MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Rhizobium etli bv. mimosae str. Mim1 plasmid pRetMIM1f

Total Repeats: 238

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021911	A	6	6	4700	4705	100 %	0 %	0 %	0 %	528837525
2	NC_021911	T	6	6	28520	28525	0 %	100 %	0 %	0 %	528837551
3	NC_021911	G	6	6	52308	52313	0 %	0 %	100 %	0 %	528837573
4	NC_021911	G	6	6	57514	57519	0 %	0 %	100 %	0 %	528837579
5	NC_021911	A	6	6	57633	57638	100 %	0 %	0 %	0 %	528837579
6	NC_021911	C	6	6	73840	73845	0 %	0 %	0 %	100 %	528837599
7	NC_021911	C	7	7	77073	77079	0 %	0 %	0 %	100 %	528837603
8	NC_021911	A	6	6	84932	84937	100 %	0 %	0 %	0 %	528837610
9	NC_021911	A	7	7	89297	89303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021911	G	6	6	90834	90839	0 %	0 %	100 %	0 %	528837619
11	NC_021911	G	7	7	94877	94883	0 %	0 %	100 %	0 %	528837622
12	NC_021911	T	6	6	103611	103616	0 %	100 %	0 %	0 %	528837630
13	NC_021911	C	6	6	105347	105352	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_021911	C	6	6	114430	114435	0 %	0 %	0 %	100 %	528837636
15	NC_021911	A	6	6	116784	116789	100 %	0 %	0 %	0 %	528837639
16	NC_021911	A	6	6	117097	117102	100 %	0 %	0 %	0 %	528837640
17	NC_021911	T	6	6	119480	119485	0 %	100 %	0 %	0 %	528837641
18	NC_021911	T	6	6	122546	122551	0 %	100 %	0 %	0 %	528837642
19	NC_021911	C	6	6	123266	123271	0 %	0 %	0 %	100 %	528837643
20	NC_021911	C	7	7	128769	128775	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_021911	A	6	6	130622	130627	100 %	0 %	0 %	0 %	528837646
22	NC_021911	T	6	6	132652	132657	0 %	100 %	0 %	0 %	528837648
23	NC_021911	C	6	6	137658	137663	0 %	0 %	0 %	100 %	528837655
24	NC_021911	C	6	6	137742	137747	0 %	0 %	0 %	100 %	528837655
25	NC_021911	C	6	6	140293	140298	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_021911	C	7	7	142230	142236	0 %	0 %	0 %	100 %	528837657
27	NC_021911	C	6	6	144617	144622	0 %	0 %	0 %	100 %	528837659
28	NC_021911	T	6	6	154693	154698	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021911	A	7	7	156215	156221	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021911	G	6	6	166655	166660	0 %	0 %	100 %	0 %	528837666
31	NC_021911	G	6	6	174734	174739	0 %	0 %	100 %	0 %	528837675
32	NC_021911	G	7	7	177419	177425	0 %	0 %	100 %	0 %	528837677
33	NC_021911	G	6	6	180775	180780	0 %	0 %	100 %	0 %	528837682
34	NC_021911	C	6	6	181562	181567	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_021911	T	6	6	197810	197815	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021911	C	6	6	199930	199935	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_021911	A	6	6	201274	201279	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021911	T	6	6	203191	203196	0 %	100 %	0 %	0 %	528837703
39	NC_021911	A	6	6	211911	211916	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021911	G	6	6	214372	214377	0 %	0 %	100 %	0 %	528837716
41	NC_021911	G	6	6	218816	218821	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021911	A	6	6	225624	225629	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021911	A	6	6	233332	233337	100 %	0 %	0 %	0 %	528837736
44	NC_021911	G	6	6	234351	234356	0 %	0 %	100 %	0 %	528837737
45	NC_021911	C	6	6	240571	240576	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_021911	A	6	6	241360	241365	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021911	G	6	6	243151	243156	0 %	0 %	100 %	0 %	528837748
