MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1503	NC_000963	TAT	2	6	75737	75742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
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1505	NC_000963	TTA	2	6	75795	75800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1506	NC_000963	TGGT	2	8	75859	75866	0 %	50 %	50 %	0 %	15603946
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1508	NC_000963	TGAT	2	8	75958	75965	25 %	50 %	25 %	0 %	15603946
1509	NC_000963	GCA	2	6	76002	76007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603946
1510	NC_000963	TTA	2	6	76050	76055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1511	NC_000963	GGA	2	6	76058	76063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603946
1512	NC_000963	ATG	2	6	76099	76104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1513	NC_000963	TAA	2	6	76123	76128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
1514	NC_000963	TGCT	2	8	76150	76157	0 %	50 %	25 %	25 %	15603946
1515	NC_000963	CAA	2	6	76189	76194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603946
1516	NC_000963	ACC	2	6	76199	76204	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15603946
1517	NC_000963	TGG	2	6	76310	76315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603946
1518	NC_000963	ATT	2	6	76320	76325	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1519	NC_000963	TTA	2	6	76339	76344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1520	NC_000963	TGC	2	6	76346	76351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15603946
1521	NC_000963	TAC	2	6	76355	76360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603946
1522	NC_000963	AAG	2	6	76382	76387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603946
1523	NC_000963	A	7	7	76503	76509	100 %	0 %	0 %	0 %	15603946
1524	NC_000963	TTA	2	6	76516	76521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1525	NC_000963	GGT	2	6	76556	76561	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603946
1526	NC_000963	GTA	2	6	76666	76671	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1527	NC_000963	A	6	6	76730	76735	100 %	0 %	0 %	0 %	15603946
1528	NC_000963	TAT	2	6	76736	76741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
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1531	NC_000963	TGA	2	6	76826	76831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1532	NC_000963	ATT	2	6	76842	76847	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
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1534	NC_000963	TTCG	2	8	76933	76940	0 %	50 %	25 %	25 %	15603946
1535	NC_000963	ATT	2	6	76965	76970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1536	NC_000963	ACA	2	6	76994	76999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	15603946
1537	NC_000963	A	6	6	77021	77026	100 %	0 %	0 %	0 %	15603946
1538	NC_000963	A	6	6	77052	77057	100 %	0 %	0 %	0 %	15603946
1539	NC_000963	ATA	2	6	77097	77102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
1540	NC_000963	GAA	2	6	77124	77129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603946
1541	NC_000963	GTT	2	6	77148	77153	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603946
1542	NC_000963	CTATTA	2	12	77182	77193	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	15603946
1543	NC_000963	GGGT	2	8	77208	77215	0 %	25 %	75 %	0 %	15603946
1544	NC_000963	ATA	2	6	77233	77238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
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1546	NC_000963	TAT	2	6	77285	77290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
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1549	NC_000963	ATA	2	6	77359	77364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
1550	NC_000963	TAAAGG	2	12	77369	77380	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	15603946
1551	NC_000963	TGG	2	6	77384	77389	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603946
1552	NC_000963	ACT	2	6	77402	77407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603946
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1554	NC_000963	TTA	2	6	77466	77471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603946
1555	NC_000963	AGT	2	6	77478	77483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1556	NC_000963	CAAA	2	8	77526	77533	75 %	0 %	0 %	25 %	15603946
1557	NC_000963	TGAAA	2	10	77663	77672	60 %	20 %	20 %	0 %	15603946
1558	NC_000963	A	6	6	77670	77675	100 %	0 %	0 %	0 %	15603946
1559	NC_000963	GTA	2	6	77685	77690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1560	NC_000963	TAA	2	6	77735	77740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
1561	NC_000963	ATG	2	6	77761	77766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603946
1562	NC_000963	TTG	2	6	77794	77799	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603946
1563	NC_000963	GGT	2	6	77817	77822	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603946
1564	NC_000963	ATA	2	6	77857	77862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603946
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1566	NC_000963	TTG	2	6	78259	78264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603947
1567	NC_000963	ATA	2	6	78284	78289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603947
1568	NC_000963	TAA	2	6	78335	78340	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603947
1569	NC_000963	TAA	2	6	78465	78470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603947
1570	NC_000963	CGAC	2	8	78480	78487	25 %	0 %	25 %	50 %	15603947
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1574	NC_000963	GTT	2	6	78633	78638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603947
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1594	NC_000963	T	6	6	79532	79537	0 %	100 %	0 %	0 %	15603947
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1612	NC_000963	ATTTA	2	10	80836	80845	40 %	60 %	0 %	0 %	15603949
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1614	NC_000963	TAT	2	6	80877	80882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603949
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