MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rhizobium etli CFN 42 symbiotic plasmid p42d

Total Repeats: 5892

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_004041	GCG	2	6	280380	280385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255376
4502	NC_004041	AATG	2	8	280391	280398	50 %	25 %	25 %	0 %	89255376
4503	NC_004041	TCG	2	6	280443	280448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255376
4504	NC_004041	G	6	6	281394	281399	0 %	0 %	100 %	0 %	21492705
4505	NC_004041	CCA	2	6	281410	281415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492705
4506	NC_004041	AGA	2	6	281455	281460	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492705
4507	NC_004041	TCG	2	6	281467	281472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492705
4508	NC_004041	CGG	2	6	281627	281632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492705
4509	NC_004041	GCG	2	6	281662	281667	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492705
4510	NC_004041	TCA	2	6	281668	281673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492705
4511	NC_004041	GAT	2	6	281822	281827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492705
4512	NC_004041	GCC	2	6	281838	281843	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492705
4513	NC_004041	AAC	2	6	281844	281849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492705
4514	NC_004041	CGG	2	6	281882	281887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492705
4515	NC_004041	CGG	2	6	281897	281902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492705
4516	NC_004041	GCTG	2	8	281954	281961	0 %	25 %	50 %	25 %	21492705
4517	NC_004041	ACA	2	6	282001	282006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	21492705
4518	NC_004041	TGC	2	6	282163	282168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492705
4519	NC_004041	CAT	2	6	282179	282184	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492705
4520	NC_004041	CGA	2	6	282191	282196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492705
4521	NC_004041	GGT	2	6	282233	282238	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	21492705
4522	NC_004041	GC	3	6	282647	282652	0 %	0 %	50 %	50 %	89255377
4523	NC_004041	CGT	2	6	282655	282660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255377
4524	NC_004041	CAA	2	6	282718	282723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255377
4525	NC_004041	TGA	2	6	282788	282793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255377
4526	NC_004041	CATTC	2	10	282815	282824	20 %	40 %	0 %	40 %	89255377
4527	NC_004041	TCG	2	6	282869	282874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255377
4528	NC_004041	TGC	2	6	282904	282909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255377
4529	NC_004041	GGC	2	6	282975	282980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	89255377
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4531	NC_004041	AGAA	2	8	283121	283128	75 %	0 %	25 %	0 %	89255377
4532	NC_004041	CGT	2	6	283172	283177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255377
4533	NC_004041	TGA	2	6	283216	283221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	89255377
4534	NC_004041	CCG	2	6	283222	283227	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	89255377
4535	NC_004041	A	6	6	283391	283396	100 %	0 %	0 %	0 %	89255377
4536	NC_004041	TTGA	2	8	283404	283411	25 %	50 %	25 %	0 %	89255377
4537	NC_004041	CAG	2	6	283414	283419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255377
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4539	NC_004041	GCA	2	6	283479	283484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255377
4540	NC_004041	TTTGC	2	10	283512	283521	0 %	60 %	20 %	20 %	89255377
4541	NC_004041	AG	3	6	283546	283551	50 %	0 %	50 %	0 %	89255377
4542	NC_004041	GTC	2	6	283555	283560	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255377
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4544	NC_004041	ATC	2	6	283761	283766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	89255377
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4547	NC_004041	GGA	2	6	284002	284007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492703
4548	NC_004041	TCG	2	6	284039	284044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492703
4549	NC_004041	AGG	2	6	284056	284061	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492703
4550	NC_004041	ATCG	2	8	284087	284094	25 %	25 %	25 %	25 %	21492703
4551	NC_004041	CCG	2	6	284168	284173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492703
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4553	NC_004041	GC	4	8	284222	284229	0 %	0 %	50 %	50 %	21492703
4554	NC_004041	CCA	2	6	284294	284299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	21492703
4555	NC_004041	GGC	2	6	284319	284324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492703
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4557	NC_004041	TCG	2	6	284633	284638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492702
4558	NC_004041	CTT	2	6	284698	284703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	21492702
4559	NC_004041	GCG	2	6	284753	284758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492702
