MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia conorii str. Malish 7

Total Repeats: 25774

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_003103	TAAA	2	8	22951	22958	75 %	25 %	0 %	0 %	15891942
502	NC_003103	TCA	2	6	22970	22975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891942
503	NC_003103	AAT	2	6	23601	23606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891943
504	NC_003103	ACA	2	6	24375	24380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891944
505	NC_003103	AGA	2	6	24384	24389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891944
506	NC_003103	TTA	2	6	24506	24511	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891944
507	NC_003103	GAA	2	6	24592	24597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891944
508	NC_003103	ATA	2	6	24601	24606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891944
509	NC_003103	TAT	2	6	24647	24652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891944
510	NC_003103	TAAT	2	8	24707	24714	50 %	50 %	0 %	0 %	15891944
511	NC_003103	TAC	2	6	24744	24749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891944
512	NC_003103	ATA	2	6	24755	24760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891944
513	NC_003103	TGA	2	6	24768	24773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
514	NC_003103	ATATT	2	10	24782	24791	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
515	NC_003103	A	6	6	24808	24813	100 %	0 %	0 %	0 %	15891944
516	NC_003103	ATATT	2	10	24820	24829	40 %	60 %	0 %	0 %	15891944
517	NC_003103	A	6	6	24843	24848	100 %	0 %	0 %	0 %	15891944
518	NC_003103	AAGA	2	8	24859	24866	75 %	0 %	25 %	0 %	15891944
519	NC_003103	TAG	2	6	24878	24883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
520	NC_003103	GTA	2	6	24893	24898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891944
521	NC_003103	TGC	2	6	24903	24908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891944
522	NC_003103	AAAT	2	8	24951	24958	75 %	25 %	0 %	0 %	15891944
523	NC_003103	A	6	6	25467	25472	100 %	0 %	0 %	0 %	15891945
524	NC_003103	TTA	2	6	25477	25482	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891945
525	NC_003103	AT	4	8	25489	25496	50 %	50 %	0 %	0 %	15891945
526	NC_003103	GAA	2	6	25508	25513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891945
527	NC_003103	CTT	2	6	25566	25571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891945
528	NC_003103	TAA	2	6	25588	25593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891945
529	NC_003103	ATGTT	2	10	25983	25992	20 %	60 %	20 %	0 %	15891946
530	NC_003103	TAAA	2	8	26161	26168	75 %	25 %	0 %	0 %	15891946
531	NC_003103	GCTA	2	8	26171	26178	25 %	25 %	25 %	25 %	15891946
532	NC_003103	TCA	2	6	26307	26312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891947
533	NC_003103	T	6	6	26381	26386	0 %	100 %	0 %	0 %	15891947
534	NC_003103	TTC	2	6	26399	26404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891947
535	NC_003103	T	6	6	26416	26421	0 %	100 %	0 %	0 %	15891947
536	NC_003103	TCT	2	6	26454	26459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891947
537	NC_003103	GT	3	6	26505	26510	0 %	50 %	50 %	0 %	15891947
538	NC_003103	AGC	2	6	26522	26527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891947
539	NC_003103	TCT	2	6	26529	26534	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891947
540	NC_003103	T	7	7	26606	26612	0 %	100 %	0 %	0 %	15891947
541	NC_003103	A	7	7	26634	26640	100 %	0 %	0 %	0 %	15891947
542	NC_003103	ATT	2	6	26685	26690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891947
543	NC_003103	GTA	2	6	26706	26711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891948
544	NC_003103	T	6	6	26739	26744	0 %	100 %	0 %	0 %	15891948
545	NC_003103	AAT	2	6	26746	26751	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891948
546	NC_003103	TGC	2	6	26773	26778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891948
547	NC_003103	TTA	2	6	26783	26788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891948
548	NC_003103	AGC	2	6	26803	26808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891948
549	NC_003103	T	6	6	26843	26848	0 %	100 %	0 %	0 %	15891948
550	NC_003103	T	8	8	26867	26874	0 %	100 %	0 %	0 %	15891948
551	NC_003103	T	6	6	26904	26909	0 %	100 %	0 %	0 %	15891948
552	NC_003103	T	7	7	26911	26917	0 %	100 %	0 %	0 %	15891948
553	NC_003103	TCTA	2	8	26920	26927	25 %	50 %	0 %	25 %	15891948
554	NC_003103	TTTGT	2	10	26936	26945	0 %	80 %	20 %	0 %	15891948
555	NC_003103	ATTT	2	8	26964	26971	25 %	75 %	0 %	0 %	15891948
556	NC_003103	TGTC	2	8	27028	27035	0 %	50 %	25 %	25 %	15891948
557	NC_003103	TAT	2	6	27036	27041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891948
558	NC_003103	TTC	2	6	27049	27054	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891948
559	NC_003103	A	6	6	27117	27122	100 %	0 %	0 %	0 %	15891948
560	NC_003103	AAT	2	6	27129	27134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891948
561	NC_003103	A	6	6	27183	27188	100 %	0 %	0 %	0 %	161723852
562	NC_003103	A	6	6	27213	27218	100 %	0 %	0 %	0 %	161723852
563	NC_003103	AG	3	6	27308	27313	50 %	0 %	50 %	0 %	161723852
564	NC_003103	AT	3	6	27318	27323	50 %	50 %	0 %	0 %	161723852
565	NC_003103	CAT	2	6	27615	27620	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891950
566	NC_003103	ATAC	2	8	27625	27632	50 %	25 %	0 %	25 %	15891950
567	NC_003103	CAA	2	6	27669	27674	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891950
