MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium sp. IRBG74 circular chromosome

Total Repeats: 62467

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_022535	GGGCC	2	10	45709	45718	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1002	NC_022535	GGCC	2	8	45723	45730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1003	NC_022535	CAT	2	6	45803	45808	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704458
1004	NC_022535	TGCGC	2	10	45842	45851	0 %	20 %	40 %	40 %	549704458
1005	NC_022535	CAG	2	6	45867	45872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1006	NC_022535	CGA	2	6	45890	45895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1007	NC_022535	CGC	2	6	45957	45962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1008	NC_022535	GC	3	6	45979	45984	0 %	0 %	50 %	50 %	549704458
1009	NC_022535	TCA	2	6	45988	45993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704458
1010	NC_022535	CCA	2	6	46003	46008	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549704458
1011	NC_022535	GC	3	6	46100	46105	0 %	0 %	50 %	50 %	549704458
1012	NC_022535	CG	3	6	46186	46191	0 %	0 %	50 %	50 %	549704458
1013	NC_022535	AAG	2	6	46203	46208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704458
1014	NC_022535	GAC	2	6	46227	46232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1015	NC_022535	AAG	2	6	46365	46370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704458
1016	NC_022535	ACG	2	6	46377	46382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1017	NC_022535	CGA	2	6	46412	46417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1018	NC_022535	GCT	2	6	46427	46432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1019	NC_022535	GAT	2	6	46442	46447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704458
1020	NC_022535	GGC	2	6	46527	46532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704458
1021	NC_022535	CG	3	6	46549	46554	0 %	0 %	50 %	50 %	549704458
1022	NC_022535	CTG	2	6	46572	46577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1023	NC_022535	TCG	2	6	46582	46587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1024	NC_022535	ACG	2	6	46593	46598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1025	NC_022535	GACC	2	8	46625	46632	25 %	0 %	25 %	50 %	549704458
1026	NC_022535	CATCG	2	10	46643	46652	20 %	20 %	20 %	40 %	549704458
1027	NC_022535	CCTG	2	8	46685	46692	0 %	25 %	25 %	50 %	549704458
1028	NC_022535	GCC	2	6	46702	46707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1029	NC_022535	CCG	2	6	46751	46756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1030	NC_022535	GACGGA	2	12	46763	46774	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549704458
1031	NC_022535	GAA	2	6	46815	46820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704458
1032	NC_022535	CGA	2	6	46838	46843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1033	NC_022535	TCG	2	6	46884	46889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704458
1034	NC_022535	CCG	2	6	46907	46912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1035	NC_022535	CCG	2	6	46978	46983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1036	NC_022535	CGC	2	6	47027	47032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704458
1037	NC_022535	AGA	2	6	47084	47089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_022535	TTTTA	2	10	47113	47122	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_022535	GCT	2	6	47289	47294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704459
1040	NC_022535	TCACCG	2	12	47302	47313	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	549704459
1041	NC_022535	TCT	2	6	47316	47321	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704459
1042	NC_022535	GCC	2	6	47345	47350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704459
1043	NC_022535	TCT	2	6	47460	47465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704459
1044	NC_022535	GATCC	2	10	47517	47526	20 %	20 %	20 %	40 %	549704459
1045	NC_022535	AC	3	6	47552	47557	50 %	0 %	0 %	50 %	549704459
1046	NC_022535	TTA	2	6	47591	47596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704459
1047	NC_022535	CTT	2	6	47608	47613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704459
1048	NC_022535	AGC	2	6	47622	47627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704459
1049	NC_022535	GAA	2	6	47699	47704	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704459
1050	NC_022535	TTC	2	6	47811	47816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704459
1051	NC_022535	TCGGCC	2	12	47842	47853	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549704459
1052	NC_022535	TGG	2	6	47890	47895	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549704459
1053	NC_022535	ACG	2	6	47929	47934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704459
1054	NC_022535	CAT	2	6	47954	47959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704459
1055	NC_022535	CGCT	2	8	47970	47977	0 %	25 %	25 %	50 %	549704459
1056	NC_022535	GGC	2	6	47987	47992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704459
1057	NC_022535	ATCG	2	8	48005	48012	25 %	25 %	25 %	25 %	549704459
1058	NC_022535	GAA	2	6	48047	48052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704459
1059	NC_022535	GC	3	6	48098	48103	0 %	0 %	50 %	50 %	549704459
1060	NC_022535	GC	3	6	48131	48136	0 %	0 %	50 %	50 %	549704459
1061	NC_022535	GGA	2	6	48164	48169	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704459
1062	NC_022535	ATT	2	6	48172	48177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704459
1063	NC_022535	GGCT	2	8	48180	48187	0 %	25 %	50 %	25 %	549704459
1064	NC_022535	ATA	2	6	48267	48272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_022535	TGGC	2	8	48275	48282	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1066	NC_022535	AGG	2	6	48336	48341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_022535	TTC	2	6	48446	48451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549704460
