	2	6	268161	268166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	32470949
5031	NC_005027	AGA	2	6	268172	268177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470949
5032	NC_005027	GAC	2	6	268206	268211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5033	NC_005027	GAC	2	6	268218	268223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5034	NC_005027	GACGC	2	10	268236	268245	20 %	0 %	40 %	40 %	32470949
5035	NC_005027	ACC	2	6	268284	268289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470949
5036	NC_005027	ATCGA	2	10	268347	268356	40 %	20 %	20 %	20 %	32470949
5037	NC_005027	CCG	2	6	268386	268391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470949
5038	NC_005027	TGG	2	6	268396	268401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470949
5039	NC_005027	CAA	2	6	268517	268522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470949
5040	NC_005027	GTC	2	6	268545	268550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5041	NC_005027	CA	3	6	268597	268602	50 %	0 %	0 %	50 %	32470949
5042	NC_005027	GCT	2	6	268622	268627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5043	NC_005027	GAT	2	6	268638	268643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470949
5044	NC_005027	GCT	2	6	268670	268675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5045	NC_005027	CGA	2	6	268697	268702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5046	NC_005027	TGAA	2	8	268735	268742	50 %	25 %	25 %	0 %	32470949
5047	NC_005027	GGTC	2	8	268744	268751	0 %	25 %	50 %	25 %	32470949
5048	NC_005027	CGT	2	6	268817	268822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5049	NC_005027	CAC	2	6	268859	268864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470949
5050	NC_005027	TC	3	6	268971	268976	0 %	50 %	0 %	50 %	32470949
5051	NC_005027	GCT	2	6	269000	269005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5052	NC_005027	GAT	2	6	269025	269030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470949
5053	NC_005027	CCG	2	6	269276	269281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470949
5054	NC_005027	CGA	2	6	269297	269302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470949
5055	NC_005027	AAC	2	6	269515	269520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470950
5056	NC_005027	AAC	2	6	269528	269533	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470950
5057	NC_005027	TGG	2	6	269552	269557	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470950
5058	NC_005027	AAC	2	6	269594	269599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	32470950
5059	NC_005027	GGCG	2	8	269601	269608	0 %	0 %	75 %	25 %	32470950
5060	NC_005027	TCG	2	6	269612	269617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
5061	NC_005027	AAG	3	9	269621	269629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470950
5062	NC_005027	GAT	2	6	269706	269711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470950
5063	NC_005027	CGC	2	6	269749	269754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470950
5064	NC_005027	GAA	2	6	269809	269814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470950
5065	NC_005027	CGA	2	6	269883	269888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470950
5066	NC_005027	CGC	2	6	269900	269905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470950
5067	NC_005027	CTG	2	6	270067	270072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
5068	NC_005027	GAA	2	6	270103	270108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470950
5069	NC_005027	ACC	2	6	270130	270135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470950
5070	NC_005027	CGAAA	2	10	270147	270156	60 %	0 %	20 %	20 %	32470950
5071	NC_005027	CGT	3	9	270207	270215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
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5073	NC_005027	CCA	2	6	270329	270334	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470950
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5079	NC_005027	CGT	2	6	270537	270542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470950
5080	NC_005027	GCTT	2	8	270646	270653	0 %	50 %	25 %	25 %	32470951
5081	NC_005027	CGA	2	6	270774	270779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
5082	NC_005027	CTG	2	6	270848	270853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470951
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5086	NC_005027	ATTG	2	8	270968	270975	25 %	50 %	25 %	0 %	32470951
5087	NC_005027	TTCG	2	8	271004	271011	0 %	50 %	25 %	25 %	32470951
5088	NC_005027	GAA	2	6	271022	271027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470951
5089	NC_005027	CGA	2	6	271086	271091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
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5092	NC_005027	GGTT	2	8	271162	271169	0 %	50 %	50 %	0 %	32470951
5093	NC_005027	TCC	2	6	271176	271181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	32470951
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5095	NC_005027	AGC	2	6	271212	271217	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
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5103	NC_005027	TGG	2	6	271416	271421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470951
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5106	NC_005027	TC	3	6	271484	271489	0 %	50 %	0 %	50 %	32470951
5107	NC_005027	CCCG	2	8	271519	271526	0 %	0 %	25 %	75 %	32470951
5108	NC_005027	GAA	2	6	271577	271582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	32470951
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5111	NC_005027	GAC	2	6	271618	271623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470951
5112	NC_005027	GGT	2	6	271650	271655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	32470951
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5114	NC_005027	G	6	6	271698	271703	0 %	0 %	100 %	0 %	32470951
5115	NC_005027	CGC	2	6	271758	271763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	32470952
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5118	NC_005027	TGC	2	6	271883	271888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470952
5119	NC_005027	TGC	2	6	271892	271897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470952
5120	NC_005027	GCT	2	6	271941	271946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470952
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5122	NC_005027	GAT	2	6	272040	272045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	32470952
5123	NC_005027	ACG	2	6	272152	272157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470952
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5125	NC_005027	CA	3	6	272277	272282	50 %	0 %	0 %	50 %	32470952
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5241	NC_005027	ACCA	2	8	278180	278187	50 %	0 %	0 %	50 %	32470954
5242	NC_005027	ACG	2	6	278188	278193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	32470954
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5245	NC_005027	TGC	2	6	278388	278393	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	32470954
5246	NC_005027	CCAA	2	8	278424	278431	50 %	0 %	0 %	50 %	32470954
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5248	NC_005027	ATC	2	6	278596	278601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	32470954
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5253	NC_005027	GAAGC	2	10	278816	278825	40 %	0 %	40 %	20 %	32470954
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5490	NC_005027	GCG	2	6	290532	290537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	32470965
5491	NC_005027	CCA	2	6	290544	290549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	32470965
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