MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 734

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	GCGA	2	8	914	921	25 %	0 %	50 %	25 %	21492963
2	NC_004041	GACT	2	8	1005	1012	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
3	NC_004041	TGCC	2	8	1405	1412	0 %	25 %	25 %	50 %	21492963
4	NC_004041	CATG	2	8	1518	1525	25 %	25 %	25 %	25 %	21492963
5	NC_004041	GCCG	2	8	2749	2756	0 %	0 %	50 %	50 %	21492961
6	NC_004041	GCTC	2	8	3319	3326	0 %	25 %	25 %	50 %	21492961
7	NC_004041	TGAC	2	8	5069	5076	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
8	NC_004041	TCGA	2	8	5089	5096	25 %	25 %	25 %	25 %	21492960
9	NC_004041	GCCC	2	8	6320	6327	0 %	0 %	25 %	75 %	89255299
10	NC_004041	CAGG	2	8	6634	6641	25 %	0 %	50 %	25 %	89255299
11	NC_004041	TTCC	2	8	6670	6677	0 %	50 %	0 %	50 %	89255299
12	NC_004041	CGCA	2	8	7909	7916	25 %	0 %	25 %	50 %	21492958
13	NC_004041	GATC	2	8	8046	8053	25 %	25 %	25 %	25 %	21492958
14	NC_004041	CATC	2	8	8273	8280	25 %	25 %	0 %	50 %	21492958
15	NC_004041	GCCG	2	8	8355	8362	0 %	0 %	50 %	50 %	21492958
16	NC_004041	TGTT	2	8	8366	8373	0 %	75 %	25 %	0 %	21492958
17	NC_004041	CCGT	2	8	8765	8772	0 %	25 %	25 %	50 %	21492958
18	NC_004041	GCGA	2	8	9104	9111	25 %	0 %	50 %	25 %	21492958
19	NC_004041	ATCA	2	8	9202	9209	50 %	25 %	0 %	25 %	21492958
20	NC_004041	GGCT	2	8	9256	9263	0 %	25 %	50 %	25 %	21492958
21	NC_004041	CCAT	2	8	9744	9751	25 %	25 %	0 %	50 %	21492957
22	NC_004041	GTCA	2	8	9851	9858	25 %	25 %	25 %	25 %	21492957
23	NC_004041	TGAT	2	8	10748	10755	25 %	50 %	25 %	0 %	21492956
24	NC_004041	CGCA	2	8	10891	10898	25 %	0 %	25 %	50 %	21492956
25	NC_004041	GAGT	2	8	11121	11128	25 %	25 %	50 %	0 %	21492956
26	NC_004041	CGGT	2	8	12799	12806	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
27	NC_004041	GCCC	2	8	12929	12936	0 %	0 %	25 %	75 %	21492955
28	NC_004041	TGCC	2	8	13329	13336	0 %	25 %	25 %	50 %	21492955
29	NC_004041	GCCC	2	8	13388	13395	0 %	0 %	25 %	75 %	21492955
30	NC_004041	ATCT	2	8	13887	13894	25 %	50 %	0 %	25 %	21492955
31	NC_004041	CTGG	2	8	13940	13947	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
32	NC_004041	AGCG	2	8	14150	14157	25 %	0 %	50 %	25 %	21492955
33	NC_004041	CGGG	2	8	14164	14171	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
34	NC_004041	GGGC	2	8	14222	14229	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
35	NC_004041	GACA	2	8	14751	14758	50 %	0 %	25 %	25 %	21492955
36	NC_004041	CGTG	2	8	15002	15009	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
37	NC_004041	TTGC	2	8	15082	15089	0 %	50 %	25 %	25 %	21492955
38	NC_004041	CGTG	2	8	15848	15855	0 %	25 %	50 %	25 %	21492955
39	NC_004041	GGCG	2	8	16229	16236	0 %	0 %	75 %	25 %	21492955
40	NC_004041	CCAA	2	8	16359	16366	50 %	0 %	0 %	50 %	21492955
41	NC_004041	CGAC	2	8	16666	16673	25 %	0 %	25 %	50 %	21492954
42	NC_004041	AAAG	2	8	16974	16981	75 %	0 %	25 %	0 %	21492954
43	NC_004041	TCGC	2	8	17502	17509	0 %	25 %	25 %	50 %	21492953
44	NC_004041	GCCG	2	8	17704	17711	0 %	0 %	50 %	50 %	21492953
45	NC_004041	CGAT	2	8	17952	17959	25 %	25 %	25 %	25 %	21492953
46	NC_004041	GCTC	2	8	18944	18951	0 %	25 %	25 %	50 %	21492951
