MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 1698

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_003296	AAGAC	2	10	5114	5123	60 %	0 %	20 %	20 %	17548225
2	NC_003296	GTCCA	2	10	7073	7082	20 %	20 %	20 %	40 %	17548227
3	NC_003296	GCTGT	2	10	7145	7154	0 %	40 %	40 %	20 %	17548227
4	NC_003296	CGCGC	2	10	10431	10440	0 %	0 %	40 %	60 %	17548229
5	NC_003296	CGCAT	2	10	10750	10759	20 %	20 %	20 %	40 %	17548229
6	NC_003296	ATCGA	2	10	12052	12061	40 %	20 %	20 %	20 %	17548230
7	NC_003296	CGGCA	2	10	12613	12622	20 %	0 %	40 %	40 %	17548230
8	NC_003296	CCGCA	2	10	12852	12861	20 %	0 %	20 %	60 %	17548231
9	NC_003296	GCCGG	2	10	13134	13143	0 %	0 %	60 %	40 %	17548231
10	NC_003296	GCCAG	2	10	13343	13352	20 %	0 %	40 %	40 %	17548231
11	NC_003296	GCGCG	2	10	13710	13719	0 %	0 %	60 %	40 %	17548232
12	NC_003296	CCGGC	2	10	14002	14011	0 %	0 %	40 %	60 %	17548232
13	NC_003296	ATGCG	2	10	14971	14980	20 %	20 %	40 %	20 %	17548233
14	NC_003296	GCCGT	2	10	15826	15835	0 %	20 %	40 %	40 %	17548233
15	NC_003296	GCAGC	2	10	15944	15953	20 %	0 %	40 %	40 %	17548233
16	NC_003296	GATGC	2	10	15978	15987	20 %	20 %	40 %	20 %	17548233
17	NC_003296	AATGG	2	10	19477	19486	40 %	20 %	40 %	0 %	17548236
18	NC_003296	CGGCG	2	10	22735	22744	0 %	0 %	60 %	40 %	17548239
19	NC_003296	GATGA	2	10	27163	27172	40 %	20 %	40 %	0 %	17548244
20	NC_003296	CCAGG	2	10	28235	28244	20 %	0 %	40 %	40 %	17548245
21	NC_003296	GCAGG	2	10	29606	29615	20 %	0 %	60 %	20 %	17548247
22	NC_003296	CTCGC	2	10	32394	32403	0 %	20 %	20 %	60 %	17548249
23	NC_003296	GGCAT	2	10	35162	35171	20 %	20 %	40 %	20 %	17548251
24	NC_003296	GCTGC	2	10	36264	36273	0 %	20 %	40 %	40 %	17548252
25	NC_003296	CGGCG	2	10	39225	39234	0 %	0 %	60 %	40 %	17548254
26	NC_003296	ATCGC	2	10	39235	39244	20 %	20 %	20 %	40 %	17548254
27	NC_003296	CGTGG	2	10	39867	39876	0 %	20 %	60 %	20 %	17548254
28	NC_003296	GGCGC	2	10	40472	40481	0 %	0 %	60 %	40 %	17548255
29	NC_003296	GGGCT	2	10	41691	41700	0 %	20 %	60 %	20 %	17548257
30	NC_003296	GCACG	2	10	41717	41726	20 %	0 %	40 %	40 %	17548257
31	NC_003296	CCGCG	2	10	42311	42320	0 %	0 %	40 %	60 %	17548257
32	NC_003296	TCGTC	2	10	43935	43944	0 %	40 %	20 %	40 %	17548258
33	NC_003296	TCGCC	2	10	43956	43965	0 %	20 %	20 %	60 %	17548258
34	NC_003296	GAGCC	2	10	46185	46194	20 %	0 %	40 %	40 %	17548262
35	NC_003296	CGGCG	2	10	46299	46308	0 %	0 %	60 %	40 %	17548263
36	NC_003296	AAATC	2	10	47608	47617	60 %	20 %	0 %	20 %	17548265
37	NC_003296	GCGCA	2	10	48519	48528	20 %	0 %	40 %	40 %	17548265
38	NC_003296	GCTGA	2	10	49718	49727	20 %	20 %	40 %	20 %	17548266
39	NC_003296	GCGGT	2	10	51019	51028	0 %	20 %	60 %	20 %	17548267
40	NC_003296	GAAGA	2	10	52391	52400	60 %	0 %	40 %	0 %	17548269
41	NC_003296	ATGCA	2	10	57942	57951	40 %	20 %	20 %	20 %	17548273
42	NC_003296	CGAGC	2	10	58792	58801	20 %	0 %	40 %	40 %	17548273
43	NC_003296	GCCGA	3	15	60901	60915	20 %	0 %	40 %	40 %	17548275
44	NC_003296	GCCAC	2	10	61045	61054	20 %	0 %	20 %	60 %	17548275
45	NC_003296	TGCAA	2	10	64416	64425	40 %	20 %	20 %	20 %	17548278
