MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_022545	AGC	2	6	94318	94323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2003	NC_022545	GCC	2	6	94345	94350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2004	NC_022545	GCC	2	6	94377	94382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2005	NC_022545	CCG	2	6	94421	94426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2006	NC_022545	ACG	2	6	94431	94436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2007	NC_022545	GCG	2	6	94557	94562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2008	NC_022545	AGG	2	6	94618	94623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2009	NC_022545	CAT	2	6	94652	94657	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728183
2010	NC_022545	GAG	2	6	94728	94733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728183
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2012	NC_022545	GCC	2	6	94752	94757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728183
2013	NC_022545	GGGC	2	8	94781	94788	0 %	0 %	75 %	25 %	549728183
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2019	NC_022545	GAC	2	6	94935	94940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2023	NC_022545	GA	4	8	95133	95140	50 %	0 %	50 %	0 %	549728184
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2058	NC_022545	GGT	2	6	97007	97012	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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2128	NC_022545	CAT	2	6	99810	99815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728189
2129	NC_022545	TGG	2	6	99816	99821	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728189
2130	NC_022545	CGA	2	6	99825	99830	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728189
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2133	NC_022545	TTC	2	6	99874	99879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728189
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2142	NC_022545	GGAT	2	8	100350	100357	25 %	25 %	50 %	0 %	549728189
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2158	NC_022545	TCC	2	6	101067	101072	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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2248	NC_022545	CGGCA	2	10	105034	105043	20 %	0 %	40 %	40 %	549728193
2249	NC_022545	AGC	2	6	105068	105073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728193
2250	NC_022545	GCT	2	6	105078	105083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728193
2251	NC_022545	CGA	2	6	105087	105092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728193
2252	NC_022545	CCT	2	6	105120	105125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2253	NC_022545	AGCA	2	8	105195	105202	50 %	0 %	25 %	25 %	549728194
2254	NC_022545	GAA	2	6	105222	105227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728194
2255	NC_022545	GCC	2	6	105264	105269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
2256	NC_022545	CGA	2	6	105281	105286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2257	NC_022545	CGG	2	6	105303	105308	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728194
2258	NC_022545	ATC	2	6	105337	105342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2259	NC_022545	ATG	2	6	105409	105414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2260	NC_022545	AGC	3	9	105445	105453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2261	NC_022545	GAT	2	6	105456	105461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2262	NC_022545	TGA	2	6	105464	105469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2263	NC_022545	GAT	2	6	105480	105485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2264	NC_022545	ATC	2	6	105517	105522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2265	NC_022545	CAGC	2	8	105549	105556	25 %	0 %	25 %	50 %	549728194
2266	NC_022545	CGC	2	6	105564	105569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
2267	NC_022545	CAG	2	6	105582	105587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2268	NC_022545	GTG	2	6	105598	105603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728194
2269	NC_022545	CGA	2	6	105668	105673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2270	NC_022545	ACGC	2	8	105729	105736	25 %	0 %	25 %	50 %	549728194
2271	NC_022545	GAT	2	6	105744	105749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728194
2272	NC_022545	CAG	2	6	105756	105761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2273	NC_022545	CAG	2	6	105780	105785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2274	NC_022545	ATA	2	6	105786	105791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728194
2275	NC_022545	CGGA	2	8	105821	105828	25 %	0 %	50 %	25 %	549728194
2276	NC_022545	CGA	2	6	105845	105850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2277	NC_022545	GCT	2	6	105871	105876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728194
2278	NC_022545	GCAA	2	8	105877	105884	50 %	0 %	25 %	25 %	549728194
2279	NC_022545	CGG	2	6	105902	105907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728194
2280	NC_022545	GCC	2	6	105933	105938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
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2282	NC_022545	TGT	2	6	105962	105967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728194
2283	NC_022545	ATC	2	6	105979	105984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
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2285	NC_022545	ATC	2	6	106060	106065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728194
2286	NC_022545	GCCC	2	8	106067	106074	0 %	0 %	25 %	75 %	549728194
2287	NC_022545	GCC	2	6	106110	106115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
2288	NC_022545	TGACC	2	10	106139	106148	20 %	20 %	20 %	40 %	549728194
2289	NC_022545	CCG	2	6	106153	106158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728194
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2301	NC_022545	CCCG	2	8	106548	106555	0 %	0 %	25 %	75 %	549728195
2302	NC_022545	TCG	2	6	106574	106579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728195
