MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_003911	TCA	2	6	299440	299445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695202
6002	NC_003911	GTC	2	6	299477	299482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695202
6003	NC_003911	CGG	2	6	299528	299533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695202
6004	NC_003911	CAG	2	6	299567	299572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
6005	NC_003911	CAC	2	6	299611	299616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695202
6006	NC_003911	GCC	2	6	299641	299646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695202
6007	NC_003911	CGG	2	6	299655	299660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695202
6008	NC_003911	GCC	2	6	299701	299706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695202
6009	NC_003911	CAG	2	6	299747	299752	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
6010	NC_003911	CAC	2	6	299780	299785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695202
6011	NC_003911	CAG	2	6	299786	299791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
6012	NC_003911	CTT	2	6	299843	299848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695202
6013	NC_003911	TCA	2	6	299875	299880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695202
6014	NC_003911	CGG	2	6	300049	300054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695202
6015	NC_003911	CTG	2	6	300882	300887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6016	NC_003911	CCGCG	2	10	300961	300970	0 %	0 %	40 %	60 %	56695203
6017	NC_003911	CCCG	2	8	300971	300978	0 %	0 %	25 %	75 %	56695203
6018	NC_003911	CGC	2	6	300999	301004	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695203
6019	NC_003911	GCCC	2	8	301013	301020	0 %	0 %	25 %	75 %	56695203
6020	NC_003911	CCGCG	2	10	301064	301073	0 %	0 %	40 %	60 %	56695203
6021	NC_003911	CG	5	10	301070	301079	0 %	0 %	50 %	50 %	56695203
6022	NC_003911	GCG	2	6	301141	301146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6023	NC_003911	GC	3	6	301180	301185	0 %	0 %	50 %	50 %	56695203
6024	NC_003911	TGA	2	6	301189	301194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695203
6025	NC_003911	CGA	2	6	301217	301222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6026	NC_003911	GGC	2	6	301234	301239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6027	NC_003911	CGGG	2	8	301247	301254	0 %	0 %	75 %	25 %	56695203
6028	NC_003911	GGC	2	6	301280	301285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6029	NC_003911	GGC	2	6	301336	301341	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695203
6030	NC_003911	ATG	2	6	301380	301385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695203
6031	NC_003911	GGTGCT	2	12	301427	301438	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695203
6032	NC_003911	TGC	2	6	301528	301533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6033	NC_003911	CTG	2	6	301554	301559	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6034	NC_003911	CTG	2	6	301596	301601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695203
6035	NC_003911	GA	3	6	301619	301624	50 %	0 %	50 %	0 %	56695203
6036	NC_003911	GC	4	8	301664	301671	0 %	0 %	50 %	50 %	56695204
6037	NC_003911	GCC	2	6	301676	301681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6038	NC_003911	CGC	2	6	301690	301695	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6039	NC_003911	ATT	2	6	301731	301736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56695204
6040	NC_003911	GGCGAT	2	12	301762	301773	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	56695204
6041	NC_003911	GCTGGT	2	12	301795	301806	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695204
6042	NC_003911	TGA	2	6	301828	301833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695204
6043	NC_003911	GC	3	6	301837	301842	0 %	0 %	50 %	50 %	56695204
6044	NC_003911	CGC	3	9	301840	301848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6045	NC_003911	TGC	2	6	301866	301871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695204
6046	NC_003911	GCC	2	6	301927	301932	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6047	NC_003911	TGACC	2	10	301957	301966	20 %	20 %	20 %	40 %	56695204
6048	NC_003911	GCG	2	6	301973	301978	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695204
6049	NC_003911	CGC	2	6	302028	302033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695204
6050	NC_003911	TCGG	2	8	302069	302076	0 %	25 %	50 %	25 %	56695204
6051	NC_003911	GTC	2	6	302183	302188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695204
6052	NC_003911	ATG	2	6	302299	302304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695205
6053	NC_003911	GC	3	6	302325	302330	0 %	0 %	50 %	50 %	56695205
6054	NC_003911	CG	4	8	302336	302343	0 %	0 %	50 %	50 %	56695205
6055	NC_003911	GCC	2	6	302350	302355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695205
6056	NC_003911	CGG	2	6	302369	302374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695205