1068	NC_022535	GAA	2	6	48487	48492	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1069	NC_022535	A	6	6	48528	48533	100 %	0 %	0 %	0 %	549704460
1070	NC_022535	GA	3	6	48549	48554	50 %	0 %	50 %	0 %	549704460
1071	NC_022535	TGC	2	6	48667	48672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1072	NC_022535	GTT	2	6	48692	48697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704460
1073	NC_022535	CGC	2	6	48727	48732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1074	NC_022535	CCGATG	2	12	48786	48797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1075	NC_022535	AGGGC	2	10	48807	48816	20 %	0 %	60 %	20 %	549704460
1076	NC_022535	GC	3	6	48854	48859	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1077	NC_022535	CCGCT	2	10	48876	48885	0 %	20 %	20 %	60 %	549704460
1078	NC_022535	TCG	2	6	48924	48929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1079	NC_022535	GCT	2	6	48934	48939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1080	NC_022535	TTG	2	6	48945	48950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549704460
1081	NC_022535	CGA	2	6	49023	49028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1082	NC_022535	GATC	2	8	49066	49073	25 %	25 %	25 %	25 %	549704460
1083	NC_022535	GGGC	2	8	49101	49108	0 %	0 %	75 %	25 %	549704460
1084	NC_022535	GAC	2	6	49138	49143	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1085	NC_022535	CAT	2	6	49144	49149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1086	NC_022535	GCC	2	6	49169	49174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1087	NC_022535	GGC	2	6	49256	49261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1088	NC_022535	CGC	2	6	49274	49279	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1089	NC_022535	TAT	2	6	49295	49300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549704460
1090	NC_022535	GCCGG	2	10	49330	49339	0 %	0 %	60 %	40 %	549704460
1091	NC_022535	CAT	2	6	49423	49428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1092	NC_022535	GTC	2	6	49436	49441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1093	NC_022535	ATGT	2	8	49508	49515	25 %	50 %	25 %	0 %	549704460
1094	NC_022535	GAA	2	6	49541	49546	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1095	NC_022535	CAT	2	6	49621	49626	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1096	NC_022535	GAG	2	6	49631	49636	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704460
1097	NC_022535	CGC	2	6	49637	49642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1098	NC_022535	CG	3	6	49670	49675	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1099	NC_022535	TCA	2	6	49695	49700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549704460
1100	NC_022535	GAT	2	6	49759	49764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704460
1101	NC_022535	GCC	2	6	49787	49792	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1102	NC_022535	CGC	2	6	49798	49803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1103	NC_022535	GGC	2	6	49897	49902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1104	NC_022535	AGA	2	6	49914	49919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1105	NC_022535	CGC	2	6	50011	50016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1106	NC_022535	GAA	2	6	50105	50110	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704460
1107	NC_022535	ACA	2	6	50127	50132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704460
1108	NC_022535	GCT	2	6	50184	50189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1109	NC_022535	CAA	2	6	50206	50211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549704460
1110	NC_022535	GGA	2	6	50224	50229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549704460
1111	NC_022535	CG	3	6	50231	50236	0 %	0 %	50 %	50 %	549704460
1112	NC_022535	GCA	2	6	50254	50259	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1113	NC_022535	CGT	2	6	50284	50289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1114	NC_022535	TCG	2	6	50304	50309	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1115	NC_022535	GGC	2	6	50326	50331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1116	NC_022535	GCT	2	6	50411	50416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704460
1117	NC_022535	CCG	3	9	50476	50484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549704460
1118	NC_022535	GGC	2	6	50506	50511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549704460
1119	NC_022535	A	6	6	50536	50541	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_022535	GCC	2	6	50542	50547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1121	NC_022535	CGG	2	6	50559	50564	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_022535	CTG	2	6	50577	50582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1123	NC_022535	TGC	2	6	50615	50620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549704461
1124	NC_022535	GAA	2	6	50683	50688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549704461
1125	NC_022535	ATA	2	6	50979	50984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549704461
1126	NC_022535	CG	3	6	50996	51001	0 %	0 %	50 %	50 %	549704461
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1246	NC_022535	TGT	2	6	56499	56504	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1247	NC_022535	CACGA	2	10	56512	56521	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1248	NC_022535	CGC	2	6	56540	56545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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1500	NC_022535	TGA	2	6	69623	69628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549704470

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