MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ruegeria pomeroyi DSS-3 chromosome

Total Repeats: 85118

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_003911	GAG	2	6	221260	221265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695127
4502	NC_003911	GCCA	2	8	221311	221318	25 %	0 %	25 %	50 %	56695127
4503	NC_003911	CAT	2	6	221388	221393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695127
4504	NC_003911	GAG	2	6	221396	221401	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695127
4505	NC_003911	TGA	2	6	221448	221453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695127
4506	NC_003911	CGCT	2	8	221489	221496	0 %	25 %	25 %	50 %	56695127
4507	NC_003911	GGGGTT	2	12	221499	221510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695127
4508	NC_003911	GAC	2	6	221526	221531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4509	NC_003911	GGT	2	6	221532	221537	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695127
4510	NC_003911	TGC	2	6	221553	221558	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4511	NC_003911	GC	3	6	221557	221562	0 %	0 %	50 %	50 %	56695127
4512	NC_003911	GC	3	6	221587	221592	0 %	0 %	50 %	50 %	56695127
4513	NC_003911	GT	3	6	221595	221600	0 %	50 %	50 %	0 %	56695127
4514	NC_003911	CATT	2	8	221739	221746	25 %	50 %	0 %	25 %	56695127
4515	NC_003911	TGC	2	6	221783	221788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4516	NC_003911	GCC	2	6	221827	221832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695127
4517	NC_003911	ATG	2	6	221894	221899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695127
4518	NC_003911	AAC	2	6	221940	221945	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695127
4519	NC_003911	GC	3	6	221994	221999	0 %	0 %	50 %	50 %	56695127
4520	NC_003911	TCG	2	6	222044	222049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4521	NC_003911	GCGG	2	8	222069	222076	0 %	0 %	75 %	25 %	56695127
4522	NC_003911	TGA	2	6	222087	222092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695127
4523	NC_003911	AGA	2	6	222186	222191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695127
4524	NC_003911	TTGA	2	8	222223	222230	25 %	50 %	25 %	0 %	56695127
4525	NC_003911	CGA	2	6	222381	222386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4526	NC_003911	GCG	2	6	222570	222575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695127
4527	NC_003911	T	7	7	222591	222597	0 %	100 %	0 %	0 %	56695127
4528	NC_003911	CCGA	2	8	222617	222624	25 %	0 %	25 %	50 %	56695127
4529	NC_003911	GTC	2	6	222689	222694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4530	NC_003911	GCA	2	6	222790	222795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4531	NC_003911	CG	3	6	222806	222811	0 %	0 %	50 %	50 %	56695127
4532	NC_003911	GGC	2	6	222825	222830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695127
4533	NC_003911	TTGG	2	8	222843	222850	0 %	50 %	50 %	0 %	56695127
4534	NC_003911	GGC	2	6	222874	222879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695127
4535	NC_003911	GAA	2	6	222880	222885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695127
4536	NC_003911	CTG	2	6	222922	222927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4537	NC_003911	CGC	2	6	222953	222958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695127
4538	NC_003911	CGCGG	2	10	222963	222972	0 %	0 %	60 %	40 %	56695127
4539	NC_003911	GAC	2	6	222982	222987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695127
4540	NC_003911	GC	3	6	222989	222994	0 %	0 %	50 %	50 %	56695127
4541	NC_003911	TTG	2	6	223018	223023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56695127
4542	NC_003911	ATC	2	6	223337	223342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695128
4543	NC_003911	AGA	2	6	223372	223377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56695128
4544	NC_003911	CATCA	2	10	223380	223389	40 %	20 %	0 %	40 %	56695128
4545	NC_003911	GGCCCG	2	12	223443	223454	0 %	0 %	50 %	50 %	56695128
4546	NC_003911	TCG	2	6	223498	223503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4547	NC_003911	GGT	3	9	223569	223577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695128
4548	NC_003911	GCT	2	6	223614	223619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4549	NC_003911	CCA	2	6	223664	223669	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695128
4550	NC_003911	GGT	2	6	223770	223775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695128
4551	NC_003911	CGG	2	6	223776	223781	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4552	NC_003911	GCC	2	6	223801	223806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695128
4553	NC_003911	TGA	2	6	223807	223812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695128
4554	NC_003911	GGC	2	6	223890	223895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4555	NC_003911	TGC	2	6	223936	223941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4556	NC_003911	GGC	2	6	223977	223982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4557	NC_003911	CGG	2	6	223994	223999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4558	NC_003911	GC	3	6	224009	224014	0 %	0 %	50 %	50 %	56695128
4559	NC_003911	GCA	2	6	224084	224089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4560	NC_003911	TCG	2	6	224090	224095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4561	NC_003911	CAT	2	6	224112	224117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695128
