MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_003911	CGC	2	6	274713	274718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695172
5502	NC_003911	GC	5	10	274753	274762	0 %	0 %	50 %	50 %	56695172
5503	NC_003911	GGC	2	6	274828	274833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695172
5504	NC_003911	GGC	3	9	274855	274863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695172
5505	NC_003911	GAT	2	6	274990	274995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695173
5506	NC_003911	GT	3	6	275023	275028	0 %	50 %	50 %	0 %	56695173
5507	NC_003911	GCG	2	6	275104	275109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695173
5508	NC_003911	CG	3	6	275144	275149	0 %	0 %	50 %	50 %	56695173
5509	NC_003911	ACC	3	9	275193	275201	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695173
5510	NC_003911	C	8	8	275242	275249	0 %	0 %	0 %	100 %	56695173
5511	NC_003911	CAG	2	6	275350	275355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695174
5512	NC_003911	CGG	2	6	275379	275384	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695174
5513	NC_003911	TTG	2	6	275408	275413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695174
5514	NC_003911	ACC	2	6	275414	275419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695174
5515	NC_003911	TGG	2	6	275420	275425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695174
5516	NC_003911	GTTC	2	8	275433	275440	0 %	50 %	25 %	25 %	56695174
5517	NC_003911	CGG	2	6	275574	275579	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695174
5518	NC_003911	GC	3	6	275624	275629	0 %	0 %	50 %	50 %	56695174
5519	NC_003911	CGG	2	6	275688	275693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695174
5520	NC_003911	TCAT	2	8	275720	275727	25 %	50 %	0 %	25 %	56695174
5521	NC_003911	CGG	3	9	275733	275741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695174
5522	NC_003911	GGC	3	9	275773	275781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695174
5523	NC_003911	CGT	2	6	276001	276006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695175
5524	NC_003911	CCG	2	6	276012	276017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695175
5525	NC_003911	CGG	2	6	276097	276102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695175
5526	NC_003911	GCAT	2	8	276316	276323	25 %	25 %	25 %	25 %	56695175
5527	NC_003911	GCC	2	6	276362	276367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695175
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5529	NC_003911	CTGG	2	8	276407	276414	0 %	25 %	50 %	25 %	56695175
5530	NC_003911	GCTG	2	8	276554	276561	0 %	25 %	50 %	25 %	56695175
5531	NC_003911	CGC	2	6	276686	276691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695175
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5533	NC_003911	GCG	2	6	276816	276821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695175
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5535	NC_003911	CGG	2	6	276859	276864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695175
5536	NC_003911	GCA	2	6	276872	276877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695175
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5538	NC_003911	CAAC	2	8	277004	277011	50 %	0 %	0 %	50 %	56695176
5539	NC_003911	TTCGT	2	10	277037	277046	0 %	60 %	20 %	20 %	56695176
5540	NC_003911	CGC	2	6	277170	277175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695176
5541	NC_003911	CTG	2	6	277189	277194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695176
5542	NC_003911	ACC	2	6	277199	277204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695176
5543	NC_003911	CTG	2	6	277276	277281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695176
5544	NC_003911	GTT	2	6	277317	277322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695176
5545	NC_003911	GTG	2	6	277345	277350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695176
5546	NC_003911	CTT	2	6	277578	277583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695177
5547	NC_003911	GGCG	2	8	277607	277614	0 %	0 %	75 %	25 %	56695177
5548	NC_003911	GCCGC	2	10	277654	277663	0 %	0 %	40 %	60 %	56695177
5549	NC_003911	ACCG	2	8	277737	277744	25 %	0 %	25 %	50 %	56695177
5550	NC_003911	TGA	2	6	277756	277761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695177
5551	NC_003911	CG	3	6	277793	277798	0 %	0 %	50 %	50 %	56695177
5552	NC_003911	CCG	2	6	277867	277872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695177
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5555	NC_003911	CCG	2	6	278005	278010	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695177
5556	NC_003911	CGA	3	9	278027	278035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695177
5557	NC_003911	GCA	2	6	278063	278068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695177
5558	NC_003911	GAA	2	6	278159	278164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695177
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5560	NC_003911	CGA	2	6	278177	278182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695177
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5562	NC_003911	CAA	2	6	278312	278317	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695177
5563	NC_003911	CGA	2	6	278345	278350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695177
