MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Ralstonia solanacearum GMI1000 plasmid pGMI1000MP

Total Repeats: 49225

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003296	CAT	2	6	21062	21067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548237
502	NC_003296	GCC	2	6	21077	21082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548237
503	NC_003296	CAA	2	6	21095	21100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	17548237
504	NC_003296	CGA	3	9	21131	21139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548237
505	NC_003296	AGG	2	6	21166	21171	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	17548237
506	NC_003296	TGC	2	6	21186	21191	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548238
507	NC_003296	GCT	2	6	21316	21321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548238
508	NC_003296	CAC	2	6	21463	21468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548238
509	NC_003296	GCG	2	6	21609	21614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548238
510	NC_003296	AGC	2	6	21615	21620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548238
511	NC_003296	CG	3	6	21657	21662	0 %	0 %	50 %	50 %	17548238
512	NC_003296	TGC	3	9	21663	21671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548238
513	NC_003296	CGA	2	6	21673	21678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548238
514	NC_003296	ATC	2	6	21701	21706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548238
515	NC_003296	CTG	2	6	21860	21865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548238
516	NC_003296	CG	3	6	21873	21878	0 %	0 %	50 %	50 %	17548238
517	NC_003296	GGC	2	6	21896	21901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548238
518	NC_003296	CCGC	2	8	22033	22040	0 %	0 %	25 %	75 %	17548239
519	NC_003296	CG	3	6	22042	22047	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
520	NC_003296	CCAG	2	8	22075	22082	25 %	0 %	25 %	50 %	17548239
521	NC_003296	GCC	2	6	22167	22172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548239
522	NC_003296	CGC	2	6	22205	22210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548239
523	NC_003296	GCG	2	6	22235	22240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548239
524	NC_003296	CG	3	6	22239	22244	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
525	NC_003296	GGC	2	6	22253	22258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548239
526	NC_003296	CAGC	2	8	22259	22266	25 %	0 %	25 %	50 %	17548239
527	NC_003296	GCT	2	6	22267	22272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548239
528	NC_003296	GTC	2	6	22292	22297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548239
529	NC_003296	GCC	2	6	22395	22400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548239
530	NC_003296	CAG	2	6	22472	22477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548239
531	NC_003296	TGGC	2	8	22536	22543	0 %	25 %	50 %	25 %	17548239
532	NC_003296	CGG	2	6	22550	22555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548239
533	NC_003296	GGCC	2	8	22612	22619	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
534	NC_003296	CGGC	2	8	22635	22642	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
535	NC_003296	GC	3	6	22654	22659	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
536	NC_003296	CG	3	6	22684	22689	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
537	NC_003296	CGGCG	2	10	22735	22744	0 %	0 %	60 %	40 %	17548239
538	NC_003296	GGT	2	6	22751	22756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548239
539	NC_003296	GC	3	6	22775	22780	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
540	NC_003296	GAA	3	9	22845	22853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	17548239
541	NC_003296	GC	3	6	22869	22874	0 %	0 %	50 %	50 %	17548239
542	NC_003296	TGC	2	6	23365	23370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548240
543	NC_003296	TTC	2	6	23433	23438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548240
544	NC_003296	CG	3	6	23440	23445	0 %	0 %	50 %	50 %	17548240
545	NC_003296	GCG	2	6	23449	23454	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548240
546	NC_003296	CG	3	6	23476	23481	0 %	0 %	50 %	50 %	17548240
547	NC_003296	GC	3	6	23502	23507	0 %	0 %	50 %	50 %	17548240
548	NC_003296	TCG	3	9	23515	23523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548240
549	NC_003296	TGG	2	6	23530	23535	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548240
550	NC_003296	CGG	2	6	23565	23570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548240
551	NC_003296	GGC	3	9	23603	23611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548240
552	NC_003296	GCG	2	6	23634	23639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548240
553	NC_003296	TGG	2	6	23730	23735	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548241
554	NC_003296	CG	3	6	23747	23752	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
555	NC_003296	CGA	2	6	23821	23826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548241
556	NC_003296	TGG	2	6	23859	23864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548241
557	NC_003296	TGG	2	6	23913	23918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548241
558	NC_003296	GC	3	6	23919	23924	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
559	NC_003296	CTG	2	6	23925	23930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
560	NC_003296	CGG	2	6	23942	23947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548241
561	NC_003296	GCT	2	6	23948	23953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
562	NC_003296	GC	3	6	24049	24054	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
563	NC_003296	CGT	2	6	24076	24081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
564	NC_003296	GCG	2	6	24100	24105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548241
565	NC_003296	GCT	2	6	24158	24163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
566	NC_003296	TGC	2	6	24172	24177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
567	NC_003296	GTCG	2	8	24194	24201	0 %	25 %	50 %	25 %	17548241
568	NC_003296	CTG	2	6	24213	24218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
569	NC_003296	TGCG	2	8	24221	24228	0 %	25 %	50 %	25 %	17548241