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2305	NC_022545	CAT	2	6	106689	106694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728195
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2308	NC_022545	CGA	2	6	106844	106849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728195
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2310	NC_022545	TCC	2	6	106954	106959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2311	NC_022545	TCC	2	6	107108	107113	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728196
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2320	NC_022545	CATCGG	2	12	107419	107430	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728196
2321	NC_022545	CAT	2	6	107455	107460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728196
2322	NC_022545	CTG	2	6	107479	107484	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728196
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2326	NC_022545	CGA	2	6	107580	107585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728196
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2334	NC_022545	TCCGC	2	10	107832	107841	0 %	20 %	20 %	60 %	549728196
2335	NC_022545	AT	3	6	107855	107860	50 %	50 %	0 %	0 %	549728196
2336	NC_022545	CAT	2	6	107971	107976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728196
2337	NC_022545	TCC	3	9	107999	108007	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2338	NC_022545	TTG	2	6	108009	108014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2339	NC_022545	T	6	6	108049	108054	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2340	NC_022545	GAT	2	6	108099	108104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2341	NC_022545	GGC	2	6	108154	108159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728197
2342	NC_022545	CGC	2	6	108204	108209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728197
2343	NC_022545	AGCC	2	8	108220	108227	25 %	0 %	25 %	50 %	549728197
2344	NC_022545	CAT	2	6	108251	108256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728197
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2348	NC_022545	GAA	2	6	108483	108488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728197
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2352	NC_022545	CGG	2	6	108683	108688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728197
2353	NC_022545	GTG	2	6	108715	108720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728197
2354	NC_022545	GAT	2	6	108726	108731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728197
2355	NC_022545	GAC	2	6	108732	108737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728197
2356	NC_022545	CG	4	8	108738	108745	0 %	0 %	50 %	50 %	549728197
2357	NC_022545	ATTGTC	2	12	108780	108791	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549728197
2358	NC_022545	TGA	3	9	108815	108823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728197
2359	NC_022545	CGA	2	6	108853	108858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728197
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2362	NC_022545	CGA	2	6	109090	109095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728198
2363	NC_022545	ACGGA	2	10	109136	109145	40 %	0 %	40 %	20 %	549728198
2364	NC_022545	CGC	2	6	109211	109216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728198
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2369	NC_022545	CGC	2	6	109414	109419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728198
2370	NC_022545	CTGCC	2	10	109436	109445	0 %	20 %	20 %	60 %	549728198
2371	NC_022545	ACC	2	6	109479	109484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728198
2372	NC_022545	CTC	2	6	109487	109492	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728198
2373	NC_022545	CGG	2	6	109513	109518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728198
2374	NC_022545	ATC	2	6	109572	109577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728198
2375	NC_022545	TCC	2	6	109629	109634	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728198
2376	NC_022545	GATCTT	2	12	109649	109660	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	549728198
2377	NC_022545	GCG	2	6	109682	109687	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728198
2378	NC_022545	GC	3	6	109758	109763	0 %	0 %	50 %	50 %	549728198
2379	NC_022545	AGC	2	6	109788	109793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728198
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2381	NC_022545	CGG	2	6	109978	109983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728198
2382	NC_022545	CGT	2	6	110029	110034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728198
2383	NC_022545	CCA	2	6	110047	110052	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728198
2384	NC_022545	CCG	2	6	110063	110068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728198
2385	NC_022545	TGCG	2	8	110124	110131	0 %	25 %	50 %	25 %	549728198
2386	NC_022545	CTCCC	2	10	110152	110161	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2387	NC_022545	GCG	2	6	110244	110249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728199
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2389	NC_022545	ACCGG	2	10	110255	110264	20 %	0 %	40 %	40 %	549728199
2390	NC_022545	AGA	2	6	110349	110354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728199
2391	NC_022545	GC	3	6	110393	110398	0 %	0 %	50 %	50 %	549728199
2392	NC_022545	CCG	2	6	110513	110518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728199
2393	NC_022545	TCG	2	6	110612	110617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728199
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2395	NC_022545	CCGA	2	8	110684	110691	25 %	0 %	25 %	50 %	549728199
2396	NC_022545	AC	3	6	110695	110700	50 %	0 %	0 %	50 %	549728199
2397	NC_022545	CTT	2	6	110701	110706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728199
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2399	NC_022545	GGC	2	6	110869	110874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728199