47	NC_004041	ATCG	2	8	19451	19458	25 %	25 %	25 %	25 %	21492951
48	NC_004041	ACGG	2	8	19726	19733	25 %	0 %	50 %	25 %	21492951
49	NC_004041	CCGC	2	8	21192	21199	0 %	0 %	25 %	75 %	21492948
50	NC_004041	CGTT	2	8	23595	23602	0 %	50 %	25 %	25 %	89255301
51	NC_004041	CGGA	2	8	23786	23793	25 %	0 %	50 %	25 %	89255301
52	NC_004041	GGCG	2	8	24144	24151	0 %	0 %	75 %	25 %	21492943
53	NC_004041	CGGA	2	8	24264	24271	25 %	0 %	50 %	25 %	21492943
54	NC_004041	GCCG	2	8	24357	24364	0 %	0 %	50 %	50 %	21492943
55	NC_004041	CGTT	2	8	24769	24776	0 %	50 %	25 %	25 %	89255302
56	NC_004041	TCGC	2	8	24847	24854	0 %	25 %	25 %	50 %	89255302
57	NC_004041	ACCA	2	8	25054	25061	50 %	0 %	0 %	50 %	89255302
58	NC_004041	ATTC	2	8	25338	25345	25 %	50 %	0 %	25 %	89255302
59	NC_004041	GACG	2	8	25347	25354	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
60	NC_004041	GGCC	2	8	25953	25960	0 %	0 %	50 %	50 %	89255302
61	NC_004041	GACG	2	8	26004	26011	25 %	0 %	50 %	25 %	89255302
62	NC_004041	CAGA	2	8	26259	26266	50 %	0 %	25 %	25 %	89255303
63	NC_004041	ACTG	2	8	26346	26353	25 %	25 %	25 %	25 %	89255303
64	NC_004041	CAGC	2	8	27278	27285	25 %	0 %	25 %	50 %	21492940
65	NC_004041	GCAC	2	8	29312	29319	25 %	0 %	25 %	50 %	21492939
66	NC_004041	TTCG	2	8	29703	29710	0 %	50 %	25 %	25 %	21492939
67	NC_004041	TGGG	2	8	31313	31320	0 %	25 %	75 %	0 %	21492936
68	NC_004041	ATCT	2	8	31514	31521	25 %	50 %	0 %	25 %	21492936
69	NC_004041	GCGA	2	8	32582	32589	25 %	0 %	50 %	25 %	21492934
70	NC_004041	ACCC	2	8	33055	33062	25 %	0 %	0 %	75 %	21492934
71	NC_004041	CTGC	2	8	33510	33517	0 %	25 %	25 %	50 %	21492933
72	NC_004041	CTTG	2	8	33719	33726	0 %	50 %	25 %	25 %	89255304
73	NC_004041	CCAG	2	8	33845	33852	25 %	0 %	25 %	50 %	89255304
74	NC_004041	AAGC	2	8	34007	34014	50 %	0 %	25 %	25 %	89255304
75	NC_004041	GGAT	2	8	34473	34480	25 %	25 %	50 %	0 %	89255305
76	NC_004041	GCAA	2	8	34998	35005	50 %	0 %	25 %	25 %	89255306
77	NC_004041	TCGG	2	8	35196	35203	0 %	25 %	50 %	25 %	89255306
78	NC_004041	TCAG	2	8	37046	37053	25 %	25 %	25 %	25 %	89255307
79	NC_004041	GAAC	2	8	37778	37785	50 %	0 %	25 %	25 %	89255309
80	NC_004041	GCCG	2	8	37947	37954	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
81	NC_004041	GATC	2	8	38567	38574	25 %	25 %	25 %	25 %	89255309
82	NC_004041	AGCC	2	8	38693	38700	25 %	0 %	25 %	50 %	89255309
83	NC_004041	CTGG	2	8	38813	38820	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
84	NC_004041	TCGG	2	8	38944	38951	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
85	NC_004041	GGTC	2	8	39291	39298	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
86	NC_004041	GGCG	2	8	39335	39342	0 %	0 %	75 %	25 %	89255309
87	NC_004041	GTCG	2	8	39401	39408	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
88	NC_004041	ATCC	2	8	41018	41025	25 %	25 %	0 %	50 %	89255311
89	NC_004041	GCCG	2	8	41049	41056	0 %	0 %	50 %	50 %	89255311
90	NC_004041	ATCG	2	8	41099	41106	25 %	25 %	25 %	25 %	89255311
91	NC_004041	CCTT	2	8	41394	41401	0 %	50 %	0 %	50 %	89255311
92	NC_004041	GCCG	2	8	43203	43210	0 %	0 %	50 %	50 %	89255312
93	NC_004041	TCAG	2	8	43225	43232	25 %	25 %	25 %	25 %	89255312
94	NC_004041	AGGA	2	8	43605	43612	50 %	0 %	50 %	0 %	89255312
