MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_022535	CTT	2	6	160006	160011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704555
3502	NC_022535	CAGC	2	8	160016	160023	25 %	0 %	25 %	50 %	549704555
3503	NC_022535	GAA	2	6	160028	160033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704555
3504	NC_022535	CAT	2	6	160129	160134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704555
3505	NC_022535	CGC	2	6	160165	160170	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704555
3506	NC_022535	G	6	6	160211	160216	0 %	0 %	100 %	0 %	549704555
3507	NC_022535	CGC	2	6	160252	160257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704555
3508	NC_022535	CAGGA	2	10	160263	160272	40 %	0 %	40 %	20 %	549704555
3509	NC_022535	CTT	2	6	160425	160430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704556
3510	NC_022535	CGG	2	6	160534	160539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704556
3511	NC_022535	AT	3	6	160573	160578	50 %	50 %	0 %	0 %	549704556
3512	NC_022535	GCG	2	6	160664	160669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704557
3513	NC_022535	TCT	2	6	160712	160717	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704557
3514	NC_022535	ATG	2	6	160759	160764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704557
3515	NC_022535	TC	3	6	160791	160796	0 %	50 %	0 %	50 %	549704557
3516	NC_022535	ACA	2	6	160807	160812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704557
3517	NC_022535	CTT	2	6	160907	160912	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704557
3518	NC_022535	CAA	2	6	160949	160954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704557
3519	NC_022535	TCCGCC	2	12	161020	161031	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	549704557
3520	NC_022535	TTC	2	6	161048	161053	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3521	NC_022535	CGA	2	6	161058	161063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_022535	CGT	2	6	161107	161112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3523	NC_022535	GC	3	6	161192	161197	0 %	0 %	50 %	50 %	549704558
3524	NC_022535	GCG	2	6	161249	161254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704558
3525	NC_022535	GAA	2	6	161259	161264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704558
3526	NC_022535	GAC	2	6	161268	161273	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704558
3527	NC_022535	GC	3	6	161297	161302	0 %	0 %	50 %	50 %	549704558
3528	NC_022535	CCA	2	6	161368	161373	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704558
3529	NC_022535	TGC	2	6	161424	161429	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704558
3530	NC_022535	GAA	2	6	161526	161531	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704558
3531	NC_022535	CAG	2	6	161532	161537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704558
3532	NC_022535	TGA	2	6	161576	161581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704558
3533	NC_022535	CCG	2	6	161629	161634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704558
3534	NC_022535	GCC	2	6	161644	161649	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704558
3535	NC_022535	A	6	6	161652	161657	100 %	0 %	0 %	0 %	549704558
3536	NC_022535	GCT	2	6	161678	161683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704558
3537	NC_022535	C	6	6	161769	161774	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3538	NC_022535	GCG	2	6	161784	161789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_022535	GCC	2	6	161828	161833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3540	NC_022535	GAT	2	6	161836	161841	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704559
3541	NC_022535	GCA	3	9	161950	161958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704559
3542	NC_022535	GCA	2	6	162017	162022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704559
3543	NC_022535	CAA	2	6	162055	162060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704559
3544	NC_022535	GATG	2	8	162070	162077	25 %	25 %	50 %	0 %	549704559
3545	NC_022535	CGT	2	6	162079	162084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704559
3546	NC_022535	TGA	2	6	162130	162135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704559
3547	NC_022535	GGC	2	6	162176	162181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704559
3548	NC_022535	TGA	2	6	162186	162191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704559
3549	NC_022535	TCA	2	6	162222	162227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704559
3550	NC_022535	TGA	2	6	162303	162308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704559
3551	NC_022535	GGTGCG	2	12	162310	162321	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	549704559
3552	NC_022535	CCG	2	6	162380	162385	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704560
3553	NC_022535	ATG	2	6	162429	162434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704560
3554	NC_022535	TGGCGA	2	12	162439	162450	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549704560
3555	NC_022535	AG	3	6	162478	162483	50 %	0 %	50 %	0 %	549704560
3556	NC_022535	GAA	2	6	162589	162594	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704560
3557	NC_022535	CGC	2	6	162801	162806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704560
3558	NC_022535	CCA	2	6	162820	162825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704560
3559	NC_022535	CCGC	2	8	162831	162838	0 %	0 %	25 %	75 %	549704560
3560	NC_022535	CGCGG	2	10	162914	162923	0 %	0 %	60 %	40 %	549704560
3561	NC_022535	TGA	2	6	163048	163053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704560
3562	NC_022535	ACG	2	6	163058	163063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704560
3563	NC_022535	TCTG	2	8	163066	163073	0 %	50 %	25 %	25 %	549704560
