MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_000963	TTA	2	6	168091	168096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604017
3503	NC_000963	GTG	2	6	168118	168123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15604017
3504	NC_000963	TTAC	2	8	168203	168210	25 %	50 %	0 %	25 %	15604017
3505	NC_000963	AGA	2	6	168233	168238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604017
3506	NC_000963	ACT	2	6	168294	168299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604017
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3510	NC_000963	AT	3	6	168467	168472	50 %	50 %	0 %	0 %	15604017
3511	NC_000963	TGT	2	6	168491	168496	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604017
3512	NC_000963	A	6	6	168519	168524	100 %	0 %	0 %	0 %	15604017
3513	NC_000963	TTA	2	6	168531	168536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604017
3514	NC_000963	AGG	2	6	168610	168615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604017
3515	NC_000963	TGA	2	6	168650	168655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604017
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3517	NC_000963	TAG	2	6	168730	168735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604017
3518	NC_000963	A	6	6	168739	168744	100 %	0 %	0 %	0 %	15604017
3519	NC_000963	TGA	2	6	168761	168766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604017
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3521	NC_000963	ATTT	2	8	168860	168867	25 %	75 %	0 %	0 %	15604017
3522	NC_000963	CTG	2	6	168868	168873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604017
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3527	NC_000963	AGC	2	6	169016	169021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604017
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3534	NC_000963	AATT	2	8	170158	170165	50 %	50 %	0 %	0 %	15604018
3535	NC_000963	GTT	2	6	170220	170225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604018
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3538	NC_000963	TAG	2	6	170266	170271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604018
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3543	NC_000963	ACC	2	6	170472	170477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604018
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3554	NC_000963	GCA	2	6	170916	170921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604018
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3622	NC_000963	A	6	6	174234	174239	100 %	0 %	0 %	0 %	15604021
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3870	NC_000963	T	6	6	185864	185869	0 %	100 %	0 %	0 %	15604031
3871	NC_000963	TTGT	2	8	185893	185900	0 %	75 %	25 %	0 %	15604031
3872	NC_000963	T	6	6	185938	185943	0 %	100 %	0 %	0 %	15604031
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3999	NC_000963	TAT	2	6	192049	192054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604036
4000	NC_000963	GTA	2	6	192069	192074	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604036

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