MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_004041	CGG	2	6	214350	214355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492765
3502	NC_004041	AGAA	2	8	214388	214395	75 %	0 %	25 %	0 %	21492765
3503	NC_004041	GCG	2	6	214487	214492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492765
3504	NC_004041	GCC	2	6	214521	214526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492765
3505	NC_004041	TCG	2	6	214545	214550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492765
3506	NC_004041	GGT	2	6	214568	214573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492765
3507	NC_004041	GA	3	6	214607	214612	50 %	0 %	50 %	0 %	21492765
3508	NC_004041	TCT	2	6	214720	214725	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492765
3509	NC_004041	TGG	2	6	214728	214733	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492765
3510	NC_004041	GTG	2	6	214752	214757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492765
3511	NC_004041	CGC	2	6	214906	214911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492765
3512	NC_004041	CCA	2	6	214918	214923	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492765
3513	NC_004041	GC	3	6	214959	214964	0 %	0 %	50 %	50 %	21492765
3514	NC_004041	GCC	2	6	215003	215008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492765
3515	NC_004041	CTTC	2	8	215056	215063	0 %	50 %	0 %	50 %	21492765
3516	NC_004041	CGGCA	2	10	215123	215132	20 %	0 %	40 %	40 %	21492765
3517	NC_004041	GCG	2	6	215157	215162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492765
3518	NC_004041	CGA	2	6	215174	215179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492765
3519	NC_004041	TTC	3	9	215327	215335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492764
3520	NC_004041	TCCA	2	8	215376	215383	25 %	25 %	0 %	50 %	21492764
3521	NC_004041	GATC	2	8	215404	215411	25 %	25 %	25 %	25 %	21492764
3522	NC_004041	CCA	2	6	215425	215430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492764
3523	NC_004041	GTG	2	6	215453	215458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492764
3524	NC_004041	TGCG	2	8	215511	215518	0 %	25 %	50 %	25 %	21492764
3525	NC_004041	ACA	2	6	215527	215532	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492764
3526	NC_004041	CG	3	6	215572	215577	0 %	0 %	50 %	50 %	21492764
3527	NC_004041	GGT	2	6	215596	215601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492764
3528	NC_004041	CGC	2	6	215722	215727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492764
3529	NC_004041	TGC	2	6	215771	215776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3530	NC_004041	CCT	3	9	215797	215805	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492764
3531	NC_004041	AGC	2	6	215862	215867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3532	NC_004041	TCTG	2	8	215875	215882	0 %	50 %	25 %	25 %	21492764
3533	NC_004041	GAA	2	6	215924	215929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492764
3534	NC_004041	CTC	2	6	215945	215950	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492764
3535	NC_004041	TGA	2	6	215968	215973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492764
3536	NC_004041	AAG	2	6	216083	216088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492764
3537	NC_004041	CGT	2	6	216157	216162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3538	NC_004041	CAC	2	6	216260	216265	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492764
3539	NC_004041	GAC	2	6	216299	216304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3540	NC_004041	GTC	2	6	216311	216316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3541	NC_004041	CA	3	6	216332	216337	50 %	0 %	0 %	50 %	21492764
3542	NC_004041	CCT	2	6	216373	216378	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492764
3543	NC_004041	CAC	2	6	216425	216430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492764
3544	NC_004041	GGTC	2	8	216445	216452	0 %	25 %	50 %	25 %	21492764
3545	NC_004041	GCA	2	6	216568	216573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3546	NC_004041	CCG	2	6	216600	216605	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492764
3547	NC_004041	GCC	2	6	216609	216614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492764
3548	NC_004041	GC	3	6	216647	216652	0 %	0 %	50 %	50 %	21492764
3549	NC_004041	TGC	2	6	216664	216669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492764
3550	NC_004041	TTC	2	6	216672	216677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492764
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3552	NC_004041	GCTC	2	8	216827	216834	0 %	25 %	25 %	50 %	21492763
3553	NC_004041	TCG	2	6	216872	216877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492763
3554	NC_004041	GCC	2	6	216891	216896	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492763
3555	NC_004041	GGT	2	6	216920	216925	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492763
3556	NC_004041	AGC	2	6	217039	217044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492763
3557	NC_004041	GCCC	2	8	217068	217075	0 %	0 %	25 %	75 %	21492763
3558	NC_004041	CCG	2	6	217177	217182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492763
3559	NC_004041	TTC	2	6	217243	217248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492763
3560	NC_004041	CGA	2	6	217283	217288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492763
3561	NC_004041	GGA	2	6	217315	217320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492763
3562	NC_004041	TCA	2	6	217349	217354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492763
3563	NC_004041	TCG	2	6	217360	217365	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492763
3564	NC_004041	GACC	2	8	217409	217416	25 %	0 %	25 %	50 %	21492763
3565	NC_004041	TGC	2	6	217453	217458	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492763
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3567	NC_004041	GTAC	2	8	217530	217537	25 %	25 %	25 %	25 %	21492763
3568	NC_004041	CAT	2	6	217596	217601	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492763
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3570	NC_004041	ATG	2	6	217660	217665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492763
