MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 linear chromosome

Total Repeats: 44171

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022545	CGA	2	6	27407	27412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728111
502	NC_022545	CGG	2	6	27507	27512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728111
503	NC_022545	GGA	2	6	27546	27551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728111
504	NC_022545	CCGA	2	8	27634	27641	25 %	0 %	25 %	50 %	549728111
505	NC_022545	CAGG	2	8	27651	27658	25 %	0 %	50 %	25 %	549728111
506	NC_022545	GGA	2	6	27693	27698	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728111
507	NC_022545	CAG	3	9	27810	27818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728111
508	NC_022545	GGA	2	6	27864	27869	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728111
509	NC_022545	TTC	2	6	27871	27876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728111
510	NC_022545	CG	3	6	27892	27897	0 %	0 %	50 %	50 %	549728111
511	NC_022545	GGC	2	6	27900	27905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728111
512	NC_022545	GCCG	2	8	27919	27926	0 %	0 %	50 %	50 %	549728111
513	NC_022545	ACGCTG	2	12	28024	28035	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549728111
514	NC_022545	TGC	2	6	28049	28054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728111
515	NC_022545	GGC	2	6	28062	28067	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728111
516	NC_022545	AGC	2	6	28070	28075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728111
517	NC_022545	TCA	2	6	28112	28117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728111
518	NC_022545	TCT	2	6	28212	28217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728111
519	NC_022545	CCAG	2	8	28253	28260	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
520	NC_022545	CCG	2	6	28295	28300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
521	NC_022545	GGC	2	6	28362	28367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_022545	GCC	2	6	28376	28381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
523	NC_022545	GAG	2	6	28420	28425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_022545	ACC	2	6	28602	28607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728112
525	NC_022545	CGG	2	6	28669	28674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728112
526	NC_022545	CCG	2	6	28725	28730	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728112
527	NC_022545	CTC	2	6	28753	28758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728112
528	NC_022545	GTG	2	6	28772	28777	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549728112
529	NC_022545	TCC	2	6	28817	28822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728112
530	NC_022545	GGC	2	6	28895	28900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728112
531	NC_022545	AT	3	6	28908	28913	50 %	50 %	0 %	0 %	549728112
532	NC_022545	GAG	2	6	29088	29093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
533	NC_022545	TCG	2	6	29132	29137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728113
534	NC_022545	TCG	2	6	29141	29146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728113
535	NC_022545	ATG	2	6	29177	29182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728113
536	NC_022545	CGG	2	6	29217	29222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728113
537	NC_022545	AGG	2	6	29228	29233	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728113
538	NC_022545	CGG	2	6	29265	29270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728113
539	NC_022545	TCG	2	6	29282	29287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728113
540	NC_022545	TCA	2	6	29289	29294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728113
541	NC_022545	AGG	2	6	29327	29332	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728113
542	NC_022545	ACCAC	2	10	29405	29414	40 %	0 %	0 %	60 %	549728113
543	NC_022545	ACGGCA	2	12	29429	29440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728113
544	NC_022545	AGGT	2	8	29459	29466	25 %	25 %	50 %	0 %	549728113
545	NC_022545	GGC	2	6	29494	29499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728113
546	NC_022545	CGC	2	6	29511	29516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728113
547	NC_022545	ACG	2	6	29547	29552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_022545	ATC	2	6	29580	29585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
549	NC_022545	GCC	2	6	29624	29629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728114
550	NC_022545	GGC	2	6	29631	29636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728114
551	NC_022545	CCG	2	6	29660	29665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728114
552	NC_022545	CGG	2	6	29787	29792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728114
553	NC_022545	GCG	2	6	29825	29830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728114
554	NC_022545	ATCA	2	8	29842	29849	50 %	25 %	0 %	25 %	549728114
555	NC_022545	GCG	2	6	29852	29857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728114
556	NC_022545	CTG	2	6	29887	29892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728114
557	NC_022545	CTTTT	2	10	30049	30058	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
558	NC_022545	ACG	2	6	30078	30083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_022545	ATC	2	6	30132	30137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_022545	TCG	2	6	30206	30211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728115
561	NC_022545	GCA	2	6	30235	30240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728115
562	NC_022545	CGG	2	6	30252	30257	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728115
563	NC_022545	GCC	2	6	30289	30294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728115
564	NC_022545	CGC	2	6	30384	30389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728115
565	NC_022545	CGG	3	9	30405	30413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728115
566	NC_022545	GCA	2	6	30462	30467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728115
567	NC_022545	CAA	3	9	30474	30482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728115
568	NC_022545	CGT	2	6	30525	30530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728115
569	NC_022545	CAGT	2	8	30592	30599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
570	NC_022545	CGG	2	6	30680	30685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728116
571	NC_022545	CTG	2	6	30825	30830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728116
572	NC_022545	TCGC	2	8	30845	30852	0 %	25 %	25 %	50 %	549728116
573	NC_022545	GA	3	6	30876	30881	50 %	0 %	50 %	0 %	549728116
574	NC_022545	ATC	2	6	30887	30892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728116
