MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 4197

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004041	GGC	2	6	91	96	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
2	NC_004041	GCC	2	6	242	247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492964
3	NC_004041	TCA	2	6	250	255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
4	NC_004041	GGC	2	6	286	291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
5	NC_004041	AAC	2	6	350	355	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492964
6	NC_004041	CTG	2	6	359	364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492964
7	NC_004041	CGG	2	6	400	405	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492964
8	NC_004041	TCA	2	6	429	434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492964
9	NC_004041	CGA	2	6	620	625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
10	NC_004041	GAA	2	6	832	837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
11	NC_004041	GGC	2	6	851	856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
12	NC_004041	GGA	2	6	859	864	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
13	NC_004041	GCC	2	6	880	885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
14	NC_004041	CGA	2	6	894	899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
15	NC_004041	GCG	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
16	NC_004041	CGC	2	6	1035	1040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
17	NC_004041	GGA	2	6	1062	1067	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492963
18	NC_004041	GGC	2	6	1084	1089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492963
19	NC_004041	CGA	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
20	NC_004041	TCA	2	6	1161	1166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
21	NC_004041	GAA	2	6	1171	1176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492963
22	NC_004041	ATC	2	6	1184	1189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
23	NC_004041	GCT	2	6	1194	1199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
24	NC_004041	CGA	2	6	1209	1214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
25	NC_004041	GGT	2	6	1249	1254	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492963
26	NC_004041	AGC	2	6	1259	1264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
27	NC_004041	CGA	2	6	1302	1307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492963
28	NC_004041	CTT	2	6	1344	1349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492963
29	NC_004041	TCG	2	6	1374	1379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492963
30	NC_004041	GCC	2	6	1498	1503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492963
31	NC_004041	CAT	2	6	1570	1575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492963
32	NC_004041	GCA	2	6	2483	2488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
33	NC_004041	TCG	2	6	2514	2519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
34	NC_004041	GGT	2	6	2546	2551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492961
35	NC_004041	TCC	2	6	2573	2578	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492961
36	NC_004041	CAT	2	6	2626	2631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492961
37	NC_004041	CGC	2	6	2639	2644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492961
38	NC_004041	CGT	2	6	2765	2770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492961
39	NC_004041	GAT	2	6	2794	2799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492961
40	NC_004041	AAG	2	6	2813	2818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492961
41	NC_004041	CGA	2	6	2929	2934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492961
42	NC_004041	CTT	2	6	2995	3000	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492961
43	NC_004041	GGC	2	6	3004	3009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492961
44	NC_004041	TAT	2	6	3017	3022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492961
45	NC_004041	ACC	2	6	3304	3309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492961
46	NC_004041	CAG	2	6	4444	4449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
47	NC_004041	GCC	2	6	4565	4570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
48	NC_004041	TCA	2	6	4578	4583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492960
49	NC_004041	CGA	2	6	4667	4672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492960
50	NC_004041	TGC	2	6	4736	4741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
51	NC_004041	CGT	2	6	4847	4852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492960
52	NC_004041	CGC	2	6	4894	4899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
53	NC_004041	CGC	2	6	5031	5036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492960
54	NC_004041	TTG	2	6	5293	5298	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492960
55	NC_004041	AGT	2	6	5351	5356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492960
56	NC_004041	CAA	2	6	6036	6041	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255299
57	NC_004041	GAG	2	6	6095	6100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
58	NC_004041	TCG	2	6	6183	6188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
59	NC_004041	CAG	2	6	6368	6373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
60	NC_004041	CCG	2	6	6428	6433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
61	NC_004041	TCC	2	6	6498	6503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255299
62	NC_004041	AGG	2	6	6623	6628	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255299
63	NC_004041	TCG	2	6	6714	6719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
64	NC_004041	ATC	2	6	6729	6734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255299
65	NC_004041	CGT	2	6	6761	6766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255299
66	NC_004041	CGA	2	6	6769	6774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255299
67	NC_004041	GCC	3	9	6878	6886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
68	NC_004041	CGG	2	6	6900	6905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255299
69	NC_004041	TGA	2	6	6922	6927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255299