3571	NC_004041	CCT	2	6	217682	217687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492763
3572	NC_004041	CGA	2	6	217760	217765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492763
3573	NC_004041	AGGC	2	8	217766	217773	25 %	0 %	50 %	25 %	21492763
3574	NC_004041	GACC	2	8	217806	217813	25 %	0 %	25 %	50 %	21492763
3575	NC_004041	GTC	2	6	217848	217853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492763
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3591	NC_004041	CAA	2	6	218669	218674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492762
3592	NC_004041	CGT	2	6	218723	218728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3593	NC_004041	GTC	2	6	218775	218780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3594	NC_004041	CGA	2	6	218807	218812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492762
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3598	NC_004041	TGA	2	6	218948	218953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492762
3599	NC_004041	CGA	2	6	218969	218974	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3600	NC_004041	GGAC	2	8	219024	219031	25 %	0 %	50 %	25 %	21492762
3601	NC_004041	TCCA	2	8	219046	219053	25 %	25 %	0 %	50 %	21492762
3602	NC_004041	TCC	2	6	219070	219075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492762
3603	NC_004041	GC	4	8	219137	219144	0 %	0 %	50 %	50 %	21492762
3604	NC_004041	AGCG	2	8	219153	219160	25 %	0 %	50 %	25 %	21492762
3605	NC_004041	CCT	2	6	219200	219205	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492762
3606	NC_004041	CGA	2	6	219254	219259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3607	NC_004041	CGT	2	6	219326	219331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3608	NC_004041	TGG	2	6	219340	219345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492762
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3610	NC_004041	CTT	2	6	219417	219422	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492762
3611	NC_004041	GTC	2	6	219441	219446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3612	NC_004041	GTT	2	6	219489	219494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492762
3613	NC_004041	CTC	2	6	219507	219512	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492762
3614	NC_004041	TCG	2	6	219517	219522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
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3620	NC_004041	ACCG	2	8	219666	219673	25 %	0 %	25 %	50 %	21492762
3621	NC_004041	TCA	2	6	219755	219760	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492762
3622	NC_004041	TCG	2	6	219829	219834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492762
3623	NC_004041	CTT	2	6	219858	219863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492762
3624	NC_004041	GCG	2	6	219864	219869	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492762
3625	NC_004041	CGC	2	6	219873	219878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492762
3626	NC_004041	ACC	2	6	220077	220082	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492761
3627	NC_004041	TCG	2	6	220119	220124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492761
3628	NC_004041	ATG	2	6	220131	220136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492761
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3630	NC_004041	TCT	2	6	220216	220221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492761
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3632	NC_004041	CAGC	2	8	220354	220361	25 %	0 %	25 %	50 %	21492761
3633	NC_004041	GCC	2	6	220412	220417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492761
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3642	NC_004041	CGA	2	6	220843	220848	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492761
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3646	NC_004041	TTCA	2	8	221372	221379	25 %	50 %	0 %	25 %	89255364
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3654	NC_004041	TCGA	2	8	222147	222154	25 %	25 %	25 %	25 %	21492759
3655	NC_004041	CGG	2	6	222177	222182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492759
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3662	NC_004041	CGG	2	6	222550	222555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492759
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3733	NC_004041	GCTC	2	8	227342	227349	0 %	25 %	25 %	50 %	89255366
3734	NC_004041	AAACC	2	10	227387	227396	60 %	0 %	0 %	40 %	89255366
3735	NC_004041	GGA	2	6	227410	227415	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255366
3736	NC_004041	GAT	2	6	227421	227426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255366
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3738	NC_004041	CGT	2	6	227468	227473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255366
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3741	NC_004041	AGT	2	6	227516	227521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255366
3742	NC_004041	GACA	2	8	227578	227585	50 %	0 %	25 %	25 %	89255366
3743	NC_004041	TCC	2	6	227675	227680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255367
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3991	NC_004041	TCA	2	6	242527	242532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492737
3992	NC_004041	GC	4	8	242577	242584	0 %	0 %	50 %	50 %	21492737
3993	NC_004041	CGCAG	2	10	243143	243152	20 %	0 %	40 %	40 %	89255370
3994	NC_004041	ACTG	2	8	243177	243184	25 %	25 %	25 %	25 %	89255370
3995	NC_004041	CCCG	2	8	243187	243194	0 %	0 %	25 %	75 %	89255370
3996	NC_004041	CGT	2	6	243216	243221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255370
3997	NC_004041	CT	3	6	243229	243234	0 %	50 %	0 %	50 %	89255370
3998	NC_004041	GTT	2	6	243265	243270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255370
3999	NC_004041	C	6	6	243315	243320	0 %	0 %	0 %	100 %	89255370
4000	NC_004041	CGA	2	6	243377	243382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255370

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