MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_004041	GCC	2	6	182112	182117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255355
3002	NC_004041	GAC	2	6	182157	182162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255355
3003	NC_004041	CCG	2	6	182167	182172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255355
3004	NC_004041	CG	4	8	182186	182193	0 %	0 %	50 %	50 %	89255355
3005	NC_004041	GAG	2	6	182268	182273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492794
3006	NC_004041	GCG	2	6	182282	182287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492794
3007	NC_004041	CCTTT	2	10	182288	182297	0 %	60 %	0 %	40 %	21492794
3008	NC_004041	CG	3	6	182312	182317	0 %	0 %	50 %	50 %	21492794
3009	NC_004041	GAT	2	6	182329	182334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492794
3010	NC_004041	CCT	2	6	182343	182348	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492794
3011	NC_004041	ATCTCC	2	12	182357	182368	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	21492794
3012	NC_004041	CGCGG	2	10	182386	182395	0 %	0 %	60 %	40 %	21492794
3013	NC_004041	CAA	2	6	182422	182427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492794
3014	NC_004041	GAT	2	6	182477	182482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492794
3015	NC_004041	CAG	2	6	182699	182704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3016	NC_004041	GCA	2	6	182716	182721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3017	NC_004041	GCC	2	6	182733	182738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3018	NC_004041	GAT	2	6	182756	182761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492793
3019	NC_004041	CGT	2	6	182779	182784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3020	NC_004041	GGGC	2	8	182800	182807	0 %	0 %	75 %	25 %	21492793
3021	NC_004041	ATC	2	6	182964	182969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492793
3022	NC_004041	GGA	2	6	182978	182983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3023	NC_004041	TGA	2	6	183103	183108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492793
3024	NC_004041	GGA	2	6	183128	183133	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3025	NC_004041	AAG	2	6	183147	183152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492793
3026	NC_004041	GTC	2	6	183189	183194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3027	NC_004041	GGGC	2	8	183235	183242	0 %	0 %	75 %	25 %	21492793
3028	NC_004041	GACAT	2	10	183313	183322	40 %	20 %	20 %	20 %	21492793
3029	NC_004041	GGC	2	6	183395	183400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492793
3030	NC_004041	GCCG	2	8	183434	183441	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3031	NC_004041	CGCC	2	8	183446	183453	0 %	0 %	25 %	75 %	21492793
3032	NC_004041	GCT	2	6	183473	183478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3033	NC_004041	AGC	2	6	183502	183507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3034	NC_004041	CGA	2	6	183530	183535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3035	NC_004041	CGA	2	6	183569	183574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3036	NC_004041	ACG	2	6	183690	183695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3037	NC_004041	TGC	2	6	183703	183708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3038	NC_004041	GCG	2	6	183820	183825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492793
3039	NC_004041	TGG	2	6	183890	183895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492793
3040	NC_004041	GCCGGC	2	12	183918	183929	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3041	NC_004041	GCT	2	6	183938	183943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3042	NC_004041	TGC	2	6	183944	183949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3043	NC_004041	CCT	2	6	184060	184065	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492793
3044	NC_004041	CGA	2	6	184124	184129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3045	NC_004041	TGG	2	6	184138	184143	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492793
3046	NC_004041	GCA	2	6	184148	184153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3047	NC_004041	GAG	2	6	184179	184184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3048	NC_004041	GCGAT	2	10	184210	184219	20 %	20 %	40 %	20 %	21492793
3049	NC_004041	TGC	2	6	184244	184249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3050	NC_004041	GCC	2	6	184300	184305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3051	NC_004041	CGAT	2	8	184423	184430	25 %	25 %	25 %	25 %	21492793
3052	NC_004041	GCT	2	6	184449	184454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3053	NC_004041	GC	3	6	184455	184460	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3054	NC_004041	AG	3	6	184461	184466	50 %	0 %	50 %	0 %	21492793
3055	NC_004041	TGA	2	6	184514	184519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492793
3056	NC_004041	CTG	2	6	184521	184526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3057	NC_004041	ACG	2	6	184543	184548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3058	NC_004041	GCC	2	6	184650	184655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3059	NC_004041	CAT	2	6	184664	184669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492793