6057	NC_003911	GCG	2	6	302416	302421	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695205
6058	NC_003911	GGGTCG	2	12	302459	302470	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	56695205
6059	NC_003911	CTG	2	6	302476	302481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695205
6060	NC_003911	TGGC	2	8	302482	302489	0 %	25 %	50 %	25 %	56695205
6061	NC_003911	GC	3	6	302495	302500	0 %	0 %	50 %	50 %	56695205
6062	NC_003911	CG	3	6	302541	302546	0 %	0 %	50 %	50 %	56695205
6063	NC_003911	GTG	2	6	302677	302682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695205
6064	NC_003911	TGG	2	6	302714	302719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695205
6065	NC_003911	CCG	2	6	302792	302797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695205
6066	NC_003911	CGCTG	2	10	302805	302814	0 %	20 %	40 %	40 %	56695205
6067	NC_003911	AG	3	6	302835	302840	50 %	0 %	50 %	0 %	56695205
6068	NC_003911	CGA	2	6	302863	302868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695206
6069	NC_003911	TCGA	2	8	302924	302931	25 %	25 %	25 %	25 %	56695206
6070	NC_003911	GGA	2	6	302932	302937	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695206
6071	NC_003911	CG	3	6	302968	302973	0 %	0 %	50 %	50 %	56695206
6072	NC_003911	CTG	2	6	302984	302989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695206
6073	NC_003911	CCG	2	6	302995	303000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695206
6074	NC_003911	CGA	2	6	303010	303015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695206
6075	NC_003911	GC	3	6	303016	303021	0 %	0 %	50 %	50 %	56695206
6076	NC_003911	ATC	2	6	303074	303079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695206
6077	NC_003911	CGG	2	6	303085	303090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695206
6078	NC_003911	CGG	2	6	303207	303212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695206
6079	NC_003911	CG	4	8	303219	303226	0 %	0 %	50 %	50 %	56695206
6080	NC_003911	G	6	6	303229	303234	0 %	0 %	100 %	0 %	56695206
6081	NC_003911	G	6	6	303241	303246	0 %	0 %	100 %	0 %	56695206
6082	NC_003911	AAT	2	6	303355	303360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	56695206
6083	NC_003911	CTG	2	6	303548	303553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695207
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6085	NC_003911	CG	3	6	303622	303627	0 %	0 %	50 %	50 %	56695207
6086	NC_003911	GC	3	6	303730	303735	0 %	0 %	50 %	50 %	56695207
6087	NC_003911	GGGC	2	8	303742	303749	0 %	0 %	75 %	25 %	56695207
6088	NC_003911	TCG	2	6	303774	303779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695207
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6090	NC_003911	CG	4	8	303851	303858	0 %	0 %	50 %	50 %	56695207
6091	NC_003911	GATG	2	8	303868	303875	25 %	25 %	50 %	0 %	56695207
6092	NC_003911	CCGAGG	2	12	303876	303887	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56695207
6093	NC_003911	GCC	2	6	303935	303940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695207
6094	NC_003911	GCA	2	6	303979	303984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695207
6095	NC_003911	GCC	4	12	304013	304024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695207
6096	NC_003911	CCG	2	6	304029	304034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695207
6097	NC_003911	GGCGC	2	10	304069	304078	0 %	0 %	60 %	40 %	56695207
6098	NC_003911	GC	3	6	304100	304105	0 %	0 %	50 %	50 %	56695207
6099	NC_003911	CTGA	2	8	304169	304176	25 %	25 %	25 %	25 %	56695207
6100	NC_003911	TGG	2	6	304239	304244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695207
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6104	NC_003911	GC	3	6	304356	304361	0 %	0 %	50 %	50 %	56695207
6105	NC_003911	GCG	3	9	304430	304438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695207
6106	NC_003911	CCG	2	6	304532	304537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695207
6107	NC_003911	CGG	2	6	304643	304648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695207
6108	NC_003911	GGT	2	6	304696	304701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695207
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6113	NC_003911	CCGGG	2	10	304933	304942	0 %	0 %	60 %	40 %	56695207
6114	NC_003911	GCG	2	6	304976	304981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
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6120	NC_003911	GCC	2	6	305291	305296	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695208
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6122	NC_003911	CCG	2	6	305362	305367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695208
6123	NC_003911	CGA	2	6	305443	305448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695208
6124	NC_003911	CAC	2	6	305485	305490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695208
6125	NC_003911	GGT	2	6	305518	305523	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
6126	NC_003911	CGG	2	6	305610	305615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
