MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_004041	CCT	2	6	310702	310707	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492673
5002	NC_004041	TGAT	2	8	310735	310742	25 %	50 %	25 %	0 %	21492673
5003	NC_004041	CAC	2	6	310748	310753	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492673
5004	NC_004041	TTCG	2	8	310787	310794	0 %	50 %	25 %	25 %	21492673
5005	NC_004041	C	6	6	310802	310807	0 %	0 %	0 %	100 %	21492673
5006	NC_004041	GGT	2	6	310855	310860	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492673
5007	NC_004041	GCGA	2	8	310878	310885	25 %	0 %	50 %	25 %	21492673
5008	NC_004041	TCA	2	6	310908	310913	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492673
5009	NC_004041	ATC	2	6	310926	310931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492673
5010	NC_004041	AGC	2	6	310948	310953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492673
5011	NC_004041	TCCG	2	8	310972	310979	0 %	25 %	25 %	50 %	21492673
5012	NC_004041	GCG	2	6	310990	310995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492673
5013	NC_004041	GCC	2	6	311066	311071	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492673
5014	NC_004041	GAC	2	6	311078	311083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492673
5015	NC_004041	CAG	2	6	311084	311089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492673
5016	NC_004041	AGA	2	6	311100	311105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492673
5017	NC_004041	TTC	2	6	311115	311120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492673
5018	NC_004041	TCG	2	6	311213	311218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5019	NC_004041	CCG	2	6	311288	311293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492672
5020	NC_004041	GCA	2	6	311301	311306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5021	NC_004041	ATC	2	6	311318	311323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492672
5022	NC_004041	CTG	2	6	311392	311397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5023	NC_004041	GTA	2	6	311518	311523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5024	NC_004041	ACCC	2	8	311545	311552	25 %	0 %	0 %	75 %	21492672
5025	NC_004041	CAT	2	6	311629	311634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492672
5026	NC_004041	CGA	2	6	311673	311678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5027	NC_004041	TCA	2	6	311679	311684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492672
5028	NC_004041	GAT	2	6	311689	311694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5029	NC_004041	TCA	2	6	311733	311738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492672
5030	NC_004041	GCC	2	6	311752	311757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492672
5031	NC_004041	AGG	2	6	311760	311765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492672
5032	NC_004041	GAT	2	6	311835	311840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5033	NC_004041	GGCC	2	8	311844	311851	0 %	0 %	50 %	50 %	21492672
5034	NC_004041	GAT	2	6	311884	311889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5035	NC_004041	CCGG	2	8	311910	311917	0 %	0 %	50 %	50 %	21492672
5036	NC_004041	CAT	2	6	311944	311949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492672
5037	NC_004041	CGG	2	6	311961	311966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492672
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5039	NC_004041	ACC	2	6	311997	312002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492672
5040	NC_004041	AG	3	6	312033	312038	50 %	0 %	50 %	0 %	21492672
5041	NC_004041	ACG	2	6	312060	312065	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5042	NC_004041	GTT	2	6	312079	312084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492672
5043	NC_004041	GCA	2	6	312093	312098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5044	NC_004041	CG	3	6	312252	312257	0 %	0 %	50 %	50 %	21492672
5045	NC_004041	TGAT	2	8	312260	312267	25 %	50 %	25 %	0 %	21492672
5046	NC_004041	AGA	2	6	312318	312323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492672
5047	NC_004041	TCC	2	6	312340	312345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492672
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5049	NC_004041	CAC	2	6	312373	312378	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492672
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5053	NC_004041	GAT	2	6	312508	312513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5054	NC_004041	CGA	2	6	312519	312524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5055	NC_004041	CGA	2	6	312531	312536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5056	NC_004041	TCG	2	6	312578	312583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5057	NC_004041	AGC	3	9	312647	312655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
5058	NC_004041	GAT	2	6	312705	312710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492672
5059	NC_004041	AGC	2	6	312731	312736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492672
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5061	NC_004041	GGC	2	6	314117	314122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492671
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5063	NC_004041	CAA	2	6	314144	314149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492671
5064	NC_004041	CG	3	6	314313	314318	0 %	0 %	50 %	50 %	21492671
5065	NC_004041	GGCATG	2	12	314367	314378	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	21492671
5066	NC_004041	GGTG	2	8	314393	314400	0 %	25 %	75 %	0 %	21492671
5067	NC_004041	TGG	2	6	314669	314674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255386
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5069	NC_004041	GAC	2	6	314780	314785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255386
5070	NC_004041	T	7	7	314802	314808	0 %	100 %	0 %	0 %	89255386
5071	NC_004041	GCCA	2	8	314831	314838	25 %	0 %	25 %	50 %	89255386
5072	NC_004041	GGCA	2	8	314913	314920	25 %	0 %	50 %	25 %	89255386
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5101	NC_004041	TGCAG	2	10	317759	317768	20 %	20 %	40 %	20 %	21492668
5102	NC_004041	CCA	2	6	317779	317784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492668
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5105	NC_004041	CTT	2	6	317884	317889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492668
5106	NC_004041	CGA	2	6	317935	317940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492668
5107	NC_004041	TTC	2	6	318906	318911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492667
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5109	NC_004041	CGGC	2	8	318948	318955	0 %	0 %	50 %	50 %	21492667
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5112	NC_004041	CAGGT	2	10	319125	319134	20 %	20 %	40 %	20 %	21492667
5113	NC_004041	CG	3	6	319159	319164	0 %	0 %	50 %	50 %	21492667
5114	NC_004041	CTTC	2	8	319209	319216	0 %	50 %	0 %	50 %	21492666