3060	NC_004041	GCT	2	6	184784	184789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3061	NC_004041	GTC	2	6	184818	184823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3062	NC_004041	ATG	2	6	184926	184931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492793
3063	NC_004041	GCG	2	6	184989	184994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492793
3064	NC_004041	GCC	2	6	185049	185054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3065	NC_004041	CGAGGA	2	12	185102	185113	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	21492793
3066	NC_004041	CGA	2	6	185117	185122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3067	NC_004041	GGAC	2	8	185143	185150	25 %	0 %	50 %	25 %	21492793
3068	NC_004041	CGA	2	6	185198	185203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3069	NC_004041	CGA	2	6	185282	185287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3070	NC_004041	GAG	2	6	185310	185315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3071	NC_004041	CAGA	2	8	185345	185352	50 %	0 %	25 %	25 %	21492793
3072	NC_004041	CCG	2	6	185359	185364	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3073	NC_004041	TCG	2	6	185422	185427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3080	NC_004041	TGC	2	6	185836	185841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3081	NC_004041	GCT	2	6	185846	185851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3086	NC_004041	TCG	2	6	185995	186000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3090	NC_004041	GC	3	6	186170	186175	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3091	NC_004041	GGGACG	2	12	186214	186225	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	21492793
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3093	NC_004041	CGGC	3	12	186394	186405	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3094	NC_004041	GAG	2	6	186408	186413	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
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3099	NC_004041	GTCG	2	8	186596	186603	0 %	25 %	50 %	25 %	21492793
3100	NC_004041	CAG	2	6	186648	186653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3102	NC_004041	GAG	2	6	186720	186725	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492793
3103	NC_004041	TGC	2	6	186743	186748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3104	NC_004041	ATCGC	2	10	186751	186760	20 %	20 %	20 %	40 %	21492793
3105	NC_004041	CGC	3	9	186758	186766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3106	NC_004041	GCC	2	6	186783	186788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492793
3107	NC_004041	CTG	2	6	186816	186821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
3108	NC_004041	CCGG	2	8	186838	186845	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3109	NC_004041	GC	4	8	186893	186900	0 %	0 %	50 %	50 %	21492793
3110	NC_004041	CGG	2	6	186957	186962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492793
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3112	NC_004041	CAG	2	6	187043	187048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3117	NC_004041	AGCGG	2	10	187274	187283	20 %	0 %	60 %	20 %	21492793
3118	NC_004041	GCT	2	6	187293	187298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492793
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3120	NC_004041	CG	3	6	187565	187570	0 %	0 %	50 %	50 %	89255356
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3122	NC_004041	TGC	2	6	187740	187745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255356
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3124	NC_004041	GCAC	2	8	187780	187787	25 %	0 %	25 %	50 %	89255356
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3161	NC_004041	GACC	2	8	190074	190081	25 %	0 %	25 %	50 %	21492790
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3233	NC_004041	CTGG	2	8	194518	194525	0 %	25 %	50 %	25 %	89255358
3234	NC_004041	CG	3	6	194534	194539	0 %	0 %	50 %	50 %	89255358
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3245	NC_004041	ATAG	2	8	194975	194982	50 %	25 %	25 %	0 %	89255358
3246	NC_004041	GCTT	2	8	195011	195018	0 %	50 %	25 %	25 %	89255358
3247	NC_004041	GCG	2	6	195217	195222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492785
3248	NC_004041	GCTC	2	8	195244	195251	0 %	25 %	25 %	50 %	21492785
3249	NC_004041	GGC	2	6	195278	195283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492785
3250	NC_004041	CGAGAT	2	12	195472	195483	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21492785
3251	NC_004041	TGT	2	6	195487	195492	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492785
3252	NC_004041	TCG	2	6	195514	195519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492785
3253	NC_004041	GAT	2	6	195561	195566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492785
3254	NC_004041	CTC	2	6	195608	195613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492785
3255	NC_004041	TTC	2	6	195750	195755	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492785
3256	NC_004041	ATG	2	6	195783	195788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492785
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3258	NC_004041	G	6	6	195919	195924	0 %	0 %	100 %	0 %	21492785
