MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_000963	CCA	2	6	192143	192148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604036
4002	NC_000963	GTA	2	6	192165	192170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604036
4003	NC_000963	TAA	2	6	192175	192180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604036
4004	NC_000963	ATA	2	6	192210	192215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604036
4005	NC_000963	CCT	2	6	192275	192280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604036
4006	NC_000963	TAG	2	6	192351	192356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604036
4007	NC_000963	CTC	2	6	192375	192380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	15604036
4008	NC_000963	T	7	7	192455	192461	0 %	100 %	0 %	0 %	15604036
4009	NC_000963	ATA	2	6	192473	192478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604036
4010	NC_000963	TTC	2	6	192508	192513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604036
4011	NC_000963	AGA	2	6	192538	192543	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604036
4012	NC_000963	TTAA	2	8	192554	192561	50 %	50 %	0 %	0 %	15604036
4013	NC_000963	TAT	2	6	192600	192605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604036
4014	NC_000963	CTT	2	6	192627	192632	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604036
4015	NC_000963	CTG	2	6	192648	192653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604036
4016	NC_000963	CTA	2	6	192663	192668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604036
4017	NC_000963	TAT	2	6	192676	192681	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604036
4018	NC_000963	AGG	2	6	192682	192687	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604036
4019	NC_000963	ATT	2	6	192728	192733	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604036
4020	NC_000963	GCAA	2	8	192737	192744	50 %	0 %	25 %	25 %	15604036
4021	NC_000963	TAAT	2	8	192746	192753	50 %	50 %	0 %	0 %	15604036
4022	NC_000963	CTG	2	6	192762	192767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604036
4023	NC_000963	CTT	2	6	192813	192818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604036
4024	NC_000963	CTT	2	6	192825	192830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604036
4025	NC_000963	TAC	2	6	192852	192857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604036
4026	NC_000963	ACC	2	6	192883	192888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604036
4027	NC_000963	CAATA	2	10	192999	193008	60 %	20 %	0 %	20 %	15604036
4028	NC_000963	TAA	2	6	193050	193055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604036
4029	NC_000963	AG	3	6	193066	193071	50 %	0 %	50 %	0 %	15604036
4030	NC_000963	AAT	2	6	193203	193208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604037
4031	NC_000963	TCACAA	2	12	193212	193223	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	15604037
4032	NC_000963	TAA	2	6	193263	193268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604037
4033	NC_000963	GCA	2	6	193288	193293	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604037
4034	NC_000963	CTTG	2	8	193360	193367	0 %	50 %	25 %	25 %	15604037
4035	NC_000963	TAA	2	6	193377	193382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604037
4036	NC_000963	TAA	2	6	193467	193472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604037
4037	NC_000963	TTA	2	6	193570	193575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604037
4038	NC_000963	CTA	2	6	193583	193588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604037
4039	NC_000963	AGT	2	6	193599	193604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604037
4040	NC_000963	ATA	2	6	193697	193702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604037
4041	NC_000963	AAT	2	6	193716	193721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604038
4042	NC_000963	A	6	6	193764	193769	100 %	0 %	0 %	0 %	15604038
4043	NC_000963	TCT	2	6	193779	193784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604038
4044	NC_000963	GCT	2	6	193857	193862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604038
4045	NC_000963	ACT	2	6	193868	193873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604038
4046	NC_000963	TTG	2	6	193918	193923	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604038
4047	NC_000963	AGC	2	6	193931	193936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604038
4048	NC_000963	TGG	2	6	193940	193945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604038
4049	NC_000963	TTA	2	6	193969	193974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604038
4050	NC_000963	ATA	2	6	193984	193989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604038
4051	NC_000963	ATA	2	6	193996	194001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604038
4052	NC_000963	AAT	2	6	194003	194008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604038