3564	NC_022535	GCCG	2	8	163114	163121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3565	NC_022535	TGGC	2	8	163140	163147	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3566	NC_022535	TGCC	2	8	163212	163219	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3567	NC_022535	AAAT	2	8	163259	163266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3568	NC_022535	A	7	7	163287	163293	100 %	0 %	0 %	0 %	549704561
3569	NC_022535	GGC	2	6	163313	163318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704561
3570	NC_022535	CAC	2	6	163390	163395	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704561
3571	NC_022535	GCC	2	6	163471	163476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704561
3572	NC_022535	TCTCGC	2	12	163478	163489	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	549704561
3573	NC_022535	GCC	2	6	163509	163514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704561
3574	NC_022535	TTC	2	6	163689	163694	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704561
3575	NC_022535	GTC	2	6	163743	163748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704561
3576	NC_022535	GCCG	2	8	163763	163770	0 %	0 %	50 %	50 %	549704561
3577	NC_022535	TCG	2	6	163780	163785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704561
3578	NC_022535	TC	3	6	163823	163828	0 %	50 %	0 %	50 %	549704561
3579	NC_022535	GC	3	6	163835	163840	0 %	0 %	50 %	50 %	549704561
3580	NC_022535	GCAG	2	8	163937	163944	25 %	0 %	50 %	25 %	549704561
3581	NC_022535	CGA	2	6	164014	164019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704561
3582	NC_022535	GCC	2	6	164091	164096	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704561
3583	NC_022535	TTC	2	6	164106	164111	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704561
3584	NC_022535	CTG	2	6	164151	164156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704561
3585	NC_022535	TCA	2	6	164215	164220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704561
3586	NC_022535	CAGC	2	8	164232	164239	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3587	NC_022535	AAG	2	6	164271	164276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3588	NC_022535	TGGCG	2	10	164318	164327	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
3589	NC_022535	TTC	2	6	164414	164419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704562
3590	NC_022535	T	7	7	164424	164430	0 %	100 %	0 %	0 %	549704562
3591	NC_022535	TATC	2	8	164512	164519	25 %	50 %	0 %	25 %	549704562
3592	NC_022535	GCT	2	6	164650	164655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704562
3593	NC_022535	CG	3	6	164674	164679	0 %	0 %	50 %	50 %	549704562
3594	NC_022535	GCT	2	6	164707	164712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704562
3595	NC_022535	GCT	2	6	164746	164751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704562
3596	NC_022535	ATC	2	6	164780	164785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704562
3597	NC_022535	TGG	2	6	164790	164795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704562
3598	NC_022535	CGG	2	6	164816	164821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704562
3599	NC_022535	TGG	2	6	164826	164831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704562
3600	NC_022535	GCC	2	6	164834	164839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704562
3601	NC_022535	GTG	2	6	164867	164872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704562
3602	NC_022535	TCC	2	6	164916	164921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704562
3603	NC_022535	TCG	2	6	164955	164960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704562
3604	NC_022535	CCT	2	6	164976	164981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549704562
3605	NC_022535	ATC	2	6	164999	165004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704562
3606	NC_022535	ATC	2	6	165035	165040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704562
3607	NC_022535	CAT	2	6	165046	165051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704562
3608	NC_022535	TGA	2	6	165131	165136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704562
3609	NC_022535	CCA	2	6	165212	165217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704563
3610	NC_022535	CTG	2	6	165283	165288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704563
3611	NC_022535	CAT	2	6	165291	165296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704563
3612	NC_022535	TGT	2	6	165332	165337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704563
3613	NC_022535	CAGG	2	8	165338	165345	25 %	0 %	50 %	25 %	549704563
3614	NC_022535	AAC	2	6	165536	165541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704563
3615	NC_022535	CGG	2	6	165546	165551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704563
3616	NC_022535	GCA	2	6	165555	165560	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704563
3617	NC_022535	CTG	2	6	165604	165609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704563
3618	NC_022535	CGA	2	6	165612	165617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704563
3619	NC_022535	TTG	2	6	165664	165669	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704563
3620	NC_022535	AGA	2	6	165692	165697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704563
3621	NC_022535	CACG	2	8	165711	165718	25 %	0 %	25 %	50 %	549704563
3622	NC_022535	GAG	2	6	165724	165729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704563
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3753	NC_022535	CCG	2	6	170599	170604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3757	NC_022535	TTGAG	2	10	170765	170774	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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