70	NC_004041	CGC	2	6	6928	6933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
71	NC_004041	CCG	3	9	7008	7016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255299
72	NC_004041	CGG	2	6	7208	7213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
73	NC_004041	AGC	2	6	7217	7222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
74	NC_004041	CGC	2	6	7227	7232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
75	NC_004041	CTT	2	6	7286	7291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492958
76	NC_004041	ACA	2	6	7326	7331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
77	NC_004041	GGT	2	6	7372	7377	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
78	NC_004041	ACG	2	6	7450	7455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
79	NC_004041	GAC	2	6	7469	7474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
80	NC_004041	GTG	2	6	7584	7589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
81	NC_004041	GCC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
82	NC_004041	ACG	2	6	7829	7834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
83	NC_004041	TAT	2	6	7934	7939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492958
84	NC_004041	GAT	2	6	7945	7950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
85	NC_004041	CGA	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
86	NC_004041	GCC	2	6	8112	8117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
87	NC_004041	CGG	2	6	8118	8123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
88	NC_004041	CAA	2	6	8442	8447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
89	NC_004041	ATG	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
90	NC_004041	TGA	2	6	8622	8627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
91	NC_004041	AGC	2	6	8721	8726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
92	NC_004041	TGG	2	6	8735	8740	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
93	NC_004041	GCC	2	6	8812	8817	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
94	NC_004041	CAA	2	6	8838	8843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
95	NC_004041	CCG	2	6	8865	8870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492958
96	NC_004041	CAA	2	6	8916	8921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492958
97	NC_004041	TGA	2	6	8933	8938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492958
98	NC_004041	GAC	2	6	8944	8949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
99	NC_004041	AGG	2	6	9026	9031	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492958
100	NC_004041	GAA	2	6	9226	9231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492958
101	NC_004041	CGG	2	6	9317	9322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
102	NC_004041	CGG	2	6	9363	9368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
103	NC_004041	TGG	2	6	9370	9375	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492958
104	NC_004041	CAG	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492958
105	NC_004041	GCG	2	6	9469	9474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492958
106	NC_004041	TCG	2	6	9500	9505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492958
107	NC_004041	GGT	2	6	9534	9539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492957
108	NC_004041	GCA	2	6	9549	9554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492957
109	NC_004041	CGG	2	6	9616	9621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492957
110	NC_004041	CGG	3	9	9653	9661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492957
111	NC_004041	GCG	2	6	9768	9773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492957
112	NC_004041	CGC	2	6	9780	9785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492957
113	NC_004041	ACC	2	6	9873	9878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492957
114	NC_004041	GCC	2	6	9911	9916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492957
115	NC_004041	GTC	2	6	9941	9946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492957
116	NC_004041	TGC	2	6	9980	9985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492957
117	NC_004041	GAA	3	9	10228	10236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492956
118	NC_004041	CCG	2	6	10526	10531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492956
119	NC_004041	GCT	3	9	10861	10869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492956
120	NC_004041	TTA	2	6	10877	10882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492956
121	NC_004041	CAT	2	6	10995	11000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492956
122	NC_004041	ACT	2	6	11054	11059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492956
123	NC_004041	CGG	2	6	11169	11174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492956
124	NC_004041	CTT	2	6	11263	11268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492956
125	NC_004041	AGT	2	6	12173	12178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492955
126	NC_004041	CGC	2	6	12189	12194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
127	NC_004041	AAC	2	6	12226	12231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492955
128	NC_004041	ACG	2	6	12272	12277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
129	NC_004041	GAA	2	6	12397	12402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492955
130	NC_004041	AAG	2	6	12579	12584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492955
131	NC_004041	GTC	2	6	12852	12857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
132	NC_004041	CCA	2	6	12858	12863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492955
133	NC_004041	GGA	2	6	12902	12907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492955
134	NC_004041	GCA	2	6	12923	12928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
135	NC_004041	GAA	2	6	12951	12956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492955
136	NC_004041	GAC	2	6	13032	13037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
137	NC_004041	TGC	2	6	13083	13088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
138	NC_004041	TTC	2	6	13092	13097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492955
139	NC_004041	CTT	2	6	13153	13158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492955