4562	NC_003911	GGC	2	6	224193	224198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4563	NC_003911	TGC	2	6	224202	224207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4564	NC_003911	CG	3	6	224274	224279	0 %	0 %	50 %	50 %	56695128
4565	NC_003911	CGG	2	6	224306	224311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4566	NC_003911	TGC	2	6	224344	224349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
4567	NC_003911	CAC	3	9	224373	224381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695128
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4569	NC_003911	GC	3	6	224476	224481	0 %	0 %	50 %	50 %	56695128
4570	NC_003911	CAT	2	6	224490	224495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695128
4571	NC_003911	GC	3	6	224496	224501	0 %	0 %	50 %	50 %	56695128
4572	NC_003911	CAT	2	6	224607	224612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695128
4573	NC_003911	GCG	2	6	224617	224622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
4574	NC_003911	CGGGG	2	10	224634	224643	0 %	0 %	80 %	20 %	56695128
4575	NC_003911	GGC	2	6	224673	224678	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695128
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4577	NC_003911	TGC	2	6	224710	224715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695128
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4581	NC_003911	CGCT	2	8	225035	225042	0 %	25 %	25 %	50 %	56695129
4582	NC_003911	GAG	2	6	225044	225049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56695129
4583	NC_003911	GCCG	2	8	225057	225064	0 %	0 %	50 %	50 %	56695129
4584	NC_003911	GCG	2	6	225130	225135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695129
4585	NC_003911	GCT	2	6	225169	225174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695129
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4589	NC_003911	CACGG	2	10	225293	225302	20 %	0 %	40 %	40 %	56695129
4590	NC_003911	GC	3	6	225375	225380	0 %	0 %	50 %	50 %	56695129
4591	NC_003911	GC	3	6	225414	225419	0 %	0 %	50 %	50 %	56695129
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4593	NC_003911	GCG	2	6	225475	225480	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695129
4594	NC_003911	GC	3	6	225663	225668	0 %	0 %	50 %	50 %	56695129
4595	NC_003911	GC	3	6	225728	225733	0 %	0 %	50 %	50 %	56695129
4596	NC_003911	GGC	3	9	225778	225786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695129
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4601	NC_003911	CGC	2	6	226020	226025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695130
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4603	NC_003911	CGC	2	6	226257	226262	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695130
4604	NC_003911	GCA	2	6	226277	226282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695130
4605	NC_003911	CAGG	2	8	226369	226376	25 %	0 %	50 %	25 %	56695130
4606	NC_003911	GAAAG	2	10	226411	226420	60 %	0 %	40 %	0 %	56695130
4607	NC_003911	GA	3	6	226430	226435	50 %	0 %	50 %	0 %	56695130
4608	NC_003911	CG	3	6	226464	226469	0 %	0 %	50 %	50 %	56695130
4609	NC_003911	CCA	2	6	226542	226547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56695130
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4614	NC_003911	CCCGC	2	10	226645	226654	0 %	0 %	20 %	80 %	56695130
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4622	NC_003911	GCGCT	2	10	226982	226991	0 %	20 %	40 %	40 %	56695130
4623	NC_003911	ATGG	2	8	227005	227012	25 %	25 %	50 %	0 %	56695130
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4625	NC_003911	ATC	2	6	227126	227131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695130
4626	NC_003911	GCC	2	6	227138	227143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695130
4627	NC_003911	C	6	6	227156	227161	0 %	0 %	0 %	100 %	56695130
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4629	NC_003911	ATC	2	6	227255	227260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695130
4630	NC_003911	CGC	2	6	227293	227298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695130
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4732	NC_003911	GCA	2	6	231826	231831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695133
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4737	NC_003911	GAT	2	6	231986	231991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695133
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4740	NC_003911	TGG	2	6	232072	232077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695133
4741	NC_003911	GGCGCA	2	12	232079	232090	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	56695133
4742	NC_003911	CGG	2	6	232162	232167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695133
4743	NC_003911	CAG	2	6	232175	232180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695133
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4747	NC_003911	CGG	3	9	232327	232335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695133
4748	NC_003911	CTG	2	6	232367	232372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695133
4749	NC_003911	CG	4	8	232417	232424	0 %	0 %	50 %	50 %	56695133
4750	NC_003911	GCTG	2	8	232489	232496	0 %	25 %	50 %	25 %	56695133
