MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_003911	GCG	2	6	173528	173533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695081
3502	NC_003911	GCC	2	6	173596	173601	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695081
3503	NC_003911	CGC	2	6	173610	173615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695081
3504	NC_003911	CAG	3	9	173678	173686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3505	NC_003911	CTG	2	6	173703	173708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3506	NC_003911	CCA	2	6	173710	173715	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695081
3507	NC_003911	GAT	2	6	173849	173854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695081
3508	NC_003911	TCG	2	6	173880	173885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3509	NC_003911	CG	3	6	173884	173889	0 %	0 %	50 %	50 %	56695081
3510	NC_003911	CAG	2	6	173936	173941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3511	NC_003911	CAG	2	6	173946	173951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3512	NC_003911	GGT	2	6	173972	173977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695081
3513	NC_003911	CCT	2	6	174052	174057	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695081
3514	NC_003911	GGTGA	2	10	174111	174120	20 %	20 %	60 %	0 %	56695081
3515	NC_003911	AGC	2	6	174174	174179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3516	NC_003911	GCGCTT	2	12	174236	174247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695081
3517	NC_003911	ACA	2	6	174382	174387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695082
3518	NC_003911	GA	4	8	174461	174468	50 %	0 %	50 %	0 %	56695082
3519	NC_003911	TGC	2	6	174510	174515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3520	NC_003911	ACC	2	6	174524	174529	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695082
3521	NC_003911	CGG	2	6	174607	174612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3522	NC_003911	GTC	2	6	174650	174655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3523	NC_003911	TGC	2	6	174822	174827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3524	NC_003911	GGTCA	2	10	174849	174858	20 %	20 %	40 %	20 %	56695082
3525	NC_003911	GCTCG	2	10	174874	174883	0 %	20 %	40 %	40 %	56695082
3526	NC_003911	GCT	2	6	174934	174939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3527	NC_003911	GGC	2	6	174940	174945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3528	NC_003911	TCG	2	6	175038	175043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3529	NC_003911	GGC	2	6	175044	175049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3530	NC_003911	CTG	2	6	175064	175069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3531	NC_003911	CTGG	2	8	175087	175094	0 %	25 %	50 %	25 %	56695082
3532	NC_003911	CGC	2	6	175164	175169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695082
3533	NC_003911	CG	3	6	175186	175191	0 %	0 %	50 %	50 %	56695082
3534	NC_003911	CTG	2	6	175286	175291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3535	NC_003911	CCG	2	6	175362	175367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695082
3536	NC_003911	CG	3	6	175374	175379	0 %	0 %	50 %	50 %	56695082
3537	NC_003911	ACG	2	6	175398	175403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3538	NC_003911	GTG	2	6	175451	175456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695082
3539	NC_003911	CGG	2	6	175554	175559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3540	NC_003911	CG	3	6	175632	175637	0 %	0 %	50 %	50 %	56695082
3541	NC_003911	GGC	2	6	175666	175671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3542	NC_003911	GGC	3	9	175676	175684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3543	NC_003911	GAC	2	6	175687	175692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695082
3544	NC_003911	CG	3	6	175902	175907	0 %	0 %	50 %	50 %	56695082
3545	NC_003911	CGG	2	6	175924	175929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695082
3546	NC_003911	CGC	2	6	175966	175971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695082
3547	NC_003911	GAA	2	6	177002	177007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695083
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3549	NC_003911	GC	3	6	177117	177122	0 %	0 %	50 %	50 %	56695083
3550	NC_003911	GCCTTG	2	12	177128	177139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695083
3551	NC_003911	CCCG	2	8	177171	177178	0 %	0 %	25 %	75 %	56695083
3552	NC_003911	GC	4	8	177198	177205	0 %	0 %	50 %	50 %	56695083
3553	NC_003911	GAG	2	6	177253	177258	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695083
3554	NC_003911	CGA	2	6	177308	177313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695083
3555	NC_003911	TGCC	2	8	177339	177346	0 %	25 %	25 %	50 %	56695083
3556	NC_003911	CGG	2	6	177347	177352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3557	NC_003911	GCG	2	6	177377	177382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3558	NC_003911	GGC	3	9	177384	177392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3559	NC_003911	GC	3	6	177391	177396	0 %	0 %	50 %	50 %	56695083
3560	NC_003911	ATCC	2	8	177403	177410	25 %	25 %	0 %	50 %	56695083
3561	NC_003911	GCAT	2	8	177413	177420	25 %	25 %	25 %	25 %	56695083
3562	NC_003911	CTG	2	6	177432	177437	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695083
3563	NC_003911	TGA	2	6	177443	177448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695083
3564	NC_003911	CGG	2	6	177519	177524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3565	NC_003911	TTG	2	6	177562	177567	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695083