48	NC_021911	A	7	7	243418	243424	100 %	0 %	0 %	0 %	528837748
49	NC_021911	G	7	7	243540	243546	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021911	T	6	6	244238	244243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021911	T	7	7	244510	244516	0 %	100 %	0 %	0 %	528837749
52	NC_021911	A	6	6	248401	248406	100 %	0 %	0 %	0 %	528837752
53	NC_021911	C	6	6	255906	255911	0 %	0 %	0 %	100 %	528837764
54	NC_021911	T	6	6	258748	258753	0 %	100 %	0 %	0 %	528837768
55	NC_021911	G	6	6	261039	261044	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021911	A	6	6	266287	266292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021911	A	7	7	267274	267280	100 %	0 %	0 %	0 %	528837774
58	NC_021911	A	6	6	271253	271258	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021911	A	6	6	272235	272240	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021911	T	7	7	277136	277142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021911	G	6	6	294561	294566	0 %	0 %	100 %	0 %	528837795
62	NC_021911	T	6	6	297180	297185	0 %	100 %	0 %	0 %	528837799
63	NC_021911	C	6	6	311429	311434	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
64	NC_021911	C	6	6	324273	324278	0 %	0 %	0 %	100 %	528837823
65	NC_021911	G	6	6	324364	324369	0 %	0 %	100 %	0 %	528837823
66	NC_021911	T	7	7	327282	327288	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021911	A	6	6	327623	327628	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021911	A	6	6	336665	336670	100 %	0 %	0 %	0 %	528837836
69	NC_021911	T	6	6	338612	338617	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021911	T	6	6	338619	338624	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021911	G	6	6	342676	342681	0 %	0 %	100 %	0 %	528837841
72	NC_021911	T	6	6	344828	344833	0 %	100 %	0 %	0 %	528837843
73	NC_021911	T	6	6	352983	352988	0 %	100 %	0 %	0 %	528837851
74	NC_021911	C	6	6	370787	370792	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
75	NC_021911	T	6	6	372080	372085	0 %	100 %	0 %	0 %	528837868
76	NC_021911	T	6	6	372540	372545	0 %	100 %	0 %	0 %	528837868
77	NC_021911	A	6	6	376509	376514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021911	A	6	6	382608	382613	100 %	0 %	0 %	0 %	528837878
79	NC_021911	G	6	6	394312	394317	0 %	0 %	100 %	0 %	528837888
80	NC_021911	A	6	6	395470	395475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021911	T	7	7	404488	404494	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021911	A	6	6	406432	406437	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021911	G	6	6	409571	409576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021911	T	6	6	409845	409850	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021911	A	6	6	411052	411057	100 %	0 %	0 %	0 %	528837904
86	NC_021911	G	7	7	411381	411387	0 %	0 %	100 %	0 %	528837904
87	NC_021911	C	6	6	428068	428073	0 %	0 %	0 %	100 %	528837919
88	NC_021911	A	6	6	428589	428594	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021911	T	6	6	430101	430106	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021911	T	7	7	430445	430451	0 %	100 %	0 %	0 %	528837922
91	NC_021911	T	7	7	438506	438512	0 %	100 %	0 %	0 %	528837928
92	NC_021911	A	6	6	438655	438660	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021911	A	7	7	442930	442936	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021911	A	8	8	452463	452470	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_021911	T	6	6	456122	456127	0 %	100 %	0 %	0 %	528837942