3259	NC_004041	GCG	2	6	195940	195945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492785
3260	NC_004041	GTT	2	6	195995	196000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492785
3261	NC_004041	GAC	2	6	196007	196012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492785
3262	NC_004041	ACG	2	6	196044	196049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492785
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3264	NC_004041	CGG	2	6	196163	196168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492784
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3266	NC_004041	AGC	2	6	196326	196331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492784
3267	NC_004041	ACC	2	6	196371	196376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492784
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3269	NC_004041	GCG	2	6	196530	196535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492784
3270	NC_004041	GTA	2	6	196631	196636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492784
3271	NC_004041	TGA	2	6	196718	196723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492784
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3273	NC_004041	GCG	2	6	196884	196889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492783
3274	NC_004041	AAG	2	6	196908	196913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492783
3275	NC_004041	GC	3	6	196972	196977	0 %	0 %	50 %	50 %	21492783
3276	NC_004041	TA	3	6	196992	196997	50 %	50 %	0 %	0 %	21492783
3277	NC_004041	CGA	2	6	197024	197029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492783
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3287	NC_004041	CGCAG	2	10	197845	197854	20 %	0 %	40 %	40 %	21492782
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3293	NC_004041	AAC	2	6	198044	198049	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492782
3294	NC_004041	GA	3	6	198128	198133	50 %	0 %	50 %	0 %	21492782
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3302	NC_004041	CGT	3	9	198583	198591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492782
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3329	NC_004041	CGA	2	6	201898	201903	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492779
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3353	NC_004041	GAG	2	6	204245	204250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255360
3354	NC_004041	CGGC	2	8	204251	204258	0 %	0 %	50 %	50 %	89255360
3355	NC_004041	GCT	2	6	204984	204989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492775
3356	NC_004041	AGC	2	6	205001	205006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492775
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3358	NC_004041	AGG	2	6	205061	205066	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492775
3359	NC_004041	CGT	2	6	205125	205130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492775
3360	NC_004041	TTGC	2	8	205213	205220	0 %	50 %	25 %	25 %	21492775
3361	NC_004041	GCG	2	6	205229	205234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492775
3362	NC_004041	GGA	2	6	205419	205424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492775
3363	NC_004041	AATC	2	8	205473	205480	50 %	25 %	0 %	25 %	21492775
3364	NC_004041	TGC	2	6	205502	205507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492775
3365	NC_004041	GAGC	2	8	205530	205537	25 %	0 %	50 %	25 %	21492775
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3367	NC_004041	AGC	2	6	205562	205567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492775
3368	NC_004041	TGC	2	6	205598	205603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492775
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3371	NC_004041	GCC	2	6	205690	205695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492775
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3375	NC_004041	TGG	2	6	205872	205877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492775
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3488	NC_004041	GGA	2	6	213899	213904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492765
3489	NC_004041	GC	4	8	213925	213932	0 %	0 %	50 %	50 %	21492765
3490	NC_004041	CG	3	6	213973	213978	0 %	0 %	50 %	50 %	21492765
3491	NC_004041	GCTG	2	8	214006	214013	0 %	25 %	50 %	25 %	21492765
3492	NC_004041	GTCG	2	8	214018	214025	0 %	25 %	50 %	25 %	21492765
3493	NC_004041	CCG	2	6	214069	214074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492765
3494	NC_004041	GTC	2	6	214078	214083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492765
3495	NC_004041	TTC	2	6	214124	214129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492765
3496	NC_004041	CGGC	2	8	214162	214169	0 %	0 %	50 %	50 %	21492765
3497	NC_004041	GTG	2	6	214200	214205	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492765
3498	NC_004041	GAA	2	6	214238	214243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492765
3499	NC_004041	TCT	2	6	214288	214293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492765
3500	NC_004041	GAAATG	2	12	214301	214312	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	21492765

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