6127	NC_003911	GC	3	6	305636	305641	0 %	0 %	50 %	50 %	56695208
6128	NC_003911	GCA	2	6	305848	305853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695208
6129	NC_003911	GGT	2	6	305866	305871	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
6130	NC_003911	TGG	2	6	305991	305996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
6131	NC_003911	TGC	2	6	306000	306005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695208
6132	NC_003911	TGTTCC	2	12	306006	306017	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	56695208
6133	NC_003911	CG	3	6	306022	306027	0 %	0 %	50 %	50 %	56695208
6134	NC_003911	GGC	2	6	306043	306048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
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6137	NC_003911	ATC	2	6	306134	306139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695208
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6139	NC_003911	GTC	2	6	306170	306175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695208
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6142	NC_003911	CG	3	6	306241	306246	0 %	0 %	50 %	50 %	56695208
6143	NC_003911	ATC	2	6	306287	306292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695208
6144	NC_003911	GTG	2	6	306473	306478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
6145	NC_003911	GCTG	2	8	306492	306499	0 %	25 %	50 %	25 %	56695208
6146	NC_003911	GGT	2	6	306532	306537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695208
6147	NC_003911	GGC	2	6	306559	306564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
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6149	NC_003911	TCA	2	6	306600	306605	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695208
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6151	NC_003911	TCA	2	6	306666	306671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695208
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6153	NC_003911	GC	3	6	306724	306729	0 %	0 %	50 %	50 %	56695208
6154	NC_003911	GAG	2	6	306734	306739	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695208
6155	NC_003911	CGG	2	6	306802	306807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
6156	NC_003911	TCGA	2	8	306869	306876	25 %	25 %	25 %	25 %	56695208
6157	NC_003911	GCG	2	6	306999	307004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
6158	NC_003911	GGC	2	6	307051	307056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695208
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6166	NC_003911	CAGC	2	8	307375	307382	25 %	0 %	25 %	50 %	56695208
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6169	NC_003911	AGG	2	6	307563	307568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695208
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6202	NC_003911	GCG	2	6	308635	308640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695209
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6240	NC_003911	CCG	2	6	310889	310894	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695212
6241	NC_003911	CCG	2	6	310928	310933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695212
6242	NC_003911	GCG	2	6	310972	310977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695212
6243	NC_003911	CCGG	2	8	310979	310986	0 %	0 %	50 %	50 %	56695212
6244	NC_003911	AGC	2	6	310999	311004	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695212
6245	NC_003911	GC	3	6	311007	311012	0 %	0 %	50 %	50 %	56695212
6246	NC_003911	GGTGG	2	10	311013	311022	0 %	20 %	80 %	0 %	56695212
6247	NC_003911	CGG	2	6	311054	311059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695212
6248	NC_003911	GC	3	6	311086	311091	0 %	0 %	50 %	50 %	56695212
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6362	NC_003911	CAG	2	6	316381	316386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695216
6363	NC_003911	GCC	2	6	316415	316420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695216
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6365	NC_003911	ATGTCT	2	12	316437	316448	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	56695216
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6367	NC_003911	GAT	2	6	316480	316485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695216
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6371	NC_003911	CCG	2	6	316566	316571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695216
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6494	NC_003911	GC	3	6	322817	322822	0 %	0 %	50 %	50 %	56695225
6495	NC_003911	CGGGC	2	10	322858	322867	0 %	0 %	60 %	40 %	56695225
6496	NC_003911	CCTG	2	8	322892	322899	0 %	25 %	25 %	50 %	56695225
6497	NC_003911	GAA	2	6	322923	322928	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695225
6498	NC_003911	AGGC	2	8	322996	323003	25 %	0 %	50 %	25 %	56695225
6499	NC_003911	TGC	2	6	323029	323034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695225
6500	NC_003911	GCG	2	6	323042	323047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695225

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