MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_022545	GCC	2	6	179836	179841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728264
4002	NC_022545	AGA	2	6	179860	179865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728264
4003	NC_022545	CCGC	2	8	179891	179898	0 %	0 %	25 %	75 %	549728264
4004	NC_022545	ATCG	2	8	179976	179983	25 %	25 %	25 %	25 %	549728264
4005	NC_022545	TCT	2	6	180003	180008	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_022545	GCG	2	6	180041	180046	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_022545	GCC	3	9	180055	180063	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_022545	TTA	2	6	180073	180078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_022545	AGCA	2	8	180095	180102	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4010	NC_022545	T	6	6	180142	180147	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4011	NC_022545	CGGCC	2	10	180216	180225	0 %	0 %	40 %	60 %	549728265
4012	NC_022545	GC	3	6	180255	180260	0 %	0 %	50 %	50 %	549728265
4013	NC_022545	GCCTT	2	10	180318	180327	0 %	40 %	20 %	40 %	549728265
4014	NC_022545	TCA	2	6	180429	180434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728265
4015	NC_022545	GTC	2	6	180450	180455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728265
4016	NC_022545	CGG	3	9	180521	180529	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728265
4017	NC_022545	GCCG	2	8	180617	180624	0 %	0 %	50 %	50 %	549728265
4018	NC_022545	CGA	3	9	180694	180702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728265
4019	NC_022545	CGC	2	6	180707	180712	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728265
4020	NC_022545	TCCGGC	2	12	180726	180737	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549728265
4021	NC_022545	GCC	3	9	180746	180754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728265
4022	NC_022545	AT	3	6	180771	180776	50 %	50 %	0 %	0 %	549728265
4023	NC_022545	GAT	2	6	180815	180820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728265
4024	NC_022545	GCA	2	6	180847	180852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728265
4025	NC_022545	AAT	2	6	180964	180969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728265
4026	NC_022545	CCATT	2	10	180985	180994	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4027	NC_022545	CGA	2	6	181028	181033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_022545	CTT	2	6	181084	181089	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728266
4029	NC_022545	TCG	2	6	181095	181100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728266
4030	NC_022545	CAG	2	6	181204	181209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728266
4031	NC_022545	GCC	2	6	181282	181287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728266
4032	NC_022545	TGCG	2	8	181394	181401	0 %	25 %	50 %	25 %	549728266
4033	NC_022545	CCT	2	6	181521	181526	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728266
4034	NC_022545	GCC	2	6	181604	181609	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728266
4035	NC_022545	TCG	2	6	181613	181618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728266
4036	NC_022545	CAG	2	6	181630	181635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728266
4037	NC_022545	TCGC	2	8	181642	181649	0 %	25 %	25 %	50 %	549728266
4038	NC_022545	GAA	2	6	181661	181666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728266
4039	NC_022545	GCG	2	6	181704	181709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728266
4040	NC_022545	TTC	2	6	181715	181720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728266
4041	NC_022545	ATG	2	6	181856	181861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728266
4042	NC_022545	CCG	2	6	181920	181925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728266
4043	NC_022545	TAT	2	6	181933	181938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728266
4044	NC_022545	CTG	3	9	181966	181974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728266
4045	NC_022545	ATG	2	6	181988	181993	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728266
4046	NC_022545	CGTTTT	2	12	182032	182043	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	549728266
4047	NC_022545	TCT	2	6	182106	182111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728266
4048	NC_022545	CAC	2	6	182119	182124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728266
4049	NC_022545	GTT	2	6	182146	182151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728266
4050	NC_022545	TCGATT	2	12	182183	182194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4051	NC_022545	T	7	7	182232	182238	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4052	NC_022545	GGC	2	6	182255	182260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_022545	GGA	2	6	182263	182268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_022545	ATG	2	6	182303	182308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728267
4055	NC_022545	TTC	2	6	182311	182316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728267
4056	NC_022545	TAA	2	6	182407	182412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728267
4057	NC_022545	CA	3	6	182445	182450	50 %	0 %	0 %	50 %	549728267
4058	NC_022545	CGG	2	6	182481	182486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728267
4059	NC_022545	TGA	2	6	182504	182509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728267
4060	NC_022545	CTT	2	6	182511	182516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728268
4061	NC_022545	CAG	2	6	182526	182531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4062	NC_022545	GCC	2	6	182545	182550	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728268
4063	NC_022545	TCT	2	6	182594	182599	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728268
4064	NC_022545	GCT	2	6	182681	182686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4065	NC_022545	GCT	2	6	182789	182794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4066	NC_022545	ATG	2	6	182847	182852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728268
4067	NC_022545	CAT	2	6	182906	182911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728268
4068	NC_022545	GGC	2	6	182930	182935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728268
4069	NC_022545	CAG	2	6	183078	183083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4070	NC_022545	GGC	2	6	183086	183091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728268
4071	NC_022545	GCT	2	6	183110	183115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4072	NC_022545	CCG	2	6	183155	183160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728268