96	NC_021911	A	6	6	458597	458602	100 %	0 %	0 %	0 %	528837943
97	NC_021911	T	6	6	459133	459138	0 %	100 %	0 %	0 %	528837944
98	NC_021911	G	6	6	459804	459809	0 %	0 %	100 %	0 %	528837945
99	NC_021911	T	6	6	468458	468463	0 %	100 %	0 %	0 %	528837953
100	NC_021911	G	6	6	477554	477559	0 %	0 %	100 %	0 %	528837961
101	NC_021911	T	6	6	477639	477644	0 %	100 %	0 %	0 %	528837962
102	NC_021911	T	6	6	477803	477808	0 %	100 %	0 %	0 %	528837962
103	NC_021911	T	6	6	478631	478636	0 %	100 %	0 %	0 %	528837963
104	NC_021911	A	9	9	482402	482410	100 %	0 %	0 %	0 %	528837967
105	NC_021911	A	6	6	485004	485009	100 %	0 %	0 %	0 %	528837970
106	NC_021911	T	6	6	490453	490458	0 %	100 %	0 %	0 %	528837977
107	NC_021911	C	6	6	498790	498795	0 %	0 %	0 %	100 %	528837982
108	NC_021911	T	6	6	505760	505765	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021911	A	6	6	507676	507681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021911	C	6	6	509782	509787	0 %	0 %	0 %	100 %	528837990
111	NC_021911	C	6	6	516053	516058	0 %	0 %	0 %	100 %	528837995
112	NC_021911	G	8	8	516155	516162	0 %	0 %	100 %	0 %	528837995
113	NC_021911	A	6	6	516924	516929	100 %	0 %	0 %	0 %	528837996
114	NC_021911	G	6	6	517947	517952	0 %	0 %	100 %	0 %	528837996
115	NC_021911	A	6	6	528727	528732	100 %	0 %	0 %	0 %	528838008
116	NC_021911	G	6	6	536695	536700	0 %	0 %	100 %	0 %	528838015
117	NC_021911	A	7	7	538180	538186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021911	G	6	6	556156	556161	0 %	0 %	100 %	0 %	528838034
119	NC_021911	A	6	6	556591	556596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021911	A	8	8	563943	563950	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021911	T	6	6	564916	564921	0 %	100 %	0 %	0 %	528838040
122	NC_021911	C	6	6	566027	566032	0 %	0 %	0 %	100 %	528838041
123	NC_021911	T	6	6	585904	585909	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021911	T	7	7	586856	586862	0 %	100 %	0 %	0 %	528838062
125	NC_021911	T	6	6	589828	589833	0 %	100 %	0 %	0 %	528838064
126	NC_021911	C	7	7	590478	590484	0 %	0 %	0 %	100 %	528838064
127	NC_021911	G	6	6	596944	596949	0 %	0 %	100 %	0 %	528838071
128	NC_021911	A	7	7	598169	598175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021911	A	6	6	599527	599532	100 %	0 %	0 %	0 %	528838073
130	NC_021911	T	6	6	606652	606657	0 %	100 %	0 %	0 %	528838079
131	NC_021911	A	7	7	610710	610716	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021911	G	8	8	614367	614374	0 %	0 %	100 %	0 %	528838086
133	NC_021911	T	6	6	617249	617254	0 %	100 %	0 %	0 %	528838088
134	NC_021911	T	8	8	623410	623417	0 %	100 %	0 %	0 %	528838096
135	NC_021911	T	6	6	632474	632479	0 %	100 %	0 %	0 %	528838106
136	NC_021911	C	6	6	635026	635031	0 %	0 %	0 %	100 %	528838109
137	NC_021911	T	6	6	643410	643415	0 %	100 %	0 %	0 %	528838116
138	NC_021911	G	6	6	648912	648917	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021911	C	6	6	653198	653203	0 %	0 %	0 %	100 %	528838128
140	NC_021911	A	6	6	663748	663753	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_021911	T	6	6	664124	664129	0 %	100 %	0 %	0 %	528838136
142	NC_021911	C	6	6	671936	671941	0 %	0 %	0 %	100 %	528838141
143	NC_021911	T	6	6	675189	675194	0 %	100 %	0 %	0 %	528838144