4560	NC_004041	CCG	2	6	284774	284779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492702
4561	NC_004041	GCC	2	6	284795	284800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492702
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4564	NC_004041	AAG	2	6	285058	285063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	21492702
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4567	NC_004041	CTGC	2	8	285353	285360	0 %	25 %	25 %	50 %	89255378
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4582	NC_004041	GGCTT	2	10	286270	286279	0 %	40 %	40 %	20 %	21492700
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4605	NC_004041	CTTT	2	8	287713	287720	0 %	75 %	0 %	25 %	89255380
4606	NC_004041	GCT	2	6	287794	287799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	89255380
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4609	NC_004041	GCA	3	9	288013	288021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255380
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4612	NC_004041	GAC	2	6	288182	288187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	89255380
4613	NC_004041	GCTG	2	8	288215	288222	0 %	25 %	50 %	25 %	89255380
4614	NC_004041	GAAG	2	8	288320	288327	50 %	0 %	50 %	0 %	89255380
4615	NC_004041	GGA	3	9	288331	288339	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255380
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4620	NC_004041	GGA	3	9	288580	288588	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	89255380
4621	NC_004041	T	6	6	288599	288604	0 %	100 %	0 %	0 %	89255380
4622	NC_004041	CACG	2	8	288691	288698	25 %	0 %	25 %	50 %	89255380
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4624	NC_004041	AAC	3	9	288815	288823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	89255380
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4747	NC_004041	CGA	2	6	297605	297610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492688
4748	NC_004041	CG	3	6	297621	297626	0 %	0 %	50 %	50 %	21492688
4749	NC_004041	TCC	2	6	297703	297708	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	21492688
4750	NC_004041	GTA	2	6	297712	297717	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492688
4751	NC_004041	GATCA	2	10	297736	297745	40 %	20 %	20 %	20 %	21492688
4752	NC_004041	G	6	6	297876	297881	0 %	0 %	100 %	0 %	21492688
4753	NC_004041	ACGCTC	2	12	297976	297987	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	21492688
4754	NC_004041	TCG	2	6	298097	298102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492687
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4757	NC_004041	GTGC	2	8	298193	298200	0 %	25 %	50 %	25 %	21492687
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4764	NC_004041	AGC	2	6	298478	298483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492687
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4766	NC_004041	GCA	2	6	298536	298541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492687
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4768	NC_004041	GCCT	2	8	298669	298676	0 %	25 %	25 %	50 %	21492687
4769	NC_004041	AGC	2	6	298757	298762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492687
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4771	NC_004041	GCA	3	9	298801	298809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492687
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4773	NC_004041	AGCC	2	8	298855	298862	25 %	0 %	25 %	50 %	21492687
4774	NC_004041	TGA	2	6	298974	298979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	21492687
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4777	NC_004041	CG	3	6	299111	299116	0 %	0 %	50 %	50 %	21492687
4778	NC_004041	TCA	2	6	299162	299167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	21492687
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4781	NC_004041	GA	3	6	299369	299374	50 %	0 %	50 %	0 %	21492687
4782	NC_004041	AGCG	2	8	299448	299455	25 %	0 %	50 %	25 %	21492686
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4787	NC_004041	GCA	2	6	299605	299610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492686
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4991	NC_004041	CGT	2	6	310214	310219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492675
4992	NC_004041	CGC	2	6	310225	310230	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492675
4993	NC_004041	CGG	2	6	310283	310288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	21492674
4994	NC_004041	TGCT	2	8	310303	310310	0 %	50 %	25 %	25 %	21492674
4995	NC_004041	CGA	2	6	310340	310345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	21492674
4996	NC_004041	AGG	2	6	310363	310368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	21492674
4997	NC_004041	TCACC	2	10	310416	310425	20 %	20 %	0 %	60 %	21492673
4998	NC_004041	CGT	2	6	310438	310443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492673
4999	NC_004041	GCC	2	6	310572	310577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	21492673
5000	NC_004041	GTC	2	6	310634	310639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	21492673

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