MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodococcus erythropolis CCM2595 plasmid pRECF1

Total Repeats: 2092

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_022125	GC	3	6	86309	86314	0 %	0 %	50 %	50 %	532437343
2002	NC_022125	GTG	2	6	86381	86386	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437343
2003	NC_022125	TGGA	2	8	86472	86479	25 %	25 %	50 %	0 %	532437343
2004	NC_022125	GTA	2	6	86485	86490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532437343
2005	NC_022125	GAT	2	6	86584	86589	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532437343
2006	NC_022125	GTG	2	6	86672	86677	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437343
2007	NC_022125	GCG	2	6	86755	86760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437344
2008	NC_022125	CAG	3	9	86784	86792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437344
2009	NC_022125	ATC	2	6	86793	86798	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532437344
2010	NC_022125	CGA	2	6	86855	86860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437344
2011	NC_022125	GT	3	6	86873	86878	0 %	50 %	50 %	0 %	532437344
2012	NC_022125	CGA	3	9	86933	86941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437344
2013	NC_022125	GA	3	6	86991	86996	50 %	0 %	50 %	0 %	532437344
2014	NC_022125	GAT	2	6	87027	87032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532437344
2015	NC_022125	ATC	2	6	87070	87075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	532437344
2016	NC_022125	CGG	2	6	87089	87094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437344
2017	NC_022125	CGC	2	6	87105	87110	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532437344
2018	NC_022125	CGG	2	6	87148	87153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437344
2019	NC_022125	TCGC	2	8	87160	87167	0 %	25 %	25 %	50 %	532437344
2020	NC_022125	TTCT	2	8	87174	87181	0 %	75 %	0 %	25 %	532437344
2021	NC_022125	GTC	2	6	87234	87239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437344
2022	NC_022125	GGT	2	6	87331	87336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437344
2023	NC_022125	TCGG	2	8	87369	87376	0 %	25 %	50 %	25 %	532437344
2024	NC_022125	GGT	2	6	87477	87482	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437345
2025	NC_022125	CGG	2	6	87506	87511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2026	NC_022125	TGG	2	6	87528	87533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437345
2027	NC_022125	CTG	2	6	87668	87673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2028	NC_022125	TTC	2	6	87685	87690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532437345
2029	NC_022125	GTC	2	6	87723	87728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2030	NC_022125	CTT	2	6	87755	87760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532437345
2031	NC_022125	CGG	2	6	87761	87766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2032	NC_022125	CGG	2	6	87769	87774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2033	NC_022125	TCG	2	6	87814	87819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2034	NC_022125	CGT	2	6	87872	87877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2035	NC_022125	GGTC	2	8	87881	87888	0 %	25 %	50 %	25 %	532437345
2036	NC_022125	CCG	2	6	87896	87901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532437345
2037	NC_022125	GTT	2	6	87932	87937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532437345
2038	NC_022125	GGC	2	6	87993	87998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2039	NC_022125	TCAGA	2	10	88001	88010	40 %	20 %	20 %	20 %	532437345
2040	NC_022125	GCA	2	6	88012	88017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2041	NC_022125	CGA	2	6	88049	88054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2042	NC_022125	GGC	2	6	88065	88070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2043	NC_022125	CGTG	2	8	88109	88116	0 %	25 %	50 %	25 %	532437345
2044	NC_022125	CGG	2	6	88134	88139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2045	NC_022125	CCA	2	6	88198	88203	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532437345
2046	NC_022125	GCG	2	6	88219	88224	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437345
2047	NC_022125	TGC	2	6	88227	88232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2048	NC_022125	ACG	3	9	88270	88278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2049	NC_022125	TGA	3	9	88334	88342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532437345
2050	NC_022125	CGATGG	2	12	88343	88354	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437345
2051	NC_022125	CGA	2	6	88376	88381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437345
2052	NC_022125	CAGGT	2	10	88396	88405	20 %	20 %	40 %	20 %	532437345
2053	NC_022125	GGT	2	6	88470	88475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	532437345
2054	NC_022125	CGAGTG	2	12	88499	88510	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437345
2055	NC_022125	AGCA	2	8	88512	88519	50 %	0 %	25 %	25 %	532437345
2056	NC_022125	TTCC	2	8	88577	88584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2057	NC_022125	TCG	2	6	88607	88612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2058	NC_022125	TG	3	6	88638	88643	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2059	NC_022125	GTC	2	6	88649	88654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437346
2060	NC_022125	TGT	2	6	88711	88716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	532437346
2061	NC_022125	TCTGCC	2	12	88734	88745	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	532437346
2062	NC_022125	GTC	2	6	88781	88786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437346
2063	NC_022125	TGGGCT	2	12	88864	88875	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	532437346
2064	NC_022125	GGC	2	6	88905	88910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437346
2065	NC_022125	TTCG	2	8	88993	89000	0 %	50 %	25 %	25 %	532437346
2066	NC_022125	TCAT	2	8	89007	89014	25 %	50 %	0 %	25 %	532437346
2067	NC_022125	CT	3	6	89026	89031	0 %	50 %	0 %	50 %	532437347
2068	NC_022125	CTT	2	6	89058	89063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	532437347
2069	NC_022125	GTC	2	6	89080	89085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2070	NC_022125	TGA	2	6	89139	89144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	532437347
2071	NC_022125	CGT	2	6	89145	89150	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2072	NC_022125	GAC	2	6	89170	89175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2073	NC_022125	CTCG	2	8	89202	89209	0 %	25 %	25 %	50 %	532437347
2074	NC_022125	ACG	2	6	89258	89263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2075	NC_022125	TCG	2	6	89264	89269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2076	NC_022125	GCTT	2	8	89300	89307	0 %	50 %	25 %	25 %	532437347
2077	NC_022125	ACG	2	6	89345	89350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2078	NC_022125	AGGTCG	2	12	89357	89368	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	532437347
2079	NC_022125	GCG	2	6	89465	89470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	532437347
2080	NC_022125	GCT	2	6	89477	89482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2081	NC_022125	TCG	2	6	89495	89500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2082	NC_022125	G	7	7	89503	89509	0 %	0 %	100 %	0 %	532437347
2083	NC_022125	GCT	2	6	89612	89617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2084	NC_022125	CCG	2	6	89693	89698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	532437347
2085	NC_022125	CGA	2	6	89793	89798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2086	NC_022125	GTC	2	6	89852	89857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	532437347
2087	NC_022125	ACC	2	6	89866	89871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	532437347
2088	NC_022125	GCAAT	2	10	89990	89999	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2089	NC_022125	TGC	2	6	90021	90026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2090	NC_022125	GCA	2	6	90080	90085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_022125	CAC	2	6	90207	90212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2092	NC_022125	GAC	2	6	90217	90222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.