MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_004041	GCG	2	6	64146	64151	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255318
1002	NC_004041	TC	3	6	64235	64240	0 %	50 %	0 %	50 %	89255318
1003	NC_004041	GGT	3	9	64256	64264	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255318
1004	NC_004041	GC	3	6	64285	64290	0 %	0 %	50 %	50 %	89255318
1005	NC_004041	CGG	2	6	64291	64296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255318
1006	NC_004041	CCG	2	6	64299	64304	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255318
1007	NC_004041	GCA	2	6	64311	64316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255318
1008	NC_004041	CGG	2	6	64324	64329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255318
1009	NC_004041	CGC	2	6	64349	64354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255318
1010	NC_004041	CT	3	6	64381	64386	0 %	50 %	0 %	50 %	89255318
1011	NC_004041	CTG	4	12	64449	64460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255318
1012	NC_004041	CGC	2	6	64494	64499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1013	NC_004041	GGCGA	2	10	64508	64517	20 %	0 %	60 %	20 %	89255319
1014	NC_004041	GCG	2	6	64526	64531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255319
1015	NC_004041	GCT	2	6	64549	64554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255319
1016	NC_004041	GCC	2	6	64574	64579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1017	NC_004041	GATGG	2	10	64581	64590	20 %	20 %	60 %	0 %	89255319
1018	NC_004041	CGC	2	6	64596	64601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1019	NC_004041	CGG	2	6	64628	64633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255319
1020	NC_004041	CGG	2	6	64640	64645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255319
1021	NC_004041	CGC	2	6	64703	64708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1022	NC_004041	CGGA	2	8	64725	64732	25 %	0 %	50 %	25 %	89255319
1023	NC_004041	CGGG	2	8	64751	64758	0 %	0 %	75 %	25 %	89255319
1024	NC_004041	ATC	2	6	64767	64772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255319
1025	NC_004041	GCC	2	6	64823	64828	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1026	NC_004041	CGC	3	9	64884	64892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1027	NC_004041	GAGC	2	8	64903	64910	25 %	0 %	50 %	25 %	89255319
1028	NC_004041	AGGCA	2	10	64911	64920	40 %	0 %	40 %	20 %	89255319
1029	NC_004041	GTC	2	6	64922	64927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255319
1030	NC_004041	GGGC	2	8	64995	65002	0 %	0 %	75 %	25 %	89255319
1031	NC_004041	CGGCT	2	10	65023	65032	0 %	20 %	40 %	40 %	89255319
1032	NC_004041	GCC	2	6	65069	65074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255319
1033	NC_004041	CGA	2	6	65077	65082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255319
1034	NC_004041	CA	3	6	65092	65097	50 %	0 %	0 %	50 %	89255319
1035	NC_004041	CAT	2	6	65142	65147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492906
1036	NC_004041	CGG	2	6	65150	65155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492906
1037	NC_004041	GGC	2	6	65178	65183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492906
1038	NC_004041	GGC	2	6	65193	65198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492906
1039	NC_004041	CGC	2	6	65211	65216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1040	NC_004041	GCC	2	6	65239	65244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1041	NC_004041	GCC	2	6	65254	65259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1042	NC_004041	GCC	2	6	65302	65307	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1043	NC_004041	GCC	2	6	65317	65322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1044	NC_004041	GGT	2	6	65376	65381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492906
1045	NC_004041	TCGG	2	8	65389	65396	0 %	25 %	50 %	25 %	21492906
1046	NC_004041	CGA	2	6	65421	65426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492906
1047	NC_004041	CGCCA	2	10	65446	65455	20 %	0 %	20 %	60 %	21492906
1048	NC_004041	GCC	2	6	65509	65514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492906
1049	NC_004041	ATC	2	6	65543	65548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492906
1050	NC_004041	CGG	2	6	65606	65611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492906
1051	NC_004041	GACG	2	8	65710	65717	25 %	0 %	50 %	25 %	21492905
1052	NC_004041	GCG	2	6	65719	65724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492905
1053	NC_004041	CTG	2	6	65756	65761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1054	NC_004041	GTC	2	6	65846	65851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1055	NC_004041	TC	3	6	65875	65880	0 %	50 %	0 %	50 %	21492905
