MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Rickettsia prowazekii str. Madrid E chromosome

Total Repeats: 22306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_000963	CTG	2	6	215913	215918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	15604055
4502	NC_000963	CTT	2	6	216000	216005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604055
4503	NC_000963	ACT	2	6	216020	216025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604055
4504	NC_000963	TTAG	2	8	216026	216033	25 %	50 %	25 %	0 %	15604055
4505	NC_000963	CCTC	2	8	216043	216050	0 %	25 %	0 %	75 %	15604055
4506	NC_000963	TGCCA	2	10	216055	216064	20 %	20 %	20 %	40 %	15604055
4507	NC_000963	TTC	2	6	216073	216078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604055
4508	NC_000963	CAC	2	6	216135	216140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604055
4509	NC_000963	TTCTAC	2	12	216199	216210	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	15604055
4510	NC_000963	T	8	8	216229	216236	0 %	100 %	0 %	0 %	15604055
4511	NC_000963	TA	3	6	216273	216278	50 %	50 %	0 %	0 %	15604055
4512	NC_000963	T	7	7	216284	216290	0 %	100 %	0 %	0 %	15604055
4513	NC_000963	ATA	2	6	216404	216409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604055
4514	NC_000963	ACT	2	6	216430	216435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604055
4515	NC_000963	T	6	6	216473	216478	0 %	100 %	0 %	0 %	15604055
4516	NC_000963	AAT	2	6	216519	216524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604055
4517	NC_000963	ATT	2	6	216568	216573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604055
4518	NC_000963	AGA	2	6	216583	216588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604055
4519	NC_000963	ATT	3	9	216592	216600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604055
4520	NC_000963	TTTG	2	8	216610	216617	0 %	75 %	25 %	0 %	15604055
4521	NC_000963	TTA	2	6	216650	216655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604055
4522	NC_000963	TTA	2	6	216665	216670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604055
4523	NC_000963	A	6	6	216685	216690	100 %	0 %	0 %	0 %	15604055
4524	NC_000963	TA	3	6	216738	216743	50 %	50 %	0 %	0 %	15604055
4525	NC_000963	TTC	2	6	216745	216750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604055
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4527	NC_000963	TTA	2	6	216788	216793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604055
4528	NC_000963	TTC	2	6	216799	216804	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604055
4529	NC_000963	TCTT	2	8	218523	218530	0 %	75 %	0 %	25 %	15604056
4530	NC_000963	ATA	2	6	218562	218567	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604056
4531	NC_000963	GCGA	2	8	218620	218627	25 %	0 %	50 %	25 %	15604056
4532	NC_000963	TC	3	6	218630	218635	0 %	50 %	0 %	50 %	15604056
4533	NC_000963	TAA	2	6	218748	218753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604056
4534	NC_000963	T	6	6	218780	218785	0 %	100 %	0 %	0 %	15604056
4535	NC_000963	CCA	2	6	218816	218821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604056
4536	NC_000963	TCA	2	6	218837	218842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604056
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4538	NC_000963	CAAA	2	8	218871	218878	75 %	0 %	0 %	25 %	15604056
4539	NC_000963	AGCA	2	8	218890	218897	50 %	0 %	25 %	25 %	15604056
4540	NC_000963	CAC	2	6	218913	218918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	15604056
4541	NC_000963	TTA	2	6	218930	218935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4542	NC_000963	TCT	2	6	218939	218944	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604056
4543	NC_000963	TAG	2	6	218961	218966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	15604056
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4545	NC_000963	GCA	2	6	219098	219103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604056
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4547	NC_000963	T	6	6	219200	219205	0 %	100 %	0 %	0 %	15604056
4548	NC_000963	A	7	7	219236	219242	100 %	0 %	0 %	0 %	15604056
4549	NC_000963	TTA	2	6	219288	219293	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4550	NC_000963	TC	3	6	219301	219306	0 %	50 %	0 %	50 %	15604056
4551	NC_000963	TTC	2	6	219313	219318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604056
4552	NC_000963	ATT	2	6	219385	219390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4553	NC_000963	TAA	2	6	219451	219456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604056
4554	NC_000963	AT	3	6	219477	219482	50 %	50 %	0 %	0 %	15604056
4555	NC_000963	TTA	2	6	219494	219499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4556	NC_000963	TTA	2	6	219519	219524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4557	NC_000963	TCT	2	6	219578	219583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604056
4558	NC_000963	TTC	2	6	219613	219618	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604056
4559	NC_000963	AAT	2	6	219633	219638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604056
4560	NC_000963	TTTC	2	8	219684	219691	0 %	75 %	0 %	25 %	15604056
4561	NC_000963	ATT	3	9	219802	219810	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4562	NC_000963	AATA	2	8	219827	219834	75 %	25 %	0 %	0 %	15604056
4563	NC_000963	ATT	2	6	219874	219879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	15604056
4564	NC_000963	A	6	6	219884	219889	100 %	0 %	0 %	0 %	15604056
4565	NC_000963	T	7	7	219967	219973	0 %	100 %	0 %	0 %	15604056
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4572	NC_000963	TAA	2	6	220113	220118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604056
4573	NC_000963	CA	3	6	220119	220124	50 %	0 %	0 %	50 %	15604056
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4593	NC_000963	AAT	2	6	220938	220943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	15604057
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4604	NC_000963	CTTCTC	2	12	221848	221859	0 %	50 %	0 %	50 %	15604058
4605	NC_000963	CAG	2	6	221893	221898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604058
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4609	NC_000963	GAA	2	6	222017	222022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	15604058
4610	NC_000963	TTG	2	6	222026	222031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	15604058
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4612	NC_000963	T	7	7	222144	222150	0 %	100 %	0 %	0 %	15604058
4613	NC_000963	CTTG	2	8	222215	222222	0 %	50 %	25 %	25 %	15604058
4614	NC_000963	TCT	2	6	222233	222238	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	15604058
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4621	NC_000963	CAT	2	6	222394	222399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604058
4622	NC_000963	AGC	2	6	222401	222406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	15604058
4623	NC_000963	CAT	2	6	222433	222438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	15604058
4624	NC_000963	TAGC	2	8	222469	222476	25 %	25 %	25 %	25 %	15604058
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