575	NC_022545	CCT	2	6	31279	31284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728116
576	NC_022545	TGT	2	6	31285	31290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549728116
577	NC_022545	CT	3	6	31381	31386	0 %	50 %	0 %	50 %	549728116
578	NC_022545	ACCGA	2	10	31421	31430	40 %	0 %	20 %	40 %	549728116
579	NC_022545	CCA	2	6	31456	31461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728116
580	NC_022545	ATC	2	6	31476	31481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728116
581	NC_022545	GCCC	2	8	31495	31502	0 %	0 %	25 %	75 %	549728116
582	NC_022545	CA	3	6	31539	31544	50 %	0 %	0 %	50 %	549728116
583	NC_022545	TGA	2	6	31552	31557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728116
584	NC_022545	AAG	2	6	31560	31565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728116
585	NC_022545	GA	3	6	31705	31710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
586	NC_022545	GC	4	8	31732	31739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
587	NC_022545	GC	3	6	31780	31785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
588	NC_022545	GAT	2	6	31859	31864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728117
589	NC_022545	GGGA	2	8	31893	31900	25 %	0 %	75 %	0 %	549728117
590	NC_022545	GGC	2	6	31937	31942	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728117
591	NC_022545	AGG	2	6	31978	31983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728117
592	NC_022545	CGG	2	6	32008	32013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728117
593	NC_022545	GTGG	2	8	32075	32082	0 %	25 %	75 %	0 %	549728117
594	NC_022545	GTCG	2	8	32090	32097	0 %	25 %	50 %	25 %	549728117
595	NC_022545	TCCGGC	2	12	32140	32151	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549728117
596	NC_022545	CG	3	6	32168	32173	0 %	0 %	50 %	50 %	549728117
597	NC_022545	CGG	2	6	32182	32187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728117
598	NC_022545	TGA	2	6	32342	32347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
599	NC_022545	GCCG	2	8	32353	32360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
600	NC_022545	CAC	2	6	32469	32474	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728118
601	NC_022545	AGC	2	6	32487	32492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728118
602	NC_022545	TCGA	2	8	32493	32500	25 %	25 %	25 %	25 %	549728118
603	NC_022545	GTC	3	9	32501	32509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728118
604	NC_022545	CGA	2	6	32545	32550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728118
605	NC_022545	ATG	2	6	32628	32633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728118
606	NC_022545	CAT	2	6	32656	32661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728118
607	NC_022545	GAA	3	9	32732	32740	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549728118
608	NC_022545	ATG	2	6	32787	32792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728118
609	NC_022545	CAC	2	6	32828	32833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728118
610	NC_022545	ATA	2	6	32897	32902	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728118
611	NC_022545	AAT	2	6	32908	32913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549728118
612	NC_022545	AGG	2	6	32931	32936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549728118
613	NC_022545	TTCGCT	2	12	33023	33034	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_022545	GGCT	2	8	33069	33076	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
615	NC_022545	CTC	2	6	33089	33094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_022545	GCG	2	6	33100	33105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
617	NC_022545	GGT	2	6	33119	33124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
618	NC_022545	GCC	2	6	33180	33185	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
619	NC_022545	AGC	2	6	33239	33244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728119
620	NC_022545	CCA	2	6	33324	33329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728119
621	NC_022545	ATG	2	6	33356	33361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728119
622	NC_022545	TCA	2	6	33365	33370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549728119
623	NC_022545	GGC	2	6	33415	33420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_022545	GAC	2	6	33436	33441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
625	NC_022545	CAA	2	6	33448	33453	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_022545	CTC	2	6	33594	33599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728120
627	NC_022545	CGC	2	6	33642	33647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728120
628	NC_022545	GCC	2	6	33657	33662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728120
629	NC_022545	CGA	2	6	33699	33704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728120
630	NC_022545	CGA	2	6	33780	33785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728120
631	NC_022545	CTC	2	6	33822	33827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549728120
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633	NC_022545	TTC	2	6	33841	33846	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549728120
634	NC_022545	CTG	2	6	33885	33890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549728120
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638	NC_022545	CGA	2	6	33995	34000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728120
639	NC_022545	GGC	2	6	34059	34064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549728120
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652	NC_022545	CGA	2	6	34817	34822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549728120
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659	NC_022545	ACA	2	6	35164	35169	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549728120
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669	NC_022545	CTC	2	6	35619	35624	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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673	NC_022545	CGG	2	6	35828	35833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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750	NC_022545	ATG	2	6	38742	38747	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728122
751	NC_022545	CCA	2	6	38769	38774	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549728122
752	NC_022545	GCC	2	6	38899	38904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549728122
753	NC_022545	GAT	2	6	38963	38968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549728123
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1000	NC_022545	CGATG	2	10	49302	49311	20 %	20 %	40 %	20 %	549728132

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