MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_004041	ACG	2	6	90981	90986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1502	NC_004041	CAA	2	6	91024	91029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255325
1503	NC_004041	GTT	2	6	91072	91077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255325
1504	NC_004041	AAG	2	6	91113	91118	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255325
1505	NC_004041	CA	3	6	91256	91261	50 %	0 %	0 %	50 %	89255325
1506	NC_004041	GCCC	2	8	91265	91272	0 %	0 %	25 %	75 %	89255325
1507	NC_004041	CAG	2	6	91302	91307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1508	NC_004041	TCCA	2	8	91323	91330	25 %	25 %	0 %	50 %	89255325
1509	NC_004041	GCT	2	6	91348	91353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1510	NC_004041	TCT	2	6	91355	91360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255325
1511	NC_004041	GCA	2	6	91424	91429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1512	NC_004041	AAC	2	6	91547	91552	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255325
1513	NC_004041	GAC	2	6	91600	91605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1514	NC_004041	AGG	2	6	91649	91654	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255325
1515	NC_004041	CGG	2	6	91663	91668	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255325
1516	NC_004041	CAT	2	6	91681	91686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255325
1517	NC_004041	GC	3	6	91742	91747	0 %	0 %	50 %	50 %	89255325
1518	NC_004041	AGCA	2	8	91851	91858	50 %	0 %	25 %	25 %	89255325
1519	NC_004041	GGCAAC	2	12	91893	91904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1520	NC_004041	GCCA	2	8	91998	92005	25 %	0 %	25 %	50 %	89255325
1521	NC_004041	TCG	2	6	92010	92015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255325
1522	NC_004041	GGA	2	6	92256	92261	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492881
1523	NC_004041	ATC	2	6	92295	92300	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492881
1524	NC_004041	ACCG	2	8	92346	92353	25 %	0 %	25 %	50 %	21492881
1525	NC_004041	CG	3	6	92402	92407	0 %	0 %	50 %	50 %	21492881
1526	NC_004041	CTT	2	6	92443	92448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492881
1527	NC_004041	CAG	2	6	92450	92455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492881
1528	NC_004041	TCA	2	6	92475	92480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492881
1529	NC_004041	GTC	2	6	92493	92498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492881
1530	NC_004041	GC	5	10	92500	92509	0 %	0 %	50 %	50 %	21492881
1531	NC_004041	GGA	2	6	92894	92899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492880
1532	NC_004041	CTA	2	6	92984	92989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492880
1533	NC_004041	AGGC	2	8	92997	93004	25 %	0 %	50 %	25 %	21492880
1534	NC_004041	CGACGT	2	12	93007	93018	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21492880
1535	NC_004041	CGT	2	6	93020	93025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492880
1536	NC_004041	GC	4	8	93050	93057	0 %	0 %	50 %	50 %	21492880
1537	NC_004041	GC	3	6	93518	93523	0 %	0 %	50 %	50 %	21492879
1538	NC_004041	TCA	2	6	93605	93610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492879
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1541	NC_004041	CT	3	6	93727	93732	0 %	50 %	0 %	50 %	21492879
1542	NC_004041	GAA	2	6	93746	93751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492879
1543	NC_004041	TCG	2	6	93801	93806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492879
1544	NC_004041	CGTC	2	8	93843	93850	0 %	25 %	25 %	50 %	21492879
1545	NC_004041	GAG	2	6	93935	93940	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492879
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1549	NC_004041	CGG	2	6	94062	94067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492879
1550	NC_004041	GCG	2	6	94071	94076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492879
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1558	NC_004041	GGGC	2	8	94734	94741	0 %	0 %	75 %	25 %	21492878
1559	NC_004041	TGT	2	6	94757	94762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492878
1560	NC_004041	CGG	2	6	94827	94832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492878
1561	NC_004041	CT	3	6	95088	95093	0 %	50 %	0 %	50 %	21492878
1562	NC_004041	GGC	2	6	95158	95163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492878
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1574	NC_004041	ACCG	2	8	95908	95915	25 %	0 %	25 %	50 %	21492877
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1597	NC_004041	ACGTCG	2	12	96974	96985	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	21492875
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1599	NC_004041	GCG	2	6	97045	97050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492875
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1601	NC_004041	TAC	4	12	97153	97164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492875
1602	NC_004041	TGC	2	6	97275	97280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492875
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1607	NC_004041	AGC	2	6	97658	97663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255327
1608	NC_004041	CAG	2	6	97796	97801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255327
1609	NC_004041	TGG	2	6	97812	97817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255327
1610	NC_004041	ATC	3	9	97835	97843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255327
1611	NC_004041	TGC	2	6	97844	97849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255327
1612	NC_004041	TGGC	2	8	97994	98001	0 %	25 %	50 %	25 %	89255327
1613	NC_004041	A	6	6	98004	98009	100 %	0 %	0 %	0 %	89255327
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1615	NC_004041	CTT	2	6	98058	98063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255327
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1621	NC_004041	G	7	7	98294	98300	0 %	0 %	100 %	0 %	89255327
1622	NC_004041	CCG	2	6	98307	98312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255327
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1624	NC_004041	TCCT	2	8	98441	98448	0 %	50 %	0 %	50 %	89255327
1625	NC_004041	CG	3	6	98483	98488	0 %	0 %	50 %	50 %	89255327
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1627	NC_004041	GGT	2	6	98547	98552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255327
1628	NC_004041	CTG	2	6	98556	98561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255327
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1630	NC_004041	ACT	2	6	98574	98579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255327
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1750	NC_004041	GTG	2	6	106068	106073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255331
1751	NC_004041	GT	3	6	106105	106110	0 %	50 %	50 %	0 %	89255331
1752	NC_004041	GGC	2	6	106125	106130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255331
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1869	NC_004041	GC	3	6	114897	114902	0 %	0 %	50 %	50 %	21492859
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1871	NC_004041	T	6	6	114989	114994	0 %	100 %	0 %	0 %	21492859
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1873	NC_004041	GAC	2	6	115253	115258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492859
1874	NC_004041	GCG	2	6	115287	115292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492859
1875	NC_004041	ACT	2	6	115299	115304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492859
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1878	NC_004041	TCG	2	6	115718	115723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255332
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1991	NC_004041	ATTC	2	8	121959	121966	25 %	50 %	0 %	25 %	21492856
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1994	NC_004041	CG	3	6	122158	122163	0 %	0 %	50 %	50 %	21492856
1995	NC_004041	ATCGAA	2	12	122170	122181	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	21492856
1996	NC_004041	CTT	2	6	122230	122235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492856
1997	NC_004041	GAT	2	6	122269	122274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492856
1998	NC_004041	GATC	2	8	122334	122341	25 %	25 %	25 %	25 %	21492856
1999	NC_004041	TCAT	2	8	122344	122351	25 %	50 %	0 %	25 %	21492856
2000	NC_004041	GAA	2	6	122374	122379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492856

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