1056	NC_004041	CCGG	2	8	65931	65938	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1057	NC_004041	GTC	2	6	65978	65983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1058	NC_004041	CCGG	2	8	66020	66027	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1059	NC_004041	CG	3	6	66034	66039	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1060	NC_004041	GCC	2	6	66119	66124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492905
1061	NC_004041	GC	3	6	66174	66179	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1062	NC_004041	TCG	2	6	66213	66218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1063	NC_004041	CAA	3	9	66220	66228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492905
1064	NC_004041	GC	3	6	66246	66251	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1065	NC_004041	TGG	2	6	66252	66257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492905
1066	NC_004041	ACA	2	6	66294	66299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492905
1067	NC_004041	TGA	2	6	66378	66383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492905
1068	NC_004041	TGC	2	6	66429	66434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1069	NC_004041	TGC	2	6	66487	66492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1070	NC_004041	CCG	2	6	66500	66505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492905
1071	NC_004041	GCG	2	6	66508	66513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492905
1072	NC_004041	GC	3	6	66559	66564	0 %	0 %	50 %	50 %	21492905
1073	NC_004041	TCG	2	6	66609	66614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492905
1074	NC_004041	CGATC	2	10	66631	66640	20 %	20 %	20 %	40 %	21492905
1075	NC_004041	GAA	2	6	66644	66649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492905
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1078	NC_004041	GGGC	2	8	66699	66706	0 %	0 %	75 %	25 %	21492905
1079	NC_004041	CGAT	2	8	66717	66724	25 %	25 %	25 %	25 %	21492905
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1092	NC_004041	TCCGG	2	10	67077	67086	0 %	20 %	40 %	40 %	21492904
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1099	NC_004041	GC	3	6	67361	67366	0 %	0 %	50 %	50 %	21492904
1100	NC_004041	AGCCGG	2	12	67367	67378	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	21492904
1101	NC_004041	CCTT	2	8	67454	67461	0 %	50 %	0 %	50 %	21492904
1102	NC_004041	TCG	2	6	67469	67474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492904
1103	NC_004041	GCC	2	6	67484	67489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492904
1104	NC_004041	CGC	2	6	67495	67500	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492904
1105	NC_004041	GAC	2	6	67515	67520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492904
1106	NC_004041	GTCG	2	8	67554	67561	0 %	25 %	50 %	25 %	21492904
1107	NC_004041	G	7	7	67606	67612	0 %	0 %	100 %	0 %	21492904
1108	NC_004041	CGTC	2	8	67777	67784	0 %	25 %	25 %	50 %	21492904
1109	NC_004041	ATC	2	6	67915	67920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492904
1110	NC_004041	GGC	2	6	68045	68050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492903
1111	NC_004041	TGC	2	6	68059	68064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492903
1112	NC_004041	CCT	2	6	68086	68091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492903
1113	NC_004041	GTC	2	6	68106	68111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492903
1114	NC_004041	CTG	2	6	68112	68117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492903
1115	NC_004041	CAG	2	6	68142	68147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492903
1116	NC_004041	CGC	2	6	68149	68154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492903
1117	NC_004041	TGA	2	6	68200	68205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492903
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1119	NC_004041	TGC	2	6	68233	68238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492903
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1121	NC_004041	AGA	2	6	68371	68376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492903
1122	NC_004041	CGA	2	6	68411	68416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492903
1123	NC_004041	TGA	2	6	68500	68505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492903
1124	NC_004041	TGG	2	6	68530	68535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492903
1125	NC_004041	GAT	2	6	68549	68554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492903
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1127	NC_004041	GCT	3	9	68585	68593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492903
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