5115	NC_004041	TC	3	6	319248	319253	0 %	50 %	0 %	50 %	21492666
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5119	NC_004041	GTC	2	6	319559	319564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492665
5120	NC_004041	AAGC	2	8	319567	319574	50 %	0 %	25 %	25 %	21492665
5121	NC_004041	GCT	2	6	319722	319727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492665
5122	NC_004041	CAG	2	6	319750	319755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492665
5123	NC_004041	CAG	2	6	319860	319865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492665
5124	NC_004041	GCTC	2	8	320329	320336	0 %	25 %	25 %	50 %	89255388
5125	NC_004041	TCG	2	6	320374	320379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
5126	NC_004041	GCC	2	6	320393	320398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
5127	NC_004041	GGT	2	6	320422	320427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255388
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5130	NC_004041	CCG	2	6	320679	320684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
5131	NC_004041	TTC	2	6	320745	320750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	89255388
5132	NC_004041	CGA	2	6	320785	320790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255388
5133	NC_004041	GGA	2	6	320817	320822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255388
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5137	NC_004041	TGC	2	6	320955	320960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255388
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5139	NC_004041	GTAC	2	8	321032	321039	25 %	25 %	25 %	25 %	89255388
5140	NC_004041	CAT	2	6	321098	321103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255388
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5146	NC_004041	GACC	2	8	321308	321315	25 %	0 %	25 %	50 %	89255388
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5154	NC_004041	CCG	2	6	321493	321498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255388
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5229	NC_004041	CAT	2	6	327146	327151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492661
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5231	NC_004041	AG	3	6	327276	327281	50 %	0 %	50 %	0 %	21492661
5232	NC_004041	AAGC	2	8	327639	327646	50 %	0 %	25 %	25 %	21492660
5233	NC_004041	CGG	2	6	327701	327706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492660
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5235	NC_004041	CGACC	2	10	327745	327754	20 %	0 %	20 %	60 %	21492660
5236	NC_004041	T	6	6	327766	327771	0 %	100 %	0 %	0 %	21492660
5237	NC_004041	CA	3	6	327802	327807	50 %	0 %	0 %	50 %	21492660
5238	NC_004041	GCA	3	9	327827	327835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492660
5239	NC_004041	GAT	2	6	327978	327983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492660
5240	NC_004041	GAT	2	6	328266	328271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492659
5241	NC_004041	CTT	2	6	328312	328317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492659
5242	NC_004041	GCAG	2	8	328327	328334	25 %	0 %	50 %	25 %	21492659
5243	NC_004041	CGG	2	6	328338	328343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492659
5244	NC_004041	TAT	2	6	328482	328487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21492659
5245	NC_004041	TGT	2	6	328547	328552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	21492659
5246	NC_004041	GACGA	2	10	328618	328627	40 %	0 %	40 %	20 %	21492659
5247	NC_004041	AGC	2	6	328643	328648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492659
5248	NC_004041	GAA	2	6	328656	328661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492659
5249	NC_004041	GAT	2	6	328672	328677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492659
5250	NC_004041	GCG	2	6	328698	328703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492659
5251	NC_004041	ACT	2	6	328742	328747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492659
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5253	NC_004041	GGGC	2	8	328770	328777	0 %	0 %	75 %	25 %	21492659
5254	NC_004041	ACG	2	6	328783	328788	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492659
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5259	NC_004041	ATA	2	6	329099	329104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	21492659
5260	NC_004041	ACC	2	6	329129	329134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492659
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5262	NC_004041	ATT	2	6	329473	329478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	21493005
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5274	NC_004041	CATC	2	8	330167	330174	25 %	25 %	0 %	50 %	89255389
5275	NC_004041	GAC	2	6	330201	330206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255389
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5282	NC_004041	GCT	2	6	330622	330627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255389
5283	NC_004041	ATTGA	2	10	330795	330804	40 %	40 %	20 %	0 %	21493003
5284	NC_004041	T	7	7	330821	330827	0 %	100 %	0 %	0 %	21493003
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5320	NC_004041	GTC	2	6	333725	333730	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21493002
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5339	NC_004041	TGCGA	2	10	334601	334610	20 %	20 %	40 %	20 %	89255390
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5351	NC_004041	ATCT	2	8	334838	334845	25 %	50 %	0 %	25 %	89255390
5352	NC_004041	GC	3	6	334852	334857	0 %	0 %	50 %	50 %	89255390
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5359	NC_004041	GAAC	2	8	335146	335153	50 %	0 %	25 %	25 %	89255390
5360	NC_004041	GGAGC	2	10	335192	335201	20 %	0 %	60 %	20 %	89255390
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5362	NC_004041	GGCT	2	8	335226	335233	0 %	25 %	50 %	25 %	89255390
5363	NC_004041	GCC	2	6	335250	335255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255390
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5491	NC_004041	GTA	2	6	344195	344200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255397
5492	NC_004041	TCC	2	6	344211	344216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	89255397
5493	NC_004041	CG	3	6	344377	344382	0 %	0 %	50 %	50 %	89255397
5494	NC_004041	ACC	2	6	344526	344531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	89255397
5495	NC_004041	CGT	2	6	344593	344598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255397
5496	NC_004041	C	6	6	344644	344649	0 %	0 %	0 %	100 %	89255397
5497	NC_004041	ACG	2	6	344798	344803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255397
5498	NC_004041	GTG	2	6	344840	344845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	89255397
5499	NC_004041	GATC	2	8	344850	344857	25 %	25 %	25 %	25 %	89255397
5500	NC_004041	GCA	2	6	344903	344908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255397

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