MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1002	NC_003911	CCCGCC	2	12	47399	47410	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	56694974
1003	NC_003911	GC	3	6	47447	47452	0 %	0 %	50 %	50 %	56694974
1004	NC_003911	TGC	2	6	47457	47462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694974
1005	NC_003911	GCG	2	6	47472	47477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694974
1006	NC_003911	GC	3	6	47639	47644	0 %	0 %	50 %	50 %	56694974
1007	NC_003911	GCT	2	6	47656	47661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694974
1008	NC_003911	GCC	2	6	47666	47671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694974
1009	NC_003911	CGG	2	6	47762	47767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694974
1010	NC_003911	CTG	2	6	47813	47818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694974
1011	NC_003911	CTG	2	6	47940	47945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56698725
1012	NC_003911	GC	3	6	48083	48088	0 %	0 %	50 %	50 %	56694975
1013	NC_003911	GCG	2	6	48206	48211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694975
1014	NC_003911	GAT	2	6	48242	48247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694975
1015	NC_003911	ACC	2	6	48312	48317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694975
1016	NC_003911	GC	3	6	48327	48332	0 %	0 %	50 %	50 %	56694975
1017	NC_003911	GC	3	6	48420	48425	0 %	0 %	50 %	50 %	56694975
1018	NC_003911	GAC	2	6	48468	48473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694975
1019	NC_003911	TCG	2	6	48478	48483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694975
1020	NC_003911	GCT	2	6	48491	48496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694975
1021	NC_003911	GGC	2	6	48497	48502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694975
1022	NC_003911	GC	3	6	48529	48534	0 %	0 %	50 %	50 %	56694975
1023	NC_003911	AAC	2	6	48558	48563	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694975
1024	NC_003911	TGCGC	2	10	48569	48578	0 %	20 %	40 %	40 %	56694975
1025	NC_003911	GCC	2	6	48645	48650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694975
1026	NC_003911	CCG	2	6	48691	48696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694975
1027	NC_003911	GC	4	8	48726	48733	0 %	0 %	50 %	50 %	56694975
1028	NC_003911	TGC	2	6	48897	48902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694976
1029	NC_003911	CG	4	8	48976	48983	0 %	0 %	50 %	50 %	56694976
1030	NC_003911	CG	3	6	48992	48997	0 %	0 %	50 %	50 %	56694976
1031	NC_003911	TCA	2	6	49014	49019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694976
1032	NC_003911	GCC	2	6	49034	49039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694976
1033	NC_003911	AAG	2	6	49074	49079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694976
1034	NC_003911	ATGACG	2	12	49143	49154	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	56694976
1035	NC_003911	CG	3	6	49254	49259	0 %	0 %	50 %	50 %	56694976
1036	NC_003911	GC	3	6	49274	49279	0 %	0 %	50 %	50 %	56694976
1037	NC_003911	CGG	2	6	49306	49311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694976
1038	NC_003911	GTC	2	6	49367	49372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694976
1039	NC_003911	GAT	2	6	49455	49460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694977
1040	NC_003911	GGCA	2	8	49484	49491	25 %	0 %	50 %	25 %	56694977
1041	NC_003911	TGG	2	6	49514	49519	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694977
1042	NC_003911	GCT	2	6	49554	49559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694977
1043	NC_003911	GGGC	2	8	49657	49664	0 %	0 %	75 %	25 %	56694977
1044	NC_003911	GC	3	6	49694	49699	0 %	0 %	50 %	50 %	56694977
1045	NC_003911	CGG	2	6	49893	49898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694977
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1047	NC_003911	GC	3	6	49923	49928	0 %	0 %	50 %	50 %	56694977
1048	NC_003911	GCA	2	6	49954	49959	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694977
1049	NC_003911	GC	3	6	50123	50128	0 %	0 %	50 %	50 %	56694977
1050	NC_003911	TCG	2	6	50189	50194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694977
1051	NC_003911	CCGC	2	8	50237	50244	0 %	0 %	25 %	75 %	56694977
1052	NC_003911	GGCT	2	8	50294	50301	0 %	25 %	50 %	25 %	56694977
1053	NC_003911	CT	3	6	50300	50305	0 %	50 %	0 %	50 %	56694977
1054	NC_003911	GCC	2	6	50386	50391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694977
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1056	NC_003911	GCT	2	6	50440	50445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694978
1057	NC_003911	GCC	2	6	50447	50452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694978
1058	NC_003911	CGCC	2	8	50454	50461	0 %	0 %	25 %	75 %	56694978
1059	NC_003911	CTG	2	6	50483	50488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694978
1060	NC_003911	TCA	2	6	50499	50504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694978
1061	NC_003911	ATC	2	6	50522	50527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694978
1062	NC_003911	CCG	2	6	50586	50591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694978
1063	NC_003911	CGC	2	6	50604	50609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694978