46	NC_003296	GCCAC	2	10	64497	64506	20 %	0 %	20 %	60 %	17548278
47	NC_003296	ACGAC	2	10	64841	64850	40 %	0 %	20 %	40 %	17548278
48	NC_003296	TGGCC	2	10	65172	65181	0 %	20 %	40 %	40 %	17548279
49	NC_003296	CGGCG	2	10	67616	67625	0 %	0 %	60 %	40 %	17548280
50	NC_003296	GCTGC	2	10	69256	69265	0 %	20 %	40 %	40 %	17548281
51	NC_003296	CCGCA	2	10	73169	73178	20 %	0 %	20 %	60 %	17548284
52	NC_003296	GACGC	2	10	73783	73792	20 %	0 %	40 %	40 %	17548285
53	NC_003296	AGCGC	2	10	76799	76808	20 %	0 %	40 %	40 %	17548287
54	NC_003296	GCCGT	2	10	76935	76944	0 %	20 %	40 %	40 %	17548287
55	NC_003296	CGAGC	2	10	78153	78162	20 %	0 %	40 %	40 %	17548289
56	NC_003296	GCGCG	2	10	80881	80890	0 %	0 %	60 %	40 %	17548291
57	NC_003296	CCTGC	2	10	81694	81703	0 %	20 %	20 %	60 %	17548291
58	NC_003296	GGTTG	2	10	92295	92304	0 %	40 %	60 %	0 %	17548305
59	NC_003296	GAACG	2	10	92998	93007	40 %	0 %	40 %	20 %	17548306
60	NC_003296	CGCTA	2	10	93425	93434	20 %	20 %	20 %	40 %	17548306
61	NC_003296	ACCGC	2	10	94041	94050	20 %	0 %	20 %	60 %	17548306
62	NC_003296	AGGCG	2	10	94246	94255	20 %	0 %	60 %	20 %	17548306
63	NC_003296	CGCGG	2	10	97176	97185	0 %	0 %	60 %	40 %	17548307
64	NC_003296	TCGAT	2	10	97203	97212	20 %	40 %	20 %	20 %	17548307
65	NC_003296	TGCCG	2	10	98112	98121	0 %	20 %	40 %	40 %	17548309
66	NC_003296	GGCCG	2	10	98601	98610	0 %	0 %	60 %	40 %	17548310
67	NC_003296	CGTGC	2	10	98993	99002	0 %	20 %	40 %	40 %	17548311
68	NC_003296	GACGC	2	10	99341	99350	20 %	0 %	40 %	40 %	17548311
69	NC_003296	CTGGC	2	10	99419	99428	0 %	20 %	40 %	40 %	17548311
70	NC_003296	TCAAC	2	10	100445	100454	40 %	20 %	0 %	40 %	17548312
71	NC_003296	GGCTC	2	10	101934	101943	0 %	20 %	40 %	40 %	17548315
72	NC_003296	TGCCA	2	10	102231	102240	20 %	20 %	20 %	40 %	17548315
73	NC_003296	GAAAC	2	10	102529	102538	60 %	0 %	20 %	20 %	17548316
74	NC_003296	GCGCC	2	10	106352	106361	0 %	0 %	40 %	60 %	17548320
75	NC_003296	CGGCG	2	10	109896	109905	0 %	0 %	60 %	40 %	17548321
76	NC_003296	TTCCA	2	10	110105	110114	20 %	40 %	0 %	40 %	17548321
77	NC_003296	TGGCC	2	10	110580	110589	0 %	20 %	40 %	40 %	17548321
78	NC_003296	CGGCG	2	10	110620	110629	0 %	0 %	60 %	40 %	17548321
79	NC_003296	ACCGC	2	10	112579	112588	20 %	0 %	20 %	60 %	17548322
80	NC_003296	GCCGC	2	10	112652	112661	0 %	0 %	40 %	60 %	17548322
81	NC_003296	GGCCG	2	10	112676	112685	0 %	0 %	60 %	40 %	17548322
82	NC_003296	CGGCG	2	10	112979	112988	0 %	0 %	60 %	40 %	17548322
83	NC_003296	CGGAC	2	10	113257	113266	20 %	0 %	40 %	40 %	17548322
84	NC_003296	GGCAC	2	10	115523	115532	20 %	0 %	40 %	40 %	17548324
85	NC_003296	ACGGC	2	10	116422	116431	20 %	0 %	40 %	40 %	17548324
86	NC_003296	GCCGC	2	10	116491	116500	0 %	0 %	40 %	60 %	17548324
87	NC_003296	AACGG	2	10	117036	117045	40 %	0 %	40 %	20 %	17548324
88	NC_003296	GACTC	2	10	118118	118127	20 %	20 %	20 %	40 %	17548325
89	NC_003296	CCGTG	2	10	119654	119663	0 %	20 %	40 %	40 %	17548326
90	NC_003296	TCCAG	2	10	122440	122449	20 %	20 %	20 %	40 %	17548328
91	NC_003296	GCGCG	2	10	125673	125682	0 %	0 %	60 %	40 %	17548331
92	NC_003296	CGGCG	2	10	126620	126629	0 %	0 %	60 %	40 %	17548332
