MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 1852

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000963	AG	3	6	685	690	50 %	0 %	50 %	0 %	15603882
2	NC_000963	AT	3	6	787	792	50 %	50 %	0 %	0 %	15603882
3	NC_000963	AT	3	6	1546	1551	50 %	50 %	0 %	0 %	15603884
4	NC_000963	TA	3	6	1664	1669	50 %	50 %	0 %	0 %	15603884
5	NC_000963	AG	3	6	2238	2243	50 %	0 %	50 %	0 %	15603885
6	NC_000963	TA	3	6	2401	2406	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
7	NC_000963	TG	3	6	2517	2522	0 %	50 %	50 %	0 %	15603885
8	NC_000963	AT	3	6	2661	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	15603885
9	NC_000963	TC	3	6	2974	2979	0 %	50 %	0 %	50 %	15603886
10	NC_000963	AT	3	6	3393	3398	50 %	50 %	0 %	0 %	15603886
11	NC_000963	GA	3	6	3473	3478	50 %	0 %	50 %	0 %	15603886
12	NC_000963	AT	4	8	3895	3902	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
13	NC_000963	GA	3	6	4225	4230	50 %	0 %	50 %	0 %	15603887
14	NC_000963	TA	3	6	4564	4569	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
15	NC_000963	AT	3	6	5769	5774	50 %	50 %	0 %	0 %	15603887
16	NC_000963	TC	3	6	6785	6790	0 %	50 %	0 %	50 %	15603888
17	NC_000963	TA	3	6	8301	8306	50 %	50 %	0 %	0 %	15603890
18	NC_000963	TG	3	6	9910	9915	0 %	50 %	50 %	0 %	15603891
19	NC_000963	GA	3	6	10053	10058	50 %	0 %	50 %	0 %	15603891
20	NC_000963	AT	3	6	10970	10975	50 %	50 %	0 %	0 %	15603892
21	NC_000963	AT	4	8	12034	12041	50 %	50 %	0 %	0 %	15603893
22	NC_000963	TA	3	6	12057	12062	50 %	50 %	0 %	0 %	15603893
23	NC_000963	TA	3	6	12482	12487	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
24	NC_000963	TA	3	6	12831	12836	50 %	50 %	0 %	0 %	15603894
25	NC_000963	CT	3	6	12922	12927	0 %	50 %	0 %	50 %	15603894
26	NC_000963	TA	3	6	13513	13518	50 %	50 %	0 %	0 %	15603895
27	NC_000963	TG	3	6	13647	13652	0 %	50 %	50 %	0 %	15603895
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31	NC_000963	TA	3	6	17486	17491	50 %	50 %	0 %	0 %	15603897
32	NC_000963	TA	3	6	18615	18620	50 %	50 %	0 %	0 %	15603898
33	NC_000963	AT	3	6	18672	18677	50 %	50 %	0 %	0 %	15603898
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50	NC_000963	AT	3	6	33983	33988	50 %	50 %	0 %	0 %	15603912
51	NC_000963	AT	3	6	34007	34012	50 %	50 %	0 %	0 %	15603912
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68	NC_000963	AG	3	6	46459	46464	50 %	0 %	50 %	0 %	15603921
69	NC_000963	TA	3	6	46646	46651	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
70	NC_000963	AT	3	6	47107	47112	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
71	NC_000963	AG	3	6	47113	47118	50 %	0 %	50 %	0 %	15603921
72	NC_000963	AT	3	6	47369	47374	50 %	50 %	0 %	0 %	15603921
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