144	NC_021911	A	7	7	675592	675598	100 %	0 %	0 %	0 %	528838144
145	NC_021911	G	6	6	687528	687533	0 %	0 %	100 %	0 %	528838153
146	NC_021911	C	6	6	690860	690865	0 %	0 %	0 %	100 %	528838156
147	NC_021911	G	6	6	706550	706555	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021911	G	6	6	714796	714801	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
149	NC_021911	C	6	6	719125	719130	0 %	0 %	0 %	100 %	528838173
150	NC_021911	T	7	7	720981	720987	0 %	100 %	0 %	0 %	528838178
151	NC_021911	A	6	6	737985	737990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_021911	T	6	6	757521	757526	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_021911	G	6	6	762907	762912	0 %	0 %	100 %	0 %	528838217
154	NC_021911	A	6	6	766960	766965	100 %	0 %	0 %	0 %	528838222
155	NC_021911	A	6	6	769553	769558	100 %	0 %	0 %	0 %	528838224
156	NC_021911	T	6	6	789308	789313	0 %	100 %	0 %	0 %	528838244
157	NC_021911	G	6	6	792500	792505	0 %	0 %	100 %	0 %	528838248
158	NC_021911	T	6	6	800004	800009	0 %	100 %	0 %	0 %	528838255
159	NC_021911	A	6	6	802970	802975	100 %	0 %	0 %	0 %	528838257
160	NC_021911	T	7	7	802998	803004	0 %	100 %	0 %	0 %	528838257
161	NC_021911	A	6	6	811673	811678	100 %	0 %	0 %	0 %	528838269
162	NC_021911	A	6	6	821051	821056	100 %	0 %	0 %	0 %	528838278
163	NC_021911	T	6	6	823569	823574	0 %	100 %	0 %	0 %	528838283
164	NC_021911	T	6	6	827255	827260	0 %	100 %	0 %	0 %	528838287
165	NC_021911	T	6	6	834852	834857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_021911	A	6	6	835604	835609	100 %	0 %	0 %	0 %	528838297
167	NC_021911	T	6	6	837066	837071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_021911	G	6	6	842026	842031	0 %	0 %	100 %	0 %	528838307
169	NC_021911	A	6	6	846985	846990	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_021911	A	6	6	847691	847696	100 %	0 %	0 %	0 %	528838309
171	NC_021911	C	6	6	848658	848663	0 %	0 %	0 %	100 %	528838310
172	NC_021911	T	6	6	851469	851474	0 %	100 %	0 %	0 %	528838312
173	NC_021911	T	6	6	852156	852161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_021911	A	6	6	852882	852887	100 %	0 %	0 %	0 %	528838313
175	NC_021911	C	6	6	869687	869692	0 %	0 %	0 %	100 %	528838326
176	NC_021911	A	6	6	882176	882181	100 %	0 %	0 %	0 %	528838336
177	NC_021911	T	6	6	883054	883059	0 %	100 %	0 %	0 %	528838337
178	NC_021911	T	6	6	884013	884018	0 %	100 %	0 %	0 %	528838337
179	NC_021911	G	6	6	884132	884137	0 %	0 %	100 %	0 %	528838338
180	NC_021911	A	6	6	887873	887878	100 %	0 %	0 %	0 %	528838342
181	NC_021911	A	7	7	893350	893356	100 %	0 %	0 %	0 %	528838347
182	NC_021911	T	7	7	894089	894095	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021911	T	6	6	894156	894161	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
184	NC_021911	A	6	6	896463	896468	100 %	0 %	0 %	0 %	528838350
185	NC_021911	C	6	6	900224	900229	0 %	0 %	0 %	100 %	528838353
186	NC_021911	T	6	6	901745	901750	0 %	100 %	0 %	0 %	528838353
187	NC_021911	C	6	6	901999	902004	0 %	0 %	0 %	100 %	528838354
188	NC_021911	C	6	6	902162	902167	0 %	0 %	0 %	100 %	528838354
189	NC_021911	A	6	6	910584	910589	100 %	0 %	0 %	0 %	528838361
190	NC_021911	C	6	6	915302	915307	0 %	0 %	0 %	100 %	528838365
191	NC_021911	A	6	6	917549	917554	100 %	0 %	0 %	0 %	528838367
192	NC_021911	C	6	6	919933	919938	0 %	0 %	0 %	100 %	528838369
193	NC_021911	A	6	6	923765	923770	100 %	0 %	0 %	0 %	528838373
