MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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502	NC_000963	CTA	2	6	23602	23607	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603904
503	NC_000963	TTC	2	6	23666	23671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603904
504	NC_000963	GCC	2	6	23681	23686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	15603904
505	NC_000963	TAA	2	6	23705	23710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603904
506	NC_000963	TATT	2	8	23718	23725	25 %	75 %	0 %	0 %	15603904
507	NC_000963	TTG	3	9	23744	23752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15603904
508	NC_000963	TAATA	2	10	23753	23762	60 %	40 %	0 %	0 %	15603904
509	NC_000963	GCA	2	6	23814	23819	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15603904
510	NC_000963	TTA	2	6	23868	23873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603904
511	NC_000963	TA	3	6	23879	23884	50 %	50 %	0 %	0 %	15603904
512	NC_000963	T	9	9	23885	23893	0 %	100 %	0 %	0 %	15603904
513	NC_000963	TGA	2	6	23913	23918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603904
514	NC_000963	TAA	2	6	23919	23924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603904
515	NC_000963	ACT	2	6	23958	23963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603904
516	NC_000963	T	6	6	23975	23980	0 %	100 %	0 %	0 %	15603904
517	NC_000963	ATC	2	6	24002	24007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603904
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519	NC_000963	T	8	8	24044	24051	0 %	100 %	0 %	0 %	15603904
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521	NC_000963	ATT	2	6	24089	24094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603904
522	NC_000963	ATT	2	6	24098	24103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603904
523	NC_000963	ACT	2	6	24108	24113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603904
524	NC_000963	GAG	2	6	24154	24159	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15603904
525	NC_000963	TAT	2	6	24163	24168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603904
526	NC_000963	TAT	2	6	24188	24193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603904
527	NC_000963	AAAAAT	2	12	24246	24257	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	15603904
528	NC_000963	TAG	2	6	24391	24396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603905
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533	NC_000963	AGA	2	6	24746	24751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15603905
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536	NC_000963	TA	3	6	25284	25289	50 %	50 %	0 %	0 %	15603906
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539	NC_000963	TAT	2	6	25337	25342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603906
540	NC_000963	T	6	6	25370	25375	0 %	100 %	0 %	0 %	15603906
541	NC_000963	ATC	2	6	25395	25400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603906
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543	NC_000963	ATT	2	6	25503	25508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603906
544	NC_000963	TAG	2	6	25568	25573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603906
545	NC_000963	AAAT	2	8	25619	25626	75 %	25 %	0 %	0 %	15603906
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547	NC_000963	CATATA	2	12	25742	25753	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	15603906
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549	NC_000963	ATT	2	6	25836	25841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603906
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551	NC_000963	TAA	2	6	25979	25984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15603906
552	NC_000963	AT	3	6	25990	25995	50 %	50 %	0 %	0 %	15603906
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554	NC_000963	TGA	2	6	26132	26137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15603907
555	NC_000963	CTT	2	6	26214	26219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603907
556	NC_000963	CAT	3	9	26338	26346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603907
557	NC_000963	TAT	2	6	26385	26390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15603907
558	NC_000963	CTT	2	6	26457	26462	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15603907
559	NC_000963	TA	3	6	26494	26499	50 %	50 %	0 %	0 %	15603907
560	NC_000963	TCA	2	6	26519	26524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15603907
561	NC_000963	T	6	6	26558	26563	0 %	100 %	0 %	0 %	15603907
562	NC_000963	T	7	7	26583	26589	0 %	100 %	0 %	0 %	15603907
563	NC_000963	TGG	2	6	26761	26766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	15603907
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567	NC_000963	AT	3	6	26837	26842	50 %	50 %	0 %	0 %	15603907
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570	NC_000963	TAGT	2	8	27259	27266	25 %	50 %	25 %	0 %	15603908
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