MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_004041	GTG	2	6	122425	122430	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492856
2002	NC_004041	CCG	2	6	122447	122452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492856
2003	NC_004041	GCAG	2	8	122454	122461	25 %	0 %	50 %	25 %	21492856
2004	NC_004041	CTT	2	6	122499	122504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492856
2005	NC_004041	GC	3	6	122550	122555	0 %	0 %	50 %	50 %	21492856
2006	NC_004041	CGC	2	6	122586	122591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492856
2007	NC_004041	GAT	2	6	122597	122602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492856
2008	NC_004041	CTT	2	6	123061	123066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255333
2009	NC_004041	CACG	2	8	123078	123085	25 %	0 %	25 %	50 %	89255333
2010	NC_004041	TTG	2	6	123153	123158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255333
2011	NC_004041	GAA	2	6	123168	123173	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255333
2012	NC_004041	CAC	2	6	123220	123225	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255333
2013	NC_004041	AGCC	2	8	123238	123245	25 %	0 %	25 %	50 %	89255333
2014	NC_004041	GA	3	6	123247	123252	50 %	0 %	50 %	0 %	89255333
2015	NC_004041	GGT	2	6	123283	123288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255333
2016	NC_004041	CGG	2	6	123316	123321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255333
2017	NC_004041	TCA	2	6	123369	123374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2018	NC_004041	GGAC	2	8	123396	123403	25 %	0 %	50 %	25 %	89255333
2019	NC_004041	GTC	2	6	123406	123411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255333
2020	NC_004041	TTC	2	6	123418	123423	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255333
2021	NC_004041	ATTTCA	2	12	123424	123435	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	89255333
2022	NC_004041	CTT	2	6	123481	123486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255333
2023	NC_004041	GAG	2	6	123500	123505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255333
2024	NC_004041	TCA	2	6	123553	123558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2025	NC_004041	TGC	2	6	123567	123572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255333
2026	NC_004041	CAT	2	6	123617	123622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255333
2027	NC_004041	GAT	2	6	123643	123648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255333
2028	NC_004041	CG	3	6	123696	123701	0 %	0 %	50 %	50 %	89255333
2029	NC_004041	TTGC	2	8	123821	123828	0 %	50 %	25 %	25 %	89255333
2030	NC_004041	AGATGC	2	12	123849	123860	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	21492854
2031	NC_004041	CGC	2	6	123942	123947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492854
2032	NC_004041	CAAT	2	8	124011	124018	50 %	25 %	0 %	25 %	21492854
2033	NC_004041	CGT	2	6	124069	124074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2034	NC_004041	GCA	2	6	124076	124081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2035	NC_004041	AGGTTG	2	12	124101	124112	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	21492854
2036	NC_004041	GTCAT	2	10	124124	124133	20 %	40 %	20 %	20 %	21492854
2037	NC_004041	TGC	2	6	124210	124215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2038	NC_004041	CGG	2	6	124231	124236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2039	NC_004041	ACC	2	6	124269	124274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492854
2040	NC_004041	GCG	2	6	124278	124283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2041	NC_004041	TGTCG	2	10	124306	124315	0 %	40 %	40 %	20 %	21492854
2042	NC_004041	GCT	2	6	124361	124366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2043	NC_004041	CT	3	6	124365	124370	0 %	50 %	0 %	50 %	21492854
2044	NC_004041	TGA	2	6	124404	124409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492854
2045	NC_004041	CGG	2	6	124456	124461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2046	NC_004041	CGA	2	6	124566	124571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492854
2047	NC_004041	T	6	6	124576	124581	0 %	100 %	0 %	0 %	21492854
2048	NC_004041	TTG	2	6	124599	124604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492854
2049	NC_004041	GCG	2	6	124626	124631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492854
2050	NC_004041	GGAGA	2	10	124775	124784	40 %	0 %	60 %	0 %	21492854
2051	NC_004041	CG	3	6	124824	124829	0 %	0 %	50 %	50 %	21492854
2052	NC_004041	TGA	2	6	124906	124911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492854
2053	NC_004041	AC	3	6	125266	125271	50 %	0 %	0 %	50 %	21492853
2054	NC_004041	GTC	2	6	125407	125412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492853
2055	NC_004041	ATG	2	6	125453	125458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492853
2056	NC_004041	GTT	2	6	125524	125529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492853
2057	NC_004041	GGC	2	6	125542	125547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492853
2058	NC_004041	ACA	2	6	125651	125656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492853
2059	NC_004041	TCA	2	6	125687	125692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492853
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2061	NC_004041	TTA	2	6	126089	126094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	89255334
2062	NC_004041	GAG	2	6	126139	126144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255334
2063	NC_004041	CG	3	6	126166	126171	0 %	0 %	50 %	50 %	89255334
2064	NC_004041	CTC	2	6	126235	126240	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255334
2065	NC_004041	ATC	2	6	126292	126297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255334
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2070	NC_004041	CCAG	2	8	126414	126421	25 %	0 %	25 %	50 %	89255334
2071	NC_004041	GGC	2	6	126422	126427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255334
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2073	NC_004041	TTGCG	2	10	126470	126479	0 %	40 %	40 %	20 %	89255334
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2105	NC_004041	CTTCG	2	10	129835	129844	0 %	40 %	20 %	40 %	89255335
2106	NC_004041	CG	4	8	129934	129941	0 %	0 %	50 %	50 %	89255335
2107	NC_004041	TGA	2	6	130023	130028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255335
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2121	NC_004041	ATG	2	6	130954	130959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255336
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2123	NC_004041	GTC	3	9	131039	131047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255336