4073	NC_022545	TGT	2	6	183184	183189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728268
4074	NC_022545	GAA	2	6	183203	183208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728268
4075	NC_022545	GAA	2	6	183210	183215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728268
4076	NC_022545	TTC	2	6	183246	183251	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728268
4077	NC_022545	CCA	2	6	183275	183280	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728268
4078	NC_022545	ATC	2	6	183330	183335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728268
4079	NC_022545	TGG	2	6	183362	183367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728268
4080	NC_022545	GAA	2	6	183369	183374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728268
4081	NC_022545	CAG	2	6	183405	183410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4082	NC_022545	CCT	2	6	183514	183519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728268
4083	NC_022545	ATC	2	6	183555	183560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728268
4084	NC_022545	CG	3	6	183573	183578	0 %	0 %	50 %	50 %	549728268
4085	NC_022545	CGA	2	6	183629	183634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4086	NC_022545	CGA	2	6	183647	183652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4087	NC_022545	CGC	2	6	183665	183670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728268
4088	NC_022545	TCT	2	6	183671	183676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728268
4089	NC_022545	CTG	2	6	183780	183785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4090	NC_022545	GTC	2	6	183912	183917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4091	NC_022545	GAA	2	6	183944	183949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728268
4092	NC_022545	CGTC	2	8	183964	183971	0 %	25 %	25 %	50 %	549728268
4093	NC_022545	TGC	2	6	184060	184065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4094	NC_022545	CTGG	2	8	184103	184110	0 %	25 %	50 %	25 %	549728268
4095	NC_022545	TTCC	2	8	184184	184191	0 %	50 %	0 %	50 %	549728268
4096	NC_022545	TGC	2	6	184225	184230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728268
4097	NC_022545	CTT	2	6	184416	184421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728268
4098	NC_022545	GCGG	2	8	184470	184477	0 %	0 %	75 %	25 %	549728269
4099	NC_022545	GCC	2	6	184494	184499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728269
4100	NC_022545	CG	3	6	184514	184519	0 %	0 %	50 %	50 %	549728269
4101	NC_022545	CCCT	2	8	184542	184549	0 %	25 %	0 %	75 %	549728269
4102	NC_022545	CGC	2	6	184559	184564	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728269
4103	NC_022545	GCA	2	6	184627	184632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728269
4104	NC_022545	AAGG	2	8	184676	184683	50 %	0 %	50 %	0 %	549728269
4105	NC_022545	CG	3	6	184720	184725	0 %	0 %	50 %	50 %	549728269
4106	NC_022545	GCCC	2	8	184741	184748	0 %	0 %	25 %	75 %	549728269
4107	NC_022545	CCA	2	6	184804	184809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728269
4108	NC_022545	GCGCC	2	10	184819	184828	0 %	0 %	40 %	60 %	549728269
4109	NC_022545	CGC	2	6	184843	184848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728269
4110	NC_022545	GCA	2	6	184869	184874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728269
4111	NC_022545	TGC	2	6	184929	184934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728269
4112	NC_022545	AGC	2	6	184950	184955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728269
4113	NC_022545	CAG	2	6	184991	184996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728269
4114	NC_022545	CAT	2	6	185065	185070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728269
4115	NC_022545	GCC	2	6	185127	185132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728269
4116	NC_022545	CGCC	2	8	185331	185338	0 %	0 %	25 %	75 %	549728269
4117	NC_022545	GAGC	2	8	185359	185366	25 %	0 %	50 %	25 %	549728269
4118	NC_022545	CAT	2	6	185408	185413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728269
4119	NC_022545	CGC	2	6	185423	185428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728269
4120	NC_022545	ATCG	2	8	185622	185629	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4121	NC_022545	GCG	4	12	185632	185643	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_022545	GCG	2	6	185661	185666	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728270
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4233	NC_022545	CAG	3	9	191108	191116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4237	NC_022545	GCCAT	2	10	191235	191244	20 %	20 %	20 %	40 %	549728275
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4243	NC_022545	CGA	2	6	191452	191457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728275
4244	NC_022545	CGCGT	2	10	191503	191512	0 %	20 %	40 %	40 %	549728275
4245	NC_022545	AGC	2	6	191622	191627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728275
4246	NC_022545	CCTTGC	2	12	191635	191646	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549728275
4247	NC_022545	GC	3	6	191648	191653	0 %	0 %	50 %	50 %	549728275
4248	NC_022545	ATC	2	6	191664	191669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728275
4249	NC_022545	CGC	2	6	191672	191677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728275
4250	NC_022545	AGC	2	6	191745	191750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728275
4251	NC_022545	CGG	2	6	191788	191793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728275
4252	NC_022545	GTG	2	6	191804	191809	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728275
4253	NC_022545	AGC	2	6	191859	191864	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728275
4254	NC_022545	CCG	2	6	191875	191880	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728275
4255	NC_022545	GC	3	6	191936	191941	0 %	0 %	50 %	50 %	549728275
4256	NC_022545	TCG	2	6	191955	191960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728275
4257	NC_022545	ATG	2	6	192000	192005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728275
4258	NC_022545	ATG	2	6	192048	192053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728275
4259	NC_022545	TGG	2	6	192055	192060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728275
4260	NC_022545	TCT	2	6	192073	192078	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728275
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4262	NC_022545	TCC	2	6	192108	192113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728275
4263	NC_022545	GGC	2	6	192124	192129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728275
4264	NC_022545	CGG	2	6	192166	192171	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728275