4053	NC_000963	TTG	2	6	194038	194043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604038
4054	NC_000963	GAGTT	2	10	194044	194053	20 %	40 %	40 %	0 %	15604038
4055	NC_000963	T	6	6	194067	194072	0 %	100 %	0 %	0 %	15604038
4056	NC_000963	AGA	2	6	194084	194089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604038
4057	NC_000963	ATTA	2	8	194090	194097	50 %	50 %	0 %	0 %	15604038
4058	NC_000963	TAT	2	6	194191	194196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604038
4059	NC_000963	ATT	2	6	194285	194290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604038
4060	NC_000963	ATTT	2	8	194364	194371	25 %	75 %	0 %	0 %	15604038
4061	NC_000963	TAAA	2	8	194380	194387	75 %	25 %	0 %	0 %	15604038
4062	NC_000963	A	6	6	194385	194390	100 %	0 %	0 %	0 %	15604038
4063	NC_000963	TAC	3	9	195422	195430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604039
4064	NC_000963	TCCTTT	2	12	195447	195458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604039
4065	NC_000963	AGGTT	2	10	195459	195468	20 %	40 %	40 %	0 %	15604039
4066	NC_000963	TTG	2	6	195640	195645	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604040
4067	NC_000963	CAT	2	6	195735	195740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604040
4068	NC_000963	TTC	2	6	195799	195804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604040
4069	NC_000963	ATT	2	6	195865	195870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604040
4070	NC_000963	TTA	2	6	195887	195892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604040
4071	NC_000963	TA	3	6	195939	195944	50 %	50 %	0 %	0 %	15604040
4072	NC_000963	TGA	2	6	195970	195975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604040
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4074	NC_000963	GTA	2	6	196037	196042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604040
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4077	NC_000963	TTC	2	6	196090	196095	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604040
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4080	NC_000963	CTT	2	6	196152	196157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604040
4081	NC_000963	TTA	2	6	196187	196192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604040
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4083	NC_000963	TCA	2	6	196289	196294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604040
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4085	NC_000963	CAA	2	6	196323	196328	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15604040
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4088	NC_000963	TTAT	2	8	196448	196455	25 %	75 %	0 %	0 %	15604040
4089	NC_000963	AAG	2	6	196503	196508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604040
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4094	NC_000963	AT	3	6	196688	196693	50 %	50 %	0 %	0 %	15604040
4095	NC_000963	CT	3	6	196809	196814	0 %	50 %	0 %	50 %	15604041
4096	NC_000963	T	6	6	196833	196838	0 %	100 %	0 %	0 %	15604041
4097	NC_000963	TAA	2	6	196902	196907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604041
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4099	NC_000963	TATTG	2	10	197020	197029	20 %	60 %	20 %	0 %	15604041
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4102	NC_000963	GCA	2	6	197123	197128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604041
4103	NC_000963	CCAAA	2	10	197164	197173	60 %	0 %	0 %	40 %	15604041
4104	NC_000963	T	7	7	197182	197188	0 %	100 %	0 %	0 %	15604041
4105	NC_000963	TTG	2	6	197273	197278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604042
4106	NC_000963	ACC	2	6	197295	197300	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604042
4107	NC_000963	TTTCTT	2	12	197303	197314	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	15604042
4108	NC_000963	TCT	3	9	197326	197334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604042
4109	NC_000963	TAT	3	9	197339	197347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604042
4110	NC_000963	TGAAGA	2	12	197381	197392	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15604042
4111	NC_000963	TA	3	6	197521	197526	50 %	50 %	0 %	0 %	15604043
4112	NC_000963	TAC	2	6	197617	197622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604043
4113	NC_000963	CT	3	6	197709	197714	0 %	50 %	0 %	50 %	15604043
4114	NC_000963	A	7	7	197735	197741	100 %	0 %	0 %	0 %	15604043
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4122	NC_000963	TAC	2	6	198043	198048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604043
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4497	NC_000963	CTA	2	6	215724	215729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604055
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4500	NC_000963	TCT	2	6	215889	215894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604055

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