140	NC_004041	GAG	2	6	13212	13217	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492955
141	NC_004041	CGC	2	6	13248	13253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
142	NC_004041	CGT	2	6	13304	13309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
143	NC_004041	GCT	2	6	13421	13426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
144	NC_004041	TCT	2	6	13432	13437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492955
145	NC_004041	TGA	2	6	13467	13472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492955
146	NC_004041	CGC	2	6	13483	13488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
147	NC_004041	GGC	2	6	13583	13588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492955
148	NC_004041	CGA	2	6	13709	13714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
149	NC_004041	GAC	2	6	13777	13782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
150	NC_004041	ATC	2	6	13831	13836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492955
151	NC_004041	GCC	2	6	13872	13877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
152	NC_004041	CTG	2	6	14303	14308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
153	NC_004041	CCG	2	6	14422	14427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
154	NC_004041	CAC	2	6	14600	14605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492955
155	NC_004041	TCA	2	6	14615	14620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492955
156	NC_004041	CGC	2	6	14769	14774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
157	NC_004041	CGA	2	6	14780	14785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
158	NC_004041	CTT	2	6	14837	14842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492955
159	NC_004041	GTC	2	6	14853	14858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
160	NC_004041	CAT	2	6	14913	14918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492955
161	NC_004041	CGG	2	6	14933	14938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492955
162	NC_004041	CAA	2	6	15069	15074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492955
163	NC_004041	TGC	2	6	15105	15110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
164	NC_004041	CAT	2	6	15141	15146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492955
165	NC_004041	CAG	2	6	15243	15248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
166	NC_004041	TGG	3	9	15266	15274	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492955
167	NC_004041	AGG	2	6	15301	15306	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492955
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169	NC_004041	TCG	2	6	15421	15426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492955
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171	NC_004041	CCG	2	6	15467	15472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492955
172	NC_004041	GAC	2	6	15659	15664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492955
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201	NC_004041	ATG	2	6	18537	18542	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492952
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245	NC_004041	TCT	2	6	22446	22451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492947
246	NC_004041	CAC	2	6	22545	22550	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492946
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251	NC_004041	ACG	2	6	22977	22982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255301
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253	NC_004041	CGG	2	6	23050	23055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255301
254	NC_004041	CGA	2	6	23073	23078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255301
255	NC_004041	CGA	2	6	23203	23208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255301
256	NC_004041	CGA	2	6	23277	23282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255301
257	NC_004041	GTC	2	6	23372	23377	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255301
258	NC_004041	CGT	2	6	23382	23387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255301
259	NC_004041	ATG	2	6	23420	23425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255301
260	NC_004041	GCA	2	6	23464	23469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255301
261	NC_004041	CGC	2	6	23506	23511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255301
262	NC_004041	GGA	2	6	23576	23581	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255301
263	NC_004041	GCG	2	6	23775	23780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255301
264	NC_004041	CGG	2	6	24018	24023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492943
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266	NC_004041	GGA	2	6	24155	24160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492943
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280	NC_004041	GGC	2	6	24786	24791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255302
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283	NC_004041	TTC	2	6	24958	24963	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255302
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290	NC_004041	GCG	2	6	25379	25384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255302
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379	NC_004041	TCA	2	6	34215	34220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255304
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382	NC_004041	TAC	2	6	34436	34441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255305
383	NC_004041	GCG	2	6	34444	34449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255305
384	NC_004041	TGG	2	6	34518	34523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255305
385	NC_004041	GGC	2	6	34566	34571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255305
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499	NC_004041	CCG	3	9	45805	45813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492921
500	NC_004041	TCG	2	6	45853	45858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492921

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