MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_004041	ATT	2	6	243423	243428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255370
4002	NC_004041	AGC	2	6	243454	243459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4003	NC_004041	ATA	2	6	243503	243508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	89255370
4004	NC_004041	ATCG	3	12	243525	243536	25 %	25 %	25 %	25 %	89255370
4005	NC_004041	ACG	2	6	243545	243550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4006	NC_004041	CGA	2	6	243567	243572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4007	NC_004041	AG	3	6	243672	243677	50 %	0 %	50 %	0 %	89255370
4008	NC_004041	ATC	2	6	243691	243696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255370
4009	NC_004041	GC	3	6	243707	243712	0 %	0 %	50 %	50 %	89255370
4010	NC_004041	CAG	2	6	243769	243774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4011	NC_004041	GGT	2	6	243792	243797	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255370
4012	NC_004041	T	6	6	243853	243858	0 %	100 %	0 %	0 %	89255370
4013	NC_004041	GC	3	6	243996	244001	0 %	0 %	50 %	50 %	89255370
4014	NC_004041	CGCC	2	8	244061	244068	0 %	0 %	25 %	75 %	89255370
4015	NC_004041	CTG	2	6	244081	244086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4016	NC_004041	GCC	2	6	244251	244256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255370
4017	NC_004041	CTT	2	6	244300	244305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255370
4018	NC_004041	CAA	2	6	244314	244319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255370
4019	NC_004041	TCG	3	9	244345	244353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4020	NC_004041	TGCG	2	8	244411	244418	0 %	25 %	50 %	25 %	89255370
4021	NC_004041	TCG	2	6	244492	244497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
4022	NC_004041	CTC	2	6	244498	244503	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255370
4023	NC_004041	CGG	2	6	244524	244529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255370
4024	NC_004041	CGC	2	6	244577	244582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255370
4025	NC_004041	CGGG	2	8	244586	244593	0 %	0 %	75 %	25 %	89255370
4026	NC_004041	GCATC	2	10	244788	244797	20 %	20 %	20 %	40 %	89255370
4027	NC_004041	GAT	2	6	245040	245045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492734
4028	NC_004041	ACC	2	6	245186	245191	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492734
4029	NC_004041	AGA	2	6	245202	245207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492734
4030	NC_004041	ATT	2	6	245216	245221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492734
4031	NC_004041	CG	3	6	245223	245228	0 %	0 %	50 %	50 %	21492734
4032	NC_004041	CATG	2	8	245229	245236	25 %	25 %	25 %	25 %	21492734
4033	NC_004041	GCC	2	6	245306	245311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492734
4034	NC_004041	GTC	2	6	245317	245322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4035	NC_004041	GAA	2	6	245436	245441	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492734
4036	NC_004041	CCA	2	6	245501	245506	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492734
4037	NC_004041	CGT	2	6	245635	245640	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4038	NC_004041	TGG	2	6	245684	245689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492734
4039	NC_004041	CAT	2	6	245715	245720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
4040	NC_004041	TGA	2	6	245738	245743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492734
4041	NC_004041	ACG	2	6	245756	245761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4042	NC_004041	TAAA	2	8	245777	245784	75 %	25 %	0 %	0 %	21492734
4043	NC_004041	G	6	6	245798	245803	0 %	0 %	100 %	0 %	21492734
4044	NC_004041	CTA	2	6	245853	245858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
4045	NC_004041	GGC	2	6	245923	245928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492734
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4047	NC_004041	GA	3	6	246026	246031	50 %	0 %	50 %	0 %	21492734
4048	NC_004041	AGC	2	6	246132	246137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4049	NC_004041	GTCGCG	2	12	246157	246168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	21492734
4050	NC_004041	TCG	2	6	246235	246240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4051	NC_004041	CAT	2	6	246321	246326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492734
4052	NC_004041	CGT	2	6	246348	246353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492734
4053	NC_004041	CGC	2	6	246465	246470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492734
4054	NC_004041	GCG	2	6	246493	246498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492734
4055	NC_004041	GCA	2	6	246685	246690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492733
4056	NC_004041	CGC	2	6	246730	246735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492733
4057	NC_004041	AGG	2	6	246832	246837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492732
4058	NC_004041	A	7	7	246924	246930	100 %	0 %	0 %	0 %	21492732
4059	NC_004041	CGA	2	6	246956	246961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492732
4060	NC_004041	CAG	2	6	246993	246998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492732
4061	NC_004041	TCG	2	6	247039	247044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492732
4062	NC_004041	CGC	2	6	247079	247084	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492732
4063	NC_004041	CTG	2	6	247096	247101	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492732
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4069	NC_004041	GCA	2	6	247598	247603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492731
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4073	NC_004041	GTC	2	6	247804	247809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492731
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4101	NC_004041	GTTTA	2	10	249751	249760	20 %	60 %	20 %	0 %	21492730
4102	NC_004041	CGC	2	6	251233	251238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255371
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4104	NC_004041	CAG	3	9	251330	251338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255371
4105	NC_004041	GCC	2	6	251376	251381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255371
4106	NC_004041	CA	3	6	251419	251424	50 %	0 %	0 %	50 %	89255371
4107	NC_004041	CAAG	2	8	251497	251504	50 %	0 %	25 %	25 %	89255371
4108	NC_004041	GCTGAT	2	12	251555	251566	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	89255371
4109	NC_004041	TCCG	2	8	251596	251603	0 %	25 %	25 %	50 %	89255371
4110	NC_004041	ATC	2	6	251642	251647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255371
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4112	NC_004041	TGG	2	6	251687	251692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255371