4751	NC_003911	TGCCG	2	10	232506	232515	0 %	20 %	40 %	40 %	56695133
4752	NC_003911	CCG	3	9	232513	232521	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695133
4753	NC_003911	AG	3	6	232524	232529	50 %	0 %	50 %	0 %	56695133
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4755	NC_003911	ACAG	2	8	232694	232701	50 %	0 %	25 %	25 %	56695134
4756	NC_003911	CGA	2	6	232796	232801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695134
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4856	NC_003911	GGCG	2	8	237998	238005	0 %	0 %	75 %	25 %	56695139
4857	NC_003911	CGT	2	6	238031	238036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695139
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4864	NC_003911	GGC	2	6	238347	238352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695140
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4870	NC_003911	GTG	2	6	238472	238477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695140
4871	NC_003911	GCT	2	6	238495	238500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695140
4872	NC_003911	TGG	2	6	238512	238517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695140
4873	NC_003911	CGA	2	6	238603	238608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695140
4874	NC_003911	TCGA	2	8	238634	238641	25 %	25 %	25 %	25 %	56695140
4875	NC_003911	TGA	2	6	238674	238679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695140
4876	NC_003911	TGC	2	6	238686	238691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695140
4877	NC_003911	TGCTGG	2	12	238704	238715	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	56695140
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4879	NC_003911	TGC	2	6	238809	238814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695140
4880	NC_003911	CAT	3	9	238948	238956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56695140
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4884	NC_003911	GTG	2	6	239108	239113	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695140
4885	NC_003911	CGA	2	6	239173	239178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695140
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4887	NC_003911	GCC	2	6	239207	239212	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695140
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4889	NC_003911	TGC	2	6	239301	239306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695140
4890	NC_003911	CCGAC	2	10	239319	239328	20 %	0 %	20 %	60 %	56695140
4891	NC_003911	GTG	2	6	239472	239477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695140
4892	NC_003911	GCCC	2	8	239627	239634	0 %	0 %	25 %	75 %	56695141
4893	NC_003911	ATG	2	6	239649	239654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56695141
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4896	NC_003911	TCCG	2	8	239935	239942	0 %	25 %	25 %	50 %	56695141
4897	NC_003911	CGA	2	6	240117	240122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695142
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4899	NC_003911	CG	3	6	240171	240176	0 %	0 %	50 %	50 %	56695142
4900	NC_003911	GGT	2	6	240177	240182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56695142
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4903	NC_003911	CGG	2	6	240248	240253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695142
4904	NC_003911	CT	3	6	240292	240297	0 %	50 %	0 %	50 %	56695142
4905	NC_003911	CGGAT	2	10	240311	240320	20 %	20 %	40 %	20 %	56695142
4906	NC_003911	CCGG	2	8	240338	240345	0 %	0 %	50 %	50 %	56695142
4907	NC_003911	CGG	2	6	240366	240371	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695142
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4912	NC_003911	GCA	2	6	240651	240656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695143
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4932	NC_003911	GCTC	2	8	241453	241460	0 %	25 %	25 %	50 %	56695144
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4986	NC_003911	CGTT	2	8	244168	244175	0 %	50 %	25 %	25 %	56695147
4987	NC_003911	GCC	2	6	244234	244239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695147
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4989	NC_003911	CG	3	6	244289	244294	0 %	0 %	50 %	50 %	56695147
4990	NC_003911	TCTG	2	8	244339	244346	0 %	50 %	25 %	25 %	56695147
4991	NC_003911	GTGCC	2	10	244350	244359	0 %	20 %	40 %	40 %	56695147
4992	NC_003911	GCC	3	9	244357	244365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56695147
4993	NC_003911	GCG	3	9	244429	244437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695147
4994	NC_003911	GTC	2	6	244476	244481	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695147
4995	NC_003911	GTC	2	6	244488	244493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56695147
4996	NC_003911	ACA	2	6	244551	244556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	56695148
4997	NC_003911	TGACA	2	10	244583	244592	40 %	20 %	20 %	20 %	56695148
4998	NC_003911	GGC	2	6	244640	244645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56695148
4999	NC_003911	CGA	2	6	244742	244747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56695148
5000	NC_003911	TCT	2	6	244777	244782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56695148

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