95	NC_004041	TCCA	2	8	43815	43822	25 %	25 %	0 %	50 %	89255312
96	NC_004041	AACC	2	8	43898	43905	50 %	0 %	0 %	50 %	89255312
97	NC_004041	CGTC	2	8	44323	44330	0 %	25 %	25 %	50 %	21492922
98	NC_004041	AACG	2	8	44708	44715	50 %	0 %	25 %	25 %	21492922
99	NC_004041	CTAT	2	8	44867	44874	25 %	50 %	0 %	25 %	21492922
100	NC_004041	AAAC	2	8	46025	46032	75 %	0 %	0 %	25 %	21492921
101	NC_004041	GACG	2	8	46639	46646	25 %	0 %	50 %	25 %	21492920
102	NC_004041	CTCG	2	8	46687	46694	0 %	25 %	25 %	50 %	21492920
103	NC_004041	TGTC	2	8	46935	46942	0 %	50 %	25 %	25 %	21492920
104	NC_004041	TGAT	2	8	47295	47302	25 %	50 %	25 %	0 %	21492919
105	NC_004041	ACGC	2	8	47788	47795	25 %	0 %	25 %	50 %	21492919
106	NC_004041	CACC	2	8	47988	47995	25 %	0 %	0 %	75 %	21492919
107	NC_004041	AAGG	2	8	48480	48487	50 %	0 %	50 %	0 %	21492919
108	NC_004041	AGCT	2	8	48489	48496	25 %	25 %	25 %	25 %	21492919
109	NC_004041	GCCG	2	8	48776	48783	0 %	0 %	50 %	50 %	21492919
110	NC_004041	AGCG	2	8	49451	49458	25 %	0 %	50 %	25 %	21492919
111	NC_004041	GACA	2	8	50629	50636	50 %	0 %	25 %	25 %	21492917
112	NC_004041	GGTG	2	8	52283	52290	0 %	25 %	75 %	0 %	89255314
113	NC_004041	CAGC	2	8	52400	52407	25 %	0 %	25 %	50 %	89255314
114	NC_004041	TTCA	2	8	54094	54101	25 %	50 %	0 %	25 %	21492914
115	NC_004041	GCAG	2	8	55003	55010	25 %	0 %	50 %	25 %	89255315
116	NC_004041	ATGG	2	8	55016	55023	25 %	25 %	50 %	0 %	89255315
117	NC_004041	CCAA	2	8	55389	55396	50 %	0 %	0 %	50 %	89255316
118	NC_004041	GGCA	2	8	57038	57045	25 %	0 %	50 %	25 %	89255317
119	NC_004041	CACC	2	8	57231	57238	25 %	0 %	0 %	75 %	89255317
120	NC_004041	GTCA	2	8	57370	57377	25 %	25 %	25 %	25 %	89255317
121	NC_004041	GCCG	2	8	58881	58888	0 %	0 %	50 %	50 %	89255317
122	NC_004041	GGCA	2	8	59055	59062	25 %	0 %	50 %	25 %	89255317
123	NC_004041	CGGC	2	8	59075	59082	0 %	0 %	50 %	50 %	89255317
124	NC_004041	GGCC	2	8	59094	59101	0 %	0 %	50 %	50 %	89255317
125	NC_004041	TCAT	2	8	59491	59498	25 %	50 %	0 %	25 %	89255317
126	NC_004041	ATCG	2	8	59731	59738	25 %	25 %	25 %	25 %	21492910
127	NC_004041	ATCA	2	8	60038	60045	50 %	25 %	0 %	25 %	21492910
128	NC_004041	GCCG	2	8	60355	60362	0 %	0 %	50 %	50 %	21492910
129	NC_004041	CACC	2	8	60871	60878	25 %	0 %	0 %	75 %	21492910
130	NC_004041	GATC	2	8	61498	61505	25 %	25 %	25 %	25 %	21492910
131	NC_004041	TCGC	2	8	62273	62280	0 %	25 %	25 %	50 %	21492910
132	NC_004041	GGGC	2	8	62316	62323	0 %	0 %	75 %	25 %	21492910
133	NC_004041	ATCG	2	8	63546	63553	25 %	25 %	25 %	25 %	21492909
134	NC_004041	TCAC	2	8	63604	63611	25 %	25 %	0 %	50 %	21492909
135	NC_004041	GGCG	2	8	63923	63930	0 %	0 %	75 %	25 %	89255318
136	NC_004041	CGGA	2	8	64725	64732	25 %	0 %	50 %	25 %	89255319
137	NC_004041	CGGG	2	8	64751	64758	0 %	0 %	75 %	25 %	89255319
138	NC_004041	GAGC	2	8	64903	64910	25 %	0 %	50 %	25 %	89255319
139	NC_004041	GGGC	2	8	64995	65002	0 %	0 %	75 %	25 %	89255319
140	NC_004041	TCGG	2	8	65389	65396	0 %	25 %	50 %	25 %	21492906
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142	NC_004041	CCGG	2	8	65931	65938	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
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