570	NC_003296	CAC	2	6	24311	24316	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	17548241
571	NC_003296	GCT	2	6	24332	24337	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
572	NC_003296	CCG	2	6	24343	24348	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
573	NC_003296	CCG	2	6	24352	24357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
574	NC_003296	CAT	2	6	24359	24364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548241
575	NC_003296	TTC	2	6	24375	24380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548241
576	NC_003296	ATTTCG	2	12	24409	24420	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	17548241
577	NC_003296	GGCCTG	2	12	24450	24461	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17548241
578	NC_003296	GCC	2	6	24462	24467	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
579	NC_003296	GCT	3	9	24482	24490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
580	NC_003296	CG	5	10	24504	24513	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
581	NC_003296	GC	3	6	24522	24527	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
582	NC_003296	GGGC	2	8	24560	24567	0 %	0 %	75 %	25 %	17548241
583	NC_003296	TCG	2	6	24571	24576	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
584	NC_003296	GCTGGT	2	12	24671	24682	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	17548241
585	NC_003296	CCG	2	6	24700	24705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
586	NC_003296	GCG	2	6	24730	24735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548241
587	NC_003296	GCG	2	6	24757	24762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548241
588	NC_003296	CTG	2	6	24774	24779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
589	NC_003296	GCAT	2	8	24790	24797	25 %	25 %	25 %	25 %	17548241
590	NC_003296	GCT	2	6	24800	24805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
591	NC_003296	GCCGGT	2	12	24818	24829	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17548241
592	NC_003296	GGT	2	6	24839	24844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548241
593	NC_003296	GCT	2	6	24857	24862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548241
594	NC_003296	GGC	2	6	24863	24868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548241
595	NC_003296	ACG	2	6	24870	24875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548241
596	NC_003296	CGC	2	6	24880	24885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
597	NC_003296	TGA	2	6	24898	24903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17548241
598	NC_003296	GGT	2	6	24929	24934	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548241
599	NC_003296	GCAT	2	8	24951	24958	25 %	25 %	25 %	25 %	17548241
600	NC_003296	GC	3	6	24988	24993	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
601	NC_003296	GC	3	6	25017	25022	0 %	0 %	50 %	50 %	17548241
602	NC_003296	CGA	2	6	25028	25033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548241
603	NC_003296	GCC	2	6	25046	25051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548241
604	NC_003296	GC	3	6	25674	25679	0 %	0 %	50 %	50 %	17548242
605	NC_003296	GAGGGC	2	12	25739	25750	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	17548242
606	NC_003296	GGC	2	6	25995	26000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548243
607	NC_003296	GTG	2	6	26107	26112	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	17548243
608	NC_003296	GAT	2	6	26126	26131	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	17548243
609	NC_003296	TGGCGC	2	12	26810	26821	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	17548244
610	NC_003296	TCCG	2	8	26901	26908	0 %	25 %	25 %	50 %	17548244
611	NC_003296	CGG	2	6	26913	26918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548244
612	NC_003296	CGC	2	6	26937	26942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548244
613	NC_003296	CAG	2	6	26982	26987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548244
614	NC_003296	GC	3	6	26999	27004	0 %	0 %	50 %	50 %	17548244
615	NC_003296	GCG	2	6	27043	27048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548244
616	NC_003296	GGC	2	6	27049	27054	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548244
617	NC_003296	CGG	2	6	27101	27106	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548244
618	NC_003296	CTT	2	6	27153	27158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	17548244
619	NC_003296	GATGA	2	10	27163	27172	40 %	20 %	40 %	0 %	17548244
620	NC_003296	ACG	2	6	27187	27192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548244
621	NC_003296	TAC	2	6	27202	27207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	17548244
622	NC_003296	GCCT	2	8	27296	27303	0 %	25 %	25 %	50 %	17548244
623	NC_003296	TCG	2	6	27317	27322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	17548244
624	NC_003296	CGA	2	6	27386	27391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	17548244
625	NC_003296	G	6	6	27427	27432	0 %	0 %	100 %	0 %	17548244
626	NC_003296	GT	3	6	27479	27484	0 %	50 %	50 %	0 %	17548244
627	NC_003296	GCC	3	9	27553	27561	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548244
628	NC_003296	GC	3	6	27918	27923	0 %	0 %	50 %	50 %	17548245
629	NC_003296	GGC	2	6	28000	28005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548245
630	NC_003296	CGG	2	6	28010	28015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548245
631	NC_003296	CCG	2	6	28023	28028	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	17548245
632	NC_003296	CG	3	6	28060	28065	0 %	0 %	50 %	50 %	17548245
633	NC_003296	TGCG	2	8	28084	28091	0 %	25 %	50 %	25 %	17548245
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753	NC_003296	GGC	2	6	33296	33301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548249
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756	NC_003296	CGG	2	6	33954	33959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	17548250
757	NC_003296	TTCT	2	8	34012	34019	0 %	75 %	0 %	25 %	17548250
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887	NC_003296	GC	4	8	39799	39806	0 %	0 %	50 %	50 %	17548254
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