5564	NC_003911	TGC	2	6	278377	278382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695177
5565	NC_003911	TGC	2	6	278390	278395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695177
5566	NC_003911	CGC	2	6	278416	278421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695177
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5571	NC_003911	AGGC	2	8	278686	278693	25 %	0 %	50 %	25 %	56695177
5572	NC_003911	TCA	2	6	278767	278772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695177
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5574	NC_003911	GGACC	2	10	278933	278942	20 %	0 %	40 %	40 %	56695177
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5577	NC_003911	GGTC	2	8	279100	279107	0 %	25 %	50 %	25 %	56695177
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5583	NC_003911	TGCAG	2	10	279455	279464	20 %	20 %	40 %	20 %	56695178
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5585	NC_003911	CCAGA	2	10	279496	279505	40 %	0 %	20 %	40 %	56695178
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5588	NC_003911	CG	3	6	279575	279580	0 %	0 %	50 %	50 %	56695178
5589	NC_003911	CAG	2	6	279676	279681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695178
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5593	NC_003911	CAG	2	6	279922	279927	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695178
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5599	NC_003911	AGCGC	2	10	280280	280289	20 %	0 %	40 %	40 %	56695179
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5602	NC_003911	CGC	2	6	280325	280330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695179
5603	NC_003911	CG	3	6	280343	280348	0 %	0 %	50 %	50 %	56695179
5604	NC_003911	GGC	2	6	280359	280364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695179
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5607	NC_003911	GCG	2	6	280461	280466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695179
5608	NC_003911	TGA	2	6	280490	280495	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695179
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5613	NC_003911	CAC	3	9	280817	280825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695180
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5624	NC_003911	TGG	2	6	281206	281211	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695180
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5748	NC_003911	CGT	2	6	286285	286290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	161598435
5749	NC_003911	CGG	2	6	286307	286312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	161598435
5750	NC_003911	GC	3	6	286336	286341	0 %	0 %	50 %	50 %	161598435
5751	NC_003911	CGA	2	6	286345	286350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	161598435
5752	NC_003911	TGA	2	6	286372	286377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	161598435
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5754	NC_003911	CAT	2	6	286687	286692	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695186
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5761	NC_003911	G	6	6	287295	287300	0 %	0 %	100 %	0 %	56695186
5762	NC_003911	CTG	2	6	287434	287439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695187
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5773	NC_003911	GCC	2	6	287929	287934	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695187
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5785	NC_003911	TGA	2	6	288567	288572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695188
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5853	NC_003911	TGCAC	2	10	291595	291604	20 %	20 %	20 %	40 %	56695192
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5861	NC_003911	CG	3	6	291980	291985	0 %	0 %	50 %	50 %	56695192
5862	NC_003911	CCTGG	2	10	292092	292101	0 %	20 %	40 %	40 %	56695193
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5865	NC_003911	GAC	2	6	292174	292179	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695193
5866	NC_003911	CACC	2	8	292185	292192	25 %	0 %	0 %	75 %	56695193
5867	NC_003911	CAC	3	9	292287	292295	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695193
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5869	NC_003911	CTT	2	6	292338	292343	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695193
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5931	NC_003911	GCCA	2	8	296623	296630	25 %	0 %	25 %	50 %	56695198
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5993	NC_003911	TTC	2	6	298992	298997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695201
5994	NC_003911	CCT	2	6	299093	299098	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56695201
5995	NC_003911	CAG	2	6	299192	299197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202
5996	NC_003911	TCG	2	6	299265	299270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695202
5997	NC_003911	C	6	6	299293	299298	0 %	0 %	0 %	100 %	56695202
5998	NC_003911	GGT	2	6	299374	299379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695202
5999	NC_003911	CCAT	2	8	299409	299416	25 %	25 %	0 %	50 %	56695202
6000	NC_003911	GCA	2	6	299434	299439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695202

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