194	NC_021911	T	6	6	927017	927022	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
195	NC_021911	C	6	6	930605	930610	0 %	0 %	0 %	100 %	528838381
196	NC_021911	C	6	6	932432	932437	0 %	0 %	0 %	100 %	528838382
197	NC_021911	A	6	6	937080	937085	100 %	0 %	0 %	0 %	528838387
198	NC_021911	A	6	6	941080	941085	100 %	0 %	0 %	0 %	528838389
199	NC_021911	T	9	9	943195	943203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_021911	T	8	8	950540	950547	0 %	100 %	0 %	0 %	528838396
201	NC_021911	T	6	6	951384	951389	0 %	100 %	0 %	0 %	528838397
202	NC_021911	A	6	6	951412	951417	100 %	0 %	0 %	0 %	528838397
203	NC_021911	A	6	6	956509	956514	100 %	0 %	0 %	0 %	528838401
204	NC_021911	C	8	8	956900	956907	0 %	0 %	0 %	100 %	528838401
205	NC_021911	C	7	7	957145	957151	0 %	0 %	0 %	100 %	528838401
206	NC_021911	C	6	6	957579	957584	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
207	NC_021911	C	7	7	962787	962793	0 %	0 %	0 %	100 %	528838407
208	NC_021911	A	6	6	964085	964090	100 %	0 %	0 %	0 %	528838408
209	NC_021911	G	6	6	965584	965589	0 %	0 %	100 %	0 %	528838410
210	NC_021911	A	6	6	971335	971340	100 %	0 %	0 %	0 %	528838414
211	NC_021911	G	6	6	978069	978074	0 %	0 %	100 %	0 %	528838419
212	NC_021911	T	6	6	981272	981277	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
213	NC_021911	T	6	6	982621	982626	0 %	100 %	0 %	0 %	528838423
214	NC_021911	G	6	6	985750	985755	0 %	0 %	100 %	0 %	528838426
215	NC_021911	A	6	6	987802	987807	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_021911	A	6	6	998331	998336	100 %	0 %	0 %	0 %	528838439
217	NC_021911	T	6	6	1001631	1001636	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
218	NC_021911	A	6	6	1004621	1004626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
219	NC_021911	G	6	6	1006851	1006856	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
220	NC_021911	T	6	6	1014518	1014523	0 %	100 %	0 %	0 %	528838456
221	NC_021911	C	6	6	1016797	1016802	0 %	0 %	0 %	100 %	528838458
222	NC_021911	A	6	6	1022440	1022445	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
223	NC_021911	G	6	6	1024407	1024412	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
224	NC_021911	T	6	6	1024788	1024793	0 %	100 %	0 %	0 %	528838464
225	NC_021911	T	7	7	1033334	1033340	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
226	NC_021911	T	6	6	1035412	1035417	0 %	100 %	0 %	0 %	528838476
227	NC_021911	T	6	6	1038779	1038784	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
228	NC_021911	A	6	6	1041226	1041231	100 %	0 %	0 %	0 %	528838482
229	NC_021911	C	6	6	1044434	1044439	0 %	0 %	0 %	100 %	528838487
230	NC_021911	C	6	6	1045820	1045825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
231	NC_021911	A	6	6	1047357	1047362	100 %	0 %	0 %	0 %	528838490
232	NC_021911	C	6	6	1051820	1051825	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
233	NC_021911	A	6	6	1052203	1052208	100 %	0 %	0 %	0 %	528838497
234	NC_021911	A	6	6	1055936	1055941	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_021911	A	6	6	1060630	1060635	100 %	0 %	0 %	0 %	528838508
236	NC_021911	T	6	6	1062727	1062732	0 %	100 %	0 %	0 %	528838511
237	NC_021911	A	6	6	1069459	1069464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
238	NC_021911	A	6	6	1081153	1081158	100 %	0 %	0 %	0 %	528838528

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.