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2401	NC_022545	CAA	2	6	111147	111152	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2402	NC_022545	TCA	2	6	111154	111159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2403	NC_022545	ATG	2	6	111170	111175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2404	NC_022545	GGCG	2	8	111185	111192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
2405	NC_022545	GC	3	6	111200	111205	0 %	0 %	50 %	50 %	549728200
2406	NC_022545	CAGC	2	8	111206	111213	25 %	0 %	25 %	50 %	549728200
2407	NC_022545	CCG	3	9	111250	111258	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728200
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2410	NC_022545	TTGT	2	8	111375	111382	0 %	75 %	25 %	0 %	549728200
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2413	NC_022545	GAC	2	6	111536	111541	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728200
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2420	NC_022545	ACCGGC	2	12	111704	111715	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549728200
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2429	NC_022545	GAAT	2	8	112037	112044	50 %	25 %	25 %	0 %	549728201
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2433	NC_022545	TCC	2	6	112217	112222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728201
2434	NC_022545	GGAT	2	8	112268	112275	25 %	25 %	50 %	0 %	549728201
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2440	NC_022545	TCC	2	6	112562	112567	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728201
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2443	NC_022545	CGG	2	6	112688	112693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728201
2444	NC_022545	GCCT	2	8	112736	112743	0 %	25 %	25 %	50 %	549728201
2445	NC_022545	TTG	2	6	112780	112785	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728202
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2452	NC_022545	TTA	2	6	113240	113245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549728203
2453	NC_022545	CCA	2	6	113401	113406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728203
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2456	NC_022545	TGG	2	6	113529	113534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728203
2457	NC_022545	CGG	2	6	113592	113597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728203
2458	NC_022545	TCG	2	6	113665	113670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728203
2459	NC_022545	CGA	2	6	113796	113801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2460	NC_022545	ACG	2	6	113813	113818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728204
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2462	NC_022545	TCG	2	6	114009	114014	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728204
2463	NC_022545	GCCC	2	8	114049	114056	0 %	0 %	25 %	75 %	549728204
2464	NC_022545	CGG	2	6	114065	114070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728204
2465	NC_022545	TGC	2	6	114160	114165	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728204
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2468	NC_022545	ATC	2	6	114197	114202	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728204
2469	NC_022545	GCC	2	6	114230	114235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728204
2470	NC_022545	GGCCGA	2	12	114250	114261	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549728204
2471	NC_022545	CAA	2	6	114295	114300	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728204
2472	NC_022545	CGC	2	6	114350	114355	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728204
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2474	NC_022545	CGA	2	6	114454	114459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728204
2475	NC_022545	GGC	2	6	114463	114468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728204
2476	NC_022545	ACC	2	6	114486	114491	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728204
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2478	NC_022545	CG	3	6	114515	114520	0 %	0 %	50 %	50 %	549728204
2479	NC_022545	GC	3	6	114526	114531	0 %	0 %	50 %	50 %	549728204
2480	NC_022545	GCC	2	6	114546	114551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2481	NC_022545	GAG	2	6	114567	114572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2482	NC_022545	GCA	2	6	114581	114586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728205
2483	NC_022545	CGA	2	6	114614	114619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728205
2484	NC_022545	TGG	2	6	114661	114666	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728205
2485	NC_022545	AAG	2	6	114786	114791	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728205
2486	NC_022545	CGC	2	6	114871	114876	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728205
2487	NC_022545	CGA	2	6	114881	114886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728205
2488	NC_022545	ATC	2	6	114990	114995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728206
2489	NC_022545	CGA	2	6	115036	115041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728206
2490	NC_022545	CCA	2	6	115110	115115	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728206
2491	NC_022545	ATA	2	6	115139	115144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728206
2492	NC_022545	GGC	2	6	115181	115186	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206
2493	NC_022545	TGCAC	2	10	115188	115197	20 %	20 %	20 %	40 %	549728206
2494	NC_022545	CGCC	2	8	115267	115274	0 %	0 %	25 %	75 %	549728206
2495	NC_022545	CG	3	6	115305	115310	0 %	0 %	50 %	50 %	549728206
2496	NC_022545	GAA	2	6	115317	115322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728206
2497	NC_022545	CCA	2	6	115330	115335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728206
2498	NC_022545	CCGA	2	8	115404	115411	25 %	0 %	25 %	50 %	549728206
2499	NC_022545	GC	3	6	115465	115470	0 %	0 %	50 %	50 %	549728206
2500	NC_022545	GGC	2	6	115481	115486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728206

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