MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_004041	CG	3	6	33066	33071	0 %	0 %	50 %	50 %	21492934
502	NC_004041	GGC	2	6	33083	33088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492934
503	NC_004041	CTT	2	6	33169	33174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492934
504	NC_004041	GGC	2	6	33217	33222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492934
505	NC_004041	CATCTT	2	12	33239	33250	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	21492934
506	NC_004041	ATC	2	6	33349	33354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492933
507	NC_004041	TGG	2	6	33368	33373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492933
508	NC_004041	GAA	2	6	33375	33380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492933
509	NC_004041	GAT	2	6	33385	33390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492933
510	NC_004041	ATG	2	6	33433	33438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492933
511	NC_004041	CTT	2	6	33450	33455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492933
512	NC_004041	CTGC	2	8	33510	33517	0 %	25 %	25 %	50 %	21492933
513	NC_004041	CAG	2	6	33644	33649	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492933
514	NC_004041	TCT	2	6	33706	33711	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492933
515	NC_004041	CTTG	2	8	33719	33726	0 %	50 %	25 %	25 %	89255304
516	NC_004041	CG	3	6	33742	33747	0 %	0 %	50 %	50 %	89255304
517	NC_004041	GGC	2	6	33754	33759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255304
518	NC_004041	GA	3	6	33788	33793	50 %	0 %	50 %	0 %	89255304
519	NC_004041	CCAG	2	8	33845	33852	25 %	0 %	25 %	50 %	89255304
520	NC_004041	GAT	2	6	33901	33906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255304
521	NC_004041	CAT	2	6	33949	33954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255304
522	NC_004041	CGT	2	6	33997	34002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255304
523	NC_004041	AAGC	2	8	34007	34014	50 %	0 %	25 %	25 %	89255304
524	NC_004041	CTC	2	6	34045	34050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255304
525	NC_004041	A	7	7	34141	34147	100 %	0 %	0 %	0 %	89255304
526	NC_004041	GAG	2	6	34181	34186	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255304
527	NC_004041	TCA	2	6	34215	34220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255304
528	NC_004041	GCC	2	6	34258	34263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255304
529	NC_004041	GAT	2	6	34339	34344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255305
530	NC_004041	CGATC	2	10	34411	34420	20 %	20 %	20 %	40 %	89255305
531	NC_004041	TAC	2	6	34436	34441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255305
532	NC_004041	GCG	2	6	34444	34449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255305
533	NC_004041	GGAT	2	8	34473	34480	25 %	25 %	50 %	0 %	89255305
534	NC_004041	TC	3	6	34485	34490	0 %	50 %	0 %	50 %	89255305
535	NC_004041	TGG	2	6	34518	34523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255305
536	NC_004041	GGC	2	6	34566	34571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255305
537	NC_004041	GCA	2	6	34953	34958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255306
538	NC_004041	GCAA	2	8	34998	35005	50 %	0 %	25 %	25 %	89255306
539	NC_004041	GCATC	2	10	35023	35032	20 %	20 %	20 %	40 %	89255306
540	NC_004041	CAG	2	6	35039	35044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255306
541	NC_004041	CGA	2	6	35065	35070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255306
542	NC_004041	TCGG	2	8	35196	35203	0 %	25 %	50 %	25 %	89255306
543	NC_004041	CAA	2	6	35270	35275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255306
544	NC_004041	GGC	2	6	35313	35318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255306
545	NC_004041	TCCGG	2	10	35319	35328	0 %	20 %	40 %	40 %	89255306
546	NC_004041	CGA	2	6	35365	35370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255306
547	NC_004041	GC	3	6	36825	36830	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
548	NC_004041	GC	3	6	36879	36884	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
549	NC_004041	CTG	2	6	36918	36923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255307
550	NC_004041	GGC	2	6	36925	36930	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255307
551	NC_004041	GGA	2	6	36972	36977	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255307
552	NC_004041	TCAG	2	8	37046	37053	25 %	25 %	25 %	25 %	89255307
553	NC_004041	CG	3	6	37080	37085	0 %	0 %	50 %	50 %	89255307
554	NC_004041	CGA	2	6	37110	37115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255307
555	NC_004041	GCA	2	6	37135	37140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255307
556	NC_004041	AGG	2	6	37278	37283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255308
557	NC_004041	GCG	2	6	37298	37303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255308
558	NC_004041	ACC	2	6	37497	37502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255308
559	NC_004041	CCA	2	6	37508	37513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255308
560	NC_004041	CCG	2	6	37520	37525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255308
561	NC_004041	TTG	2	6	37607	37612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	89255308
562	NC_004041	ATG	2	6	37680	37685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255309
563	NC_004041	CAT	2	6	37737	37742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255309
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565	NC_004041	GC	3	6	37830	37835	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
566	NC_004041	CGT	2	6	37913	37918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255309
567	NC_004041	GC	3	6	37931	37936	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
568	NC_004041	GCCG	2	8	37947	37954	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
569	NC_004041	TGA	2	6	37967	37972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255309
570	NC_004041	GAGCG	2	10	38020	38029	20 %	0 %	60 %	20 %	89255309
571	NC_004041	TCG	2	6	38035	38040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255309
572	NC_004041	GAA	2	6	38103	38108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	89255309
573	NC_004041	TGC	2	6	38149	38154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255309
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575	NC_004041	GCC	2	6	38328	38333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255309
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577	NC_004041	GCG	2	6	38401	38406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255309
578	NC_004041	GAT	2	6	38412	38417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255309
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580	NC_004041	ACC	2	6	38443	38448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255309
581	NC_004041	TGC	2	6	38485	38490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255309
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598	NC_004041	GGTC	2	8	39291	39298	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
599	NC_004041	GGCG	2	8	39335	39342	0 %	0 %	75 %	25 %	89255309
600	NC_004041	GC	3	6	39375	39380	0 %	0 %	50 %	50 %	89255309
601	NC_004041	GTCG	2	8	39401	39408	0 %	25 %	50 %	25 %	89255309
602	NC_004041	GCA	2	6	39506	39511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255309
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607	NC_004041	CAT	2	6	40593	40598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255310
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610	NC_004041	GCG	2	6	40914	40919	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255310
611	NC_004041	CAT	2	6	40921	40926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255310
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616	NC_004041	ATCG	2	8	41099	41106	25 %	25 %	25 %	25 %	89255311
617	NC_004041	GAT	2	6	41132	41137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255311
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619	NC_004041	CCA	2	6	41176	41181	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255311
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623	NC_004041	CCTT	2	8	41394	41401	0 %	50 %	0 %	50 %	89255311
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633	NC_004041	GGC	2	6	42583	42588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492924
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760	NC_004041	AGG	2	6	49131	49136	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492919
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762	NC_004041	CA	3	6	49228	49233	50 %	0 %	0 %	50 %	21492919
763	NC_004041	GT	3	6	49290	49295	0 %	50 %	50 %	0 %	21492919
764	NC_004041	TCG	2	6	49296	49301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492919
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781	NC_004041	GCA	3	9	51071	51079	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492917
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