MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2005	NC_003911	CG	3	6	96809	96814	0 %	0 %	50 %	50 %	56695023
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2126	NC_003911	CGG	2	6	102765	102770	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695028
2127	NC_003911	ATC	2	6	102842	102847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695028
2128	NC_003911	GCA	2	6	102894	102899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695028
2129	NC_003911	GC	3	6	103086	103091	0 %	0 %	50 %	50 %	56695028
2130	NC_003911	GGC	2	6	103255	103260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
2131	NC_003911	GCC	2	6	103313	103318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695029
2132	NC_003911	GAT	2	6	103354	103359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695029
2133	NC_003911	GGT	2	6	103402	103407	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695029
2134	NC_003911	TGA	2	6	103575	103580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695029
2135	NC_003911	GAT	2	6	103618	103623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695029
2136	NC_003911	CGC	3	9	103626	103634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695029
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2138	NC_003911	CAG	2	6	103702	103707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695029
2139	NC_003911	GCCTTG	2	12	103709	103720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695029
2140	NC_003911	GAT	2	6	103822	103827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695029
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2143	NC_003911	CAT	2	6	104020	104025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695029
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2145	NC_003911	GGC	2	6	104035	104040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
2146	NC_003911	GCTG	2	8	104081	104088	0 %	25 %	50 %	25 %	56695029
2147	NC_003911	GGCGCG	2	12	104353	104364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
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2150	NC_003911	GCG	3	9	104567	104575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
2151	NC_003911	GCG	2	6	104592	104597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
2152	NC_003911	GGC	2	6	104638	104643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695029
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2154	NC_003911	CG	4	8	104925	104932	0 %	0 %	50 %	50 %	56695030
2155	NC_003911	GATG	2	8	104990	104997	25 %	25 %	50 %	0 %	56695030
2156	NC_003911	TGG	2	6	105016	105021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695030
2157	NC_003911	TGC	2	6	105040	105045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695030
2158	NC_003911	GAT	3	9	105080	105088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695030
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2161	NC_003911	GAG	2	6	105162	105167	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695030
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2163	NC_003911	CGC	2	6	105316	105321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695030
2164	NC_003911	CGA	2	6	105362	105367	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695030
2165	NC_003911	CG	3	6	105396	105401	0 %	0 %	50 %	50 %	56695030
2166	NC_003911	TGG	2	6	105532	105537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695030
2167	NC_003911	TGA	2	6	105539	105544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695030
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2178	NC_003911	CGG	2	6	105846	105851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695031
2179	NC_003911	GTG	3	9	105872	105880	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695031
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2230	NC_003911	CAGG	2	8	108000	108007	25 %	0 %	50 %	25 %	56695032
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2236	NC_003911	GC	3	6	108158	108163	0 %	0 %	50 %	50 %	56695033
2237	NC_003911	TCG	2	6	108252	108257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695033
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2239	NC_003911	GCA	2	6	108289	108294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695033
2240	NC_003911	CGC	2	6	108307	108312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695033
2241	NC_003911	TGGCC	2	10	108322	108331	0 %	20 %	40 %	40 %	56695033
2242	NC_003911	CGG	2	6	108334	108339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695033
2243	NC_003911	GCC	2	6	108369	108374	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695033
2244	NC_003911	CAG	2	6	108401	108406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695033
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2246	NC_003911	CCCG	2	8	108506	108513	0 %	0 %	25 %	75 %	56695033
2247	NC_003911	ACC	2	6	108558	108563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695033
2248	NC_003911	CGG	2	6	108643	108648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695033
2249	NC_003911	TTC	2	6	108666	108671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695033
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2251	NC_003911	GTC	2	6	108770	108775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695033
2252	NC_003911	ATC	2	6	108783	108788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695033
2253	NC_003911	GCC	2	6	108797	108802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695033
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2261	NC_003911	GCA	2	6	109273	109278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695033
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2279	NC_003911	TCG	2	6	110332	110337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695035
2280	NC_003911	CG	3	6	110408	110413	0 %	0 %	50 %	50 %	56695035
2281	NC_003911	GCC	2	6	110462	110467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695035
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2322	NC_003911	GCG	2	6	112091	112096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695035
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2336	NC_003911	CGT	2	6	113346	113351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695036
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2339	NC_003911	CAG	2	6	113433	113438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2340	NC_003911	ACG	2	6	113533	113538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
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2343	NC_003911	ACAG	2	8	113692	113699	50 %	0 %	25 %	25 %	56695036
2344	NC_003911	TGT	2	6	113708	113713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695036
2345	NC_003911	TGA	2	6	113714	113719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695036
2346	NC_003911	GAC	2	6	113775	113780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2347	NC_003911	GTC	2	6	113808	113813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2348	NC_003911	GAT	2	6	113844	113849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695036
2349	NC_003911	CTG	2	6	113850	113855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2350	NC_003911	TCA	2	6	113993	113998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695036
2351	NC_003911	CAG	2	6	114183	114188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695036
2352	NC_003911	CATGT	2	10	114264	114273	20 %	40 %	20 %	20 %	56695036
2353	NC_003911	CAAGG	2	10	114286	114295	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
2354	NC_003911	CTG	2	6	114397	114402	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2355	NC_003911	GCC	2	6	114439	114444	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2356	NC_003911	CGG	2	6	114513	114518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695037
2357	NC_003911	TGCG	2	8	114536	114543	0 %	25 %	50 %	25 %	56695037
2358	NC_003911	AC	3	6	114561	114566	50 %	0 %	0 %	50 %	56695037
2359	NC_003911	GAT	2	6	114661	114666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695037
2360	NC_003911	GCT	2	6	114708	114713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2361	NC_003911	CGC	2	6	114799	114804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
2362	NC_003911	CAT	2	6	114805	114810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695037
2363	NC_003911	CAGCAT	2	12	114826	114837	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	56695037
2364	NC_003911	GCA	2	6	115059	115064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695037
2365	NC_003911	CGG	2	6	115081	115086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695037
2366	NC_003911	AAGGC	2	10	115316	115325	40 %	0 %	40 %	20 %	56695037
2367	NC_003911	TCGA	2	8	115346	115353	25 %	25 %	25 %	25 %	56695037
2368	NC_003911	GC	3	6	115360	115365	0 %	0 %	50 %	50 %	56695037
2369	NC_003911	TGCC	2	8	115464	115471	0 %	25 %	25 %	50 %	56695037
2370	NC_003911	CTT	2	6	115497	115502	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695037
2371	NC_003911	CGC	2	6	115597	115602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695037
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2373	NC_003911	CG	3	6	115647	115652	0 %	0 %	50 %	50 %	56695037
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2439	NC_003911	GACCT	2	10	119812	119821	20 %	20 %	20 %	40 %	56695039
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2492	NC_003911	CGC	2	6	122706	122711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695043
2493	NC_003911	TGGC	2	8	122749	122756	0 %	25 %	50 %	25 %	56695043
2494	NC_003911	CG	3	6	122764	122769	0 %	0 %	50 %	50 %	56695043
2495	NC_003911	AGA	2	6	122773	122778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695043
2496	NC_003911	TCG	2	6	122837	122842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695043
2497	NC_003911	AAC	2	6	122867	122872	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695043
2498	NC_003911	TGC	2	6	122910	122915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695043
2499	NC_003911	ATC	2	6	123101	123106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695043
2500	NC_003911	GAA	2	6	123174	123179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695043

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