568	NC_003103	ATA	2	6	27701	27706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891950
569	NC_003103	TAA	2	6	27766	27771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891950
570	NC_003103	CAT	2	6	27784	27789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891950
571	NC_003103	ATC	2	6	27854	27859	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891950
572	NC_003103	A	7	7	27893	27899	100 %	0 %	0 %	0 %	15891950
573	NC_003103	A	6	6	27905	27910	100 %	0 %	0 %	0 %	15891950
574	NC_003103	ATA	2	6	27983	27988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891950
575	NC_003103	TAG	3	9	27993	28001	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891950
576	NC_003103	ATAA	2	8	28049	28056	75 %	25 %	0 %	0 %	15891950
577	NC_003103	CACT	2	8	28143	28150	25 %	25 %	0 %	50 %	15891950
578	NC_003103	T	6	6	28288	28293	0 %	100 %	0 %	0 %	15891950
579	NC_003103	TAT	2	6	28339	28344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891951
580	NC_003103	T	6	6	28349	28354	0 %	100 %	0 %	0 %	15891951
581	NC_003103	TAT	2	6	28385	28390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891951
582	NC_003103	ATA	2	6	28398	28403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891951
583	NC_003103	GTT	2	6	28542	28547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891951
584	NC_003103	TCATT	2	10	28713	28722	20 %	60 %	0 %	20 %	15891952
585	NC_003103	T	6	6	28721	28726	0 %	100 %	0 %	0 %	15891952
586	NC_003103	CTC	2	6	28741	28746	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15891952
587	NC_003103	CTG	2	6	28761	28766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891952
588	NC_003103	GAA	2	6	28813	28818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891952
589	NC_003103	ATT	2	6	28894	28899	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891952
590	NC_003103	TTC	2	6	28915	28920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891952
591	NC_003103	TAA	2	6	28954	28959	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891952
592	NC_003103	TATT	2	8	28967	28974	25 %	75 %	0 %	0 %	15891952
593	NC_003103	TTG	2	6	28993	28998	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891952
594	NC_003103	GCA	2	6	29063	29068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15891952
595	NC_003103	TAG	2	6	29082	29087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891952
596	NC_003103	AT	3	6	29129	29134	50 %	50 %	0 %	0 %	15891952
597	NC_003103	T	6	6	29134	29139	0 %	100 %	0 %	0 %	15891952
598	NC_003103	TGA	2	6	29162	29167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891952
599	NC_003103	TAA	2	6	29168	29173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891952
600	NC_003103	ACT	2	6	29207	29212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891952
601	NC_003103	T	6	6	29224	29229	0 %	100 %	0 %	0 %	15891952
602	NC_003103	ATC	2	6	29251	29256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891952
603	NC_003103	T	7	7	29294	29300	0 %	100 %	0 %	0 %	15891952
604	NC_003103	TCA	2	6	29327	29332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891952
605	NC_003103	ATT	2	6	29338	29343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891952
606	NC_003103	TAT	2	6	29440	29445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891952
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608	NC_003103	ATA	2	6	29502	29507	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891952
609	NC_003103	TAA	2	6	29520	29525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891952
610	NC_003103	TAA	2	6	29698	29703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891953
611	NC_003103	ACA	2	6	29712	29717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891953
612	NC_003103	TAG	2	6	29882	29887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891953
613	NC_003103	GTT	2	6	29895	29900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15891953
614	NC_003103	AT	3	6	29940	29945	50 %	50 %	0 %	0 %	15891953
615	NC_003103	AGA	2	6	29991	29996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15891953
616	NC_003103	TAA	2	6	30182	30187	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891953
617	NC_003103	TAG	2	6	30214	30219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15891953
618	NC_003103	CTA	2	6	30476	30481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891954
619	NC_003103	CAA	2	6	30530	30535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15891954
620	NC_003103	TAA	2	6	30543	30548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15891954
621	NC_003103	AATT	2	8	30602	30609	50 %	50 %	0 %	0 %	15891954
622	NC_003103	T	6	6	30608	30613	0 %	100 %	0 %	0 %	15891954
623	NC_003103	ATC	2	6	30633	30638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15891954
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625	NC_003103	TACC	2	8	30692	30699	25 %	25 %	0 %	50 %	15891954
626	NC_003103	ATT	2	6	30741	30746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891954
627	NC_003103	TGC	2	6	30885	30890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15891954
628	NC_003103	CTT	2	6	30932	30937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15891954
629	NC_003103	CATATA	2	12	30980	30991	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15891954
630	NC_003103	GTTA	2	8	31074	31081	25 %	50 %	25 %	0 %	15891954
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632	NC_003103	ATT	2	6	31143	31148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15891954
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