4265	NC_022545	GAT	3	9	192259	192267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4266	NC_022545	AAT	2	6	192317	192322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4267	NC_022545	GCTT	2	8	192349	192356	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4268	NC_022545	CAGC	2	8	192404	192411	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4269	NC_022545	GAG	2	6	192429	192434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4270	NC_022545	CG	3	6	192452	192457	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4271	NC_022545	GAGG	2	8	192489	192496	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4272	NC_022545	GA	3	6	192506	192511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4273	NC_022545	AAG	2	6	192548	192553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4274	NC_022545	CGG	2	6	192599	192604	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4275	NC_022545	TGG	2	6	192659	192664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728276
4276	NC_022545	GCC	2	6	192703	192708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728276
4277	NC_022545	CG	3	6	192935	192940	0 %	0 %	50 %	50 %	549728276
4278	NC_022545	GCG	2	6	192955	192960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728276
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4284	NC_022545	CCG	2	6	193235	193240	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728276
4285	NC_022545	CTG	2	6	193245	193250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728276
4286	NC_022545	TCA	2	6	193352	193357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728276
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4302	NC_022545	TGG	2	6	194237	194242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728277
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4306	NC_022545	TGA	2	6	194289	194294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728277
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4312	NC_022545	CG	3	6	194535	194540	0 %	0 %	50 %	50 %	549728278
4313	NC_022545	CTT	2	6	194549	194554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728278
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4316	NC_022545	CGG	2	6	194633	194638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728278
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4319	NC_022545	TTG	2	6	194713	194718	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728278
4320	NC_022545	CCTTG	2	10	194825	194834	0 %	40 %	20 %	40 %	549728278
4321	NC_022545	GC	3	6	194971	194976	0 %	0 %	50 %	50 %	549728278
4322	NC_022545	ATC	2	6	195004	195009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728278
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4328	NC_022545	TCG	2	6	195164	195169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728278
4329	NC_022545	TTGTC	2	10	195212	195221	0 %	60 %	20 %	20 %	549728278
4330	NC_022545	TCCA	2	8	195235	195242	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4331	NC_022545	GCT	2	6	195265	195270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4337	NC_022545	TGC	2	6	195574	195579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728279
4338	NC_022545	CCA	2	6	195601	195606	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728279
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4345	NC_022545	GATC	2	8	195938	195945	25 %	25 %	25 %	25 %	549728279
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4351	NC_022545	TGG	2	6	196060	196065	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728279
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4353	NC_022545	CG	3	6	196137	196142	0 %	0 %	50 %	50 %	549728280
4354	NC_022545	GCT	2	6	196162	196167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728280
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4357	NC_022545	GAA	2	6	196211	196216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728280
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4359	NC_022545	CTG	2	6	196295	196300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728280
4360	NC_022545	CGATCT	2	12	196303	196314	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549728280
4361	NC_022545	ACGGA	2	10	196353	196362	40 %	0 %	40 %	20 %	549728280
4362	NC_022545	GGCG	2	8	196438	196445	0 %	0 %	75 %	25 %	549728280
4363	NC_022545	GCT	2	6	196471	196476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728280
4364	NC_022545	GC	3	6	196511	196516	0 %	0 %	50 %	50 %	549728280
4365	NC_022545	CGA	2	6	196534	196539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728280
4366	NC_022545	ATC	2	6	196560	196565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728280
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4368	NC_022545	GC	3	6	196714	196719	0 %	0 %	50 %	50 %	549728280
4369	NC_022545	GCA	2	6	196723	196728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728280
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4479	NC_022545	GTAT	2	8	201964	201971	25 %	50 %	25 %	0 %	549728287
4480	NC_022545	GAA	2	6	201978	201983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728287
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4484	NC_022545	GAA	2	6	202062	202067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728287
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4486	NC_022545	AAAG	2	8	202183	202190	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4487	NC_022545	TCG	2	6	202260	202265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728288
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4489	NC_022545	GCC	2	6	202403	202408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728288
4490	NC_022545	GCGG	2	8	202477	202484	0 %	0 %	75 %	25 %	549728288
4491	NC_022545	TGC	2	6	202557	202562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728288
4492	NC_022545	ATC	2	6	202583	202588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728288
4493	NC_022545	TCG	2	6	202608	202613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728288
4494	NC_022545	GGC	2	6	202708	202713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728288
4495	NC_022545	TGC	2	6	202743	202748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728288
4496	NC_022545	CGG	2	6	202789	202794	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728288
4497	NC_022545	CGGC	2	8	202797	202804	0 %	0 %	50 %	50 %	549728288
4498	NC_022545	GGT	2	6	203018	203023	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728288
4499	NC_022545	CAAA	2	8	203041	203048	75 %	0 %	0 %	25 %	549728288
4500	NC_022545	CG	3	6	203080	203085	0 %	0 %	50 %	50 %	549728288

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