2124	NC_004041	TAG	2	6	131067	131072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255336
2125	NC_004041	G	9	9	131222	131230	0 %	0 %	100 %	0 %	89255337
2126	NC_004041	CTG	2	6	131300	131305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255337
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2128	NC_004041	GCA	2	6	131347	131352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255337
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2132	NC_004041	CGA	2	6	131531	131536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255337
2133	NC_004041	CAAGCT	2	12	131663	131674	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	89255338
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2136	NC_004041	ACCT	2	8	131738	131745	25 %	25 %	0 %	50 %	89255338
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2155	NC_004041	TCG	2	6	132574	132579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255338
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2230	NC_004041	CG	3	6	136584	136589	0 %	0 %	50 %	50 %	89255340
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2234	NC_004041	A	6	6	136737	136742	100 %	0 %	0 %	0 %	89255341
2235	NC_004041	ATG	2	6	136766	136771	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255341
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2239	NC_004041	GGAAC	2	10	137318	137327	40 %	0 %	40 %	20 %	89255341
2240	NC_004041	GAAG	2	8	137359	137366	50 %	0 %	50 %	0 %	89255341
2241	NC_004041	ATGCG	2	10	137420	137429	20 %	20 %	40 %	20 %	89255341
2242	NC_004041	GCG	2	6	137633	137638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255341
2243	NC_004041	ATC	2	6	137642	137647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255341
2244	NC_004041	CAA	2	6	137683	137688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255341
2245	NC_004041	GTC	2	6	137731	137736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255341
2246	NC_004041	CGC	2	6	137752	137757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255341
2247	NC_004041	GC	3	6	137874	137879	0 %	0 %	50 %	50 %	89255341
2248	NC_004041	ACC	2	6	138336	138341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255342
2249	NC_004041	GCC	2	6	138445	138450	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255342
2250	NC_004041	ATC	2	6	138476	138481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255342
2251	NC_004041	GAA	2	6	138506	138511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255342
2252	NC_004041	CGC	2	6	138532	138537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255342
2253	NC_004041	CG	3	6	138541	138546	0 %	0 %	50 %	50 %	89255342
2254	NC_004041	TCCA	2	8	138573	138580	25 %	25 %	0 %	50 %	21492839
2255	NC_004041	TGG	2	6	138596	138601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492839
2256	NC_004041	ATG	2	6	138632	138637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492839
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2278	NC_004041	GCA	2	6	140171	140176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492838
2279	NC_004041	GTC	2	6	140198	140203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492838
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2284	NC_004041	GAA	2	6	140330	140335	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492838
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2312	NC_004041	ACCA	2	8	142858	142865	50 %	0 %	0 %	50 %	21492835
2313	NC_004041	TCT	2	6	142875	142880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492835
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2320	NC_004041	GGT	2	6	143111	143116	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492835
2321	NC_004041	GCG	2	6	143131	143136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492835
2322	NC_004041	ACA	2	6	143147	143152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492835
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2325	NC_004041	CAG	2	6	143245	143250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492835
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2327	NC_004041	CG	4	8	143424	143431	0 %	0 %	50 %	50 %	21492835
2328	NC_004041	AGCG	2	8	143754	143761	25 %	0 %	50 %	25 %	21492834
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2333	NC_004041	A	6	6	143982	143987	100 %	0 %	0 %	0 %	21492834
2334	NC_004041	GGATC	2	10	143994	144003	20 %	20 %	40 %	20 %	21492834
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2351	NC_004041	CGAA	2	8	144785	144792	50 %	0 %	25 %	25 %	21492834
2352	NC_004041	ATT	2	6	144803	144808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492834
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2356	NC_004041	AGG	2	6	145095	145100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492833
2357	NC_004041	TCG	2	6	145192	145197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492833
2358	NC_004041	TCGA	2	8	145208	145215	25 %	25 %	25 %	25 %	21492833
2359	NC_004041	CGCGCT	2	12	145235	145246	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	21492833
2360	NC_004041	GCTG	2	8	145249	145256	0 %	25 %	50 %	25 %	21492833
2361	NC_004041	TCG	2	6	145287	145292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492833
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2363	NC_004041	GCA	3	9	145309	145317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492833
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2366	NC_004041	GTC	2	6	145454	145459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492833
2367	NC_004041	TC	3	6	145464	145469	0 %	50 %	0 %	50 %	21492833
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2369	NC_004041	TGGT	2	8	145584	145591	0 %	50 %	50 %	0 %	21492833
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2491	NC_004041	GCA	2	6	152070	152075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255346
2492	NC_004041	GCGG	2	8	152133	152140	0 %	0 %	75 %	25 %	89255346
2493	NC_004041	GCA	2	6	152271	152276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255346
2494	NC_004041	TGA	2	6	152306	152311	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255346
2495	NC_004041	ATC	2	6	152798	152803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492826
2496	NC_004041	ACAA	2	8	152857	152864	75 %	0 %	0 %	25 %	21492826
2497	NC_004041	GCG	2	6	152909	152914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492826
2498	NC_004041	AAGC	2	8	152948	152955	50 %	0 %	25 %	25 %	21492826
2499	NC_004041	CGA	2	6	153016	153021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492826
2500	NC_004041	CCG	2	6	153082	153087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492826

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