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4114	NC_004041	GTTTC	2	10	251768	251777	0 %	60 %	20 %	20 %	89255371
4115	NC_004041	AT	3	6	251838	251843	50 %	50 %	0 %	0 %	89255371
4116	NC_004041	ACATAG	2	12	251858	251869	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	89255371
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4118	NC_004041	CG	3	6	252054	252059	0 %	0 %	50 %	50 %	21492728
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4121	NC_004041	AG	3	6	252190	252195	50 %	0 %	50 %	0 %	21492728
4122	NC_004041	GAA	2	6	252250	252255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492728
4123	NC_004041	CGA	2	6	252303	252308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4124	NC_004041	GAA	2	6	252320	252325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492728
4125	NC_004041	TCG	2	6	252336	252341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4126	NC_004041	CCG	2	6	252346	252351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492728
4127	NC_004041	TGC	2	6	252360	252365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4128	NC_004041	GAT	2	6	252371	252376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492728
4129	NC_004041	TCG	2	6	252419	252424	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4130	NC_004041	GAA	3	9	252490	252498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492728
4131	NC_004041	GTTCGC	2	12	252601	252612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4132	NC_004041	CGA	2	6	252778	252783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492728
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4134	NC_004041	ACG	2	6	252891	252896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492728
4135	NC_004041	A	6	6	252911	252916	100 %	0 %	0 %	0 %	21492728
4136	NC_004041	TCA	2	6	252993	252998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492728
4137	NC_004041	TCA	2	6	253029	253034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492728
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4139	NC_004041	TCG	2	6	253633	253638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255372
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4141	NC_004041	CCT	2	6	253736	253741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255372
4142	NC_004041	CA	3	6	253811	253816	50 %	0 %	0 %	50 %	89255372
4143	NC_004041	ATC	2	6	253822	253827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255372
4144	NC_004041	TCC	2	6	253963	253968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255372
4145	NC_004041	CGC	2	6	253991	253996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255372
4146	NC_004041	CGG	2	6	254039	254044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255372
4147	NC_004041	GCC	2	6	256119	256124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255373
4148	NC_004041	CGG	2	6	256141	256146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255373
4149	NC_004041	GCA	2	6	256159	256164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255373
4150	NC_004041	TCGT	2	8	256239	256246	0 %	50 %	25 %	25 %	89255373
4151	NC_004041	GCA	2	6	256278	256283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255373
4152	NC_004041	TTC	2	6	256324	256329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255373
4153	NC_004041	TCG	2	6	256422	256427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492725
4154	NC_004041	GAA	2	6	256432	256437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492725
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4162	NC_004041	GCT	2	6	256751	256756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492724
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4164	NC_004041	CGT	2	6	256769	256774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492724
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4169	NC_004041	GCT	3	9	257117	257125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492724
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4172	NC_004041	GC	3	6	257338	257343	0 %	0 %	50 %	50 %	21492724
4173	NC_004041	TGC	2	6	257350	257355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492724
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4195	NC_004041	CGC	2	6	258437	258442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492724
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4231	NC_004041	CGA	2	6	260948	260953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492721
4232	NC_004041	TCG	2	6	260998	261003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492721
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4234	NC_004041	GCA	2	6	262751	262756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492720
4235	NC_004041	TGC	2	6	262764	262769	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492720
4236	NC_004041	GAC	2	6	262790	262795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492720
4237	NC_004041	CGC	2	6	262823	262828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492720
4238	NC_004041	GC	4	8	262947	262954	0 %	0 %	50 %	50 %	21492720
4239	NC_004041	GGT	2	6	262963	262968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492720
4240	NC_004041	CGG	2	6	263082	263087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492720
4241	NC_004041	GTG	2	6	263109	263114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492720
4242	NC_004041	CGA	2	6	263173	263178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492720
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4244	NC_004041	GCC	2	6	263285	263290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492720
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4249	NC_004041	CAA	2	6	263686	263691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255375
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4370	NC_004041	CAC	2	6	269476	269481	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492715
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4383	NC_004041	CGGCGC	2	12	270159	270170	0 %	0 %	50 %	50 %	21492715
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4390	NC_004041	GC	3	6	270538	270543	0 %	0 %	50 %	50 %	21492714
4391	NC_004041	GCT	2	6	270580	270585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492714
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4494	NC_004041	GGA	2	6	280096	280101	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255376
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4496	NC_004041	ACC	2	6	280200	280205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255376
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4498	NC_004041	TGG	2	6	280275	280280	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255376
4499	NC_004041	CAA	2	6	280291	280296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255376
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