3566	NC_003911	CG	3	6	177719	177724	0 %	0 %	50 %	50 %	56695083
3567	NC_003911	GCTGT	2	10	177733	177742	0 %	40 %	40 %	20 %	56695083
3568	NC_003911	CGA	2	6	177831	177836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695083
3569	NC_003911	ACT	2	6	177845	177850	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695083
3570	NC_003911	GCG	2	6	177853	177858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3571	NC_003911	CCAT	2	8	177899	177906	25 %	25 %	0 %	50 %	56695083
3572	NC_003911	GAAC	2	8	177954	177961	50 %	0 %	25 %	25 %	56695083
3573	NC_003911	CGGCG	2	10	177976	177985	0 %	0 %	60 %	40 %	56695083
3574	NC_003911	GCC	2	6	178033	178038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695083
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3576	NC_003911	GCG	2	6	178173	178178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695083
3577	NC_003911	AAG	2	6	178285	178290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695083
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3579	NC_003911	GATCA	2	10	178306	178315	40 %	20 %	20 %	20 %	56695083
3580	NC_003911	CAT	2	6	178365	178370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695083
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3582	NC_003911	AAG	2	6	178399	178404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695083
3583	NC_003911	CGC	2	6	178411	178416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695083
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3586	NC_003911	TTG	2	6	178663	178668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695084
3587	NC_003911	CCG	2	6	178687	178692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695084
3588	NC_003911	CCG	2	6	178732	178737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695084
3589	NC_003911	AGC	2	6	178909	178914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695084
3590	NC_003911	CGCA	2	8	178947	178954	25 %	0 %	25 %	50 %	56695084
3591	NC_003911	CGG	2	6	179024	179029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695084
3592	NC_003911	GCG	2	6	179038	179043	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695084
3593	NC_003911	ACC	2	6	179062	179067	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695084
3594	NC_003911	TCG	2	6	179125	179130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695084
3595	NC_003911	GCAT	2	8	179144	179151	25 %	25 %	25 %	25 %	56695084
3596	NC_003911	TGG	2	6	179513	179518	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695085
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3598	NC_003911	CGGCC	2	10	179800	179809	0 %	0 %	40 %	60 %	56695085
3599	NC_003911	GGT	2	6	179811	179816	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695085
3600	NC_003911	ATC	2	6	179872	179877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695085
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3602	NC_003911	TAT	2	6	179917	179922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56695085
3603	NC_003911	GCA	2	6	179927	179932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695085
3604	NC_003911	GTGCTG	2	12	180050	180061	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695086
3605	NC_003911	GCT	2	6	180076	180081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695086
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3607	NC_003911	CTG	2	6	180170	180175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695086
3608	NC_003911	GCG	2	6	180188	180193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695086
3609	NC_003911	GC	3	6	180200	180205	0 %	0 %	50 %	50 %	56695086
3610	NC_003911	AGGGC	2	10	180211	180220	20 %	0 %	60 %	20 %	56695086
3611	NC_003911	CAG	2	6	180227	180232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695086
3612	NC_003911	TGC	2	6	180276	180281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695086
3613	NC_003911	GC	3	6	180302	180307	0 %	0 %	50 %	50 %	56695086
3614	NC_003911	ATC	2	6	180371	180376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695086
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3621	NC_003911	CGG	2	6	180624	180629	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695086
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3623	NC_003911	TGG	3	9	180690	180698	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695086
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3988	NC_003911	CATT	2	8	196528	196535	25 %	50 %	0 %	25 %	56695100
3989	NC_003911	GCCCA	2	10	196622	196631	20 %	0 %	20 %	60 %	56695100
3990	NC_003911	TGC	2	6	196690	196695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695100
3991	NC_003911	TGACC	2	10	196738	196747	20 %	20 %	20 %	40 %	56695100
3992	NC_003911	CAG	2	6	196748	196753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695100
3993	NC_003911	CGG	2	6	196762	196767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695100
3994	NC_003911	TCG	2	6	196770	196775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695100
3995	NC_003911	CGCC	2	8	196792	196799	0 %	0 %	25 %	75 %	56695100
3996	NC_003911	CAC	2	6	196847	196852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695100
3997	NC_003911	GC	3	6	197002	197007	0 %	0 %	50 %	50 %	56695100
3998	NC_003911	CCG	3	9	197029	197037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695100
3999	NC_003911	CTG	2	6	197117	197122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695100
4000	NC_003911	CG	3	6	197144	197149	0 %	0 %	50 %	50 %	56695100

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