1064	NC_003911	C	6	6	50718	50723	0 %	0 %	0 %	100 %	56694978
1065	NC_003911	CTGC	2	8	50728	50735	0 %	25 %	25 %	50 %	56694978
1066	NC_003911	CGCC	2	8	50763	50770	0 %	0 %	25 %	75 %	56694978
1067	NC_003911	AAG	2	6	50783	50788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694978
1068	NC_003911	GAT	2	6	50872	50877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694978
1069	NC_003911	TCTCGC	2	12	50889	50900	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56694978
1070	NC_003911	TGA	2	6	50907	50912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694978
1071	NC_003911	GAA	2	6	51008	51013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56694978
1072	NC_003911	GGAT	2	8	51060	51067	25 %	25 %	50 %	0 %	56694978
1073	NC_003911	CG	3	6	51079	51084	0 %	0 %	50 %	50 %	56694978
1074	NC_003911	CAA	2	6	51124	51129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56694978
1075	NC_003911	GCAA	2	8	51133	51140	50 %	0 %	25 %	25 %	56694978
1076	NC_003911	TCT	2	6	51150	51155	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56694978
1077	NC_003911	GC	3	6	51193	51198	0 %	0 %	50 %	50 %	56694978
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1079	NC_003911	GAT	2	6	51292	51297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694978
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1082	NC_003911	GGC	2	6	51390	51395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694979
1083	NC_003911	GC	3	6	51460	51465	0 %	0 %	50 %	50 %	56694979
1084	NC_003911	GCC	2	6	51571	51576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694979
1085	NC_003911	TGG	2	6	51596	51601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694979
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1087	NC_003911	GGC	2	6	51636	51641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694979
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1089	NC_003911	CTG	2	6	51745	51750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694979
1090	NC_003911	GCG	2	6	51751	51756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694979
1091	NC_003911	GC	3	6	51791	51796	0 %	0 %	50 %	50 %	56694979
1092	NC_003911	CCA	2	6	51812	51817	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56694979
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1096	NC_003911	G	7	7	52133	52139	0 %	0 %	100 %	0 %	56694980
1097	NC_003911	TGC	2	6	52162	52167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
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1099	NC_003911	TTG	2	6	52275	52280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56694980
1100	NC_003911	GC	3	6	52315	52320	0 %	0 %	50 %	50 %	56694980
1101	NC_003911	GAC	2	6	52356	52361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1102	NC_003911	CTG	2	6	52362	52367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1103	NC_003911	CGC	2	6	52391	52396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694980
1104	NC_003911	GGA	2	6	52460	52465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56694980
1105	NC_003911	TGC	2	6	52477	52482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1106	NC_003911	GCC	2	6	52539	52544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694980
1107	NC_003911	TGC	2	6	52567	52572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1108	NC_003911	TGA	2	6	52624	52629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56694980
1109	NC_003911	CCG	2	6	52630	52635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694980
1110	NC_003911	GCC	2	6	52655	52660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694980
1111	NC_003911	CG	4	8	52675	52682	0 %	0 %	50 %	50 %	56694980
1112	NC_003911	GCT	2	6	52718	52723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1113	NC_003911	TGC	2	6	52729	52734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56694980
1114	NC_003911	GGT	2	6	52807	52812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694981
1115	NC_003911	GACC	2	8	52819	52826	25 %	0 %	25 %	50 %	56694981
1116	NC_003911	TGG	2	6	52857	52862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694981
1117	NC_003911	TGG	2	6	52871	52876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56694981
1118	NC_003911	GCTG	2	8	52884	52891	0 %	25 %	50 %	25 %	56694981
1119	NC_003911	CGG	2	6	52905	52910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694981
1120	NC_003911	CG	3	6	52996	53001	0 %	0 %	50 %	50 %	56694981
1121	NC_003911	ATC	2	6	53120	53125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56694981
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1123	NC_003911	CG	4	8	53214	53221	0 %	0 %	50 %	50 %	56694981
1124	NC_003911	CGG	2	6	53244	53249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694981
1125	NC_003911	GGC	2	6	53281	53286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56694981
1126	NC_003911	CGGTG	2	10	53302	53311	0 %	20 %	60 %	20 %	56694981
1127	NC_003911	GTGG	2	8	53320	53327	0 %	25 %	75 %	0 %	56694981
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1129	NC_003911	CGC	2	6	53395	53400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56694981
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