MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 plasmid IRBL74_p

Total Repeats: 11564

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_022536	GAC	2	6	581755	581760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11502	NC_022536	AGC	2	6	581882	581887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11503	NC_022536	GTTC	2	8	581930	581937	0 %	50 %	25 %	25 %	549708228
11504	NC_022536	TCG	2	6	581984	581989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11505	NC_022536	GA	3	6	582012	582017	50 %	0 %	50 %	0 %	549708228
11506	NC_022536	ACG	2	6	582019	582024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11507	NC_022536	CCT	2	6	582027	582032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549708228
11508	NC_022536	GCG	2	6	582106	582111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708228
11509	NC_022536	CGT	2	6	582159	582164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11510	NC_022536	CAG	2	6	582292	582297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11511	NC_022536	CAA	2	6	582321	582326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549708228
11512	NC_022536	TTC	2	6	582358	582363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549708228
11513	NC_022536	GCC	3	9	582368	582376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708228
11514	NC_022536	CGC	2	6	582379	582384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708228
11515	NC_022536	CAT	2	6	582390	582395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549708228
11516	NC_022536	ATC	2	6	582416	582421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549708228
11517	NC_022536	CGG	2	6	582441	582446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708228
11518	NC_022536	GCCC	2	8	582507	582514	0 %	0 %	25 %	75 %	549708228
11519	NC_022536	C	6	6	582512	582517	0 %	0 %	0 %	100 %	549708228
11520	NC_022536	ACG	2	6	582617	582622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708228
11521	NC_022536	GAA	2	6	582646	582651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549708228
11522	NC_022536	GGC	2	6	582706	582711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708228
11523	NC_022536	TCCGG	2	10	582719	582728	0 %	20 %	40 %	40 %	549708228
11524	NC_022536	GTGC	2	8	582833	582840	0 %	25 %	50 %	25 %	549708228
11525	NC_022536	TGA	2	6	582861	582866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549708228
11526	NC_022536	CAT	2	6	582968	582973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11527	NC_022536	AAC	2	6	582979	582984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11528	NC_022536	AAC	2	6	583034	583039	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11529	NC_022536	TCTGC	2	10	583181	583190	0 %	40 %	20 %	40 %	549708229
11530	NC_022536	AGA	2	6	583238	583243	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549708229
11531	NC_022536	CGG	2	6	583255	583260	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708229
11532	NC_022536	GT	3	6	583323	583328	0 %	50 %	50 %	0 %	549708229
11533	NC_022536	CATT	2	8	583470	583477	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
11534	NC_022536	CCCG	2	8	583528	583535	0 %	0 %	25 %	75 %	549708230
11535	NC_022536	CGT	2	6	583541	583546	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11536	NC_022536	CTTGCG	2	12	583560	583571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11537	NC_022536	CCA	2	6	583629	583634	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549708230
11538	NC_022536	GAC	2	6	583800	583805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11539	NC_022536	ACT	2	6	583807	583812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549708230
11540	NC_022536	AGGC	2	8	583817	583824	25 %	0 %	50 %	25 %	549708230
11541	NC_022536	GGC	2	6	583846	583851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708230
11542	NC_022536	TTC	2	6	583879	583884	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549708230
11543	NC_022536	CCG	2	6	583892	583897	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708230
11544	NC_022536	CG	3	6	583896	583901	0 %	0 %	50 %	50 %	549708230
11545	NC_022536	CTT	2	6	583916	583921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549708230
11546	NC_022536	CT	3	6	583946	583951	0 %	50 %	0 %	50 %	549708230
11547	NC_022536	GCA	2	6	583981	583986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11548	NC_022536	GCT	2	6	584006	584011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11549	NC_022536	CCG	3	9	584134	584142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708230
11550	NC_022536	CTC	2	6	584199	584204	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549708230
11551	NC_022536	GCCA	2	8	584236	584243	25 %	0 %	25 %	50 %	549708230
11552	NC_022536	CG	3	6	584260	584265	0 %	0 %	50 %	50 %	549708230
11553	NC_022536	TGC	2	6	584267	584272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708230
11554	NC_022536	TC	3	6	584324	584329	0 %	50 %	0 %	50 %	549708230
11555	NC_022536	TTGT	2	8	584403	584410	0 %	75 %	25 %	0 %	549708230
11556	NC_022536	CCG	2	6	584431	584436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708231
11557	NC_022536	A	6	6	584468	584473	100 %	0 %	0 %	0 %	549708231
11558	NC_022536	CGC	2	6	584481	584486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549708231
11559	NC_022536	TGC	2	6	584556	584561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549708231
11560	NC_022536	AGT	2	6	584573	584578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549708231
11561	NC_022536	CGG	2	6	584613	584618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708231
11562	NC_022536	GGC	2	6	584716	584721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549708231
11563	NC_022536	GAT	2	6	584852	584857	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11564	NC_022536	TGT	2	6	584907	584912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.