MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000963	GTA	2	6	272540	272545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604090
5502	NC_000963	AGA	2	6	272583	272588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604090
5503	NC_000963	ATT	2	6	272600	272605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604090
5504	NC_000963	AT	3	6	272619	272624	50 %	50 %	0 %	0 %	15604090
5505	NC_000963	ATT	2	6	272647	272652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604090
5506	NC_000963	TGA	2	6	272667	272672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604090
5507	NC_000963	ATT	2	6	272674	272679	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604090
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5509	NC_000963	ACT	2	6	272707	272712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604090
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5511	NC_000963	A	9	9	272891	272899	100 %	0 %	0 %	0 %	15604091
5512	NC_000963	GAA	2	6	272936	272941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604091
5513	NC_000963	TTA	2	6	272952	272957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604091
5514	NC_000963	AT	3	6	273003	273008	50 %	50 %	0 %	0 %	15604091
5515	NC_000963	TAA	3	9	273025	273033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604091
5516	NC_000963	TCT	2	6	273038	273043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604091
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5519	NC_000963	AATT	2	8	273114	273121	50 %	50 %	0 %	0 %	15604091
5520	NC_000963	ATCAT	2	10	273152	273161	40 %	40 %	0 %	20 %	15604091
5521	NC_000963	TAT	2	6	273226	273231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604091
5522	NC_000963	TA	3	6	273349	273354	50 %	50 %	0 %	0 %	15604091
5523	NC_000963	T	6	6	273358	273363	0 %	100 %	0 %	0 %	15604091
5524	NC_000963	TTAT	2	8	273371	273378	25 %	75 %	0 %	0 %	15604091
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5530	NC_000963	GCA	2	6	275307	275312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604092
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5535	NC_000963	TTA	3	9	275510	275518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604092
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5538	NC_000963	A	6	6	275602	275607	100 %	0 %	0 %	0 %	15604092
5539	NC_000963	AG	3	6	275613	275618	50 %	0 %	50 %	0 %	15604092
5540	NC_000963	GGGATA	2	12	275623	275634	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	15604092
5541	NC_000963	T	8	8	275646	275653	0 %	100 %	0 %	0 %	15604092
5542	NC_000963	ATT	2	6	275682	275687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604092
5543	NC_000963	TGA	2	6	275797	275802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604092
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5549	NC_000963	GGTAT	2	10	275988	275997	20 %	40 %	40 %	0 %	15604092
5550	NC_000963	TA	4	8	276020	276027	50 %	50 %	0 %	0 %	15604092
5551	NC_000963	TA	3	6	276042	276047	50 %	50 %	0 %	0 %	15604092
5552	NC_000963	A	8	8	276050	276057	100 %	0 %	0 %	0 %	15604092
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5555	NC_000963	GAT	2	6	276348	276353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604092
5556	NC_000963	AT	3	6	276358	276363	50 %	50 %	0 %	0 %	15604092
5557	NC_000963	GAG	2	6	276372	276377	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	15604092
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5559	NC_000963	TTTA	2	8	276552	276559	25 %	75 %	0 %	0 %	15604092
5560	NC_000963	GGCAAT	2	12	276631	276642	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	15604092
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5612	NC_000963	ATTT	2	8	280443	280450	25 %	75 %	0 %	0 %	15604094
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