93	NC_003296	CAGGC	2	10	128079	128088	20 %	0 %	40 %	40 %	17548332
94	NC_003296	CGGCG	2	10	128267	128276	0 %	0 %	60 %	40 %	17548332
95	NC_003296	CCGGT	2	10	134130	134139	0 %	20 %	40 %	40 %	17548337
96	NC_003296	GCGTG	2	10	137151	137160	0 %	20 %	60 %	20 %	17548341
97	NC_003296	CGCTG	2	10	137816	137825	0 %	20 %	40 %	40 %	17548341
98	NC_003296	ATCGC	2	10	139294	139303	20 %	20 %	20 %	40 %	17548341
99	NC_003296	CACAC	2	10	139351	139360	40 %	0 %	0 %	60 %	17548341
100	NC_003296	TCCGG	2	10	139708	139717	0 %	20 %	40 %	40 %	17548342
101	NC_003296	GCATC	2	10	140270	140279	20 %	20 %	20 %	40 %	17548342
102	NC_003296	CCGCG	2	10	141089	141098	0 %	0 %	40 %	60 %	161621738
103	NC_003296	CCGGC	2	10	143480	143489	0 %	0 %	40 %	60 %	17548344
104	NC_003296	CGCGC	2	10	143829	143838	0 %	0 %	40 %	60 %	17548344
105	NC_003296	ACCGA	2	10	144344	144353	40 %	0 %	20 %	40 %	17548345
106	NC_003296	GCCGG	2	10	145992	146001	0 %	0 %	60 %	40 %	17548347
107	NC_003296	TGTGC	2	10	149214	149223	0 %	40 %	40 %	20 %	17548349
108	NC_003296	TGCGG	2	10	150156	150165	0 %	20 %	60 %	20 %	17548349
109	NC_003296	GCGAG	2	10	151653	151662	20 %	0 %	60 %	20 %	17548351
110	NC_003296	AGCGC	2	10	155501	155510	20 %	0 %	40 %	40 %	17548355
111	NC_003296	CGTGC	2	10	155710	155719	0 %	20 %	40 %	40 %	17548355
112	NC_003296	GCGCC	2	10	157150	157159	0 %	0 %	40 %	60 %	17548356
113	NC_003296	GGGCA	2	10	159206	159215	20 %	0 %	60 %	20 %	17548357
114	NC_003296	TTCCC	2	10	162483	162492	0 %	40 %	0 %	60 %	17548361
115	NC_003296	TCGCG	2	10	163164	163173	0 %	20 %	40 %	40 %	17548362
116	NC_003296	CCGGT	2	10	163424	163433	0 %	20 %	40 %	40 %	17548363
117	NC_003296	GGCGT	2	10	163536	163545	0 %	20 %	60 %	20 %	17548363
118	NC_003296	CGGCA	2	10	163730	163739	20 %	0 %	40 %	40 %	17548363
119	NC_003296	GGCTG	2	10	166517	166526	0 %	20 %	60 %	20 %	17548365
120	NC_003296	TTGCG	2	10	166539	166548	0 %	40 %	40 %	20 %	17548365
121	NC_003296	AAGGC	2	10	166600	166609	40 %	0 %	40 %	20 %	17548365
122	NC_003296	GATGC	2	10	167015	167024	20 %	20 %	40 %	20 %	17548366
123	NC_003296	CCAGC	2	10	167117	167126	20 %	0 %	20 %	60 %	17548366
124	NC_003296	GCCGT	2	10	168362	168371	0 %	20 %	40 %	40 %	17548368
125	NC_003296	AGCAG	2	10	170709	170718	40 %	0 %	40 %	20 %	17548370
126	NC_003296	CTTTT	2	10	171112	171121	0 %	80 %	0 %	20 %	17548370
127	NC_003296	CGCTG	2	10	172562	172571	0 %	20 %	40 %	40 %	17548372
128	NC_003296	CAAGC	2	10	172722	172731	40 %	0 %	20 %	40 %	17548372
129	NC_003296	AAGGG	2	10	177269	177278	40 %	0 %	60 %	0 %	17548372
130	NC_003296	ATCGA	2	10	177837	177846	40 %	20 %	20 %	20 %	17548373
131	NC_003296	GCCGG	2	10	180557	180566	0 %	0 %	60 %	40 %	17548377
132	NC_003296	CCGGC	2	10	185067	185076	0 %	0 %	40 %	60 %	17548381
133	NC_003296	CACCT	2	10	186240	186249	20 %	20 %	0 %	60 %	17548381
134	NC_003296	CCGGC	2	10	186299	186308	0 %	0 %	40 %	60 %	17548381
135	NC_003296	TGGTT	2	10	189943	189952	0 %	60 %	40 %	0 %	17548384
136	NC_003296	GGAAC	2	10	189998	190007	40 %	0 %	40 %	20 %	17548384
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